蛋白质浓度计算器:将吸光度转换为mg/mL

使用比尔-朗伯定律根据分光光度计的吸光度读数计算蛋白质浓度。支持BSA、IgG和可调参数的自定义蛋白质。

蛋白质浓度计算器

输入参数

cm
mL

结果

浓度 = 吸光度 / (消光系数 × 光程) × 稀释因子 = 0.50 / (0.667 × 1.0) × 1

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文档

蛋白质浓度计算器

介绍

蛋白质浓度计算器是生物化学家、分子生物学家和生命科学研究人员必不可少的工具,他们需要准确确定样本中的蛋白质浓度。利用紫外-可见光谱法和比尔-朗伯定律的原理,该计算器将分光光度计的吸光度读数转换为精确的蛋白质浓度值。无论您是在进行蛋白质纯化、准备电泳样本还是进行酶促测定,了解确切的蛋白质浓度对于实验成功和可重复性至关重要。

该计算器允许您根据280 nm(A280)的吸光度读数或从比色测定中快速确定蛋白质浓度,同时考虑路径长度、稀释因子和蛋白质标准的特定消光系数等因素。该工具提供以mg/mL和μg/mL为单位的结果,并根据您的溶液体积提供总蛋白质量。

比尔-朗伯定律:蛋白质浓度计算的基础

比尔-朗伯定律构成了从分光光度测量中确定蛋白质浓度的数学基础。这个光谱学中的基本原理表明,溶液对光的吸收与吸收物质的浓度和光在溶液中传播的路径长度成正比。

比尔-朗伯方程表示为:

A=ε×c×lA = \varepsilon \times c \times l

其中:

  • AA 是吸光度(无量纲)
  • ε\varepsilon 是摩尔消光系数(L mol⁻¹ cm⁻¹)或特定消光系数(L g⁻¹ cm⁻¹)
  • cc 是吸收物质的浓度(mol L⁻¹ 或 g L⁻¹)
  • ll 是样本的路径长度(cm)

重新排列该方程以求解浓度:

c=Aε×lc = \frac{A}{\varepsilon \times l}

对于稀释因子的蛋白质溶液,该方程变为:

c=Aε×l×稀释因子c = \frac{A}{\varepsilon \times l} \times \text{稀释因子}

然后可以通过将浓度乘以总容积来计算总蛋白质量:

总蛋白质=c×V\text{总蛋白质} = c \times V

其中:

  • VV 是蛋白质溶液的体积(mL)

常见蛋白质标准的消光系数

消光系数(ε)是衡量物质在特定波长下吸收光的强度。对于蛋白质,该值取决于氨基酸组成,特别是芳香族氨基酸(色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸)在280 nm下的强吸收。

以下是常见蛋白质标准在280 nm下的特定消光系数:

蛋白质标准消光系数 (L g⁻¹ cm⁻¹)
BSA(牛血清白蛋白)0.667
IgG(免疫球蛋白G)1.37
溶菌酶2.64
鸡蛋白0.7

对于自定义蛋白质,您可以选择:

  1. 使用根据氨基酸序列计算的理论消光系数
  2. 通过与已知标准的比较实验确定消光系数
  3. 如果未知确切值,则使用1.0 L g⁻¹ cm⁻¹的一般近似值

使用蛋白质浓度计算器的逐步指南

按照以下步骤准确确定样本中的蛋白质浓度:

  1. 从下拉菜单中选择您的蛋白质标准(BSA、IgG、溶菌酶、鸡蛋白或自定义)

    • 如果使用自定义蛋白质,请输入特定消光系数
  2. 输入从分光光度计测得的吸光度值(A280)

    • 确保您的分光光度计已用适当的缓冲液正确校准
    • 为获得准确结果,吸光度值应理想在0.1到1.0之间
  3. 指定您的比色皿或微孔板孔的路径长度(通常标准比色皿为1 cm)

    • 对于微孔板读数,可能为0.5 cm或更小,具体取决于孔的体积
  4. 输入稀释因子,如果您的样本在测量前被稀释

    • 例如,如果您将1份样本稀释为9份缓冲液(1:10稀释),则输入10作为稀释因子
  5. 输入您的蛋白质溶液的总容积(以mL为单位)

  6. 查看结果

    • 蛋白质浓度(mg/mL)
    • 蛋白质浓度(μg/mL)
    • 总蛋白质量(mg)
  7. 检查标准曲线,以可视化您的测量与吸光度与浓度之间的理论关系的比较

实际示例

示例1:直接A280测量的BSA标准

输入值:

  • 蛋白质标准:BSA(消光系数 = 0.667 L g⁻¹ cm⁻¹)
  • 吸光度(A280):0.8
  • 路径长度:1.0 cm
  • 稀释因子:1(未稀释)
  • 体积:2.0 mL

计算: c=0.80.667×1.0×1=1.199 mg/mLc = \frac{0.8}{0.667 \times 1.0} \times 1 = 1.199 \text{ mg/mL} 总蛋白质=1.199 mg/mL×2.0 mL=2.398 mg\text{总蛋白质} = 1.199 \text{ mg/mL} \times 2.0 \text{ mL} = 2.398 \text{ mg}

结果:

  • 蛋白质浓度:1.199 mg/mL(1199 μg/mL)
  • 总蛋白质量:2.398 mg

示例2:稀释的IgG样本

输入值:

  • 蛋白质标准:IgG(消光系数 = 1.37 L g⁻¹ cm⁻¹)
  • 吸光度(A280):1.5
  • 路径长度:1.0 cm
  • 稀释因子:5(1:5稀释)
  • 体积:10.0 mL

计算: c=1.51.37×1.0×5=5.474 mg/mLc = \frac{1.5}{1.37 \times 1.0} \times 5 = 5.474 \text{ mg/mL} 总蛋白质=5.474 mg/mL×10.0 mL=54.74 mg\text{总蛋白质} = 5.474 \text{ mg/mL} \times 10.0 \text{ mL} = 54.74 \text{ mg}

结果:

  • 蛋白质浓度:5.474 mg/mL(5474 μg/mL)
  • 总蛋白质量:54.74 mg

示例3:具有非标准路径长度的自定义蛋白质

输入值:

  • 蛋白质标准:自定义(消光系数 = 2.1 L g⁻¹ cm⁻¹)
  • 吸光度(A280):0.42
  • 路径长度:0.5 cm(微孔板读数)
  • 稀释因子:2(1:2稀释)
  • 体积:0.2 mL

计算: c=0.422.1×0.5×2=0.8 mg/mLc = \frac{0.42}{2.1 \times 0.5} \times 2 = 0.8 \text{ mg/mL} 总蛋白质=0.8 mg/mL×0.2 mL=0.16 mg\text{总蛋白质} = 0.8 \text{ mg/mL} \times 0.2 \text{ mL} = 0.16 \text{ mg}

结果:

  • 蛋白质浓度:0.8 mg/mL(800 μg/mL)
  • 总蛋白质量:0.16 mg

蛋白质浓度测定的替代方法

虽然使用比尔-朗伯定律的A280方法简单且不具破坏性,但还有几种替代方法可以用于确定蛋白质浓度:

布拉德福德测定

布拉德福德测定是一种基于蛋白质与考马斯亮蓝G-250染料结合的比色法。当染料与蛋白质结合时,其吸收峰从465 nm转移到595 nm。

优点:

  • 高灵敏度(1-20 μg/mL范围)
  • 快速简单的程序
  • 对非蛋白成分的干扰较少

缺点:

  • 非线性响应
  • 不同蛋白质之间响应的变化
  • 清洁剂的干扰

BCA(双吡啶醇酸)测定

BCA测定结合了蛋白质在碱性介质中将Cu²⁺还原为Cu⁺的反应,以及使用双吡啶醇酸对Cu⁺进行比色检测。

优点:

  • 与许多清洁剂兼容
  • 在广泛范围内线性响应(20-2000 μg/mL)
  • 不同蛋白质之间的响应更均匀

缺点:

  • 还原剂和螯合剂的干扰
  • 温度敏感反应
  • 需要更长的孵育时间

洛瑞测定

洛瑞测定结合了生物碱反应(蛋白质-铜复合物在碱性溶液中)与福林-西欧克雷特试剂的还原。

优点:

  • 高灵敏度
  • 广泛使用和接受的方法
  • 相对稳定的颜色发展

缺点:

  • 多步骤和较长的程序
  • 许多化合物的干扰
  • 狭窄的线性范围

常见问题排查

吸光度值过高(>1.5)

问题: 吸光度值超过1.5,可能超出了比尔-朗伯定律的线性范围。

解决方案:

  • 稀释样本并重新测量
  • 使用更短路径长度的比色皿
  • 考虑对高浓度样本使用不同的方法

吸光度值为负或非常低

问题: 负值或非常低的读数可能表示仪器错误或样本非常稀薄。

解决方案:

  • 检查您的分光光度计是否正确校准
  • 确保您的样本没有过于稀薄
  • 考虑使用更灵敏的方法(例如布拉德福德测定)
  • 检查比色皿中是否有气泡

不一致的读数

问题: 重复测量之间的变化。

解决方案:

  • 在测量前充分混合样本
  • 检查溶液中是否有颗粒或聚集物
  • 确保在测量过程中温度一致
  • 在测量之间正确清洁比色皿

干扰物质

问题: 一些缓冲液成分或添加剂可能会干扰吸光度读数。

解决方案:

  • 使用与样本相同的缓冲液进行校准
  • 考虑透析或缓冲液交换以去除干扰物质
  • 使用对特定干扰物质不太敏感的替代方法

常见问题解答

测量蛋白质浓度的最佳波长是什么?

对于直接吸光度测量,通常使用280 nm,因为芳香族氨基酸(特别是色氨酸和酪氨酸)在这个波长下吸收强烈。对于比色测定,最佳波长取决于特定方法:布拉德福德测定(595 nm)、BCA测定(562 nm)和洛瑞测定(750 nm)。

为什么我的蛋白质浓度读数为零或负值?

负值或零读数可能发生在以下情况下:

  • 您的分光光度计没有正确校准
  • 蛋白质浓度低于检测限
  • 样本中含有干扰测量的物质
  • 比色皿放置不正确或有划痕

A280方法的蛋白质浓度准确性如何?

A280方法通常在使用正确的消光系数的情况下准确到5-10%。当蛋白质中芳香族氨基酸较少或存在核酸(在260 nm处吸收)时,准确性会降低。

如果我的样本中含有核酸,我可以测量蛋白质浓度吗?

可以,但核酸在260 nm处强烈吸收,可能会干扰在280 nm处的蛋白质测量。您可以使用沃堡-克里斯蒂安方法来校正核酸污染:

蛋白质浓度(mg/mL)=1.55×A2800.76×A260\text{蛋白质浓度(mg/mL)} = 1.55 \times A_{280} - 0.76 \times A_{260}

如何确定我的蛋白质的消光系数?

您可以:

  1. 使用像ProtParam(ExPASy)这样的工具根据氨基酸组成计算
  2. 通过测量已知浓度的吸光度实验确定
  3. 如果蛋白质已被先前表征,则使用已发布的值

我应该为我的蛋白质样本使用什么稀释因子?

目标是使吸光度读数在0.1到1.0之间,以获得最准确的结果。如果您的读数较高,请相应稀释样本。例如,如果您的初始读数为2.5,则1:5稀释(稀释因子为5)应将其带入最佳范围。

温度如何影响蛋白质浓度测量?

温度可能会稍微影响吸光度读数,但对于大多数应用,其影响最小。然而,对于像BCA方法这样的比色测定,控制温度在孵育期间对准确结果至关重要。

我可以将这种计算器用于肽或小蛋白质吗?

可以,但小肽可能在280 nm处的吸光度非常低或没有芳香族氨基酸。对于这种情况,布拉德福德测定或BCA测定等替代方法可能更合适。

如何在不同浓度单位之间转换?

  • 1 mg/mL = 1000 μg/mL
  • 要从mg/mL转换为摩尔浓度(M),使用:摩尔浓度 (M)=浓度 (mg/mL)分子量 (g/mol)×1000\text{摩尔浓度 (M)} = \frac{\text{浓度 (mg/mL)}}{\text{分子量 (g/mol)}} \times 1000

使用A280可以准确测量的最低蛋白质浓度是多少?

使用标准分光光度计和1 cm路径长度的比色皿,最低限度通常在0.05-0.1 mg/mL之间。对于更稀的样本,请考虑使用灵敏度更高的替代方法或专用设备,如纳米滴分光光度计。

蛋白质定量方法的历史与发展

准确测量蛋白质浓度的能力在一个多世纪以来一直是生物化学研究的基础。蛋白质定量方法的发展反映了我们对蛋白质化学理解的进步和技术发展的演变。

早期方法(1900年代-1940年代)

最早的蛋白质定量方法依赖于凯氏定氮法(1883),该方法测量总氮含量。虽然准确,但该方法耗时且不特异于蛋白质。

生物碱法在20世纪初被提出,是第一种专门针对蛋白质的比色测定方法。它依赖于肽键与碱性溶液中铜离子的反应,产生紫色。

中世纪发展(1950年代-1970年代)

1951年,奥利弗·洛瑞引入了将成为科学文献中引用最多的论文之一,描述了一种改进的比色法,将生物碱反应与福林-西欧克雷特试剂结合。洛瑞方法提供了比以前技术显著提高的灵敏度。

1970年代,马里昂·布拉德福德介绍了布拉德福德测定,利用考马斯亮蓝G-250染料。该方法在速度和简单性上优于洛瑞方法。

现代时代(1980年代至今)

BCA(双吡啶醇酸)测定在1980年代开发,提供了更好的与清洁剂的兼容性,并且不同蛋白质之间的响应更加均匀。

随着分光光度技术的进步,直接在280 nm处进行紫外吸光度测量越来越受欢迎,因为其简单且不具破坏性。2000年代微量分光光度计(如NanoDrop)的发展通过使测量仅需1-2 μL样本彻底改变了蛋白质定量。

今天,研究人员可以使用各种方法,每种方法都有特定的优点,适用于特定应用,从传统的比色法到基于荧光的技术以及与蛋白质组学工作流集成的自动化系统。

参考文献

  1. Stoscheck, C.M. (1990). Quantitation of Protein. Methods in Enzymology, 182, 50-68. https://doi.org/10.1016/0076-6879(90)82008-P

  2. Noble, J.E., & Bailey, M.J. (2009). Quantitation of Protein. Methods in Enzymology, 463, 73-95. https://doi.org/10.1016/S0076-6879(09)63008-1

  3. Pace, C.N., Vajdos, F., Fee, L., Grimsley, G., & Gray, T. (1995). How to measure and predict the molar absorption coefficient of a protein. Protein Science, 4(11), 2411-2423. https://doi.org/10.1002/pro.5560041120

  4. Gasteiger E., Hoogland C., Gattiker A., Duvaud S., Wilkins M.R., Appel R.D., Bairoch A. (2005). Protein Identification and Analysis Tools on the ExPASy Server. In: Walker J.M. (eds) The Proteomics Protocols Handbook. Humana Press.

  5. Bradford, M.M. (1976). A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Analytical Biochemistry, 72(1-2), 248-254. https://doi.org/10.1016/0003-2697(76)90527-3

  6. Smith, P.K., Krohn, R.I., Hermanson, G.T., Mallia, A.K., Gartner, F.H., Provenzano, M.D., Fujimoto, E.K., Goeke, N.M., Olson, B.J., & Klenk, D.C. (1985). Measurement of protein using bicinchoninic acid. Analytical Biochemistry, 150(1), 76-85. https://doi.org/10.1016/0003-2697(85)90442-7

  7. Lowry, O.H., Rosebrough, N.J., Farr, A.L., & Randall, R.J. (1951). Protein measurement with the Folin phenol reagent. Journal of Biological Chemistry, 193(1), 265-275.

准备好计算您的蛋白质浓度了吗?在我们上面的计算器中输入您的吸光度读数和其他参数,以立即获得准确的结果。如果您对蛋白质定量有任何疑问或需要帮助解释结果,请查看常见问题解答部分或联系我们的支持团队。