Calculadora de Peso Molecular de Proteínas para Secuencias de Aminoácidos
Calcula el peso molecular de las proteínas basado en secuencias de aminoácidos. Ingresa tu secuencia de proteína utilizando los códigos estándar de una letra para obtener un peso molecular preciso en Daltons.
Estimador de Peso Molecular de Proteínas
Calcula el peso molecular de una proteína basado en su secuencia de aminoácidos.
Usa códigos estándar de aminoácidos de una letra (A, R, N, D, C, etc.)
Acerca de Este Calculador
Este calculador estima el peso molecular de una proteína basado en su secuencia de aminoácidos.
El cálculo tiene en cuenta los pesos moleculares estándar de los aminoácidos y la pérdida de agua durante la formación de enlaces peptídicos.
Para obtener resultados precisos, asegúrate de ingresar una secuencia de aminoácidos válida utilizando códigos estándar de una letra.
Documentación
Calculadora de Peso Molecular de Proteínas
Introducción
La calculadora de peso molecular de proteínas es una herramienta esencial para bioquímicos, biólogos moleculares y científicos de proteínas que necesitan determinar la masa de las proteínas en función de sus secuencias de aminoácidos. Las proteínas son macromoléculas complejas compuestas por cadenas de aminoácidos, y conocer su peso molecular es crucial para diversas técnicas de laboratorio, diseño experimental y análisis de datos. Esta calculadora proporciona una forma rápida y precisa de estimar el peso molecular de cualquier proteína utilizando su secuencia de aminoácidos, ahorrando tiempo valioso a los investigadores y reduciendo el potencial de errores de cálculo.
El peso molecular de las proteínas, a menudo expresado en Daltons (Da) o kilodaltons (kDa), representa la suma de los pesos individuales de todos los aminoácidos en la proteína, teniendo en cuenta las moléculas de agua perdidas durante la formación de enlaces peptídicos. Esta propiedad fundamental influye en el comportamiento de la proteína en solución, la movilidad en electroforesis, las propiedades de cristalización y muchas otras características físicas y químicas que son importantes en aplicaciones de investigación e industriales.
Nuestra calculadora fácil de usar requiere solo la secuencia de aminoácidos en notación de una letra de su proteína para generar estimaciones precisas del peso molecular, lo que la hace accesible tanto para investigadores experimentados como para estudiantes nuevos en la ciencia de proteínas.
Cómo se Calcula el Peso Molecular de las Proteínas
La Fórmula Básica
El peso molecular de una proteína se calcula utilizando la siguiente fórmula:
Donde:
- es el peso molecular de la proteína entera en Daltons (Da)
- es la suma de los pesos moleculares de todos los aminoácidos individuales
- es el número de aminoácidos en la secuencia
- es el peso molecular del agua (18.01528 Da)
- representa el número de enlaces peptídicos formados
- El último término tiene en cuenta los grupos terminales (H y OH)
Pesos Moleculares de Aminoácidos
El cálculo utiliza los pesos moleculares estándar de los 20 aminoácidos comunes:
Aminoácido | Código de una letra | Peso Molecular (Da) |
---|---|---|
Alanina | A | 71.03711 |
Arginina | R | 156.10111 |
Asparagina | N | 114.04293 |
Ácido aspártico | D | 115.02694 |
Cisteína | C | 103.00919 |
Ácido glutámico | E | 129.04259 |
Glutamina | Q | 128.05858 |
Glicina | G | 57.02146 |
Histidina | H | 137.05891 |
Isoleucina | I | 113.08406 |
Leucina | L | 113.08406 |
Lisina | K | 128.09496 |
Metionina | M | 131.04049 |
Fenilalanina | F | 147.06841 |
Prolina | P | 97.05276 |
Serina | S | 87.03203 |
Treonina | T | 101.04768 |
Triptófano | W | 186.07931 |
Tirosina | Y | 163.06333 |
Valina | V | 99.06841 |
Pérdida de Agua en la Formación de Enlaces Peptídicos
Cuando los aminoácidos se unen para formar una proteína, crean enlaces peptídicos. Durante este proceso, se libera una molécula de agua (H₂O) por cada enlace formado. Esta pérdida de agua debe tenerse en cuenta en el cálculo del peso molecular.
Para una proteína con n aminoácidos, se forman (n-1) enlaces peptídicos, lo que resulta en la pérdida de (n-1) moléculas de agua. Sin embargo, se agrega de nuevo una molécula de agua para tener en cuenta los grupos terminales (H en el extremo N y OH en el extremo C).
Ejemplo de Cálculo
Calculemos el peso molecular de un tripeptido simple: Ala-Gly-Ser (AGS)
-
Sumar los pesos de los aminoácidos individuales:
- Alanina (A): 71.03711 Da
- Glicina (G): 57.02146 Da
- Serina (S): 87.03203 Da
- Total: 215.0906 Da
-
Restar la pérdida de agua por los enlaces peptídicos:
- Número de enlaces peptídicos = 3-1 = 2
- Peso molecular del agua = 18.01528 Da
- Pérdida total de agua = 2 × 18.01528 = 36.03056 Da
-
Agregar de nuevo una molécula de agua para los grupos terminales:
- 18.01528 Da
-
Peso molecular final:
- 215.0906 - 36.03056 + 18.01528 = 197.07532 Da
Cómo Usar Esta Calculadora
Usar la Calculadora de Peso Molecular de Proteínas es sencillo:
-
Ingrese su secuencia de proteína en el cuadro de texto utilizando los códigos estándar de aminoácidos de una letra (A, R, N, D, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V).
-
La calculadora validará automáticamente su entrada para asegurarse de que contenga solo códigos de aminoácidos válidos.
-
Haga clic en el botón "Calcular Peso Molecular" o espere a que se complete el cálculo automático.
-
Vea los resultados, que incluyen:
- El peso molecular calculado en Daltons (Da)
- La longitud de la secuencia (número de aminoácidos)
- Un desglose de la composición de aminoácidos
- La fórmula utilizada para el cálculo
-
Puede copiar los resultados al portapapeles haciendo clic en el botón "Copiar" para usarlos en informes o análisis posteriores.
Directrices de Entrada
Para obtener resultados precisos, siga estas directrices al ingresar su secuencia de proteína:
- Use solo los códigos estándar de aminoácidos de una letra (mayúsculas o minúsculas)
- No incluya espacios, números o caracteres especiales
- Elimine cualquier carácter que no sea un aminoácido (como la numeración de secuencias)
- Para secuencias con aminoácidos no estándar, considere usar herramientas alternativas que admitan códigos de aminoácidos ampliados
Interpretando los Resultados
La calculadora proporciona varias piezas de información:
-
Peso Molecular: El peso molecular estimado de su proteína en Daltons (Da). Para proteínas más grandes, esto puede expresarse en kilodaltons (kDa).
-
Longitud de la Secuencia: El número total de aminoácidos en su secuencia.
-
Composición de Aminoácidos: Un desglose visual del contenido de aminoácidos de su proteína, mostrando tanto el conteo como el porcentaje de cada aminoácido.
-
Método de Cálculo: Una explicación clara de cómo se calculó el peso molecular, incluida la fórmula utilizada.
Casos de Uso
La Calculadora de Peso Molecular de Proteínas tiene numerosas aplicaciones en diversos campos de las ciencias de la vida:
Purificación y Análisis de Proteínas
Los investigadores utilizan la información sobre el peso molecular para:
- Configurar columnas de filtración por gel adecuadas
- Determinar concentraciones apropiadas de gel de poliacrilamida para SDS-PAGE
- Interpretar datos de espectrometría de masas
- Validar resultados de expresión y purificación de proteínas
Producción de Proteínas Recombinantes
Las empresas biotecnológicas confían en cálculos precisos del peso molecular para:
- Diseñar construcciones de expresión
- Estimar rendimientos de proteínas
- Desarrollar estrategias de purificación
- Caracterizar productos finales
Síntesis de Péptidos
Los químicos de péptidos utilizan cálculos de peso molecular para:
- Determinar la cantidad de materiales de partida necesarios
- Calcular rendimientos teóricos
- Verificar la identidad de los péptidos sintetizados
- Diseñar métodos analíticos para control de calidad
Biología Estructural
Los biólogos estructurales necesitan información sobre el peso molecular para:
- Configurar ensayos de cristalización
- Interpretar datos de difracción de rayos X
- Analizar complejos de proteínas
- Calcular estequiometría de interacciones proteína-proteína
Desarrollo Farmacéutico
Los desarrolladores de fármacos utilizan el peso molecular de las proteínas para:
- Caracterizar proteínas terapéuticas
- Desarrollar estrategias de formulación
- Diseñar métodos analíticos
- Establecer especificaciones de control de calidad
Investigación Académica
Los estudiantes e investigadores utilizan la calculadora para:
- Experimentos de laboratorio
- Análisis de datos
- Diseño experimental
- Fines educativos
Alternativas
Si bien nuestra Calculadora de Peso Molecular de Proteínas proporciona estimaciones rápidas y precisas, hay enfoques alternativos para determinar el peso molecular de las proteínas:
-
Métodos Experimentales:
- Espectrometría de Masas (MS): Proporciona mediciones de peso molecular altamente precisas y puede detectar modificaciones post-traduccionales
- Cromatografía de Exclusión por Tamaño (SEC): Estima el peso molecular en función del radio hidrodinámico
- SDS-PAGE: Proporciona un peso molecular aproximado basado en la movilidad electroforética
-
Otras Herramientas Computacionales:
- ExPASy ProtParam: Ofrece parámetros adicionales de proteínas más allá del peso molecular
- EMBOSS Pepstats: Proporciona un análisis estadístico detallado de secuencias de proteínas
- Protein Calculator v3.4: Incluye cálculos adicionales como punto isoeléctrico y coeficiente de extinción
-
Software Especializado:
- Para proteínas con aminoácidos no estándar o modificaciones post-traduccionales
- Para ensamblajes de proteínas complejas o proteínas multiméricas
- Para proteínas etiquetadas isotópicamente utilizadas en estudios de NMR
Historia de la Determinación del Peso Molecular de Proteínas
El concepto de peso molecular ha sido fundamental para la química desde que John Dalton propuso su teoría atómica a principios del siglo XIX. Sin embargo, la aplicación a las proteínas tiene una historia más reciente:
Ciencia de Proteínas Temprana (1800-1920)
- En 1838, Jöns Jacob Berzelius acuñó el término "proteína" a partir de la palabra griega "proteios", que significa "primario" o "de primera importancia".
- Científicos de proteínas tempranos como Frederick Sanger comenzaron a entender que las proteínas estaban compuestas por aminoácidos.
- El concepto de proteínas como macromoléculas con pesos moleculares definidos emergió gradualmente.
Desarrollo de Técnicas Analíticas (1930-1960)
- La invención de la ultracentrifugación por Theodor Svedberg en la década de 1920 permitió las primeras mediciones precisas de pesos moleculares de proteínas.
- El desarrollo de técnicas de electroforesis en la década de 1930 por Arne Tiselius proporcionó otro método para estimar el tamaño de las proteínas.
- En 1958, Stanford Moore y William H. Stein completaron la primera secuencia completa de aminoácidos de la ribonucleasa, permitiendo un cálculo preciso del peso molecular.
Era Moderna (1970-Presente)
- El desarrollo de técnicas de espectrometría de masas revolucionó la determinación del peso molecular de proteínas.
- John Fenn y Koichi Tanaka recibieron el Premio Nobel de Química en 2002 por su desarrollo de métodos de ionización por desorción suave para análisis espectrométricos de macromoléculas biológicas.
- Los métodos computacionales para predecir propiedades de proteínas, incluido el peso molecular, se volvieron cada vez más sofisticados y accesibles.
- La llegada de la genómica y la proteómica en las décadas de 1990 y 2000 creó una necesidad de herramientas de análisis de proteínas de alto rendimiento, incluidas calculadoras de peso molecular automatizadas.
Hoy en día, el cálculo del peso molecular de proteínas es una parte rutinaria pero esencial de la ciencia de proteínas, facilitado por herramientas como nuestra calculadora que hacen que estos cálculos sean accesibles para investigadores de todo el mundo.
Ejemplos de Código
Aquí hay ejemplos de cómo calcular el peso molecular de proteínas en varios lenguajes de programación:
1' Función VBA de Excel para el Cálculo del Peso Molecular de Proteínas
2Function ProteinMolecularWeight(sequence As String) As Double
3 ' Pesos moleculares de aminoácidos
4 Dim aaWeights As Object
5 Set aaWeights = CreateObject("Scripting.Dictionary")
6
7 ' Inicializar pesos de aminoácidos
8 aaWeights("A") = 71.03711
9 aaWeights("R") = 156.10111
10 aaWeights("N") = 114.04293
11 aaWeights("D") = 115.02694
12 aaWeights("C") = 103.00919
13 aaWeights("E") = 129.04259
14 aaWeights("Q") = 128.05858
15 aaWeights("G") = 57.02146
16 aaWeights("H") = 137.05891
17 aaWeights("I") = 113.08406
18 aaWeights("L") = 113.08406
19 aaWeights("K") = 128.09496
20 aaWeights("M") = 131.04049
21 aaWeights("F") = 147.06841
22 aaWeights("P") = 97.05276
23 aaWeights("S") = 87.03203
24 aaWeights("T") = 101.04768
25 aaWeights("W") = 186.07931
26 aaWeights("Y") = 163.06333
27 aaWeights("V") = 99.06841
28
29 ' Peso molecular del agua
30 Const WATER_WEIGHT As Double = 18.01528
31
32 ' Convertir secuencia a mayúsculas
33 sequence = UCase(sequence)
34
35 ' Calcular peso total
36 Dim totalWeight As Double
37 totalWeight = 0
38
39 ' Sumar pesos de aminoácidos individuales
40 Dim i As Integer
41 For i = 1 To Len(sequence)
42 Dim aa As String
43 aa = Mid(sequence, i, 1)
44
45 If aaWeights.Exists(aa) Then
46 totalWeight = totalWeight + aaWeights(aa)
47 Else
48 ' Código de aminoácido no válido
49 ProteinMolecularWeight = -1
50 Exit Function
51 End If
52 Next i
53
54 ' Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
55 Dim numAminoAcids As Integer
56 numAminoAcids = Len(sequence)
57
58 ProteinMolecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
59End Function
60
61' Uso en Excel:
62' =ProteinMolecularWeight("ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY")
63
1def calculate_protein_molecular_weight(sequence):
2 """
3 Calcular el peso molecular de una proteína a partir de su secuencia de aminoácidos.
4
5 Args:
6 sequence (str): Secuencia de proteína utilizando códigos de aminoácidos de una letra
7
8 Returns:
9 float: Peso molecular en Daltons (Da)
10 """
11 # Pesos moleculares de aminoácidos
12 aa_weights = {
13 'A': 71.03711,
14 'R': 156.10111,
15 'N': 114.04293,
16 'D': 115.02694,
17 'C': 103.00919,
18 'E': 129.04259,
19 'Q': 128.05858,
20 'G': 57.02146,
21 'H': 137.05891,
22 'I': 113.08406,
23 'L': 113.08406,
24 'K': 128.09496,
25 'M': 131.04049,
26 'F': 147.06841,
27 'P': 97.05276,
28 'S': 87.03203,
29 'T': 101.04768,
30 'W': 186.07931,
31 'Y': 163.06333,
32 'V': 99.06841
33 }
34
35 # Peso molecular del agua
36 WATER_WEIGHT = 18.01528
37
38 # Convertir secuencia a mayúsculas
39 sequence = sequence.upper()
40
41 # Validar secuencia
42 for aa in sequence:
43 if aa not in aa_weights:
44 raise ValueError(f"Código de aminoácido no válido: {aa}")
45
46 # Sumar pesos de aminoácidos individuales
47 total_weight = sum(aa_weights[aa] for aa in sequence)
48
49 # Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
50 num_amino_acids = len(sequence)
51 molecular_weight = total_weight - (num_amino_acids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
52
53 return molecular_weight
54
55# Ejemplo de uso:
56sequence = "MVKMDVYKGSSIGDSMSRSM"
57mw = calculate_protein_molecular_weight(sequence)
58print(f"Peso molecular: {mw:.2f} Da")
59
1function calculateProteinMolecularWeight(sequence) {
2 // Pesos moleculares de aminoácidos
3 const aaWeights = {
4 'A': 71.03711,
5 'R': 156.10111,
6 'N': 114.04293,
7 'D': 115.02694,
8 'C': 103.00919,
9 'E': 129.04259,
10 'Q': 128.05858,
11 'G': 57.02146,
12 'H': 137.05891,
13 'I': 113.08406,
14 'L': 113.08406,
15 'K': 128.09496,
16 'M': 131.04049,
17 'F': 147.06841,
18 'P': 97.05276,
19 'S': 87.03203,
20 'T': 101.04768,
21 'W': 186.07931,
22 'Y': 163.06333,
23 'V': 99.06841
24 };
25
26 // Peso molecular del agua
27 const WATER_WEIGHT = 18.01528;
28
29 // Convertir secuencia a mayúsculas
30 sequence = sequence.toUpperCase();
31
32 // Validar secuencia
33 for (let i = 0; i < sequence.length; i++) {
34 const aa = sequence[i];
35 if (!aaWeights[aa]) {
36 throw new Error(`Código de aminoácido no válido: ${aa}`);
37 }
38 }
39
40 // Sumar pesos de aminoácidos individuales
41 let totalWeight = 0;
42 for (let i = 0; i < sequence.length; i++) {
43 totalWeight += aaWeights[sequence[i]];
44 }
45
46 // Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
47 const numAminoAcids = sequence.length;
48 const molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
49
50 return molecularWeight;
51}
52
53// Ejemplo de uso:
54const sequence = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY";
55try {
56 const mw = calculateProteinMolecularWeight(sequence);
57 console.log(`Peso molecular: ${mw.toFixed(2)} Da`);
58} catch (error) {
59 console.error(error.message);
60}
61
1import java.util.HashMap;
2import java.util.Map;
3
4public class ProteinMolecularWeightCalculator {
5 private static final Map<Character, Double> aminoAcidWeights = new HashMap<>();
6 private static final double WATER_WEIGHT = 18.01528;
7
8 static {
9 // Inicializar pesos de aminoácidos
10 aminoAcidWeights.put('A', 71.03711);
11 aminoAcidWeights.put('R', 156.10111);
12 aminoAcidWeights.put('N', 114.04293);
13 aminoAcidWeights.put('D', 115.02694);
14 aminoAcidWeights.put('C', 103.00919);
15 aminoAcidWeights.put('E', 129.04259);
16 aminoAcidWeights.put('Q', 128.05858);
17 aminoAcidWeights.put('G', 57.02146);
18 aminoAcidWeights.put('H', 137.05891);
19 aminoAcidWeights.put('I', 113.08406);
20 aminoAcidWeights.put('L', 113.08406);
21 aminoAcidWeights.put('K', 128.09496);
22 aminoAcidWeights.put('M', 131.04049);
23 aminoAcidWeights.put('F', 147.06841);
24 aminoAcidWeights.put('P', 97.05276);
25 aminoAcidWeights.put('S', 87.03203);
26 aminoAcidWeights.put('T', 101.04768);
27 aminoAcidWeights.put('W', 186.07931);
28 aminoAcidWeights.put('Y', 163.06333);
29 aminoAcidWeights.put('V', 99.06841);
30 }
31
32 public static double calculateMolecularWeight(String sequence) throws IllegalArgumentException {
33 // Convertir secuencia a mayúsculas
34 sequence = sequence.toUpperCase();
35
36 // Validar secuencia
37 for (int i = 0; i < sequence.length(); i++) {
38 char aa = sequence.charAt(i);
39 if (!aminoAcidWeights.containsKey(aa)) {
40 throw new IllegalArgumentException("Código de aminoácido no válido: " + aa);
41 }
42 }
43
44 // Sumar pesos de aminoácidos individuales
45 double totalWeight = 0;
46 for (int i = 0; i < sequence.length(); i++) {
47 totalWeight += aminoAcidWeights.get(sequence.charAt(i));
48 }
49
50 // Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
51 int numAminoAcids = sequence.length();
52 double molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
53
54 return molecularWeight;
55 }
56
57 public static void main(String[] args) {
58 try {
59 String sequence = "MVKMDVYKGSSIGDSMSRSM";
60 double mw = calculateMolecularWeight(sequence);
61 System.out.printf("Peso molecular: %.2f Da%n", mw);
62 } catch (IllegalArgumentException e) {
63 System.err.println(e.getMessage());
64 }
65 }
66}
67
1#include <iostream>
2#include <string>
3#include <map>
4#include <stdexcept>
5#include <algorithm>
6
7double calculateProteinMolecularWeight(const std::string& sequence) {
8 // Pesos moleculares de aminoácidos
9 std::map<char, double> aaWeights = {
10 {'A', 71.03711},
11 {'R', 156.10111},
12 {'N', 114.04293},
13 {'D', 115.02694},
14 {'C', 103.00919},
15 {'E', 129.04259},
16 {'Q', 128.05858},
17 {'G', 57.02146},
18 {'H', 137.05891},
19 {'I', 113.08406},
20 {'L', 113.08406},
21 {'K', 128.09496},
22 {'M', 131.04049},
23 {'F', 147.06841},
24 {'P', 97.05276},
25 {'S', 87.03203},
26 {'T', 101.04768},
27 {'W', 186.07931},
28 {'Y', 163.06333},
29 {'V', 99.06841}
30 };
31
32 // Peso molecular del agua
33 const double WATER_WEIGHT = 18.01528;
34
35 // Convertir secuencia a mayúsculas
36 std::string upperSequence = sequence;
37 std::transform(upperSequence.begin(), upperSequence.end(), upperSequence.begin(), ::toupper);
38
39 // Validar secuencia
40 for (char aa : upperSequence) {
41 if (aaWeights.find(aa) == aaWeights.end()) {
42 throw std::invalid_argument(std::string("Código de aminoácido no válido: ") + aa);
43 }
44 }
45
46 // Sumar pesos de aminoácidos individuales
47 double totalWeight = 0.0;
48 for (char aa : upperSequence) {
49 totalWeight += aaWeights[aa];
50 }
51
52 // Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
53 int numAminoAcids = upperSequence.length();
54 double molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
55
56 return molecularWeight;
57}
58
59int main() {
60 try {
61 std::string sequence = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY";
62 double mw = calculateProteinMolecularWeight(sequence);
63 std::cout << "Peso molecular: " << std::fixed << std::setprecision(2) << mw << " Da" << std::endl;
64 } catch (const std::exception& e) {
65 std::cerr << "Error: " << e.what() << std::endl;
66 }
67
68 return 0;
69}
70
Preguntas Frecuentes
¿Qué es el peso molecular de una proteína?
El peso molecular de una proteína, también llamado masa molecular, es la masa total de una molécula de proteína expresada en Daltons (Da) o kilodaltons (kDa). Representa la suma de las masas de todos los átomos en la proteína, teniendo en cuenta la pérdida de moléculas de agua durante la formación de enlaces peptídicos. Esta propiedad fundamental es crucial para la caracterización, purificación y análisis de proteínas.
¿Qué tan precisa es esta calculadora de peso molecular de proteínas?
Esta calculadora proporciona el peso molecular teórico basado en la secuencia de aminoácidos con alta precisión. Utiliza las masas monoisotópicas estándar de los aminoácidos y tiene en cuenta la pérdida de agua durante la formación de enlaces peptídicos. Sin embargo, no tiene en cuenta modificaciones post-traduccionales, aminoácidos no estándar o variaciones isotópicas que podrían estar presentes en proteínas reales.
¿Qué unidades se utilizan para el peso molecular de proteínas?
Los pesos moleculares de proteínas se expresan típicamente en Daltons (Da) o kilodaltons (kDa), donde 1 kDa equivale a 1,000 Da. El Dalton es aproximadamente igual a la masa de un átomo de hidrógeno (1.66 × 10^-24 gramos). A modo de referencia, los péptidos pequeños pueden ser de unos pocos cientos de Da, mientras que las proteínas grandes pueden ser de cientos de kDa.
¿Por qué mi peso molecular calculado difiere de los valores experimentales?
Varios factores pueden causar discrepancias entre los pesos moleculares calculados y experimentales:
- Modificaciones post-traduccionales (fosforilación, glicosilación, etc.)
- Formación de enlaces disulfuro
- Procesamiento proteolítico
- Aminoácidos no estándar
- Errores de medición experimental
- Variaciones isotópicas
Para la determinación precisa del peso molecular de proteínas modificadas, se recomienda la espectrometría de masas.
¿Puede esta calculadora manejar aminoácidos no estándar?
Sí, pero esta calculadora no ajusta automáticamente para enlaces disulfuro. Cada formación de enlace disulfuro resulta en la pérdida de dos átomos de hidrógeno (2.01588 Da). Para tener en cuenta los enlaces disulfuro, reste 2.01588 Da del peso molecular calculado por cada enlace disulfuro en su proteína.
¿Cómo se relaciona el peso molecular de las proteínas con el tamaño de la proteína?
Si bien el peso molecular se correlaciona con el tamaño de la proteína, la relación no siempre es directa. Los factores que afectan el tamaño físico de una proteína incluyen:
- Composición de aminoácidos
- Estructura secundaria y terciaria
- Capa de hidratación
- Modificaciones post-traduccionales
- Condiciones ambientales (pH, concentración de sal)
Para una estimación aproximada, una proteína globular de 10 kDa tiene un diámetro de aproximadamente 2-3 nm.
Referencias
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Kinter, M., & Sherman, N. E. (2005). Secuenciación e Identificación de Proteínas Usando Espectrometría de Masas. Wiley-Interscience.
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