BCA kalkulator prostornine vzorca za laboratorijske protokole

Izračunajte natančne prostornine vzorcev na podlagi absorpcijskih meritev BCA testa in želenih mas beljakovin. Ključno za dosledno nalaganje beljakovin pri zahodnih blotih in drugih laboratorijskih aplikacijah.

BCA kalkulator prostornine vzorca z absorbanco

Ta orodje izračuna zahtevano prostornino vzorca na podlagi rezultatov absorbance BCA in mase vzorca. Vnesite vrednost absorbance in maso vzorca za vsak vzorec, da izračunate ustrezno prostornino vzorca.

standardCurveTitle

curveTypeStandard
curveTypeEnhanced
curveTypeMicro
curveTypeCustom

Vhodi vzorca

Vzorec 1

Copy
N/A μL

Formula za izračun

Prostornina vzorca se izračuna z naslednjo formulo:

Prostornina vzorca (μL) = Masa vzorca (μg) / Koncentracija beljakovin (μg/μL)
usageTipsTitle

tipAbsorbanceRange

tipSampleMass

tipSampleVolume

tipStandardCurve

📚

Dokumentacija

BCA Absorbance Sample Volume Calculator

Uvod

BCA Absorbance Sample Volume Calculator je specializirano orodje, zasnovano za pomoč raziskovalcem in laboratorijskim tehniki pri natančnem določanju ustreznega volumna vzorca za eksperimente na podlagi rezultatov BCA (bicinchoninske kisline) testa. To orodje vzame meritve absorpcije iz vašega BCA testa in želeno maso vzorca, da izračuna natančen volumen, potreben za dosledno nalaganje beljakovin v aplikacijah, kot so western blotting, encimski testi in druge tehnike analize beljakovin.

BCA test je ena najbolj široko uporabljenih metod za kvantifikacijo beljakovin v biokemijskih in molekularno-bioloških laboratorijih. Z merjenjem absorpcije vaših beljakovinskih vzorcev in primerjavo z standardno krivuljo lahko določite koncentracijo beljakovin z visoko natančnostjo. Naš kalkulator poenostavi ta postopek z avtomatskim pretvorbo meritev absorpcije v točne volume vzorcev, potrebne za vaše eksperimente.

Razumevanje BCA testa in izračun volumna vzorca

Kaj je BCA test?

Bicinchoninska kislina (BCA) test je biokemični test za določanje skupne koncentracije beljakovin v raztopini. Načelo tega testa temelji na oblikovanju Cu²⁺-beljakovinskega kompleksa pod alkalnimi pogoji, ki mu sledi redukcija Cu²⁺ v Cu¹⁺. Količina redukcije je sorazmerna s prisotnostjo beljakovin. BCA tvori vijolični kompleks s Cu¹⁺ v alkalnem okolju, kar predstavlja osnovo za spremljanje redukcije bakra s beljakovinami.

Intenzivnost vijolične barve se povečuje sorazmerno s koncentracijo beljakovin, kar je mogoče izmeriti z uporabo spektrofotometra pri približno 562 nm. Meritve absorpcije se nato primerjajo s standardno krivuljo za določitev koncentracije beljakovin v neznanih vzorcih.

Formula za izračun volumna vzorca

Osnovna formula za izračun volumna vzorca iz rezultatov absorpcije BCA je:

Volumen vzorca (μL)=Masa vzorca (μg)Koncentracija beljakovin (μg/μL)\text{Volumen vzorca (μL)} = \frac{\text{Masa vzorca (μg)}}{\text{Koncentracija beljakovin (μg/μL)}}

Kjer:

  • Volumen vzorca je volumen vzorca, ki ga potrebujete (v mikrolitrih, μL)
  • Masa vzorca je želeni znesek beljakovin, ki jih želite uporabiti (v mikrogramih, μg)
  • Koncentracija beljakovin je izračunana iz meritve absorpcije BCA (v μg/μL)

Koncentracija beljakovin se izračuna iz meritve absorpcije z uporabo enačbe standardne krivulje:

Koncentracija beljakovin (μg/μL)=Naklon×Absorbanca+Presek\text{Koncentracija beljakovin (μg/μL)} = \text{Naklon} \times \text{Absorbanca} + \text{Presek}

Za standardni BCA test je tipični naklon približno 2.0, presek pa je pogosto blizu nič, čeprav se lahko ti vrednosti razlikujejo glede na specifične pogoje vašega testa in standardno krivuljo.

Kako uporabljati BCA Absorbance Sample Volume Calculator

Naš kalkulator poenostavi postopek določanja volumnov vzorcev iz rezultatov BCA testa. Sledite tem korakom, da dobite natančne izračune:

  1. Vnesite informacije o vzorcu:

    • Navedite ime za vaš vzorec (opcijsko, a koristno za sledenje več vzorcem)
    • Vnesite meritev absorpcije BCA iz vašega spektrofotometra
    • Vnesite želeno maso vzorca (količina beljakovin, ki jo želite uporabiti v μg)
  2. Izberite vrsto standardne krivulje:

    • Standardna (privzeto): uporablja tipične parametre standardne krivulje BCA
    • Povečana: za protokol z večjo občutljivostjo
    • Mikro: za protokol mikroplošče
    • Po meri: omogoča vam, da vnesete svoje vrednosti naklona in preseka
  3. Ogled rezultatov:

    • Kalkulator bo takoj prikazal potreben volumen vzorca v mikrolitrih
    • Rezultati so predstavljeni tudi v povzetku za enostavno sklicevanje
    • Za več vzorcev lahko dodate več vnosov in primerjate rezultate
  4. Kopirajte ali izvozite rezultate:

    • Uporabite gumb za kopiranje, da prenesete rezultate v svoj laboratorijski zvezek ali druge aplikacije
    • Vse izračune lahko shranite za prihodnjo referenco

Korak-po-korak primer

Poglejmo praktičen primer:

  1. Opravili ste BCA test in pridobili meritev absorpcije 0.75 za vaš beljakovinski vzorec.
  2. Želite naložiti 20 μg beljakovin za vaš western blot.
  3. Uporabljajoč standardno krivuljo (naklon = 2.0, presek = 0):
    • Koncentracija beljakovin = 2.0 × 0.75 + 0 = 1.5 μg/μL
    • Potreben volumen vzorca = 20 μg ÷ 1.5 μg/μL = 13.33 μL

To pomeni, da bi morali naložiti 13.33 μL vašega vzorca, da dobite 20 μg beljakovin.

Razumevanje rezultatov

Kalkulator zagotavlja več pomembnih informacij:

  1. Koncentracija beljakovin: To se izračuna iz vaše meritve absorpcije z uporabo izbrane standardne krivulje. Predstavlja količino beljakovin na enoto volumna v vašem vzorcu (μg/μL).

  2. Volumen vzorca: To je volumen vašega vzorca, ki vsebuje želeno količino beljakovin. Ta vrednost je tisto, kar boste uporabili pri pripravi vaših eksperimentov.

  3. Opozorila in priporočila: Kalkulator lahko zagotovi opozorila za:

    • Zelo visoke meritve absorpcije (>3.0), ki so lahko zunaj linearnega območja testa
    • Zelo nizke meritve absorpcije (<0.1), ki so morda blizu mejne vrednosti zaznavanja
    • Izračunane volume, ki so nepraktično veliki (>1000 μL) ali majhni (<1 μL)

Aplikacije in primeri uporabe

Priprava vzorcev za western blot

Ena najpogostejših aplikacij za ta kalkulator je priprava vzorcev za western blotting. Dosledno nalaganje beljakovin je ključno za zanesljive rezultate western blota, in ta kalkulator zagotavlja, da naložite enako količino beljakovin za vsak vzorec, tudi ko se njihove koncentracije razlikujejo.

Primer delovnega toka:

  1. Opravite BCA test na vseh vaših beljakovinskih vzorcih
  2. Odločite se za dosledno količino beljakovin za nalaganje (običajno 10-50 μg)
  3. Uporabite kalkulator za določitev volumnov, potrebnih za vsak vzorec
  4. Dodajte ustrezne volume vzorčne puferne raztopine in redukcijskega sredstva
  5. Naložite izračunane volume na vaš gel

Encimski testi

Pri encimskih testih je pogosto potrebno uporabiti specifično količino beljakovin za standardizacijo reakcijskih pogojev med različnimi vzorci ali eksperimenti.

Primer delovnega toka:

  1. Določite koncentracijo beljakovin z uporabo BCA testa
  2. Izračunajte volumen, potreben za dosego želenega zneska beljakovin
  3. Dodajte ta volumen v vašo reakcijsko mešanico
  4. Nadaljujte z vašim encimskim testom

Eksperimenti imunoprecipitacije

Pri eksperimentih imunoprecipitacije je pomembno, da začnete z dosledno količino beljakovin za primerjavo rezultatov med različnimi pogoji.

Primer delovnega toka:

  1. Izmerite koncentracijo beljakovin celičnih ali tkivnih lizatov z uporabo BCA testa
  2. Izračunajte volume, potrebne za dosego enakih količin beljakovin (običajno 500-1000 μg)
  3. Prilagodite vse vzorce na enak volumen z lizo puferjem
  4. Nadaljujte z inkubacijo z antitelesi in precipitacijo

Čiščenje beljakovin

Med čiščenjem beljakovin je pogosto potrebno slediti koncentraciji beljakovin in izračunati donose na različnih korakih.

Primer delovnega toka:

  1. Zberite frakcije med čiščenjem
  2. Opravite BCA test na izbranih frakcijah
  3. Izračunajte koncentracijo beljakovin in skupno količino beljakovin
  4. Določite volume, potrebne za naslednje aplikacije

Napredne funkcije in razmisleki

Prilagojene standardne krivulje

Medtem ko kalkulator zagotavlja privzete parametre za standardne BCA teste, lahko vnesete tudi prilagojene vrednosti, če ste ustvarili svojo standardno krivuljo. To je še posebej koristno, ko:

  • Delate z nestandardnimi beljakovinskimi vzorci
  • Uporabljate spremenjene protokole BCA
  • Delate v prisotnosti snovi, ki bi lahko motile test

Za uporabo prilagojene standardne krivulje:

  1. Izberite "Po meri" iz možnosti standardne krivulje
  2. Vnesite svoje vrednosti naklona in preseka
  3. Kalkulator bo te vrednosti uporabil za vse nadaljnje izračune

Obvladovanje več vzorcev

Kalkulator vam omogoča dodajanje več vzorcev in hkratno izračunavanje njihovih volumnov. To je še posebej koristno pri pripravi vzorcev za eksperimente, ki zahtevajo dosledno nalaganje beljakovin med različnimi pogoji.

Prednosti obdelave serij:

  • Prihranite čas z izračunom vseh volumnov naenkrat
  • Zagotovite doslednost med vsemi vašimi vzorci
  • Enostavno primerjajte koncentracije beljakovin med vzorci
  • Identificirajte odstopanja ali morebitne napake pri merjenju

Obvladovanje robnih primerov

Zelo visoke meritve absorpcije

Če je vaša meritev absorpcije nad 2.0, je lahko zunaj linearnega območja BCA testa. V takih primerih:

  1. Razredčite svoj vzorec in ponovite BCA test
  2. Alternativno uporabite sistem opozoril kalkulatorja, ki bo označil morebitne problematične meritve

Zelo nizke meritve absorpcije

Za meritve absorpcije pod 0.1 ste morda blizu meje zaznavanja testa, kar lahko vpliva na natančnost. Razmislite o:

  1. Koncentraciji vašega vzorca, če je to mogoče
  2. Uporabi bolj občutljive metode kvantifikacije beljakovin
  3. Prilagoditvi vašega eksperimentalnega načrta, da upošteva nižje količine beljakovin

Nepraktično veliki izračunani volumi

Če kalkulator predlaga volumen, ki je prevelik za vašo aplikacijo:

  1. Razmislite o koncentraciji vašega beljakovinskega vzorca
  2. Prilagodite želeno količino beljakovin navzdol, če vaš eksperiment to dopušča
  3. Uporabite največji praktični volumen in zabeležite dejansko količino beljakovin, ki ste jih uporabili

Zgodovina kvantifikacije beljakovin in BCA testa

Natančna kvantifikacija beljakovin je bila temeljna zahteva v biokemiji in molekularni biologiji, odkar so se ta področja pojavila. Zgodnje metode so se zanašale na določanje vsebnosti dušika, kar je bilo zamudno in je zahtevalo specializirano opremo.

Evolucija metod kvantifikacije beljakovin

  1. Kjeldahlova metoda (1883): Ena najzgodnejših metod za kvantifikacijo beljakovin, ki temelji na merjenju vsebnosti dušika.

  2. Biuretov test (zgodnja 1900-a): Ta metoda se opira na reakcijo med peptidnimi vezmi in bakrovimi ioniziranimi v alkalni raztopini, kar povzroča vijolično barvo.

  3. Lowryjeva metoda (1951): Razvila jo je Oliver Lowry, ta metoda združuje biuretovo reakcijo s Folin-Ciocalteu reagentom, kar povečuje občutljivost.

  4. Bradfordov test (1976): Marion Bradford je razvila to metodo z uporabo barvila Coomassie Brilliant Blue G-250, ki se veže na beljakovine in premakne maksimum absorpcije.

  5. BCA test (1985): Razvili so ga Paul Smith in njegovi sodelavci pri podjetju Pierce Chemical, ta metoda združuje biuretovo reakcijo z BCA detekcijo, kar ponuja izboljšano občutljivost in združljivost z detergenti.

Razvoj BCA testa

BCA test je prvič opisan v članku iz leta 1985 avtorjev Smith et al. z naslovom "Measurement of protein using bicinchoninic acid." Razvili so ga, da bi odpravili omejitve obstoječih metod, zlasti motnje zaradi različnih kemikalij, ki se pogosto uporabljajo pri ekstrakciji in čiščenju beljakovin.

Ključna inovacija je bila uporaba bicinchoninske kisline za zaznavanje Cu¹⁺ ionov, ki jih proizvaja redukcija Cu²⁺ s strani beljakovin, kar tvori vijolični kompleks, ki ga je mogoče meriti spektrofotometrično. To je prineslo več prednosti:

  1. Višja občutljivost kot biuretova metoda
  2. Manjša dovzetnost za motnje od nekaterih snovi v primerjavi z Lowryjevo metodo
  3. Boljša združljivost z detergenti kot Bradfordova metoda
  4. Enostavnejši protokol z manj reagenti in koraki

Od svojega uvajanja je BCA test postal ena najbolj široko uporabljenih metod kvantifikacije beljakovin v biokemijskih in molekularno-bioloških laboratorijih po vsem svetu.

Primeri kode za izračun volumna vzorca

Excel formula

1=IF(B2<=0,"Napaka: Neveljavna absorpcija",IF(C2<=0,"Napaka: Neveljavna masa vzorca",C2/(2*B2)))
2
3' Kjer:
4' B2 vsebuje meritev absorpcije
5' C2 vsebuje želeno maso vzorca v μg
6' Formula vrne potreben volumen vzorca v μL
7

Python implementacija

1import numpy as np
2import matplotlib.pyplot as plt
3
4def calculate_protein_concentration(absorbance, slope=2.0, intercept=0):
5    """Izračunajte koncentracijo beljakovin iz absorpcije z uporabo standardne krivulje."""
6    if absorbance < 0:
7        raise ValueError("Absorpcija ne more biti negativna")
8    return (slope * absorbance) + intercept
9
10def calculate_sample_volume(absorbance, sample_mass, slope=2.0, intercept=0):
11    """Izračunajte potreben volumen vzorca na podlagi absorpcije in želenega zneska."""
12    if sample_mass <= 0:
13        raise ValueError("Masa vzorca mora biti pozitivna")
14    
15    protein_concentration = calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept)
16    
17    if protein_concentration <= 0:
18        raise ValueError("Izračunana koncentracija beljakovin mora biti pozitivna")
19    
20    return sample_mass / protein_concentration
21
22# Primer uporabe
23absorbance = 0.75
24sample_mass = 20  # μg
25slope = 2.0
26intercept = 0
27
28try:
29    volume = calculate_sample_volume(absorbance, sample_mass, slope, intercept)
30    print(f"Za absorpcijo {absorbance} in želeno maso beljakovin {sample_mass} μg:")
31    print(f"Koncentracija beljakovin: {calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept):.2f} μg/μL")
32    print(f"Potreben volumen vzorca: {volume:.2f} μL")
33except ValueError as e:
34    print(f"Napaka: {e}")
35

R koda za analizo

1# Funkcija za izračun koncentracije beljakovin iz absorpcije
2calculate_protein_concentration <- function(absorbance, slope = 2.0, intercept = 0) {
3  if (absorbance < 0) {
4    stop("Absorpcija ne more biti negativna")
5  }
6  return((slope * absorbance) + intercept)
7}
8
9# Funkcija za izračun volumna vzorca
10calculate_sample_volume <- function(absorbance, sample_mass, slope = 2.0, intercept = 0) {
11  if (sample_mass <= 0) {
12    stop("Masa vzorca mora biti pozitivna")
13  }
14  
15  protein_concentration <- calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept)
16  
17  if (protein_concentration <= 0) {
18    stop("Izračunana koncentracija beljakovin mora biti pozitivna")
19  }
20  
21  return(sample_mass / protein_concentration)
22}
23
24# Primer uporabe
25absorbance <- 0.75
26sample_mass <- 20  # μg
27slope <- 2.0
28intercept <- 0
29
30tryCatch({
31  volume <- calculate_sample_volume(absorbance, sample_mass, slope, intercept)
32  protein_concentration <- calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept)
33  
34  cat(sprintf("Za absorpcijo %.2f in želeno maso beljakovin %.2f μg:\n", absorbance, sample_mass))
35  cat(sprintf("Koncentracija beljakovin: %.2f μg/μL\n", protein_concentration))
36  cat(sprintf("Potreben volumen vzorca: %.2f μL\n", volume))
37}, error = function(e) {
38  cat(sprintf("Napaka: %s\n", e$message))
39})
40

JavaScript implementacija

1function calculateProteinConcentration(absorbance, slope = 2.0, intercept = 0) {
2  if (absorbance < 0) {
3    throw new Error("Absorpcija ne more biti negativna");
4  }
5  return (slope * absorbance) + intercept;
6}
7
8function calculateSampleVolume(absorbance, sampleMass, slope = 2.0, intercept = 0) {
9  if (sampleMass <= 0) {
10    throw new Error("Masa vzorca mora biti pozitivna");
11  }
12  
13  const proteinConcentration = calculateProteinConcentration(absorbance, slope, intercept);
14  
15  if (proteinConcentration <= 0) {
16    throw new Error("Izračunana koncentracija beljakovin mora biti pozitivna");
17  }
18  
19  return sampleMass / proteinConcentration;
20}
21
22// Primer uporabe
23try {
24  const absorbance = 0.75;
25  const sampleMass = 20; // μg
26  const slope = 2.0;
27  const intercept = 0;
28  
29  const proteinConcentration = calculateProteinConcentration(absorbance, slope, intercept);
30  const volume = calculateSampleVolume(absorbance, sampleMass, slope, intercept);
31  
32  console.log(`Za absorpcijo ${absorbance} in želeno maso beljakovin ${sampleMass} μg:`);
33  console.log(`Koncentracija beljakovin: ${proteinConcentration.toFixed(2)} μg/μL`);
34  console.log(`Potreben volumen vzorca: ${volume.toFixed(2)} μL`);
35} catch (error) {
36  console.error(`Napaka: ${error.message}`);
37}
38

Vizualizacija standardne krivulje

Razmerje med absorpcijo in koncentracijo beljakovin je običajno linearno v določenem razponu. Spodaj je vizualizacija standardne BCA krivulje:

BCA Standard Curve for Protein Quantification Vizualizacija linearne povezave med absorpcijo in koncentracijo beljakovin v BCA testu 0.0
<text x="150" y="370">0.5</text>
<line x1="150" y1="350" x2="150" y2="355" stroke="#64748b"/>

<text x="250" y="370">1.0</text>
<line x1="250" y1="350" x2="250" y2="355" stroke="#64748b"/>

<text x="350" y="370">1.5</text>
<line x1="350" y1="350" x2="350" y2="355" stroke="#64748b"/>

<text x="450" y="370">2.0</text>
<line x1="450" y1="350" x2="450" y2="355" stroke="#64748b"/>

<text x="550" y="370">2.5</text>
<line x1="550" y1="350" x2="550" y2="355" stroke="#64748b"/>
0.0
<text x="45" y="300">1.0</text>
<line x1="45" y1="300" x2="50" y2="300" stroke="#64748b"/>

<text x="45" y="250">2.0</text>
<line x1="45" y1="250" x2="50" y2="250" stroke="#64748b"/>

<text x="45" y="200">3.0</text>
<line x1="45" y1="200" x2="50" y2="200" stroke="#64748b"/>

<text x="45" y="150">4.0</text>
<line x1="45" y1="150" x2="50" y2="150" stroke="#64748b"/>

<text x="45" y="100">5.0</text>
<line x1="45" y1="100" x2="50" y2="100" stroke="#64748b"/>

<text x="45" y="50">6.0</text>
<line x1="45" y1="50" x2="50" y2="50" stroke="#64748b"/>

Absorbanca (562 nm) Koncentracija beljakovin (μg/μL)

Standardna krivulja Standardni vzorci

BCA Standardna krivulja

Primerjava z drugimi metodami kvantifikacije beljakovin

Različne metode kvantifikacije beljakovin imajo različne prednosti in omejitve. Tukaj je, kako se BCA test primerja z drugimi običajnimi metodami:

MetodaObčutljivostPrednostiOmejitveNajboljša uporaba
BCA test5-2000 μg/mL• Združljivost z detergenti
• Manjša variabilnost med beljakovinami
• Stabilna barvna razvoj
• Motnje zaradi redukcijskih sredstev
• Vpliv nekaterih kelatnih sredstev
• Splošna kvantifikacija beljakovin
• Vzorci, ki vsebujejo detergente
Bradfordov test1-1500 μg/mL• Hiter (2-5 min)
• Malo motenj
• Visoka variabilnost med beljakovinami
• Nezdružljivost z detergenti
• Hitre meritve
• Vzorci brez detergenta
Lowryjeva metoda1-1500 μg/mL• Dobro uveljavljen
• Dobra občutljivost
• Mnoge motnje
• Več korakov
• Zgodovinska doslednost
• Čisti beljakovinski vzorci
UV absorpcija (280 nm)20-3000 μg/mL• Nedestruktivno
• Zelo hitro
• Ni potrebnih reagentov
• Vpliv nukleinskih kislin
• Zahteva čiste vzorce
• Čiste beljakovinske raztopine
• Hitri pregledi med čiščenjem
Fluorometrična0.1-500 μg/mL• Najvišja občutljivost
• Širok dinamični razpon
• Dragi reagenti
• Zahteva fluorometer
• Zelo razredčeni vzorci
• Omejen volumen vzorca

Pogosto zastavljena vprašanja

Kaj se uporablja BCA test?

BCA (bicinchoninska kislina) test se primarno uporablja za kvantifikacijo skupne koncentracije beljakovin v vzorcu. Široko se uporablja v biokemiji, celični biologiji in molekularni biologiji za aplikacije, kot so western blotting, encimski testi, imunoprecipitacija in čiščenje beljakovin.

Kako natančen je BCA test?

BCA test je običajno natančen v razponu 5-10%, ko se pravilno izvede. Njegova natančnost je odvisna od več dejavnikov, vključno s kakovostjo standardne krivulje, odsotnostjo motenj in ali je sestava neznane beljakovine podobna standardni beljakovini, ki se uporablja.

Kaj lahko moti rezultate BCA testa?

Več snovi lahko moti rezultate BCA testa, vključno z:

  • Redukcijskimi sredstvi (DTT, β-merkaptanol, glutation)
  • Kelatnimi sredstvi (EDTA, EGTA)
  • Visokimi koncentracijami preprostih sladkorjev
  • Lipidi
  • Nekaterimi detergenti v visokih koncentracijah
  • Ammonijevimi spojinami

Kakšna je razlika med BCA in Bradfordovimi testi?

Glavne razlike so:

  • BCA test je bolj združljiv z detergenti in surfaktanti
  • Bradfordov test je hitrejši (2-5 minut proti 30+ minutam za BCA)
  • BCA ima manjšo variabilnost med beljakovinami
  • Bradford je bolj občutljiv na osnovne aminokisline
  • BCA je podvržen vplivu redukcijskih sredstev, medtem ko Bradford ni

Zakaj je moj izračunani volumen vzorca prevelik?

Če kalkulator prikazuje zelo velik volumen vzorca, to običajno kaže na nizko koncentracijo beljakovin v vašem vzorcu. To bi lahko bilo posledica:

  1. Dejansko nizke vsebnosti beljakovin v vašem izvirnem vzorcu
  2. Izgube beljakovin med pripravo
  3. Napak v postopku BCA testa
  4. Nepravilne meritve absorpcije

Razmislite o koncentraciji vašega vzorca ali prilagoditvi vašega eksperimentalnega načrta, da upoštevate nižje koncentracije beljakovin.

Lahko uporabim ta kalkulator za druge metode kvantifikacije beljakovin?

Ta kalkulator je posebej zasnovan za rezultate BCA testa. Medtem ko osnovna načela (pretvorba koncentracije v volumen) veljajo tudi za druge metode, se razmerje med absorpcijo in koncentracijo beljakovin razlikuje med različnimi testi. Za druge metode, kot so Bradford ali Lowry, bi morali uporabiti različne parametre standardne krivulje.

Kako ravnati z vzorci z absorpcijo zunaj linearnega območja?

Za meritve absorpcije zunaj linearnega območja (običajno >2.0):

  1. Razredčite svoj vzorec in ponovite BCA test
  2. Uporabite drugo metodo kvantifikacije beljakovin
  3. Prilagodite standardno krivuljo, da vključite standarde višjih koncentracij

Katero beljakovino naj uporabim kot standard?

Bovine Serum Albumin (BSA) je najpogosteje uporabljeni standard za BCA teste, ker je:

  • Enostavno dostopen in poceni
  • Zelo topen
  • Stabilen v raztopini
  • Dobro opredeljen

Vendar, če vaši vzorci vsebujejo prevladujočo beljakovino, ki se bistveno razlikuje od BSA, razmislite o uporabi te beljakovine kot vašega standarda za natančnejše rezultate.

Kako dolgo je reakcija BCA stabilna?

Vijolična barva, ki se razvije v BCA reakciji, je stabilna več ur pri sobni temperaturi in jo je mogoče meriti kadarkoli v tem obdobju. Vendar pa je za najboljše rezultate priporočljivo izmeriti vse standarde in vzorce približno ob istem času po razvoju barve.

Lahko ponovno uporabim standardno krivuljo iz prejšnjega eksperimenta?

Čeprav je tehnično mogoče ponovno uporabiti standardno krivuljo, to ni priporočljivo za natančno kvantifikacijo. Variacije v reagentih, pogojih inkubacije in kalibraciji instrumentov lahko vplivajo na razmerje med absorpcijo in koncentracijo beljakovin. Za zanesljive rezultate ustvarite svežo standardno krivuljo vsakič, ko izvedete test.

Reference

  1. Smith PK, Krohn RI, Hermanson GT, et al. "Measurement of protein using bicinchoninic acid." Analytical Biochemistry. 1985;150(1):76-85. doi:10.1016/0003-2697(85)90442-7

  2. Thermo Scientific. "Pierce BCA Protein Assay Kit." Navodila. Na voljo na: https://www.thermofisher.com/document-connect/document-connect.html?url=https%3A%2F%2Fassets.thermofisher.com%2FTFS-Assets%2FLSG%2Fmanuals%2FMAN0011430_Pierce_BCA_Protein_Asy_UG.pdf

  3. Walker JM. "The Bicinchoninic Acid (BCA) Assay for Protein Quantitation." In: Walker JM, ed. The Protein Protocols Handbook. Springer; 2009:11-15. doi:10.1007/978-1-59745-198-7_3

  4. Olson BJ, Markwell J. "Assays for determination of protein concentration." Current Protocols in Protein Science. 2007;Chapter 3:Unit 3.4. doi:10.1002/0471140864.ps0304s48

  5. Noble JE, Bailey MJ. "Quantitation of protein." Methods in Enzymology. 2009;463:73-95. doi:10.1016/S0076-6879(09)63008-1

Preizkusite naš BCA Absorbance Sample Volume Calculator še danes!

Sedaj, ko razumete načela kvantifikacije beljakovin BCA in izračuna volumna vzorca, preizkusite naš kalkulator, da poenostavite svoje laboratorijske delovne tokove. Preprosto vnesite svoje meritve absorpcije in želeno maso vzorca, da dobite takojšnje, natančne izračune volumna vzorca.

Ne glede na to, ali pripravljate vzorce za western blotting, encimske teste ali katerikoli drug eksperiment, temelječ na beljakovinah, vam bo naš kalkulator pomagal zagotoviti dosledne in zanesljive rezultate. Prihranite čas, zmanjšajte napake in izboljšajte ponovljivost vaših eksperimentov z BCA Absorbance Sample Volume Calculator.