Praćenje genetskih varijacija: Izračunajte frekvenciju alela u populacijama

Izračunajte frekvenciju specifičnih alela (varijanti gena) unoseći ukupan broj pojedinaca i instance alela. Osnovno za populacionu genetiku, evolucijsku biologiju i studije genetske raznolikosti.

Трacker генетских варијација

Овај алат израчунава учесталост специфичних алела (варијанти гена) у одређеној популацији. Унесите укупан број појединаца у популацији и број примерака специфичног алела да бисте израчунали његову учесталост.

Улазни подаци

Укупно број појединаца у популацији*

Број примерака специфичног алела*

Резултати

Учесталост алела

Copy

0.2500

Формула за израчунавање

f = 50 / (100 × 2) = 0.2500

Визуелизација учесталости алела

Population Representation

Target Allele

Other Alleles

📚

Dokumentacija

Traker genetske varijacije: Kalkulator frekvencije alela

Uvod

Traker genetske varijacije je specijalizovani alat dizajniran za izračunavanje frekvencije alela unutar populacije. Frekvencija alela predstavlja proporciju specifične varijante gena (alel) među svim kopijama tog gena u populaciji, služeći kao osnovno merenje u populacionoj genetici. Ovaj kalkulator pruža jednostavan metod za određivanje koliko su specifične genetske varijante uobičajene unutar grupe, što je od suštinskog značaja za razumevanje genetske raznolikosti, evolucije i rizika od bolesti u populacijama. Bilo da ste student koji uči o genetskim principima, istraživač koji analizira podatke populacije ili zdravstveni radnik koji proučava prevalenciju bolesti, ovaj alat nudi jednostavan, ali moćan način za kvantifikaciju genetske varijacije.

Šta je frekvencija alela?

Frekvencija alela se odnosi na relativnu proporciju specifičnog alela (varijante gena) među svim alelima na tom genetskom lokusu u populaciji. U većini organizama, uključujući ljude, svaka jedinka nosi dve kopije svakog gena (jednu nasleđenu od svakog roditelja), čineći ih diploidnim organizmima. Stoga, u populaciji od N jedinki, postoji 2N kopija svakog gena.

Frekvencija alela se izračunava korišćenjem sledeće formule:

$f = \frac{n_A}{2N}$

Gde:

$f$ je frekvencija alela
$n_A$ je broj instanci specifičnog alela u populaciji
$N$ je ukupan broj jedinki u populaciji
$2N$ predstavlja ukupan broj alela u populaciji (za diploidne organizme)

Na primer, ako imamo 100 jedinki u populaciji, i zabeleženo je 50 instanci određenog alela, frekvencija bi bila:

$f = \frac{50}{2 \times 100} = \frac{50}{200} = 0.25 \text{ ili } 25\%$

To znači da 25% svih alela na ovom genetskom lokusu u populaciji pripada ovoj specifičnoj varijanti.

Kako koristiti Traker genetske varijacije

Naš Kalkulator frekvencije alela je dizajniran da bude intuitivan i jednostavan za korišćenje. Pratite ove jednostavne korake da izračunate frekvenciju specifičnog alela u vašoj populaciji:

Unesite ukupan broj jedinki u populaciji u prvo polje za unos.
- Ovo treba da bude pozitivni ceo broj.
- Na primer, ako proučavate 100 ljudi, unesite "100".
Unesite broj instanci specifičnog alela koji pratite u drugom polju za unos.
- Ovo treba da bude nenegativni ceo broj.
- Za diploidne organizme, ovaj broj ne može premašiti dvostruko od broja jedinki.
- Na primer, ako je 30 ljudi u vašoj populaciji od 100 heterozigotno (imaju jednu kopiju alela) i 10 je homozigotno (imaju dve kopije), uneli biste "50" (30 + 20).
Pogledajte izračunatu frekvenciju alela prikazanu u sekciji rezultata.
- Rezultat se prikazuje kao decimalni broj između 0 i 1.
- Na primer, rezultat od 0.25 znači da alel pojavljuje u 25% mogućih kopija gena u populaciji.
Istražite vizualizaciju da biste videli grafički prikaz raspodele alela.
Koristite dugme za kopiranje da kopirate rezultat u vaš međuspremnik za korišćenje u izveštajima ili daljoj analizi.

Validacija unosa

Kalkulator vrši nekoliko provera validacije kako bi osigurao tačne rezultate:

Veličina populacije mora biti pozitivna: Broj jedinki mora biti veći od nule.
Instance alela moraju biti nenegativne: Broj instanci alela ne može biti negativan.
Maksimalne instance alela: Za diploidne organizme, broj instanci alela ne može premašiti dvostruko od broja jedinki (2N).

Ako neka od ovih validacija ne uspe, poruka o grešci će vas uputiti da ispravite svoj unos.

Razumevanje rezultata

Rezultat frekvencije alela se prikazuje kao decimalna vrednost između 0 i 1, gde:

0 (0%) označava da je alel potpuno odsutan iz populacije.
1 (100%) označava da je alel prisutan u svim mogućim kopijama gena u populaciji.

Na primer:

Frekvencija od 0.5 (50%) znači da je alel prisutan u polovini svih kopija gena.
Frekvencija od 0.05 (5%) ukazuje na relativno retki alel.
Frekvencija od 0.95 (95%) sugeriše da je alel veoma uobičajen, gotovo dostigao fiksaciju.

Kalkulator takođe pruža vizuelni prikaz frekvencije kako bi vam pomogao da tumačite rezultate na prvi pogled.

Metode i formule za izračunavanje

Osnovno izračunavanje frekvencije alela

Za diploidne organizme (poput ljudi), osnovna formula za izračunavanje frekvencije alela je:

$f = \frac{n_A}{2N}$

Gde:

$f$ je frekvencija alela A
$n_A$ je broj instanci alela A
$N$ je broj jedinki u populaciji
$2N$ je ukupan broj alela (pošto svaka jedinka ima 2 kopije)

Alternativne metode izračunavanja

Postoji nekoliko načina za izračunavanje frekvencije alela u zavisnosti od dostupnih podataka:

1. Iz broja genotipova

Ako znate broj jedinki sa svakim genotipom, možete izračunati:

$f_A = \frac{2 \times n_{AA} + n_{AB}}{2N}$

Gde:

$f_A$ je frekvencija alela A
$n_{AA}$ je broj jedinki homozigotnih za alel A
$n_{AB}$ je broj jedinki heterozigotnih (imaju i A i drugi alel)
$N$ je ukupan broj jedinki

2. Iz frekvencija genotipova

Ako znate frekvencije svakog genotipa:

$f_A = f_{AA} + \frac{f_{AB}}{2}$

Gde:

$f_A$ je frekvencija alela A
$f_{AA}$ je frekvencija genotipa AA
$f_{AB}$ je frekvencija genotipa AB

Rukovanje različitim nivoima ploidije

Dok je naš kalkulator dizajniran za diploidne organizme, koncept se može proširiti na organizme sa različitim nivoima ploidije:

Haploidni organizmi (1 kopija svakog gena): $f = \frac{n_A}{N}$
Triploidni organizmi (3 kopije svakog gena): $f = \frac{n_A}{3N}$
Tetraploidni organizmi (4 kopije svakog gena): $f = \frac{n_A}{4N}$

Upotrebe za izračunavanje frekvencije alela

Istraživanje populacione genetike

Frekvencije alela su osnovne u istraživanju populacione genetike za:

Praćenje genetske raznolikosti unutar i između populacija
- Veća genetska raznolikost (više alela sa umerenim frekvencijama) obično ukazuje na zdraviju populaciju
- Niska raznolikost može sugerisati genetske uske grlo ili efekte osnivača
Proučavanje evolucionih procesa
- Promene u frekvencijama alela tokom vremena mogu ukazivati na prirodnu selekciju
- Stabilne frekvencije mogu sugerisati uravnoteženu selekciju ili genetski drift
Analizu protoka gena između populacija
- Slične frekvencije alela između populacija mogu ukazivati na protok gena
- Različite frekvencije mogu sugerisati reproduktivnu izolaciju
Istraživanje genetskog drifta
- Nasumične promene u frekvencijama alela u malim populacijama
- Posebno važno u konzervacijskoj genetici ugroženih vrsta

Medicinske genetske aplikacije

Podaci o frekvenciji alela su ključni u medicinskoj genetici za:

Procenu rizika od bolesti
- Veće frekvencije alela povezanih sa bolestima u određenim populacijama
- Pomaže u ciljanju programa skrininga na populacije sa visokim rizikom
Farmakogenetiku
- Frekvencije alela koji utiču na metabolizam lekova
- Usmerava smernice za doziranje lekova specifične za populaciju
Genetsko savetovanje
- Pruža osnovne procene rizika za genetske poremećaje
- Pomaže u tumačenju značaja rezultata genetskog testiranja
Planiranje javnog zdravlja
- Predviđanje opterećenja bolesti u populacijama
- Alokacija resursa za genetsko testiranje i lečenje

Poljoprivredne i konzervacione aplikacije

Izračunavanje frekvencije alela je korisno u:

Uzgoju useva i stoke
- Praćenje korisnih osobina u uzgojnim populacijama
- Održavanje genetske raznolikosti u poljoprivrednim vrstama
Konzervaciji ugroženih vrsta
- Praćenje genetskog zdravlja malih populacija
- Planiranje programa uzgoja za maksimizaciju genetske raznolikosti
Upravljanju invazivnim vrstama
- Razumevanje genetske strukture invazivnih populacija
- Identifikacija izvornih populacija i puteva invazije

Obrazovne postavke

Traker genetske varijacije je odličan obrazovni alat za:

Podučavanje osnovnim genetskim principima
- Prikazuje obrasce nasleđivanja
- Ilustruje koncepte genetske raznolikosti na nivou populacije
Laboratorijske vežbe
- Omogućava studentima da analiziraju stvarne ili simulirane genetske podatke
- Pruža praktično iskustvo sa izračunavanjem u populacionoj genetici

Alternativa frekvenciji alela

Dok je frekvencija alela osnovno merenje u populacionoj genetici, nekoliko alternativnih ili komplementarnih metrika može pružiti dodatne uvide:

Frekvencija genotipa
- Merenje proporcije jedinki sa specifičnim genotipom
- Korisno za direktno procenjivanje raspodele fenotipa kada je uključena dominacija
Heterozigotnost
- Merenje proporcije heterozigotnih jedinki u populaciji
- Indikator genetske raznolikosti i ukrštanja
Indeks fiksacije (FST)
- Merenje diferencijacije populacija zbog genetske strukture
- Ranges from 0 (no differentiation) to 1 (complete differentiation)
Efektivna veličina populacije (Ne)
- Procena broja reproduktivnih jedinki u idealnoj populaciji
- Pomaže u predviđanju stope genetskog drifta i gubitka genetske varijacije
Linkage disequilibrium
- Merenje nenamenskog udruživanja alela na različitim lokusima
- Korisno za mapiranje gena i razumevanje istorije populacije

Istorijski kontekst izračunavanja frekvencije alela

Koncept frekvencije alela ima bogatu istoriju u oblasti genetike i bio je fundamentalni za naše razumevanje nasleđivanja i evolucije.

Rani razvoj

Osnova za razumevanje frekvencija alela postavljena je početkom 20. veka:

1908: G.H. Hardy i Wilhelm Weinberg su nezavisno izveli ono što je postalo poznato kao Hardy-Weinbergov princip, koji opisuje odnos između frekvencija alela i genotipa u ne-evoluirajućoj populaciji.
1918: R.A. Fisher je objavio svoj revolucionarni rad o "Korelaciji između srodnika pod pretpostavkom Mendelovskog nasleđivanja", koji je pomogao da se uspostavi oblast populacione genetike pomirenjem Mendelovskog nasleđivanja sa kontinuiranom varijacijom.
1930-ih: Sewall Wright, R.A. Fisher i J.B.S. Haldane su razvili matematičku osnovu populacione genetike, uključujući modele za to kako se frekvencije alela menjaju tokom vremena zbog selekcije, mutacije, migracije i genetskog drifta.

Savremeni razvoj

Studija frekvencija alela značajno je evoluirala sa tehnološkim napretkom:

1950-ih-1960-ih: Otkriće polimorfizama proteina omogućilo je direktno merenje genetske varijacije na molekularnom nivou.
1970-ih-1980-ih: Razvoj analize dužine restrikcionih fragmenata (RFLP) omogućio je detaljnije proučavanje genetske varijacije.
1990-ih-2000-ih: Projekat ljudskog genoma i kasniji napredak u tehnologiji sekvenciranja DNK revolucionisali su našu sposobnost merenja frekvencija alela širom celih genoma.
2010-ih-do danas: Veliki genomski projekti poput 1000 Genoma i studije asocijacije širom genoma (GWAS) stvorili su sveobuhvatne kataloge ljudske genetske varijacije i frekvencija alela širom raznih populacija.

Danas, izračunavanje frekvencije alela ostaje centralno u brojnim oblastima, od evolucione biologije do personalizovane medicine, i nastavlja da koristi sve sofisticiranije računarske alate i statističke metode.

Primeri koda za izračunavanje frekvencije alela

Excel

1' Excel formula for calculating allele frequency
2' Place in cell with number of allele instances in A1 and number of individuals in B1
3=A1/(B1*2)
4
5' Excel VBA function for calculating allele frequency
6Function AlleleFrequency(instances As Integer, individuals As Integer) As Double
7    ' Validate inputs
8    If individuals <= 0 Then
9        AlleleFrequency = CVErr(xlErrValue)
10        Exit Function
11    End If
12    
13    If instances < 0 Or instances > individuals * 2 Then
14        AlleleFrequency = CVErr(xlErrValue)
15        Exit Function
16    End If
17    
18    ' Calculate frequency
19    AlleleFrequency = instances / (individuals * 2)
20End Function
21

Python

1def calculate_allele_frequency(instances, individuals):
2    """
3    Calculate the frequency of a specific allele in a population.
4    
5    Parameters:
6    instances (int): Number of instances of the specific allele
7    individuals (int): Total number of individuals in the population
8    
9    Returns:
10    float: The allele frequency as a value between 0 and 1
11    """
12    # Validate inputs
13    if individuals <= 0:
14        raise ValueError("Number of individuals must be positive")
15    
16    if instances < 0:
17        raise ValueError("Number of instances cannot be negative")
18    
19    if instances > individuals * 2:
20        raise ValueError("Number of instances cannot exceed twice the number of individuals")
21    
22    # Calculate frequency
23    return instances / (individuals * 2)
24
25# Example usage
26try:
27    allele_instances = 50
28    population_size = 100
29    frequency = calculate_allele_frequency(allele_instances, population_size)
30    print(f"Allele frequency: {frequency:.4f} ({frequency*100:.1f}%)")
31except ValueError as e:
32    print(f"Error: {e}")
33

R

1calculate_allele_frequency <- function(instances, individuals) {
2  # Validate inputs
3  if (individuals <= 0) {
4    stop("Number of individuals must be positive")
5  }
6  
7  if (instances < 0) {
8    stop("Number of instances cannot be negative")
9  }
10  
11  if (instances > individuals * 2) {
12    stop("Number of instances cannot exceed twice the number of individuals")
13  }
14  
15  # Calculate frequency
16  instances / (individuals * 2)
17}
18
19# Example usage
20allele_instances <- 50
21population_size <- 100
22frequency <- calculate_allele_frequency(allele_instances, population_size)
23cat(sprintf("Allele frequency: %.4f (%.1f%%)\n", frequency, frequency*100))
24
25# Plotting the result
26library(ggplot2)
27data <- data.frame(
28  Allele = c("Target Allele", "Other Alleles"),
29  Frequency = c(frequency, 1-frequency)
30)
31ggplot(data, aes(x = Allele, y = Frequency, fill = Allele)) +
32  geom_bar(stat = "identity") +
33  scale_fill_manual(values = c("Target Allele" = "#4F46E5", "Other Alleles" = "#D1D5DB")) +
34  labs(title = "Allele Frequency Distribution",
35       y = "Frequency",
36       x = NULL) +
37  theme_minimal() +
38  scale_y_continuous(labels = scales::percent)
39

JavaScript

1/**
2 * Calculate the frequency of a specific allele in a population.
3 * 
4 * @param {number} instances - Number of instances of the specific allele
5 * @param {number} individuals - Total number of individuals in the population
6 * @returns {number} The allele frequency as a value between 0 and 1
7 * @throws {Error} If inputs are invalid
8 */
9function calculateAlleleFrequency(instances, individuals) {
10  // Validate inputs
11  if (individuals <= 0) {
12    throw new Error("Number of individuals must be positive");
13  }
14  
15  if (instances < 0) {
16    throw new Error("Number of instances cannot be negative");
17  }
18  
19  if (instances > individuals * 2) {
20    throw new Error("Number of instances cannot exceed twice the number of individuals");
21  }
22  
23  // Calculate frequency
24  return instances / (individuals * 2);
25}
26
27// Example usage
28try {
29  const alleleInstances = 50;
30  const populationSize = 100;
31  const frequency = calculateAlleleFrequency(alleleInstances, populationSize);
32  console.log(`Allele frequency: ${frequency.toFixed(4)} (${(frequency*100).toFixed(1)}%)`);
33} catch (error) {
34  console.error(`Error: ${error.message}`);
35}
36

Java

1public class AlleleFrequencyCalculator {
2    /**
3     * Calculate the frequency of a specific allele in a population.
4     * 
5     * @param instances Number of instances of the specific allele
6     * @param individuals Total number of individuals in the population
7     * @return The allele frequency as a value between 0 and 1
8     * @throws IllegalArgumentException If inputs are invalid
9     */
10    public static double calculateAlleleFrequency(int instances, int individuals) {
11        // Validate inputs
12        if (individuals <= 0) {
13            throw new IllegalArgumentException("Number of individuals must be positive");
14        }
15        
16        if (instances < 0) {
17            throw new IllegalArgumentException("Number of instances cannot be negative");
18        }
19        
20        if (instances > individuals * 2) {
21            throw new IllegalArgumentException("Number of instances cannot exceed twice the number of individuals");
22        }
23        
24        // Calculate frequency
25        return (double) instances / (individuals * 2);
26    }
27    
28    public static void main(String[] args) {
29        try {
30            int alleleInstances = 50;
31            int populationSize = 100;
32            double frequency = calculateAlleleFrequency(alleleInstances, populationSize);
33            System.out.printf("Allele frequency: %.4f (%.1f%%)\n", frequency, frequency*100);
34        } catch (IllegalArgumentException e) {
35            System.err.println("Error: " + e.getMessage());
36        }
37    }
38}
39

Često postavljana pitanja

Šta je alel?

Alel je varijantna forma gena. Različiti aleli proizvode varijacije u nasleđenim karakteristikama kao što su boja kose ili krvna grupa. Svaka osoba obično nasleđuje dva alela za svaki gen, jedan od svakog roditelja. Ako su dva alela ista, jedinka je homozigotna za taj gen. Ako su aleli različiti, jedinka je heterozigotna.

Zašto je važno izračunati frekvenciju alela?

Izračunavanje frekvencije alela je važno jer pomaže naučnicima da razumeju genetsku raznolikost unutar populacija, prate promene u genetskom sastavu tokom vremena, identifikuju potencijalne rizike od bolesti i proučavaju evolucione procese. Pruža kvantitativnu meru koliko su specifične genetske varijante u populaciji uobičajene ili retke.

Kako veličina uzorka utiče na izračunavanje frekvencije alela?

Veličina uzorka značajno utiče na tačnost procena frekvencije alela. Veći uzorci obično pružaju tačnije procene sa užim intervalima poverenja. Mali uzorci možda neće tačno predstavljati pravu frekvenciju populacije, posebno za retke alele. Kao pravilo, veće veličine uzorka (tipično >100 jedinki) se preferiraju za pouzdano izračunavanje frekvencije alela.

Mogu li se frekvencije alela menjati tokom vremena?

Da, frekvencije alela mogu se menjati tokom vremena zbog nekoliko evolucionih sila:

Prirodna selekcija: Povoljni aleli mogu povećati svoju frekvenciju
Genetski drift: Nasumične promene u frekvenciji, posebno u malim populacijama
Migracija: Kretanje jedinki između populacija može uvesti nove alele
Mutacija: Uvođenje novih alela
Nenamensko parenje: Može promeniti frekvencije genotipa, indirektno utičući na frekvencije alela

Kako da izračunam frekvenciju alela ako znam samo frekvencije genotipa?

Ako znate frekvencije genotipova (npr. AA, Aa, aa), možete izračunati frekvenciju alela A kao: $f(A) = f(AA) + \frac{f(Aa)}{2}$ Gde je $f(AA)$ frekvencija genotipa AA, a $f(Aa)$ frekvencija heterozigotnog genotipa.

Šta je Hardy-Weinbergova ravnoteža i kako se odnosi na frekvenciju alela?

Hardy-Weinbergova ravnoteža opisuje odnos između frekvencija alela i genotipa u ne-evoluirajućoj populaciji. Prema ovom principu, ako je p frekvencija alela A, a q frekvencija alela a (gde p + q = 1), tada su očekivane frekvencije genotipa:

AA: p²
Aa: 2pq
aa: q²

Odstupanja od ovih očekivanih frekvencija mogu ukazivati na evolucione sile koje deluju u populaciji.

Kako da se nosim sa X-linkovanim genima prilikom izračunavanja frekvencije alela?

Za X-linkovane gene, muškarci imaju samo jednu kopiju dok žene imaju dve. Da biste izračunali frekvenciju alela:

Prebrojte sve instance alela (žene doprinose dva alela, muškarci jedan)
Podelite sa ukupnim brojem X hromozoma u populaciji (2 × broj žena + broj muškaraca)

Mogu li se frekvencije alela koristiti za predviđanje rizika od bolesti?

Podaci o frekvenciji alela mogu pomoći u proceni prevalencije genetskih poremećaja u populaciji. Međutim, predviđanje rizika od bolesti kod pojedinaca zahteva dodatne informacije o penetraciji gena (verovatnoća da osoba sa genotipom razvije bolest) i ekspresivnosti (varijacija simptoma bolesti među jedinkama sa istim genotipom).

Koja je razlika između frekvencije alela i frekvencije genotipa?

Frekvencija alela se odnosi na proporciju specifičnog alela među svim alelima na tom lokusu u populaciji. Frekvencija genotipa se odnosi na proporciju jedinki sa specifičnim genotipom. Na primer, u populaciji sa genotipovima AA, Aa i aa, frekvencija alela A se izračunava iz svih A alela, dok se frekvencija genotipa AA jednostavno izražava kao proporcija jedinki sa tim specifičnim genotipom.

Kako da izračunam intervale poverenja za procene frekvencije alela?

Za velike uzorke, možete aproksimirati 95% interval poverenja za frekvenciju alela (p) koristeći: $p \pm 1.96 \times \sqrt{\frac{p(1-p)}{2N}}$ Gde je N broj jedinki uzetih u uzorak. Za male uzorke ili veoma visoke/niske frekvencije, složenije metode poput Wilsonove intervalne metode mogu biti prikladnije.

Reference

Hartl, D. L., & Clark, A. G. (2007). Principles of Population Genetics (4th ed.). Sinauer Associates.
Hamilton, M. B. (2021). Population Genetics (2nd ed.). Wiley-Blackwell.
Nielsen, R., & Slatkin, M. (2013). An Introduction to Population Genetics: Theory and Applications. Sinauer Associates.
Hedrick, P. W. (2011). Genetics of Populations (4th ed.). Jones & Bartlett Learning.
Templeton, A. R. (2006). Population Genetics and Microevolutionary Theory. Wiley-Liss.
The 1000 Genomes Project Consortium. (2015). A global reference for human genetic variation. Nature, 526(7571), 68-74. https://doi.org/10.1038/nature15393
Allele Frequency Net Database. http://www.allelefrequencies.net/
Ensembl Genome Browser. https://www.ensembl.org/
National Human Genome Research Institute. https://www.genome.gov/
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM). https://www.omim.org/

Isprobajte naš Traker genetske varijacije danas!

Razumevanje genetskog sastava populacija nikada nije bilo lakše. Naš Kalkulator frekvencije alela pruža jednostavan, ali moćan način za kvantifikaciju genetske varijacije u vašoj studijskoj populaciji. Bilo da ste student, istraživač ili zdravstveni radnik, ovaj alat će vam pomoći da dobijete dragocene uvide u populacionu genetiku.

Započnite izračunavanje frekvencija alela sada i otkrijte genetski pejzaž vaše populacije!

💬

Povratne informacije

💬

Kliknite na povratnu informaciju tosta da biste počeli davati povratne informacije o ovom alatu

🔗

Povezani alati

Otkrijte više alata koji mogu biti korisni za vaš radni proces

Praćenje genetskih varijacija: Izračunajte frekvenciju alela u populacijama

Трacker генетских варијација

Улазни подаци

Резултати

Формула за израчунавање

Визуелизација учесталости алела

Population Representation

Dokumentacija

Traker genetske varijacije: Kalkulator frekvencije alela

Uvod

Šta je frekvencija alela?

Kako koristiti Traker genetske varijacije

Validacija unosa

Razumevanje rezultata

Metode i formule za izračunavanje

Osnovno izračunavanje frekvencije alela

Alternativne metode izračunavanja

1. Iz broja genotipova

2. Iz frekvencija genotipova

Rukovanje različitim nivoima ploidije

Upotrebe za izračunavanje frekvencije alela

Istraživanje populacione genetike

Medicinske genetske aplikacije

Poljoprivredne i konzervacione aplikacije

Obrazovne postavke

Alternativa frekvenciji alela

Istorijski kontekst izračunavanja frekvencije alela

Rani razvoj

Savremeni razvoj

Primeri koda za izračunavanje frekvencije alela

Excel

Python

R

JavaScript

Java

Često postavljana pitanja

Šta je alel?

Zašto je važno izračunati frekvenciju alela?

Kako veličina uzorka utiče na izračunavanje frekvencije alela?

Mogu li se frekvencije alela menjati tokom vremena?

Kako da izračunam frekvenciju alela ako znam samo frekvencije genotipa?

Šta je Hardy-Weinbergova ravnoteža i kako se odnosi na frekvenciju alela?

Kako da se nosim sa X-linkovanim genima prilikom izračunavanja frekvencije alela?

Mogu li se frekvencije alela koristiti za predviđanje rizika od bolesti?

Koja je razlika između frekvencije alela i frekvencije genotipa?

Kako da izračunam intervale poverenja za procene frekvencije alela?

Reference

Isprobajte naš Traker genetske varijacije danas!

Povratne informacije

Povezani alati

Kalkulator gamma raspodele za analizu i vizualizaciju

Alat za analizu i vizualizaciju učestalosti karaktera

Kalkulator temperature spajanja DNK za dizajn PCR prajmera

Kalkulator koncentracije DNK: Konvertujte A260 u ng/μL

Generator nasumičnih lokacija: Kreator globalnih koordinata

Kalkulator za verovatnoće binomne raspodele i analizu

Six Sigma kalkulator: Izmerite kvalitet vašeg procesa

Pratitelj uzoraka mačje dlake: Digitalni katalog za mačje kapute

Kalkulator vremena dupliranja ćelija: Merenje brzine rasta ćelija