מנ Tracker של שונות גנטית: חשב את תדירות האללים באוכלוסיות

חשב את תדירות האללים הספציפיים (וריאנטים גנטיים) בתוך אוכלוסייה על ידי הזנת מספר הפרטים הכולל ומספר המקרים של האלל. חיוני לגנטיקה של אוכלוסיות, ביולוגיה אבולוציונית ולימודי שונות גנטית.

מ tracker של שונות גנטית

כלי זה מחשב את תדירות האללים הספציפיים (וריאציות של גן) בתוך אוכלוסייה נתונה. הזן את מספר הפרטים הכולל באוכלוסייה ואת מספר המקרים של האלל הספציפי כדי לחשב את התדירות שלו.

נתוני קלט

מספר הפרטים הכולל באוכלוסייה*

מספר המקרים של האלל הספציפי*

תוצאות

תדירות האלל

Copy

0.2500

נוסחת חישוב

f = 50 / (100 × 2) = 0.2500

המחשה של תדירות האלל

Population Representation

Target Allele

Other Alleles

📚

תיעוד

متتبع التباين الجيني: حاسبة تردد الأليل

المقدمة

يعد متتبع التباين الجيني أداة متخصصة مصممة لحساب تردد الأليل داخل مجموعة سكانية. يمثل تردد الأليل نسبة شكل معين من الجين (الأليل) بين جميع نسخ ذلك الجين في مجموعة سكانية، ويعتبر قياسًا أساسيًا في علم الوراثة السكانية. توفر هذه الحاسبة طريقة بسيطة لتحديد مدى شيوع أشكال الجينات المحددة داخل مجموعة، وهو أمر ضروري لفهم التنوع الجيني، والتطور، ومخاطر الأمراض في السكان. سواء كنت طالبًا تتعلم عن المبادئ الجينية، أو باحثًا يحلل بيانات السكان، أو محترفًا في الرعاية الصحية يدرس انتشار الأمراض، فإن هذه الأداة تقدم وسيلة بسيطة ولكن قوية لقياس التباين الجيني.

ما هو تردد الأليل؟

يشير تردد الأليل إلى النسبة النسبية لأليل معين (شكل من الجين) بين جميع الأليلات في ذلك الموضع الجيني في مجموعة سكانية. في معظم الكائنات الحية، بما في ذلك البشر، يحمل كل فرد نسختين من كل جين (واحدة موروثة من كل والد)، مما يجعلهم كائنات ثنائية الصيغة الصبغية. لذلك، في مجموعة سكانية مكونة من N فردًا، هناك 2N نسخة من كل جين.

يتم حساب تردد الأليل باستخدام الصيغة التالية:

$f = \frac{n_A}{2N}$

حيث:

$f$ هو تردد الأليل
$n_A$ هو عدد حالات الأليل المحدد في المجموعة
$N$ هو العدد الإجمالي للأفراد في المجموعة
$2N$ يمثل العدد الإجمالي للأليلات في المجموعة (بالنسبة للكائنات الثنائية الصيغة الصبغية)

على سبيل المثال، إذا كان لدينا 100 فرد في مجموعة سكانية، وتمت ملاحظة 50 حالة من أليل معين، فإن التردد سيكون:

$f = \frac{50}{2 \times 100} = \frac{50}{200} = 0.25 \text{ أو } 25\%$

هذا يعني أن 25% من جميع الأليلات في هذا الموضع الجيني في المجموعة هي من هذا الشكل المحدد.

كيفية استخدام متتبع التباين الجيني

تم تصميم حاسبة تردد الأليل لدينا لتكون بديهية وسهلة الاستخدام. اتبع هذه الخطوات البسيطة لحساب تردد أليل معين في مجموعتك السكانية:

أدخل العدد الإجمالي للأفراد في المجموعة في حقل الإدخال الأول.
- يجب أن يكون هذا عددًا صحيحًا موجبًا.
- على سبيل المثال، إذا كنت تدرس 100 شخص، أدخل "100".
أدخل عدد حالات الأليل المحدد الذي تتعقبه في حقل الإدخال الثاني.
- يجب أن يكون هذا عددًا صحيحًا غير سالب.
- بالنسبة للكائنات الثنائية الصيغة الصبغية، لا يمكن أن يتجاوز هذا الرقم ضعف عدد الأفراد.
- على سبيل المثال، إذا كان 30 شخصًا في مجموعتك السكانية المكونة من 100 يحملون أليلًا متغايرًا (لديهم نسخة واحدة من الأليل) و10 يحملون أليلًا متماثلًا (لديهم نسختان)، ستدخل "50" (30 + 20).
اطلع على تردد الأليل المحسوب المعروض في قسم النتائج.
- يتم عرض النتيجة كعدد عشري بين 0 و1.
- على سبيل المثال، تعني نتيجة 0.25 أن الأليل يظهر في 25% من جميع نسخ الجين في المجموعة.
افحص التصور لرؤية تمثيل رسومي لتوزيع الأليل.
استخدم زر النسخ لنسخ النتيجة إلى الحافظة لاستخدامها في التقارير أو التحليل الإضافي.

التحقق من صحة الإدخال

تقوم الحاسبة بإجراء عدة فحوصات للتحقق من صحة الإدخال لضمان نتائج دقيقة:

يجب أن يكون حجم المجموعة إيجابيًا: يجب أن يكون عدد الأفراد أكبر من الصفر.
يجب أن تكون حالات الأليل غير سلبية: لا يمكن أن يكون عدد حالات الأليل سالبًا.
الحد الأقصى لحالات الأليل: بالنسبة للكائنات الثنائية الصيغة الصبغية، لا يمكن أن يتجاوز عدد حالات الأليل ضعف عدد الأفراد (2N).

إذا فشلت أي من هذه التحقق، ستوجهك رسالة خطأ لتصحيح إدخالك.

فهم النتائج

يتم تقديم نتيجة تردد الأليل كقيمة عددية عشرية بين 0 و1، حيث:

0 (0%) تشير إلى أن الأليل غائب تمامًا عن المجموعة.
1 (100%) تشير إلى أن الأليل موجود في جميع نسخ الجين الممكنة في المجموعة.

على سبيل المثال:

تردد 0.5 (50%) يعني أن الأليل موجود في نصف جميع نسخ الجينات.
تردد 0.05 (5%) يشير إلى أليل نادر نسبيًا.
تردد 0.95 (95%) يشير إلى أن الأليل شائع جدًا، ويكاد يصل إلى التثبيت.

توفر الحاسبة أيضًا تمثيلًا بصريًا للتردد لمساعدتك في تفسير النتائج بسرعة.

طرق الحساب والصيغ

حساب تردد الأليل الأساسي

بالنسبة للكائنات الثنائية الصيغة الصبغية (مثل البشر)، الصيغة الأساسية لحساب تردد الأليل هي:

$f = \frac{n_A}{2N}$

حيث:

$f$ هو تردد الأليل A
$n_A$ هو عدد حالات الأليل A
$N$ هو عدد الأفراد في المجموعة
$2N$ هو العدد الإجمالي للأليلات (لأن كل فرد لديه نسختين)

طرق حساب بديلة

هناك عدة طرق لحساب تردد الأليل اعتمادًا على البيانات المتاحة:

1. من عدد النمط الجيني

إذا كنت تعرف عدد الأفراد مع كل نمط جيني، يمكنك الحساب:

$f_A = \frac{2 \times n_{AA} + n_{AB}}{2N}$

حيث:

$f_A$ هو تردد الأليل A
$n_{AA}$ هو عدد الأفراد المتماثلين للأليل A
$n_{AB}$ هو عدد الأفراد المتغايرين (الذين يحملون A وأليل آخر)
$N$ هو العدد الإجمالي للأفراد

2. من ترددات النمط الجيني

إذا كنت تعرف ترددات كل نمط جيني:

$f_A = f_{AA} + \frac{f_{AB}}{2}$

حيث:

$f_A$ هو تردد الأليل A
$f_{AA}$ هو تردد النمط الجيني AA
$f_{AB}$ هو تردد النمط الجيني AB

التعامل مع مستويات الصيغة الصبغية المختلفة

بينما تم تصميم حاسبتنا للكائنات الثنائية الصيغة الصبغية، يمكن توسيع المفهوم ليشمل الكائنات ذات مستويات الصيغة الصبغية المختلفة:

الكائنات أحادية الصيغة الصبغية (نسخة واحدة من كل جين): $f = \frac{n_A}{N}$
الكائنات ثلاثية الصيغة الصبغية (3 نسخ من كل جين): $f = \frac{n_A}{3N}$
الكائنات رباعية الصيغة الصبغية (4 نسخ من كل جين): $f = \frac{n_A}{4N}$

حالات استخدام حسابات تردد الأليل

أبحاث علم الوراثة السكانية

تعد حسابات تردد الأليل أساسية في أبحاث علم الوراثة السكانية لـ:

تتبع التنوع الجيني داخل وبين السكان
- يشير التنوع الجيني العالي (وجود أليلات متعددة بترددات معتدلة) عمومًا إلى صحة أفضل للسكان
- قد يشير التنوع المنخفض إلى اختناقات جينية أو تأثيرات مؤسسية
دراسة العمليات التطورية
- يمكن أن تشير التغيرات في ترددات الأليل بمرور الوقت إلى الانتقاء الطبيعي
- قد تشير الترددات المستقرة إلى الانتقاء المتوازن أو الانجراف الجيني
تحليل تدفق الجينات بين السكان
- قد تشير ترددات الأليل المتشابهة بين السكان إلى تدفق الجينات
- قد تشير الترددات المتميزة إلى العزلة التناسلية
التحقيق في الانجراف الجيني
- تغييرات عشوائية في ترددات الأليل في مجموعات صغيرة
- مهمة بشكل خاص في علم الوراثة الحفظية للأنواع المهددة بالانقراض

تطبيقات علم الوراثة الطبية

تعد بيانات تردد الأليل مهمة في علم الوراثة الطبية لـ:

تقييم مخاطر الأمراض
- ترددات أعلى من الأليلات المرتبطة بالأمراض في مجموعات سكانية معينة
- يساعد في استهداف برامج الفحص للمجموعات عالية المخاطر
علم الوراثة الدوائية
- ترددات الأليلات التي تؤثر على استقلاب الأدوية
- توجه إرشادات الجرعات المحددة للسكان
استشارة وراثية
- توفر تقديرات المخاطر الأساسية للاضطرابات الجينية
- تساعد في تفسير أهمية نتائج الاختبارات الجينية
تخطيط الصحة العامة
- التنبؤ بعبء المرض في السكان
- تخصيص الموارد للاختبار والعلاج الجيني

التطبيقات الزراعية والحفظية

تعد حسابات تردد الأليل قيمة في:

تربية المحاصيل والماشية
- تتبع الصفات المفيدة في مجموعات التربية
- الحفاظ على التنوع الجيني في الأنواع الزراعية
حفظ الأنواع المهددة بالانقراض
- مراقبة الصحة الجينية للمجموعات الصغيرة
- تخطيط برامج التربية لتعظيم التنوع الجيني
إدارة الأنواع الغازية
- فهم التركيب الجيني لمجموعات الأنواع الغازية
- تحديد المجموعات المصدر وطرق الغزو

الإعدادات التعليمية

يعد متتبع التباين الجيني أداة تعليمية ممتازة لـ:

تعليم المبادئ الجينية الأساسية
- توضيح أنماط الوراثة
- توضيح المفاهيم الجينية على مستوى السكان
تمارين مختبرية
- يسمح للطلاب بتحليل بيانات جينية حقيقية أو محاكاة
- يوفر تجربة عملية مع حسابات علم الوراثة السكانية

بدائل لتردد الأليل

بينما يعد تردد الأليل مقياسًا أساسيًا في علم الوراثة السكانية، يمكن أن توفر عدة مقاييس بديلة أو مكملة رؤى إضافية:

تردد النمط الجيني
- يقيس نسبة الأفراد الذين لديهم نمط جيني معين
- مفيد لتقييم توزيع النمط الظاهري مباشرة عند وجود الهيمنة
تغايرية
- يقيس نسبة الأفراد المتغايرين في مجموعة سكانية
- مؤشر على التنوع الجيني والتزاوج الخارجي
مؤشر التثبيت (FST)
- يقيس تمايز السكان بسبب التركيب الجيني
- يتراوح من 0 (لا تمايز) إلى 1 (تمايز كامل)
حجم السكان الفعال (Ne)
- يقدر عدد الأفراد القادرين على التزاوج في مجموعة مثالية
- يساعد في التنبؤ بمعدل الانجراف الجيني وفقدان التنوع الجيني
عدم التوازن في الربط
- يقيس الارتباط غير العشوائي للأليلات في مواضع مختلفة
- مفيد لرسم خرائط الجينات وفهم تاريخ السكان

السياق التاريخي لحساب تردد الأليل

لدى مفهوم تردد الأليل تاريخ غني في مجال علم الوراثة وكان أساسيًا في فهمنا للوراثة والتطور.

التطورات المبكرة

تم وضع الأساس لفهم تردد الأليل في أوائل القرن العشرين:

1908: اشتق G.H. Hardy و Wilhelm Weinberg بشكل مستقل ما أصبح يعرف بمبدأ هاردي-واينبرغ، الذي يصف العلاقة بين ترددات الأليل والنمط الجيني في مجموعة غير متطورة.
1918: نشر R.A. Fisher ورقته الرائدة حول "الارتباط بين الأقارب على فرضية الوراثة المندلية"، مما ساعد في إنشاء مجال علم الوراثة السكانية من خلال التوفيق بين الوراثة المندلية والتنوع المستمر.
1930s: طور Sewall Wright و R.A. Fisher و J.B.S. Haldane الأساس الرياضي لعلم الوراثة السكانية، بما في ذلك نماذج لكيفية تغير ترددات الأليل بمرور الوقت بسبب الانتقاء، والطفرات، والهجرة، والانجراف الجيني.

التطورات الحديثة

تطورت دراسة تردد الأليل بشكل كبير مع التقدم التكنولوجي:

1950s-1960s: سمحت اكتشافات تعدد الأشكال البروتينية بقياس مباشر للتنوع الجيني على المستوى الجزيئي.
1970s-1980s: مكنت تطوير تحليل طول شريحة التقييد (RFLP) من دراسة أكثر تفصيلاً للتنوع الجيني.
1990s-2000s: ثورة مشروع الجينوم البشري والتقدم اللاحق في تكنولوجيا تسلسل الحمض النووي في قدرتنا على قياس تردد الأليل عبر الجينومات بأكملها.
2010s-الحاضر: أنشأت مشاريع الجينوم الكبيرة مثل مشروع 1000 جينوم و دراسات الارتباط الجينومي على مستوى الجينوم (GWAS) كتالوجات شاملة للتنوع الجيني البشري وتردد الأليل عبر مجموعات سكانية متنوعة.

اليوم، تظل حسابات تردد الأليل مركزية في العديد من المجالات، من علم الأحياء التطوري إلى الطب الشخصي، وتستفيد من أدوات حسابية وأساليب إحصائية متزايدة التعقيد.

أمثلة على التعليمات البرمجية لحساب تردد الأليل

Excel

1' صيغة Excel لحساب تردد الأليل
2' ضعها في الخلية مع عدد حالات الأليل في A1 وعدد الأفراد في B1
3=A1/(B1*2)
4
5' دالة VBA في Excel لحساب تردد الأليل
6Function AlleleFrequency(instances As Integer, individuals As Integer) As Double
7    ' تحقق من صحة المدخلات
8    If individuals <= 0 Then
9        AlleleFrequency = CVErr(xlErrValue)
10        Exit Function
11    End If
12    
13    If instances < 0 Or instances > individuals * 2 Then
14        AlleleFrequency = CVErr(xlErrValue)
15        Exit Function
16    End If
17    
18    ' حساب التردد
19    AlleleFrequency = instances / (individuals * 2)
20End Function
21

Python

1def calculate_allele_frequency(instances, individuals):
2    """
3    حساب تردد أليل معين في مجموعة سكانية.
4    
5    المعلمات:
6    instances (int): عدد حالات الأليل المحدد
7    individuals (int): العدد الإجمالي للأفراد في المجموعة
8    
9    العائدات:
10    float: تردد الأليل كقيمة بين 0 و 1
11    """
12    # تحقق من صحة المدخلات
13    if individuals <= 0:
14        raise ValueError("يجب أن يكون عدد الأفراد موجبًا")
15    
16    if instances < 0:
17        raise ValueError("لا يمكن أن يكون عدد الحالات سالبًا")
18    
19    if instances > individuals * 2:
20        raise ValueError("لا يمكن أن يتجاوز عدد الحالات ضعف عدد الأفراد")
21    
22    # حساب التردد
23    return instances / (individuals * 2)
24
25# مثال على الاستخدام
26try:
27    allele_instances = 50
28    population_size = 100
29    frequency = calculate_allele_frequency(allele_instances, population_size)
30    print(f"تردد الأليل: {frequency:.4f} ({frequency*100:.1f}%)")
31except ValueError as e:
32    print(f"خطأ: {e}")
33

R

1calculate_allele_frequency <- function(instances, individuals) {
2  # تحقق من صحة المدخلات
3  if (individuals <= 0) {
4    stop("يجب أن يكون عدد الأفراد موجبًا")
5  }
6  
7  if (instances < 0) {
8    stop("لا يمكن أن يكون عدد الحالات سالبًا")
9  }
10  
11  if (instances > individuals * 2) {
12    stop("لا يمكن أن يتجاوز عدد الحالات ضعف عدد الأفراد")
13  }
14  
15  # حساب التردد
16  instances / (individuals * 2)
17}
18
19# مثال على الاستخدام
20allele_instances <- 50
21population_size <- 100
22frequency <- calculate_allele_frequency(allele_instances, population_size)
23cat(sprintf("تردد الأليل: %.4f (%.1f%%)\n", frequency, frequency*100))
24
25# رسم النتيجة
26library(ggplot2)
27data <- data.frame(
28  Allele = c("الأليل المستهدف", "أليلات أخرى"),
29  Frequency = c(frequency, 1-frequency)
30)
31ggplot(data, aes(x = Allele, y = Frequency, fill = Allele)) +
32  geom_bar(stat = "identity") +
33  scale_fill_manual(values = c("الأليل المستهدف" = "#4F46E5", "أليلات أخرى" = "#D1D5DB")) +
34  labs(title = "توزيع تردد الأليل",
35       y = "التردد",
36       x = NULL) +
37  theme_minimal() +
38  scale_y_continuous(labels = scales::percent)
39

JavaScript

1/**
2 * حساب تردد أليل معين في مجموعة سكانية.
3 * 
4 * @param {number} instances - عدد حالات الأليل المحدد
5 * @param {number} individuals - العدد الإجمالي للأفراد في المجموعة
6 * @returns {number} تردد الأليل كقيمة بين 0 و 1
7 * @throws {Error} إذا كانت المدخلات غير صالحة
8 */
9function calculateAlleleFrequency(instances, individuals) {
10  // تحقق من صحة المدخلات
11  if (individuals <= 0) {
12    throw new Error("يجب أن يكون عدد الأفراد موجبًا");
13  }
14  
15  if (instances < 0) {
16    throw new Error("لا يمكن أن يكون عدد الحالات سالبًا");
17  }
18  
19  if (instances > individuals * 2) {
20    throw new Error("لا يمكن أن يتجاوز عدد الحالات ضعف عدد الأفراد");
21  }
22  
23  // حساب التردد
24  return instances / (individuals * 2);
25}
26
27// مثال على الاستخدام
28try {
29  const alleleInstances = 50;
30  const populationSize = 100;
31  const frequency = calculateAlleleFrequency(alleleInstances, populationSize);
32  console.log(`تردد الأليل: ${frequency.toFixed(4)} (${(frequency*100).toFixed(1)}%)`);
33} catch (error) {
34  console.error(`خطأ: ${error.message}`);
35}
36

Java

1public class AlleleFrequencyCalculator {
2    /**
3     * حساب تردد أليل معين في مجموعة سكانية.
4     * 
5     * @param instances عدد حالات الأليل المحدد
6     * @param individuals العدد الإجمالي للأفراد في المجموعة
7     * @return تردد الأليل كقيمة بين 0 و 1
8     * @throws IllegalArgumentException إذا كانت المدخلات غير صالحة
9     */
10    public static double calculateAlleleFrequency(int instances, int individuals) {
11        // تحقق من صحة المدخلات
12        if (individuals <= 0) {
13            throw new IllegalArgumentException("يجب أن يكون عدد الأفراد موجبًا");
14        }
15        
16        if (instances < 0) {
17            throw new IllegalArgumentException("لا يمكن أن يكون عدد الحالات سالبًا");
18        }
19        
20        if (instances > individuals * 2) {
21            throw new IllegalArgumentException("لا يمكن أن يتجاوز عدد الحالات ضعف عدد الأفراد");
22        }
23        
24        // حساب التردد
25        return (double) instances / (individuals * 2);
26    }
27    
28    public static void main(String[] args) {
29        try {
30            int alleleInstances = 50;
31            int populationSize = 100;
32            double frequency = calculateAlleleFrequency(alleleInstances, populationSize);
33            System.out.printf("تردد الأليل: %.4f (%.1f%%)\n", frequency, frequency*100);
34        } catch (IllegalArgumentException e) {
35            System.err.println("خطأ: " + e.getMessage());
36        }
37    }
38}
39

الأسئلة الشائعة

ما هو الأليل؟

الأليل هو شكل متغير من الجين. تنتج الأليلات المختلفة تنوعًا في الخصائص الموروثة مثل لون الشعر أو فصيلة الدم. عادةً ما يرث كل شخص نسختين من كل جين، واحدة من كل والد. إذا كانت النسختان متطابقتين، فإن الفرد يكون متماثلًا للأليل لذلك الجين. إذا كانت الأليلات مختلفة، فإن الفرد يكون متغايرًا.

لماذا يعد حساب تردد الأليل مهمًا؟

يعد حساب تردد الأليل مهمًا لأنه يساعد العلماء على فهم التنوع الجيني داخل السكان، وتتبع التغيرات في التركيب الجيني بمرور الوقت، وتحديد المخاطر المحتملة للأمراض، ودراسة العمليات التطورية. يوفر مقياسًا كميًا لمدى شيوع أو ندرة أشكال الجينات المحددة في مجموعة سكانية.

كيف يؤثر حجم العينة على حسابات تردد الأليل؟

يؤثر حجم العينة بشكل كبير على دقة تقديرات تردد الأليل. توفر العينات الكبيرة عمومًا تقديرات أكثر دقة مع فترات ثقة أضيق. قد لا تمثل العينات الصغيرة بدقة التردد الحقيقي للسكان، خاصة بالنسبة للأليلات النادرة. كقاعدة عامة، يُفضل استخدام أحجام عينات أكبر (عادةً >100 فرد) للحصول على تقديرات موثوقة لتردد الأليل.

هل يمكن أن تتغير ترددات الأليل بمرور الوقت؟

نعم، يمكن أن تتغير ترددات الأليل بمرور الوقت بسبب عدة قوى تطورية:

الانتقاء الطبيعي: قد تزداد الأليلات المفيدة في التردد
الانجراف الجيني: تغييرات عشوائية في التردد، خاصة في السكان الصغار
الهجرة: حركة الأفراد بين السكان يمكن أن تقدم أليلات جديدة
الطفرة: إدخال أليلات جديدة
التزاوج غير العشوائي: يمكن أن يغير ترددات النمط الجيني، مما يؤثر بشكل غير مباشر على تردد الأليل

كيف أحسب تردد الأليل إذا كنت أعرف فقط ترددات النمط الجيني؟

إذا كنت تعرف ترددات الأنماط الجينية (مثل AA و Aa و aa)، يمكنك حساب تردد الأليل A على النحو التالي: $f(A) = f(AA) + \frac{f(Aa)}{2}$ حيث $f(AA)$ هو تردد النمط الجيني AA و $f(Aa)$ هو تردد النمط الجيني المتغاير.

ما هو توازن هاردي-واينبرغ وكيف يرتبط بتردد الأليل؟

يصف توازن هاردي-واينبرغ العلاقة بين ترددات الأليل والنمط الجيني في مجموعة غير متطورة. بموجب هذا المبدأ، إذا كان p هو تردد الأليل A و q هو تردد الأليل a (حيث p + q = 1)، فإن الترددات المتوقعة للأنماط الجينية هي:

AA: p²
Aa: 2pq
aa: q²

قد تشير الانحرافات عن هذه الترددات المتوقعة إلى وجود قوى تطورية تعمل في المجموعة.

كيف أتعامل مع الجينات المرتبطة بـ X عند حساب تردد الأليل؟

بالنسبة للجينات المرتبطة بـ X، فإن الذكور لديهم نسخة واحدة فقط بينما الإناث لديهن نسختان. لحساب تردد الأليل:

احسب جميع حالات الأليل (تساهم الإناث بنسختين، بينما يساهم الذكور بنسخة واحدة)
قسم على العدد الإجمالي لكروموسومات X في المجموعة (2 × عدد الإناث + عدد الذكور)

هل يمكن استخدام تردد الأليل للتنبؤ بمخاطر الأمراض؟

يمكن أن تساعد بيانات تردد الأليل في تقدير انتشار الاضطرابات الجينية في مجموعة سكانية. ومع ذلك، يتطلب التنبؤ بمخاطر الأمراض الفردية معلومات إضافية حول نفاذية الجين (احتمالية أن يصاب الشخص بالمرض) والتعبير (التنوع في أعراض المرض بين الأفراد الذين لديهم نفس النمط الجيني).

ما الفرق بين تردد الأليل وتردد النمط الجيني؟

يشير تردد الأليل إلى نسبة أليل معين بين جميع الأليلات في ذلك الموضع الجيني في مجموعة سكانية. بينما يشير تردد النمط الجيني إلى نسبة الأفراد الذين لديهم نمط جيني معين. على سبيل المثال، في مجموعة سكانية تحتوي على أنماط جينية AA و Aa و aa، يتم حساب تردد الأليل A من جميع أليلات A، بينما يتم حساب تردد النمط الجيني AA ببساطة كنسبة الأفراد الذين لديهم ذلك النمط الجيني المحدد.

كيف أحسب فترات الثقة لتقديرات تردد الأليل؟

للعينات الكبيرة، يمكنك تقريب فترة الثقة 95% لتردد الأليل (p) باستخدام: $p \pm 1.96 \times \sqrt{\frac{p(1-p)}{2N}}$ حيث N هو عدد الأفراد الذين تم أخذ عينات منهم. بالنسبة للعينات الصغيرة أو الترددات العالية/المنخفضة جدًا، قد تكون الطرق الأكثر تعقيدًا مثل فترة الثقة وفقًا لـ Wilson أكثر ملاءمة.

المراجع

Hartl, D. L., & Clark, A. G. (2007). مبادئ علم الوراثة السكانية (الإصدار 4). Sinauer Associates.
Hamilton, M. B. (2021). علم الوراثة السكانية (الإصدار 2). Wiley-Blackwell.
Nielsen, R., & Slatkin, M. (2013). مقدمة في علم الوراثة السكانية: النظرية والتطبيقات. Sinauer Associates.
Hedrick, P. W. (2011). علم الوراثة للسكان (الإصدار 4). Jones & Bartlett Learning.
Templeton, A. R. (2006). علم الوراثة السكانية والنظرية الميكروإيفولوشنية. Wiley-Liss.
The 1000 Genomes Project Consortium. (2015). مرجع عالمي للتنوع الجيني البشري. Nature, 526(7571), 68-74. https://doi.org/10.1038/nature15393
قاعدة بيانات تردد الأليل. http://www.allelefrequencies.net/
متصفح جينوم Ensembl. https://www.ensembl.org/
المعهد الوطني لبحوث الجينوم البشري. https://www.genome.gov/
الوراثة المندلية في الإنسان (OMIM). https://www.omim.org/

جرب متتبع التباين الجيني لدينا اليوم!

لم يكن فهم التركيب الجيني للسكان أسهل من قبل. توفر حاسبة تردد الأليل لدينا وسيلة بسيطة ولكن قوية لقياس التباين الجيني في مجموعة دراستك. سواء كنت طالبًا أو باحثًا أو محترفًا في الرعاية الصحية، ستساعدك هذه الأداة في الحصول على رؤى قيمة حول علم الوراثة السكانية.

ابدأ في حساب ترددات الأليل الآن واكتشف المشهد الجيني لمجموعتك السكانية!

💬

משוב

💬

לחץ על הפיצוץ משוב כדי להתחיל לתת משוב על כלי זה

🔗

כלים קשורים

גלה עוד כלים שעשויים להיות שימושיים עבור זרימת העבודה שלך

מנ Tracker של שונות גנטית: חשב את תדירות האללים באוכלוסיות

מ tracker של שונות גנטית

נתוני קלט

תוצאות

נוסחת חישוב

המחשה של תדירות האלל

Population Representation

תיעוד

متتبع التباين الجيني: حاسبة تردد الأليل

المقدمة

ما هو تردد الأليل؟

كيفية استخدام متتبع التباين الجيني

التحقق من صحة الإدخال

فهم النتائج

طرق الحساب والصيغ

حساب تردد الأليل الأساسي

طرق حساب بديلة

1. من عدد النمط الجيني

2. من ترددات النمط الجيني

التعامل مع مستويات الصيغة الصبغية المختلفة

حالات استخدام حسابات تردد الأليل

أبحاث علم الوراثة السكانية

تطبيقات علم الوراثة الطبية

التطبيقات الزراعية والحفظية

الإعدادات التعليمية

بدائل لتردد الأليل

السياق التاريخي لحساب تردد الأليل

التطورات المبكرة

التطورات الحديثة

أمثلة على التعليمات البرمجية لحساب تردد الأليل

Excel

Python

R

JavaScript

Java

الأسئلة الشائعة

ما هو الأليل؟

لماذا يعد حساب تردد الأليل مهمًا؟

كيف يؤثر حجم العينة على حسابات تردد الأليل؟

هل يمكن أن تتغير ترددات الأليل بمرور الوقت؟

كيف أحسب تردد الأليل إذا كنت أعرف فقط ترددات النمط الجيني؟

ما هو توازن هاردي-واينبرغ وكيف يرتبط بتردد الأليل؟

كيف أتعامل مع الجينات المرتبطة بـ X عند حساب تردد الأليل؟

هل يمكن استخدام تردد الأليل للتنبؤ بمخاطر الأمراض؟

ما الفرق بين تردد الأليل وتردد النمط الجيني؟

كيف أحسب فترات الثقة لتقديرات تردد الأليل؟

المراجع

جرب متتبع التباين الجيني لدينا اليوم!

משוב

כלים קשורים

מחשבון התפלגות גמא - ניתוח סטטיסטי וויזואליזציה

כלי לניתוח והמחשה של תדירות תווים

מחשבון טמפרטורת חיבור DNA לעיצוב פרימרים ב-PCR

מחשב ריכוז DNA: המרת A260 ל-ng/μL

יוצר מיקום אקראי: יוצר קואורדינטות גלובליות

מחשב הסתברויות הפצה בינומית - כלי לסטטיסטיקה

מחשבון סיקס סיגמה: מדוד את איכות התהליך שלך

קטלוג דיגיטלי לדפוסי פרווה של חתולים: קטלוג דיגיטלי למעילי חתולים

מחשבון זמן הכפלת תאים: מדוד את קצב הגדילה של תאים