لیب پروٹوکولز کے لیے بی سی اے ایبزوربانس نمونہ حجم کیلکولیٹر
بی سی اے ٹیسٹ کی ایبزوربانس پڑھائیوں اور مطلوبہ پروٹین ماس کی بنیاد پر درست نمونہ حجم کا حساب لگائیں۔ ویسٹرن بلٹس اور دیگر لیبارٹری ایپلیکیشنز میں مستقل پروٹین لوڈنگ کے لیے ضروری۔
بی سی اے ایبزوربنس نمونہ حجم کیلکولیٹر
یہ ٹول بی سی اے ایبزوربنس کے نتائج اور نمونہ ماس کی بنیاد پر درکار نمونہ حجم کا حساب لگاتا ہے۔ ہر نمونہ کے لیے ایبزوربنس کی قیمت اور نمونہ ماس درج کریں تاکہ متعلقہ نمونہ حجم کا حساب لگایا جا سکے۔
standardCurveTitle
نمونہ کی معلومات
نمونہ 1
حساب کتاب کا فارمولا
نمونہ حجم کا حساب لگانے کے لیے درج ذیل فارمولا استعمال کیا جاتا ہے:
usageTipsTitle
• tipAbsorbanceRange
• tipSampleMass
• tipSampleVolume
• tipStandardCurve
دستاویزات
BCA ایبزوربانس نمونہ حجم کیلکولیٹر
تعارف
BCA ایبزوربانس نمونہ حجم کیلکولیٹر ایک خصوصی ٹول ہے جو محققین اور لیبارٹری ٹیکنیشنز کو BCA (بائیکنچونک ایسڈ) ٹیسٹ کے نتائج کی بنیاد پر تجربات کے لیے مناسب نمونہ حجم درست طور پر طے کرنے میں مدد دینے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔ یہ کیلکولیٹر آپ کے BCA ٹیسٹ سے ایبزوربانس کی ریڈنگز اور آپ کی مطلوبہ نمونہ ماس کو لے کر تجربات کے لیے مستقل پروٹین لوڈنگ کے لیے درکار درست حجم کا حساب لگاتا ہے، جیسے ویسٹرن بلٹنگ، انزیمیٹک ٹیسٹ، اور دیگر پروٹین تجزیہ کی تکنیکیں۔
BCA ٹیسٹ پروٹین کی مقدار کا تعین کرنے کے لیے سب سے زیادہ استعمال ہونے والے طریقوں میں سے ایک ہے جو بایو کیمسٹری اور مالیکیولر بایولوجی کی لیبارٹریز میں استعمال ہوتا ہے۔ اپنے پروٹین نمونوں کی ایبزوربانس کی پیمائش کرکے اور انہیں ایک معیاری منحنی خطوط سے موازنہ کرکے، آپ پروٹین کی مقدار کو اعلیٰ درستگی کے ساتھ معلوم کر سکتے ہیں۔ ہمارا کیلکولیٹر اس عمل کو ہموار کرتا ہے، ایبزوربانس کی ریڈنگز کو آپ کے تجربات کے لیے درکار درست نمونہ حجم میں خودکار طور پر تبدیل کرتا ہے۔
BCA ٹیسٹ اور نمونہ حجم کے حساب کو سمجھنا
BCA ٹیسٹ کیا ہے؟
بائیکنچونک ایسڈ (BCA) ٹیسٹ ایک بایو کیمیکل ٹیسٹ ہے جو کسی حل میں پروٹین کی کل مقدار کا تعین کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ اس ٹیسٹ کا اصول الکلی حالات میں Cu²⁺-پروٹین کمپلیکس کی تشکیل پر مبنی ہے، جس کے بعد Cu²⁺ کا Cu¹⁺ میں کمی واقع ہوتی ہے۔ کمی کی مقدار موجود پروٹین کے تناسب میں ہوتی ہے۔ BCA الکلی ماحول میں Cu¹⁺ کے ساتھ ایک جامنی رنگ کا کمپلیکس بناتا ہے، جو پروٹین کی موجودگی کی نگرانی کے لیے ایک بنیاد فراہم کرتا ہے۔
جامنی رنگ کی شدت پروٹین کی مقدار کے ساتھ تناسب میں بڑھتی ہے، جسے تقریباً 562 nm پر اسپیکٹروفوٹومیٹر کا استعمال کرتے ہوئے ناپا جا سکتا ہے۔ ایبزوربانس کی ریڈنگز کو پھر ایک معیاری منحنی خطوط سے موازنہ کرکے نامعلوم نمونوں میں پروٹین کی مقدار کا تعین کیا جاتا ہے۔
نمونہ حجم کے حساب کا فارمولا
BCA ایبزوربانس کے نتائج سے نمونہ حجم کا حساب لگانے کے لیے بنیادی فارمولا یہ ہے:
جہاں:
- نمونہ حجم درکار نمونہ کا حجم ہے (مائیکرو لیٹر، μL میں)
- نمونہ ماس وہ مطلوبہ پروٹین کی مقدار ہے جو استعمال کرنا ہے (مائیکروگرام، μg میں)
- پروٹین کی مقدار BCA ایبزوربانس کی ریڈنگ سے حاصل کی جاتی ہے (μg/μL میں)
پروٹین کی مقدار کو ایبزوربانس کی ریڈنگ سے معیاری منحنی خطوط کے مساوات کا استعمال کرتے ہوئے حساب کیا جاتا ہے:
معیاری BCA ٹیسٹ کے لیے، عمومی ڈھلوان تقریباً 2.0 ہے، اور انٹرسیپٹ اکثر صفر کے قریب ہوتا ہے، حالانکہ یہ آپ کی مخصوص ٹیسٹ کی شرائط اور معیاری منحنی خطوط کی بنیاد پر مختلف ہو سکتے ہیں۔
BCA ایبزوربانس نمونہ حجم کیلکولیٹر کا استعمال کیسے کریں
ہمارا کیلکولیٹر BCA ٹیسٹ کے نتائج سے نمونہ حجم کا تعین کرنے کے عمل کو آسان بناتا ہے۔ درست حسابات حاصل کرنے کے لیے ان مراحل کی پیروی کریں:
-
نمونہ کی معلومات درج کریں:
- اپنے نمونہ کے لیے ایک نام فراہم کریں (اختیاری لیکن متعدد نمونوں کا ٹریک رکھنے کے لیے مددگار)
- اپنے اسپیکٹروفوٹومیٹر سے BCA ایبزوربانس کی ریڈنگ درج کریں
- اپنی مطلوبہ نمونہ ماس درج کریں (جو پروٹین آپ استعمال کرنا چاہتے ہیں μg میں)
-
معیاری منحنی خطوط کی قسم منتخب کریں:
- معیاری (ڈیفالٹ): روایتی BCA معیاری منحنی خطوط کے پیرامیٹرز کا استعمال کرتا ہے
- بڑھا ہوا: بڑھتی ہوئی حساسیت کے پروٹوکول کے لیے
- مائیکرو: مائیکرو پلیٹ پروٹوکول کے لیے
- حسب ضرورت: آپ کو اپنی ڈھلوان اور انٹرسیپٹ کی قیمتیں درج کرنے کی اجازت دیتا ہے
-
نتائج دیکھیں:
- کیلکولیٹر فوری طور پر مائیکرو لیٹر میں درکار نمونہ حجم دکھائے گا
- نتائج آسان حوالہ کے لیے ایک خلاصہ جدول میں بھی پیش کیے جاتے ہیں
- متعدد نمونوں کے لیے، آپ مزید اندراجات شامل کر سکتے ہیں اور نتائج کا موازنہ کر سکتے ہیں
-
نتائج کاپی یا برآمد کریں:
- نتائج کو اپنے لیب نوٹ بک یا دیگر ایپلی کیشنز میں منتقل کرنے کے لیے کاپی کے بٹن کا استعمال کریں
- تمام حسابات مستقبل کے حوالے کے لیے محفوظ کیے جا سکتے ہیں
مرحلہ وار مثال
آئیں ایک عملی مثال کے ذریعے چلتے ہیں:
- آپ نے ایک BCA ٹیسٹ کیا ہے اور اپنے پروٹین نمونہ کے لیے 0.75 کی ایبزوربانس کی ریڈنگ حاصل کی ہے۔
- آپ اپنے ویسٹرن بلٹ کے لیے 20 μg پروٹین لوڈ کرنا چاہتے ہیں۔
- معیاری منحنی خطوط (ڈھلوان = 2.0، انٹرسیپٹ = 0) کا استعمال کرتے ہوئے:
- پروٹین کی مقدار = 2.0 × 0.75 + 0 = 1.5 μg/μL
- درکار نمونہ حجم = 20 μg ÷ 1.5 μg/μL = 13.33 μL
اس کا مطلب ہے کہ آپ کو 20 μg پروٹین حاصل کرنے کے لیے اپنے نمونہ کا 13.33 μL لوڈ کرنا چاہئے۔
نتائج کو سمجھنا
کیلکولیٹر کئی اہم معلومات فراہم کرتا ہے:
-
پروٹین کی مقدار: یہ آپ کی ایبزوربانس کی ریڈنگ سے منتخب کردہ معیاری منحنی خطوط کا استعمال کرتے ہوئے حساب کی جاتی ہے۔ یہ آپ کے نمونہ میں ہر یونٹ حجم میں پروٹین کی مقدار کی نمائندگی کرتی ہے (μg/μL میں)۔
-
نمونہ حجم: یہ آپ کے نمونہ کا حجم ہے جس میں آپ کی مطلوبہ پروٹین کی مقدار موجود ہے۔ یہ وہ قیمت ہے جو آپ اپنے تجربات کی تیاری کرتے وقت استعمال کریں گے۔
-
خبرداریاں اور سفارشات: کیلکولیٹر مندرجہ ذیل کے لیے خبرداریاں فراہم کر سکتا ہے:
- بہت زیادہ ایبزوربانس کی ریڈنگ (>3.0) جو ٹیسٹ کی لکیری حد سے باہر ہو سکتی ہے
- بہت کم ایبزوربانس کی ریڈنگ (<0.1) جو پتہ لگانے کی حد کے قریب ہو سکتی ہے
- حساب کردہ حجم جو غیر عملی طور پر بڑے (>1000 μL) یا چھوٹے (<1 μL) ہیں
ایپلی کیشنز اور استعمال کے کیس
ویسٹرن بلٹ نمونہ کی تیاری
اس کیلکولیٹر کا ایک عام استعمال ویسٹرن بلٹنگ کے لیے نمونوں کی تیاری ہے۔ مستقل پروٹین لوڈنگ قابل اعتماد ویسٹرن بلٹ کے نتائج کے لیے بہت اہم ہے، اور یہ کیلکولیٹر یہ یقینی بناتا ہے کہ آپ ہر نمونہ کے لیے ایک ہی مقدار میں پروٹین لوڈ کریں، چاہے ان کی مقدار مختلف ہو۔
مثال کا ورک فلو:
- اپنے تمام پروٹین نمونوں پر BCA ٹیسٹ کریں
- لوڈ کرنے کے لیے ایک مستقل پروٹین مقدار کا انتخاب کریں (عام طور پر 10-50 μg)
- کیلکولیٹر کا استعمال کرتے ہوئے ہر نمونہ کے لیے درکار حجم کا تعین کریں
- نمونہ بفر اور کمی کرنے والے ایجنٹ کے مناسب حجم شامل کریں
- اپنے جیل پر حساب کردہ حجم لوڈ کریں
انزیمیٹک ٹیسٹ
انزیمیٹک ٹیسٹ کے لیے، اکثر پروٹین کی مخصوص مقدار کا استعمال ضروری ہوتا ہے تاکہ مختلف نمونوں یا تجربات کے درمیان ردعمل کی شرائط کو معیاری بنایا جا سکے۔
مثال کا ورک فلو:
- BCA ٹیسٹ کا استعمال کرتے ہوئے پروٹین کی مقدار کا تعین کریں
- مطلوبہ پروٹین کی مقدار حاصل کرنے کے لیے درکار حجم کا حساب لگائیں
- اس حجم کو اپنے ردعمل کے مرکب میں شامل کریں
- اپنے انزیمیٹک ٹیسٹ کے ساتھ آگے بڑھیں
امیون پریسیپٹیشن تجربات
امیون پریسیپٹیشن (IP) تجربات میں، ایک مستقل پروٹین کی مقدار کے ساتھ شروع کرنا نتائج کے موازنہ کے لیے اہم ہے۔
مثال کا ورک فلو:
- سیل یا بافتوں کے لائسٹس کے پروٹین کی مقدار کا تعین کریں BCA ٹیسٹ کا استعمال کرتے ہوئے
- تمام نمونوں کے لیے برابر پروٹین کی مقدار حاصل کرنے کے لیے حجم کا حساب لگائیں (عام طور پر 500-1000 μg)
- تمام نمونوں کو لائسز بفر کے ساتھ ایک ہی حجم میں ایڈجسٹ کریں
- اینٹی باڈی کی انکوبیشن اور پریسیپٹیشن کے ساتھ آگے بڑھیں
پروٹین کی صفائی
پروٹین کی صفائی کے دوران، مختلف مراحل پر پروٹین کی مقدار کا ٹریک رکھنا اکثر ضروری ہوتا ہے۔
مثال کا ورک فلو:
- صفائی کے دوران مختلف حصے جمع کریں
- منتخب حصوں پر BCA ٹیسٹ کریں
- پروٹین کی مقدار اور کل پروٹین کی مقدار کا تعین کریں
- اگلی ایپلی کیشنز کے لیے درکار حجم کا تعین کریں
جدید خصوصیات اور غور و خوض
حسب ضرورت معیاری منحنی خطوط
جبکہ کیلکولیٹر معیاری BCA ٹیسٹ کے لیے ڈیفالٹ پیرامیٹرز فراہم کرتا ہے، آپ اپنی معیاری منحنی خطوط تیار کرنے کے بعد اپنی مرضی کی قیمتیں بھی درج کر سکتے ہیں۔ یہ خاص طور پر اس وقت مفید ہے جب:
- غیر معیاری پروٹین نمونوں کے ساتھ کام کرنا
- ترمیم شدہ BCA پروٹوکول استعمال کرنا
- ایسے مادوں کی موجودگی میں کام کرنا جو ٹیسٹ میں مداخلت کر سکتے ہیں
حسب ضرورت معیاری منحنی خطوط استعمال کرنے کے لیے:
- معیاری منحنی خطوط کے اختیارات میں "حسب ضرورت" منتخب کریں
- اپنی ڈھلوان اور انٹرسیپٹ کی قیمتیں درج کریں
- کیلکولیٹر ان قیمتوں کو تمام بعد کے حسابات کے لیے استعمال کرے گا
متعدد نمونوں کو سنبھالنا
کیلکولیٹر آپ کو ایک ساتھ متعدد نمونوں کو شامل کرنے اور ان کے حجم کا حساب لگانے کی اجازت دیتا ہے۔ یہ خاص طور پر ان تجربات کے لیے مفید ہے جن میں مختلف حالات کے درمیان مستقل پروٹین لوڈنگ کی ضرورت ہوتی ہے۔
بیچ پروسیسنگ کے فوائد:
- ایک ہی وقت میں تمام حجم کا حساب لگانے سے وقت کی بچت
- آپ کے تمام نمونوں کے درمیان مستقل مزاجی کو یقینی بنانا
- آپ کے نمونوں کے درمیان پروٹین کی مقدار کا موازنہ کرنا آسان
- آؤٹ لائرز یا ممکنہ پیمائش کی غلطیوں کی شناخت کرنا
سرحدی معاملات سے نمٹنا
بہت زیادہ ایبزوربانس کی ریڈنگز
اگر آپ کی ایبزوربانس کی ریڈنگ 2.0 سے اوپر ہے، تو یہ BCA ٹیسٹ کی لکیری حد سے باہر ہو سکتی ہے۔ ایسے معاملات میں:
- اپنے نمونہ کو پتلا کریں اور BCA ٹیسٹ دوبارہ کریں
- متبادل طور پر، کیلکولیٹر کے انتباہی نظام کا استعمال کریں، جو ممکنہ طور پر مسئلہ والی ریڈنگز کو نشان زد کرے گا
بہت کم ایبزوربانس کی ریڈنگز
ایبزوربانس کی ریڈنگز 0.1 سے کم ہونے پر، آپ ٹیسٹ کی پتہ لگانے کی حد کے قریب ہو سکتے ہیں، جو درستگی کو متاثر کر سکتی ہے۔ غور کریں:
- اگر ممکن ہو تو اپنے نمونہ کو مرکوز کریں
- زیادہ حساس پروٹین مقدار کا تعین کرنے کے طریقہ کار کا استعمال کریں
- کم پروٹین کی مقدار کو ایڈجسٹ کرنے کے لیے اپنے تجرباتی ڈیزائن کو ایڈجسٹ کریں
غیر عملی طور پر بڑے حساب کردہ حجم
اگر کیلکولیٹر ایک ایسا حجم تجویز کرتا ہے جو آپ کی ایپلی کیشن کے لیے بہت بڑا ہے:
- اپنے پروٹین کے نمونہ کو مرکوز کرنے پر غور کریں
- اگر آپ کا تجربہ اجازت دیتا ہے تو اپنی مطلوبہ پروٹین کی مقدار کو نیچے کی طرف ایڈجسٹ کریں
- زیادہ سے زیادہ عملی حجم کا استعمال کریں اور نوٹ کریں کہ اصل میں استعمال ہونے والی پروٹین کی مقدار کیا ہے
پروٹین مقدار کا تعین کرنے کی تاریخ اور BCA ٹیسٹ
پروٹین کی درست مقدار کا تعین بایو کیمسٹری اور مالیکیولر بایولوجی میں ایک بنیادی ضرورت رہی ہے جب سے یہ شعبے ابھرتے ہیں۔ ابتدائی طریقے نائٹروجن کے مواد کے تعین پر انحصار کرتے تھے، جو وقت طلب اور خصوصی آلات کی ضرورت ہوتی تھی۔
پروٹین مقدار کے تعین کے طریقوں کی ترقی
-
کیجلڈال طریقہ (1883): پروٹین مقدار کا تعین کرنے کے لیے سب سے قدیم طریقوں میں سے ایک، جو نائٹروجن کے مواد کی پیمائش پر مبنی ہے۔
-
بایورٹ ٹیسٹ (اوائل 1900): یہ طریقہ پیپٹائڈ بانڈز اور کاپر آئنز کے درمیان تعامل پر انحصار کرتا ہے، جو ایک جامنی رنگ پیدا کرتا ہے۔
-
لووری ٹیسٹ (1951): اولیور لووری کے ذریعہ تیار کردہ، یہ طریقہ بایورٹ ردعمل کو فولین-سیوکالٹیو ریجنٹ کے ساتھ ملا کر حساسیت کو بڑھاتا ہے۔
-
برڈفورڈ ٹیسٹ (1976): میریون برڈفورڈ نے اس طریقہ کار کو تیار کیا جو پروٹین کے ساتھ کوماسے برلینٹ بلیو G-250 رنگ کا استعمال کرتا ہے، جو پروٹین کے ساتھ بندھتا ہے اور جذب کی زیادہ سے زیادہ مقدار کو منتقل کرتا ہے۔
-
BCA ٹیسٹ (1985): یہ طریقہ پال اسمتھ اور پیئرس کیمیکل کمپنی کے ساتھیوں کے ذریعہ تیار کیا گیا، اس طریقے نے بایورٹ ردعمل کو BCA پتہ لگانے کے ساتھ ملا کر حساسیت اور مختلف کیمیکلز کے ساتھ مطابقت کو بہتر بنایا۔
BCA ٹیسٹ کی ترقی
BCA ٹیسٹ کا پہلا ذکر 1985 کے ایک مقالے میں ہوا جس کا عنوان ہے "Measurement of protein using bicinchoninic acid." یہ موجودہ طریقوں کی حدود کو حل کرنے کے لیے تیار کیا گیا، خاص طور پر پروٹین نکالنے اور صفائی میں عام طور پر استعمال ہونے والے مختلف کیمیکلز سے مداخلت۔
اہم جدت یہ تھی کہ پروٹین کی کمی کے ذریعے پیدا ہونے والے Cu²⁺ کو کم کرنے کے لیے بائیکنچونک ایسڈ کا استعمال کیا جائے، جو ایک جامنی رنگ کے کمپلیکس کی تشکیل کرتا ہے جسے اسپیکٹروفوٹومیٹرک طور پر ناپا جا سکتا ہے۔ اس نے کئی فوائد فراہم کیے:
- بایورٹ طریقے سے زیادہ حساسیت
- لووری طریقے کے مقابلے میں غیر پروٹین مادوں کی مداخلت کے لیے کم حساس
- برڈفورڈ ٹیسٹ کے مقابلے میں سرفیکٹینٹس کے ساتھ بہتر مطابقت
- کم مراحل اور کیمیکلز کے ساتھ آسان پروٹوکول
اپنی متعارف کرانے کے بعد، BCA ٹیسٹ بایو کیمسٹری اور مالیکیولر بایولوجی کی لیبارٹریز میں پروٹین مقدار کا تعین کرنے کے سب سے زیادہ استعمال ہونے والے طریقوں میں سے ایک بن گیا ہے۔
نمونہ حجم کے حساب کے لیے کوڈ کے نمونے
ایکسل فارمولا
1=IF(B2<=0,"غلطی: نامناسب ایبزوربانس",IF(C2<=0,"غلطی: نامناسب نمونہ ماس",C2/(2*B2)))
2
3' جہاں:
4' B2 ایبزوربانس کی ریڈنگ ہے
5' C2 مطلوبہ نمونہ ماس μg میں ہے
6' یہ فارمولا درکار نمونہ حجم μL میں واپس کرتا ہے
7
پائتھون کا نفاذ
1import numpy as np
2import matplotlib.pyplot as plt
3
4def calculate_protein_concentration(absorbance, slope=2.0, intercept=0):
5 """ایبزوربانس سے پروٹین کی مقدار کا حساب لگائیں معیاری منحنی خطوط کا استعمال کرتے ہوئے۔"""
6 if absorbance < 0:
7 raise ValueError("ایبزوربانس منفی نہیں ہو سکتی")
8 return (slope * absorbance) + intercept
9
10def calculate_sample_volume(absorbance, sample_mass, slope=2.0, intercept=0):
11 """ایبزوربانس، نمونہ ماس اور معیاری منحنی خطوط کا استعمال کرتے ہوئے درکار نمونہ حجم کا حساب لگائیں۔"""
12 if sample_mass <= 0:
13 raise ValueError("نمونہ ماس مثبت ہونی چاہیے")
14
15 protein_concentration = calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept)
16
17 if protein_concentration <= 0:
18 raise ValueError("حساب کردہ پروٹین کی مقدار مثبت ہونی چاہیے")
19
20 return sample_mass / protein_concentration
21
22# مثال کا استعمال
23absorbance = 0.75
24sample_mass = 20 # μg
25slope = 2.0
26intercept = 0
27
28try:
29 volume = calculate_sample_volume(absorbance, sample_mass, slope, intercept)
30 print(f"ایبزوربانس {absorbance} اور مطلوبہ پروٹین ماس {sample_mass} μg کے لیے:")
31 print(f"پروٹین کی مقدار: {calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept):.2f} μg/μL")
32 print(f"درکار نمونہ حجم: {volume:.2f} μL")
33except ValueError as e:
34 print(f"غلطی: {e}")
35
R کوڈ برائے تجزیہ
1# ایبزوربانس سے پروٹین کی مقدار کا حساب لگانے کے لیے فنکشن
2calculate_protein_concentration <- function(absorbance, slope = 2.0, intercept = 0) {
3 if (absorbance < 0) {
4 stop("ایبزوربانس منفی نہیں ہو سکتی")
5 }
6 return((slope * absorbance) + intercept)
7}
8
9# نمونہ حجم کا حساب لگانے کے لیے فنکشن
10calculate_sample_volume <- function(absorbance, sample_mass, slope = 2.0, intercept = 0) {
11 if (sample_mass <= 0) {
12 stop("نمونہ ماس مثبت ہونی چاہیے")
13 }
14
15 protein_concentration <- calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept)
16
17 if (protein_concentration <= 0) {
18 stop("حساب کردہ پروٹین کی مقدار مثبت ہونی چاہیے")
19 }
20
21 return(sample_mass / protein_concentration)
22}
23
24# مثال کا استعمال
25absorbance <- 0.75
26sample_mass <- 20 # μg
27slope <- 2.0
28intercept <- 0
29
30tryCatch({
31 volume <- calculate_sample_volume(absorbance, sample_mass, slope, intercept)
32 protein_concentration <- calculate_protein_concentration(absorbance, slope, intercept)
33
34 cat(sprintf("ایبزوربانس %.2f اور مطلوبہ پروٹین ماس %.2f μg کے لیے:\n", absorbance, sample_mass))
35 cat(sprintf("پروٹین کی مقدار: %.2f μg/μL\n", protein_concentration))
36 cat(sprintf("درکار نمونہ حجم: %.2f μL\n", volume))
37}, error = function(e) {
38 cat(sprintf("غلطی: %s\n", e$message))
39})
40
جاوا اسکرپٹ کا نفاذ
1function calculateProteinConcentration(absorbance, slope = 2.0, intercept = 0) {
2 if (absorbance < 0) {
3 throw new Error("ایبزوربانس منفی نہیں ہو سکتی");
4 }
5 return (slope * absorbance) + intercept;
6}
7
8function calculateSampleVolume(absorbance, sampleMass, slope = 2.0, intercept = 0) {
9 if (sampleMass <= 0) {
10 throw new Error("نمونہ ماس مثبت ہونی چاہیے");
11 }
12
13 const proteinConcentration = calculateProteinConcentration(absorbance, slope, intercept);
14
15 if (proteinConcentration <= 0) {
16 throw new Error("حساب کردہ پروٹین کی مقدار مثبت ہونی چاہیے");
17 }
18
19 return sampleMass / proteinConcentration;
20}
21
22// مثال کا استعمال
23try {
24 const absorbance = 0.75;
25 const sampleMass = 20; // μg
26 const slope = 2.0;
27 const intercept = 0;
28
29 const proteinConcentration = calculateProteinConcentration(absorbance, slope, intercept);
30 const volume = calculateSampleVolume(absorbance, sampleMass, slope, intercept);
31
32 console.log(`ایبزوربانس ${absorbance} اور مطلوبہ پروٹین ماس ${sampleMass} μg کے لیے:`);
33 console.log(`پروٹین کی مقدار: ${proteinConcentration.toFixed(2)} μg/μL`);
34 console.log(`درکار نمونہ حجم: ${volume.toFixed(2)} μL`);
35} catch (error) {
36 console.error(`غلطی: ${error.message}`);
37}
38
معیاری منحنی خطوط کی بصری نمائندگی
ایبزوربانس اور پروٹین کی مقدار کے درمیان تعلق عام طور پر ایک خاص حد میں لکیری ہوتا ہے۔ ذیل میں BCA منحنی خطوط کی بصری نمائندگی ہے:
<text x="150" y="370">0.5</text>
<line x1="150" y1="350" x2="150" y2="355" stroke="#64748b"/>
<text x="250" y="370">1.0</text>
<line x1="250" y1="350" x2="250" y2="355" stroke="#64748b"/>
<text x="350" y="370">1.5</text>
<line x1="350" y1="350" x2="350" y2="355" stroke="#64748b"/>
<text x="450" y="370">2.0</text>
<line x1="450" y1="350" x2="450" y2="355" stroke="#64748b"/>
<text x="550" y="370">2.5</text>
<line x1="550" y1="350" x2="550" y2="355" stroke="#64748b"/>
<text x="45" y="300">1.0</text>
<line x1="45" y1="300" x2="50" y2="300" stroke="#64748b"/>
<text x="45" y="250">2.0</text>
<line x1="45" y1="250" x2="50" y2="250" stroke="#64748b"/>
<text x="45" y="200">3.0</text>
<line x1="45" y1="200" x2="50" y2="200" stroke="#64748b"/>
<text x="45" y="150">4.0</text>
<line x1="45" y1="150" x2="50" y2="150" stroke="#64748b"/>
<text x="45" y="100">5.0</text>
<line x1="45" y1="100" x2="50" y2="100" stroke="#64748b"/>
<text x="45" y="50">6.0</text>
<line x1="45" y1="50" x2="50" y2="50" stroke="#64748b"/>
دیگر پروٹین مقدار کے تعین کے طریقوں کے ساتھ موازنہ
مختلف پروٹین مقدار کے تعین کے طریقوں کے مختلف فوائد اور حدود ہیں۔ یہ دیکھیں کہ BCA ٹیسٹ دوسرے عام طریقوں کے ساتھ کیسے موازنہ کرتا ہے:
طریقہ | حساسیت کی حد | فوائد | حدود | بہترین کے لیے |
---|---|---|---|---|
BCA ٹیسٹ | 5-2000 μg/mL | • سرفیکٹینٹس کے ساتھ ہم آہنگ • پروٹین سے پروٹین کی مختلف قسم کم • رنگ کی ترقی مستحکم | • کمی کرنے والے ایجنٹوں سے متاثر • کچھ چیلٹنگ ایجنٹوں سے متاثر | • عمومی پروٹین مقدار کا تعین • سرفیکٹینٹس پر مشتمل نمونے |
برڈفورڈ ٹیسٹ | 1-1500 μg/mL | • تیز (2-5 منٹ) • چند مداخلت کرنے والے مادے | • پروٹین سے پروٹین کی مختلف قسم زیادہ • سرفیکٹینٹس کے ساتھ ہم آہنگ نہیں | • فوری پیمائش • سرفیکٹینٹس سے پاک نمونے |
لووری طریقہ | 1-1500 μg/mL | • اچھی طرح سے قائم • اچھی حساسیت | • بہت سے مداخلت کرنے والے مادے • متعدد مراحل | • تاریخی مستقل مزاجی • خالص پروٹین نمونے |
UV ایبزوربانس (280 nm) | 20-3000 μg/mL | • غیر تخریبی • بہت تیز • کوئی کیمیکلز کی ضرورت نہیں | • نیوکلیک ایسڈ سے متاثر • خالص نمونوں کی ضرورت | • خالص پروٹین حل • صفائی کے دوران فوری چیک |
فلورومیٹرک | 0.1-500 μg/mL | • سب سے زیادہ حساسیت • وسیع متحرک حد | • مہنگے کیمیکلز • فلورومیٹر کی ضرورت | • بہت پتلے نمونے • محدود نمونہ حجم |
اکثر پوچھے جانے والے سوالات
BCA ٹیسٹ کا استعمال کیا ہے؟
BCA (بائیکنچونک ایسڈ) ٹیسٹ بنیادی طور پر کسی نمونہ میں پروٹین کی کل مقدار کا تعین کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ یہ بایو کیمسٹری، سیل بایولوجی، اور مالیکیولر بایولوجی میں ویسٹرن بلٹنگ، انزیمیٹک ٹیسٹ، امیون پریسیپٹیشن، اور پروٹین صفائی جیسے ایپلی کیشنز کے لیے وسیع پیمانے پر استعمال ہوتا ہے۔
BCA ٹیسٹ کی درستگی کتنی ہے؟
BCA ٹیسٹ عام طور پر 5-10% کے اندر درست ہے جب صحیح طریقے سے کیا جائے۔ اس کی درستگی کئی عوامل پر منحصر ہے جن میں معیاری منحنی خطوط کا معیار، مداخلت کرنے والے مادوں کی عدم موجودگی، اور یہ کہ آیا نامعلوم پروٹین کا مرکب معیاری پروٹین کے ساتھ ملتا ہے جو استعمال کیا گیا ہے۔
BCA ٹیسٹ کے نتائج میں کیا چیزیں مداخلت کر سکتی ہیں؟
کئی مادے BCA ٹیسٹ کے نتائج میں مداخلت کر سکتے ہیں، بشمول:
- کمی کرنے والے ایجنٹ (DTT، β-مرکاپٹوایتھانول، گلوتھا آئن)
- چیلٹنگ ایجنٹ (EDTA، EGTA)
- سادہ شکر کی زیادہ مقدار
- چربی
- کچھ سرفیکٹینٹس کی زیادہ مقدار
- امونیا کے مرکبات
BCA اور برڈفورڈ ٹیسٹ میں کیا فرق ہے؟
اہم فرق یہ ہیں:
- BCA ٹیسٹ سرفیکٹینٹس اور سرفیکٹینٹس کے ساتھ زیادہ ہم آہنگ ہے
- برڈفورڈ ٹیسٹ تیز ہے (2-5 منٹ بمقابلہ BCA کے لیے 30+ منٹ)
- BCA میں پروٹین سے پروٹین کی مختلف قسم کم ہے
- برڈفورڈ زیادہ بنیادی امینو ایسڈز کے لیے زیادہ حساس ہے
- BCA کمی کرنے والے ایجنٹوں سے متاثر ہے، جبکہ برڈفورڈ نہیں ہے
اگر میرا حساب کردہ نمونہ حجم بہت بڑا ہے تو کیا کروں؟
اگر آپ کا کیلکولیٹر ایک بہت بڑا نمونہ حجم دکھاتا ہے تو یہ عام طور پر آپ کے نمونہ میں پروٹین کی کم مقدار کی نشاندہی کرتا ہے۔ یہ درج ذیل کی وجہ سے ہو سکتا ہے:
- آپ کے اصل نمونہ میں واقعی کم پروٹین مواد
- تیاری کے دوران پروٹین کا نقصان
- BCA ٹیسٹ کے طریقہ کار میں غلطیاں
- ایبزوربانس کی ریڈنگ میں غلطیاں
اپنے نمونہ کو مرکوز کرنے یا اپنی تجرباتی ڈیزائن کو کم پروٹین کی مقدار کو ایڈجسٹ کرنے پر غور کریں۔
کیا میں اس کیلکولیٹر کا استعمال دوسرے پروٹین مقدار کے تعین کے طریقوں کے لیے کر سکتا ہوں؟
یہ کیلکولیٹر خاص طور پر BCA ٹیسٹ کے نتائج کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔ جبکہ بنیادی اصول (مقدار کو حجم میں تبدیل کرنا) دوسرے طریقوں کے لیے لاگو ہوتا ہے، ایبزوربانس اور پروٹین کی مقدار کے درمیان تعلق مختلف ٹیسٹوں کے درمیان مختلف ہوتا ہے۔ دوسرے طریقوں جیسے برڈفورڈ یا لووری کے لیے، آپ کو مختلف معیاری منحنی خطوط کے پیرامیٹرز کا استعمال کرنے کی ضرورت ہوگی۔
اگر میرے نمونوں کی ایبزوربانس لکیری حد سے باہر ہو تو میں کیا کروں؟
ایبزوربانس کی ریڈنگز جو لکیری حد سے باہر ہیں (عام طور پر >2.0):
- اپنے نمونہ کو پتلا کریں اور BCA ٹیسٹ دوبارہ کریں
- کسی دوسرے پروٹین مقدار کے تعین کے طریقے کا استعمال کریں
- معیاری منحنی خطوط کو ایڈجسٹ کریں تاکہ زیادہ مقدار کے معیاری شامل ہوں
مجھے کس پروٹین کو معیاری کے طور پر استعمال کرنا چاہیے؟
بیوائن سیرم البومین (BSA) BCA ٹیسٹ کے لیے سب سے زیادہ استعمال ہونے والا معیاری ہے کیونکہ یہ:
- آسانی سے دستیاب اور سستا
- انتہائی حل پذیر
- حل میں مستحکم
- اچھی طرح سے بیان کردہ
تاہم، اگر آپ کے نمونے میں ایک غالب پروٹین ہو جو BSA سے نمایاں طور پر مختلف ہو، تو اس پروٹین کو اپنے معیاری کے طور پر استعمال کرنے پر غور کریں تاکہ زیادہ درست نتائج حاصل ہوں۔
BCA ردعمل کتنی دیر تک مستحکم رہتا ہے؟
BCA ردعمل میں تیار کردہ جامنی رنگ کئی گھنٹوں تک کمرے کے درجہ حرارت پر مستحکم رہتا ہے اور اس مدت کے دوران کسی بھی وقت ناپا جا سکتا ہے۔ تاہم، بہترین نتائج کے لیے یہ تجویز کیا جاتا ہے کہ آپ تمام معیاری اور نمونوں کی پیمائش تقریباً ایک ہی وقت میں کریں جب رنگ کی ترقی ہو۔
کیا میں پچھلے تجربے سے معیاری منحنی خطوط کو دوبارہ استعمال کر سکتا ہوں؟
جبکہ یہ تکنیکی طور پر ممکن ہے کہ معیاری منحنی خطوط کو دوبارہ استعمال کریں، یہ درست مقدار کے لیے تجویز نہیں کیا جاتا۔ کیمیکلز، انکیوبیشن کی شرائط، اور آلات کی کیلیبریشن میں مختلف تبدیلیاں ایبزوربانس اور پروٹین کی مقدار کے درمیان تعلق کو متاثر کر سکتی ہیں۔ قابل اعتماد نتائج کے لیے، ہر بار جب آپ ٹیسٹ کرتے ہیں تو ایک تازہ معیاری منحنی خطوط تیار کریں۔
حوالہ جات
-
اسمتھ PK، کروہن RI، ہرمنسن GT، وغیرہ۔ "بائیکنچونک ایسڈ کا استعمال کرتے ہوئے پروٹین کی مقدار کا تعین۔" تجزیاتی بایو کیمسٹری۔ 1985؛150(1):76-85۔ doi:10.1016/0003-2697(85)90442-7
-
تھرمو سائنٹیفک۔ "پیئرس BCA پروٹین ٹیسٹ کٹ۔" ہدایات۔ دستیاب ہے: https://www.thermofisher.com/document-connect/document-connect.html?url=https%3A%2F%2Fassets.thermofisher.com%2FTFS-Assets%2FLSG%2Fmanuals%2FMAN0011430_Pierce_BCA_Protein_Asy_UG.pdf
-
واکر JM۔ "بائیکنچونک ایسڈ (BCA) ٹیسٹ پروٹین کی مقدار کے تعین کے لیے۔" میں: واکر JM، ایڈ۔ پروٹین پروٹوکولز ہینڈ بک۔ اسپرنگر؛ 2009:11-15۔ doi:10.1007/978-1-59745-198-7_3
-
اولسن BJ، مارک ویل J۔ "پروٹین کی مقدار کا تعین کرنے کے طریقے۔" موجودہ پروٹوکولز ان پروٹین سائنس۔ 2007؛باب 3:یونٹ 3.4۔ doi:10.1002/0471140864.ps0304s48
-
نوبل JE، بیلی MJ۔ "پروٹین کی مقدار کا تعین۔" طریقے انزیمیولوجی۔ 2009؛463:73-95۔ doi:10.1016/S0076-6879(09)63008-1
آج ہی ہمارا BCA ایبزوربانس نمونہ حجم کیلکولیٹر آزمائیں!
اب جب کہ آپ BCA پروٹین مقدار کا تعین کرنے اور نمونہ حجم کے حساب کے پیچھے کے اصولوں کو سمجھتے ہیں، تو ہمارے کیلکولیٹر کو آزمائیں تاکہ آپ کی لیبارٹری کے ورک فلو کو ہموار کیا جا سکے۔ بس اپنی ایبزوربانس کی ریڈنگز اور مطلوبہ نمونہ ماس درج کریں تاکہ فوری، درست نمونہ حجم کے حسابات حاصل کریں۔
چاہے آپ ویسٹرن بلٹنگ، انزیمیٹک ٹیسٹ، یا کسی دوسرے پروٹین پر مبنی تجربے کے لیے نمونے تیار کر رہے ہوں، ہمارا کیلکولیٹر مستقل اور قابل اعتماد نتائج کو یقینی بنانے میں مدد کرے گا۔ وقت کی بچت کریں، غلطیوں کو کم کریں، اور اپنے تجربات کی دوبارہ پیداوار کو بہتر بنائیں BCA ایبزوربانس نمونہ حجم کیلکولیٹر کے ساتھ۔
متعلقہ اوزار
آپ کے ورک فلو کے لیے مفید ہونے والے مزید ٹولز کا انعام کریں