Genomisk Replikationsestimator | DNA Kopital Beregner

Beregn DNA-kopitaler ved at indtaste sekvensdata, målsekvens, koncentration og volumen. Enkel, præcis estimering af genomisk replikation uden komplekse konfigurationer eller API-integrationer.

Genomisk Replikationsestimator

DNA Sekvens*

Indtast den fulde DNA-sekvens, du ønsker at analysere

Målsekvens*

Indtast den specifikke DNA-sekvens, du ønsker at tælle forekomster af

DNA Koncentration*

ng/μL

Prøvevolumen*

μL

Resultater

Estimeret Kopiantal

Kopi

Beregningsmetode

Kopiantallet beregnes baseret på antallet af forekomster af målsekvensen, DNA-koncentrationen, prøvevolumen og molekylære egenskaber ved DNA.

Kopiantal = (Forekomster × Koncentration × Volumen × 6.022×10²³) ÷ (DNA Længde × 660 × 10⁹)

Visualisering

Indtast gyldige DNA-sekvenser og parametre for at se visualisering

📚

Dokumentation

Genomisk DNA Kopital Beregner

Introduktion til DNA Kopital Analyse

Genomisk DNA Kopital Beregner er et kraftfuldt værktøj designet til at estimere antallet af kopier af en specifik DNA-sekvens til stede i en genomisk prøve. DNA kopital analyse er en grundlæggende teknik inden for molekylærbiologi, genetik og klinisk diagnostik, der hjælper forskere og klinikere med at kvantificere mængden af bestemte DNA-sekvenser. Denne beregning er essentiel for forskellige anvendelser, herunder genekspressionsstudier, patogendetektion, transgene kvantificering og diagnose af genetiske lidelser karakteriseret ved kopitalvariationer (CNV'er).

Vores Genomiske Replikationsskønner giver en ligetil tilgang til at beregne DNA kopitaler uden at kræve komplekse konfigurationer eller API-integrationer. Ved at indtaste dine DNA-sekvensdata og målsekvensen, sammen med koncentrationsparametre, kan du hurtigt bestemme kopitalen af specifikke DNA-sekvenser i din prøve. Disse oplysninger er afgørende for at forstå genetiske variationer, sygdomsmekanismer og optimere eksperimentelle protokoller i molekylærbiologisk forskning.

Videnskaben Bag DNA Kopital Beregning

Forståelse af DNA Kopital

DNA kopital refererer til antallet af gange en specifik DNA-sekvens vises i et genom eller en prøve. I et normalt menneskeligt genom eksisterer de fleste gener i to kopier (en fra hver forælder). Imidlertid kan forskellige biologiske processer og genetiske tilstande føre til afvigelser fra denne standard:

Forstærkninger: Øget kopital (mere end to kopier)
Deletioner: Formindsket kopital (færre end to kopier)
Duplikationer: Specifikke segmenter duplikeret inden for genomet
Kopitalvariationer (CNV'er): Strukturelle variationer, der involverer ændringer i antallet af kopier

Nøjagtig beregning af DNA kopitaler hjælper forskere med at forstå disse variationer og deres implikationer for sundhed og sygdom.

Matematisk Formel for DNA Kopital Beregning

Kopitalen af en specifik DNA-sekvens kan beregnes ved hjælp af følgende formel:

$\text{Kopital} = \frac{\text{Forekomster} \times \text{Koncentration} \times \text{Volumen} \times N_A}{\text{DNA Længde} \times \text{Gennemsnitlig Baseparvægt} \times 10^9}$

Hvor:

Forekomster: Antallet af gange målsekvensen vises i DNA-prøven
Koncentration: DNA koncentration i ng/μL
Volumen: Prøvevolumen i μL
$N_A$ : Avogadro's tal (6.022 × 10²³ molekyler/mol)
DNA Længde: Længden af DNA-sekvensen i basepar
Gennemsnitlig Baseparvægt: Gennemsnitlig molekylvægt af et DNA basepar (660 g/mol)
10^9: Konverteringsfaktor fra ng til g

Denne formel tager højde for DNA's molekylære egenskaber og giver et estimat af den absolutte kopital i din prøve.

Variabler Forklaret

Forekomster: Dette bestemmes ved at tælle, hvor mange gange målsekvensen vises inden for den fulde DNA-sekvens. For eksempel, hvis din målsekvens er "ATCG" og den vises 5 gange i din DNA-prøve, ville forekomsterne være 5.
DNA Koncentration: Typisk målt i ng/μL (nanogram per mikroliter), repræsenterer dette mængden af DNA til stede i din opløsning. Denne værdi bestemmes normalt ved hjælp af spektrofotometriske metoder som NanoDrop eller fluorometriske assays som Qubit.
Prøvevolumen: Den samlede volumen af din DNA-prøve i mikroliter (μL).
Avogadro's Tal: Denne fundamentale konstant (6.022 × 10²³) repræsenterer antallet af molekyler i en mol af et stof.
DNA Længde: Den samlede længde af din DNA-sekvens i basepar.
Gennemsnitlig Baseparvægt: Den gennemsnitlige molekylvægt af et DNA basepar er cirka 660 g/mol. Denne værdi tager højde for den gennemsnitlige vægt af nukleotiderne og fosfodiesterbindingerne i DNA.

Sådan Bruger Du Genomisk Replikationsskønner

Vores Genomiske Replikationsskønner giver en brugervenlig grænseflade til hurtigt og præcist at beregne DNA kopitaler. Følg disse trin for at få præcise resultater:

Trin 1: Indtast Din DNA Sekvens

I det første inputfelt skal du indtaste den komplette DNA-sekvens, du ønsker at analysere. Dette skal være den fulde sekvens, hvor du ønsker at tælle forekomsterne af din målsekvens.

Vigtige bemærkninger:

Kun standard DNA-baser (A, T, C, G) accepteres
Sekvensen er ikke skiftfølsom (både "ATCG" og "atcg" behandles ens)
Fjern eventuelle mellemrum, tal eller specialtegn fra din sekvens

Eksempel på en gyldig DNA-sekvens:

1ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAG
2

Trin 2: Indtast Din Målsekvens

I det andet inputfelt skal du indtaste den specifikke DNA-sekvens, du ønsker at tælle. Dette er målsekvensen, hvis kopital du ønsker at bestemme.

Krav:

Målsekvensen må kun indeholde standard DNA-baser (A, T, C, G)
Målsekvensen skal være kortere end eller lig med hoved-DNA-sekvensen
For nøjagtige resultater bør målsekvensen repræsentere et specifikt genetisk element af interesse

Eksempel på en gyldig målsekvens:

1ATCG
2

Trin 3: Angiv DNA Koncentration og Prøvevolumen

Indtast koncentrationen af din DNA-prøve i ng/μL (nanogram per mikroliter) og volumen i μL (mikroliter).

Typiske værdier:

DNA koncentration: 1-100 ng/μL
Prøvevolumen: 1-100 μL

Trin 4: Se Dine Resultater

Efter at have indtastet alle nødvendige oplysninger, vil beregneren automatisk beregne kopitalen af din målsekvens. Resultatet repræsenterer det estimerede antal kopier af din målsekvens i hele prøven.

Resultatssektionen inkluderer også:

En visualisering af kopitalen
Muligheden for at kopiere resultatet til din udklipsholder
En detaljeret forklaring af, hvordan beregningen blev udført

Validering og Fejlhåndtering

Genomisk Replikationsskønner inkluderer flere valideringskontroller for at sikre nøjagtige resultater:

DNA Sekvens Validering: Sikrer, at inputtet kun indeholder gyldige DNA-baser (A, T, C, G).
- Fejlmeddelelse: "DNA-sekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn"
Målsekvens Validering: Kontrollerer, at målsekvensen kun indeholder gyldige DNA-baser og ikke er længere end hoved-DNA-sekvensen.
- Fejlmeddelelser:
  - "Målsekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn"
  - "Målsekvensen kan ikke være længere end DNA-sekvensen"
Koncentration og Volumen Validering: Bekræfter, at disse værdier er positive tal.
- Fejlmeddelelser:
  - "Koncentration skal være større end 0"
  - "Volumen skal være større end 0"

Anvendelser og Brugssager

DNA kopital analyse har mange anvendelser på tværs af forskellige områder inden for biologi og medicin:

Forskningsanvendelser

Genekspressionsstudier: Kvantificering af antallet af kopier af et gen kan hjælpe med at forstå dets ekspressionsniveau og funktion.
Transgene Organisme Analyse: Bestemmelse af kopitalen af indsatte gener i genetisk modificerede organismer for at vurdere integrations effektivitet.
Mikrobiel Kvantificering: Måling af mængden af specifikke mikrobielle sekvenser i miljømæssige eller kliniske prøver.
Viral Belastningstest: Kvantificering af virale genomer i patientprøver for at overvåge infektionens progression og behandlingens effektivitet.

Kliniske Anvendelser

Kræftdiagnostik: Identificering af forstærkninger eller deletioner af onkogener og tumorundertrykkende gener.
Genetisk Sygdomsdiagnose: Påvisning af kopitalvariationer forbundet med genetiske lidelser som Duchenne muskeldystrofi eller Charcot-Marie-Tooth sygdom.
Farmakogenomik: Forståelse af hvordan genkopital påvirker lægemiddelmetabolisme og respons.
Prænatal Testning: Identificering af kromosomale abnormiteter som trisomier eller mikrodeletioner.

Virkeligt Eksempel

Et forskningsteam, der undersøger brystkræft, kan bruge Genomisk Replikationsskønner til at bestemme kopitalen af HER2-genet i tumorprøver. HER2-forstærkning (øget kopital) er forbundet med aggressiv brystkræft og påvirker behandlingsbeslutninger. Ved at beregne den nøjagtige kopital kan forskerne:

Klassificere tumorer baseret på HER2-status
Korreleere kopital med patientresultater
Overvåge ændringer i kopital under behandling
Udvikle mere præcise diagnostiske kriterier

Alternativer til Kopital Beregning

Mens vores beregner giver en ligetil metode til at estimere DNA kopitaler, anvendes der også andre teknikker i forsknings- og kliniske indstillinger:

Kvantitativ PCR (qPCR): Måler DNA-forstærkning i realtid for at bestemme den oprindelige kopital.
Digital PCR (dPCR): Opdeler prøven i tusinder af individuelle reaktioner for at give absolut kvantificering uden standardkurver.
Fluorescens In Situ Hybridisering (FISH): Visualiserer og tæller specifikke DNA-sekvenser direkte i celler eller kromosomer.
Sammenlignende Genom Hybridisering (CGH): Sammenligner kopitalen af DNA-sekvenser mellem en test- og referenceprøve.
Next-Generation Sequencing (NGS): Giver genom-bred kopitalprofilering med høj opløsning.

Hver metode har sine fordele og begrænsninger i forhold til nøjagtighed, omkostninger, throughput og opløsning. Vores beregner tilbyder en hurtig og tilgængelig tilgang til indledende estimater eller når specialudstyr ikke er tilgængeligt.

Historien om DNA Kopital Analyse

Begrebet DNA kopital og dets betydning i genetik er blevet betydeligt udviklet gennem årtierne:

Tidlige Opdagelser (1950'erne-1970'erne)

Grundlaget for DNA kopital analyse blev lagt med opdagelsen af DNA-strukturen af Watson og Crick i 1953. Dog forblev evnen til at opdage variationer i kopital begrænset indtil udviklingen af molekylærbiologiske teknikker i 1970'erne.

Fremkomsten af Molekylære Teknikker (1980'erne)

1980'erne så udviklingen af Southern blotting og in situ hybridiseringsteknikker, der gjorde det muligt for forskere at opdage store kopitalændringer. Disse metoder gav de første glimt af, hvordan kopitalvariationer kunne påvirke genekspression og fænotype.

PCR Revolutionen (1990'erne)

Opfindelsen og forfiningen af Polymerase Chain Reaction (PCR) af Kary Mullis revolutionerede DNA-analyse. Udviklingen af kvantitativ PCR (qPCR) i 1990'erne gjorde det muligt at måle DNA kopitaler mere præcist og blev guldstandart for mange anvendelser.

Genomisk Æra (2000'erne-Nu)

Færdiggørelsen af Human Genome Project i 2003 og fremkomsten af mikroarray- og next-generation sequencing-teknologier har dramatisk udvidet vores evne til at opdage og analysere kopitalvariationer på tværs af hele genomet. Disse teknologier har afsløret, at kopitalvariationer er meget mere almindelige og betydningsfulde, end tidligere antaget, hvilket bidrager til både normal genetisk variation og sygdom.

I dag har beregningsmetoder og bioinformatikværktøjer yderligere forbedret vores evne til nøjagtigt at beregne og fortolke DNA kopitaler, hvilket gør denne analyse tilgængelig for forskere og klinikere verden over.

Kodeeksempler til DNA Kopital Beregning

Her er implementeringer af DNA kopital beregning i forskellige programmeringssprog:

Python Implementering

1def calculate_dna_copy_number(dna_sequence, target_sequence, concentration, volume):
2    """
3    Beregn kopitalen af en mål DNA-sekvens.
4    
5    Parametre:
6    dna_sequence (str): Den komplette DNA-sekvens
7    target_sequence (str): Målsekvensen der skal tælles
8    concentration (float): DNA koncentration i ng/μL
9    volume (float): Prøvevolumen i μL
10    
11    Returnerer:
12    int: Estimeret kopital
13    """
14    # Rens og valider sekvenser
15    dna_sequence = dna_sequence.upper().replace(" ", "")
16    target_sequence = target_sequence.upper().replace(" ", "")
17    
18    if not all(base in "ATCG" for base in dna_sequence):
19        raise ValueError("DNA-sekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn")
20    
21    if not all(base in "ATCG" for base in target_sequence):
22        raise ValueError("Målsekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn")
23    
24    if len(target_sequence) > len(dna_sequence):
25        raise ValueError("Målsekvensen kan ikke være længere end DNA-sekvensen")
26    
27    if concentration <= 0 or volume <= 0:
28        raise ValueError("Koncentration og volumen skal være større end 0")
29    
30    # Tæl forekomster af målsekvens
31    count = 0
32    pos = 0
33    while True:
34        pos = dna_sequence.find(target_sequence, pos)
35        if pos == -1:
36            break
37        count += 1
38        pos += 1
39    
40    # Konstanter
41    avogadro = 6.022e23  # molekyler/mol
42    avg_base_pair_weight = 660  # g/mol
43    
44    # Beregn kopital
45    total_dna_ng = concentration * volume
46    total_dna_g = total_dna_ng / 1e9
47    moles_dna = total_dna_g / (len(dna_sequence) * avg_base_pair_weight)
48    total_copies = moles_dna * avogadro
49    copy_number = count * total_copies
50    
51    return round(copy_number)
52
53# Eksempel på brug
54dna_seq = "ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAG"
55target_seq = "ATCG"
56conc = 10  # ng/μL
57vol = 20   # μL
58
59try:
60    result = calculate_dna_copy_number(dna_seq, target_seq, conc, vol)
61    print(f"Estimeret kopital: {result:,}")
62except ValueError as e:
63    print(f"Fejl: {e}")
64

JavaScript Implementering

1function calculateDnaCopyNumber(dnaSequence, targetSequence, concentration, volume) {
2  // Rens og valider sekvenser
3  dnaSequence = dnaSequence.toUpperCase().replace(/\s+/g, '');
4  targetSequence = targetSequence.toUpperCase().replace(/\s+/g, '');
5  
6  // Valider DNA-sekvens
7  if (!/^[ATCG]+$/.test(dnaSequence)) {
8    throw new Error("DNA-sekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn");
9  }
10  
11  // Valider målsekvens
12  if (!/^[ATCG]+$/.test(targetSequence)) {
13    throw new Error("Målsekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn");
14  }
15  
16  if (targetSequence.length > dnaSequence.length) {
17    throw new Error("Målsekvensen kan ikke være længere end DNA-sekvensen");
18  }
19  
20  if (concentration <= 0 || volume <= 0) {
21    throw new Error("Koncentration og volumen skal være større end 0");
22  }
23  
24  // Tæl forekomster af målsekvens
25  let count = 0;
26  let pos = 0;
27  
28  while (true) {
29    pos = dnaSequence.indexOf(targetSequence, pos);
30    if (pos === -1) break;
31    count++;
32    pos++;
33  }
34  
35  // Konstanter
36  const avogadro = 6.022e23; // molekyler/mol
37  const avgBasePairWeight = 660; // g/mol
38  
39  // Beregn kopital
40  const totalDnaNg = concentration * volume;
41  const totalDnaG = totalDnaNg / 1e9;
42  const molesDna = totalDnaG / (dnaSequence.length * avgBasePairWeight);
43  const totalCopies = molesDna * avogadro;
44  const copyNumber = count * totalCopies;
45  
46  return Math.round(copyNumber);
47}
48
49// Eksempel på brug
50try {
51  const dnaSeq = "ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAG";
52  const targetSeq = "ATCG";
53  const conc = 10; // ng/μL
54  const vol = 20;  // μL
55  
56  const result = calculateDnaCopyNumber(dnaSeq, targetSeq, conc, vol);
57  console.log(`Estimeret kopital: ${result.toLocaleString()}`);
58} catch (error) {
59  console.error(`Fejl: ${error.message}`);
60}
61

R Implementering

1calculate_dna_copy_number <- function(dna_sequence, target_sequence, concentration, volume) {
2  # Rens og valider sekvenser
3  dna_sequence <- gsub("\\s+", "", toupper(dna_sequence))
4  target_sequence <- gsub("\\s+", "", toupper(target_sequence))
5  
6  # Valider DNA-sekvens
7  if (!grepl("^[ATCG]+$", dna_sequence)) {
8    stop("DNA-sekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn")
9  }
10  
11  # Valider målsekvens
12  if (!grepl("^[ATCG]+$", target_sequence)) {
13    stop("Målsekvensen skal kun indeholde A, T, C, G-tegn")
14  }
15  
16  if (nchar(target_sequence) > nchar(dna_sequence)) {
17    stop("Målsekvensen kan ikke være længere end DNA-sekvensen")
18  }
19  
20  if (concentration <= 0 || volume <= 0) {
21    stop("Koncentration og volumen skal være større end 0")
22  }
23  
24  # Tæl forekomster af målsekvens
25  count <- 0
26  pos <- 1
27  
28  while (TRUE) {
29    pos <- regexpr(target_sequence, substr(dna_sequence, pos, nchar(dna_sequence)))
30    if (pos == -1) break
31    count <- count + 1
32    pos <- pos + 1
33  }
34  
35  # Konstanter
36  avogadro <- 6.022e23  # molekyler/mol
37  avg_base_pair_weight <- 660  # g/mol
38  
39  # Beregn kopital
40  total_dna_ng <- concentration * volume
41  total_dna_g <- total_dna_ng / 1e9
42  moles_dna <- total_dna_g / (nchar(dna_sequence) * avg_base_pair_weight)
43  total_copies <- moles_dna * avogadro
44  copy_number <- count * total_copies
45  
46  return(round(copy_number))
47}
48
49# Eksempel på brug
50tryCatch({
51  dna_seq <- "ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAG"
52  target_seq <- "ATCG"
53  conc <- 10  # ng/μL
54  vol <- 20   # μL
55  
56  result <- calculate_dna_copy_number(dna_seq, target_seq, conc, vol)
57  cat(sprintf("Estimeret kopital: %s\n", format(result, big.mark=",")))
58}, error = function(e) {
59  cat(sprintf("Fejl: %s\n", e$message))
60})
61

Ofte Stillede Spørgsmål (FAQ)

Hvad er DNA kopital?

DNA kopital refererer til antallet af gange en specifik DNA-sekvens vises i et genom eller en prøve. Hos mennesker eksisterer de fleste gener i to kopier (en fra hver forælder), men dette antal kan variere på grund af genetiske variationer, mutationer eller sygdomsprocesser. Beregning af kopital er vigtig for at forstå genetiske lidelser, kræftudvikling og normal genetisk variation.

Hvor nøjagtig er Genomisk Replikationsskønner?

Genomisk Replikationsskønner giver en teoretisk beregning baseret på molekylære principper og de inputparametre, du giver. Dens nøjagtighed afhænger af flere faktorer:

Nøjagtigheden af din DNA koncentrationsmåling
Renheden af din DNA-prøve
Specificiteten af din målsekvens
Nøjagtigheden af din volumenmåling

For forskning, der kræver ekstremt præcis kvantificering, kan teknikker som digital PCR give højere nøjagtighed, men vores beregner tilbyder et godt estimat til mange anvendelser.

Kan jeg bruge denne beregner til RNA sekvenser?

Nej, denne beregner er specifikt designet til DNA-sekvenser og bruger DNA-specifikke molekylvægte i sine beregninger. RNA har forskellige molekylære egenskaber (indeholder uracil i stedet for thymin og har en anden molekylvægt). For RNA kvantificering bør specialiserede RNA kopitalberegnere anvendes.

Hvilken DNA koncentrationsområde fungerer bedst med denne beregner?

Beregneren fungerer med enhver positiv DNA koncentrationsværdi. Dog er DNA koncentrationer typisk mellem 1 og 100 ng/μL for de fleste biologiske prøver. Meget lave koncentrationer (under 1 ng/μL) kan introducere mere usikkerhed i beregningen på grund af målebegrænsninger.

Hvordan håndterer beregneren overlappende sekvenser?

Beregneren tæller hver forekomst af målsekvensen, selvom de overlapper. For eksempel, i sekvensen "ATATAT", ville målet "ATA" blive talt to gange (positionerne 1-3 og 3-5). Denne tilgang er i overensstemmelse med, hvordan mange molekylærbiologiske teknikker opdager sekvenser.

Kan jeg bruge dette værktøj til at kvantificere genekspression?

Mens dette værktøj beregner DNA kopitaler, måles genekspression typisk på RNA-niveau. For genekspressionsanalyse er teknikker som RT-qPCR, RNA-seq eller mikroarrays mere passende. Dog kan DNA kopital påvirke genekspression, så disse analyser er ofte komplementære.

Hvad skal jeg gøre, hvis min DNA-sekvens indeholder tvetydige baser (N, R, Y osv.)?

Denne beregner accepterer kun standard DNA-baser (A, T, C, G). Hvis din sekvens indeholder tvetydige baser, skal du enten erstatte dem med specifikke baser baseret på din bedste viden eller fjerne disse sektioner, før du bruger beregneren.

Hvordan håndterer beregneren meget store kopitaler?

Beregneren kan håndtere meget store kopitaler og vil vise dem i et læsbart format. For ekstremt store værdier kan videnskabelig notation anvendes. Den underliggende beregning opretholder fuld præcision uanset størrelsen af resultatet.

Kan jeg bruge dette værktøj til at bestemme plasmidkopital?

Ja, du kan bruge denne beregner til at estimere plasmidkopitaler. Indtast blot den komplette plasmidsekvens som din DNA-sekvens og det specifikke område af interesse som din målsekvens. Sørg for at måle plasmid DNA koncentrationen nøjagtigt for pålidelige resultater.

Hvordan påvirker DNA koncentration kopitalberegningen?

DNA koncentration har en direkte lineær sammenhæng med den beregnede kopital. At fordoble koncentrationen vil fordoble den estimerede kopital, forudsat at alle andre parametre forbliver konstante. Dette fremhæver vigtigheden af nøjagtig koncentrationsmåling for pålidelige resultater.

Referencer

Bustin, S. A., Benes, V., Garson, J. A., Hellemans, J., Huggett, J., Kubista, M., ... & Wittwer, C. T. (2009). MIQE-retningslinjerne: minimumsinformation til offentliggørelse af kvantitative realtids PCR-eksperimenter. Clinical chemistry, 55(4), 611-622.
D'haene, B., Vandesompele, J., & Hellemans, J. (2010). Nøjagtig og objektiv kopitalprofilering ved hjælp af realtids kvantitativ PCR. Methods, 50(4), 262-270.
Hindson, B. J., Ness, K. D., Masquelier, D. A., Belgrader, P., Heredia, N. J., Makarewicz, A. J., ... & Colston, B. W. (2011). Højkapacitets droplet digital PCR-system til absolut kvantificering af DNA kopital. Analytical chemistry, 83(22), 8604-8610.
Zhao, M., Wang, Q., Wang, Q., Jia, P., & Zhao, Z. (2013). Beregningsværktøjer til detektion af kopitalvariation (CNV) ved hjælp af next-generation sequencing data: funktioner og perspektiver. BMC bioinformatics, 14(11), 1-16.
Redon, R., Ishikawa, S., Fitch, K. R., Feuk, L., Perry, G. H., Andrews, T. D., ... & Hurles, M. E. (2006). Global variation i kopital i det menneskelige genom. Nature, 444(7118), 444-454.
Zarrei, M., MacDonald, J. R., Merico, D., & Scherer, S. W. (2015). Et kortlægning af kopitalvariationer i det menneskelige genom. Nature reviews genetics, 16(3), 172-183.
Stranger, B. E., Forrest, M. S., Dunning, M., Ingle, C. E., Beazley, C., Thorne, N., ... & Dermitzakis, E. T. (2007). Relativ indflydelse af nukleotid- og kopitalvariation på genekspressionsfænotyper. Science, 315(5813), 848-853.
Alkan, C., Coe, B. P., & Eichler, E. E. (2011). Opdagelse og genotyping af genomisk strukturel variation. Nature reviews genetics, 12(5), 363-376.

Konklusion

Genomisk DNA Kopital Beregner giver en kraftfuld, men tilgængelig måde at estimere antallet af kopier af specifikke DNA-sekvenser i dine prøver. Ved at kombinere molekylære principper med brugervenligt design hjælper dette værktøj forskere, studerende og fagfolk med hurtigt at opnå værdifulde kvantitative data uden specialudstyr eller komplekse protokoller.

At forstå DNA kopital er essentielt for mange anvendelser inden for genetik, molekylærbiologi og medicin. Uanset om du studerer genforstærkning i kræft, kvantificerer transgene integrationer eller undersøger kopitalvariationer i genetiske lidelser, tilbyder vores beregner en ligetil tilgang til at få de oplysninger, du har brug for.

Vi opfordrer dig til at prøve Genomisk Replikationsskønner med dine egne DNA-sekvenser og udforske, hvordan ændringer i koncentration, volumen og målsekvenser påvirker de beregnede kopitaler. Denne hands-on oplevelse vil uddybe din forståelse af molekylære kvantificeringsprincipper og hjælpe dig med at anvende disse koncepter på dine specifikke forskningsspørgsmål.

For eventuelle spørgsmål eller feedback om beregneren, henvises der til FAQ-sektionen eller kontakt vores supportteam.

💬

Feedback

💬

Klik på feedback-toasten for at begynde at give feedback om dette værktøj.

🔗

Relaterede Værktøjer

Opdag flere værktøjer, der måske kan være nyttige for din arbejdsgang.