ಅಬ್ಸಾರ್ಬನ್ಸ್ ಓದುಗಳಿಂದ (A260) ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಿ, ಹೊಂದಿಸುವಂತಾದ ಡಿಲ್ಯೂಶನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ಗಳೊಂದಿಗೆ. ಅಣುಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳು ಮತ್ತು ಜನಿತಶಾಸ್ತ್ರದ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಸಾಧನ.
ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ಕೆಳಗಿನ ಸೂತ್ರವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ:
ಒಂದು ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಎಂಬುದು ಆನ್ಲೈನ್ನಲ್ಲಿ ಅಗತ್ಯವಾದ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಅಣುಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು, ಜನಿತಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಮತ್ತು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ತಂತ್ರಜ್ಞರಿಗೆ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೆಟ್ರಿಕ್ ಓದಿನಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ಖಚಿತವಾಗಿ ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ಉಚಿತ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಮಾನದಂಡ A260 ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ, ಇದು UV ಶೋಷಣಾ ಅಳೆಯುವಿಕೆಗಳನ್ನು ng/μL ನಲ್ಲಿ ಖಚಿತ ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಮೌಲ್ಯಗಳಿಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ.
ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅಳೆಯುವಿಕೆ ಅಣುಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳಲ್ಲಿ ಮೂಲಭೂತ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ, ಇದು PCR, ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧಗೊಳಿಸುವಿಕೆ, ಕ್ಲೋನಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಇತರ ಅಣುಜೀವ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳ ಮೊದಲು ಪ್ರಮುಖ ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣ ಹಂತವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ನಮ್ಮ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಕೈಗಣನೆಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿನ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಮತ್ತು ಒಟ್ಟು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವಾಗ ದೋಷಗಳನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವುದು ಬೀರ್-ಲ್ಯಾಂಬರ್ಟ್ ಕಾನೂನಕ್ಕೆ ಆಧಾರಿತವಾಗಿದೆ, ಇದು ಒಂದು ದ್ರಾವಣದ ಶೋಷಣೆ ಶ್ರೇಣಿಯು ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಶೋಷಕ ಪ್ರಜಾತಿಯ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಮತ್ತು ದ್ರಾವಣದ ಮೂಲಕ ಬೆಳಕಿನ ಮಾರ್ಗದ ಉದ್ದಕ್ಕೆ ನೇರವಾಗಿ ಅನುಪಾತವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಹೇಳುತ್ತದೆ. ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಡಿಎನ್ಎಗಾಗಿ, 1.0 ಶೋಷಣೆ 260nm (A260) ನಲ್ಲಿ 1cm ಮಾರ್ಗದ ಉದ್ದದಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು 50 ng/μL ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ.
ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಕೆಳಗಿನ ಸೂತ್ರವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ:
ಇಲ್ಲಿ:
ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿನ ಒಟ್ಟು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ನಂತರ ಲೆಕ್ಕಹಾಕಬಹುದು:
260nm ನಲ್ಲಿ ಶೋಷಣೆ (A260):
ಪರಿವರ್ತನಾ ಅಂಶ (50):
ಡಿಲ್ಯೂಶನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್:
ಆಯತ:
ನಿಮ್ಮ A260 ಓದುಗಳಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲು ಈ ಸರಳ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಅನುಸರಿಸಿ:
ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅಳೆಯುವಿಕೆ ಅನೇಕ ಅಣುಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನಾ ಅನ್ವಯಗಳಿಗೆ ಅಗತ್ಯವಾಗಿದೆ:
ಡಿಎನ್ಎ ತುಂಡುಗಳನ್ನು ವೆಕ್ಟರ್ಗಳಿಗೆ ಲೈಗೇಟ್ ಮಾಡುವ ಮೊದಲು, ಖಚಿತ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ತಿಳಿಯುವುದು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಉತ್ತಮ ಇನ್ಸರ್ಟ್-ಟು-ವೆಕ್ಟರ್ ಅನುಪಾತವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಪರಿವರ್ತನೆಯ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯನ್ನು ಗರಿಷ್ಠಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಇನ್ಸರ್ಟ್ ಮತ್ತು ವೆಕ್ಟರ್ ನಡುವಿನ 3:1 ಮೋಲರ್ ಅನುಪಾತವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಉತ್ತಮ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಎರಡೂ ಘಟಕಗಳ ಖಚಿತ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅಳೆಯುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
PCR ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಉತ್ತಮ ವಿಸ್ತರಣೆಗೆ 1-10 ng ಮಾದರಿ ಡಿಎನ್ಎ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಕಡಿಮೆ ಡಿಎನ್ಎ ವಿಸ್ತರಣೆಯ ವಿಫಲತೆಯನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡಬಹುದು, ಆದರೆ ಹೆಚ್ಚು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ನಿರೋಧಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಮಾಣಾತ್ಮಕ PCR (qPCR) ಗೆ, ಖಚಿತ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಲು ಇನ್ನಷ್ಟು ಖಚಿತ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಅಗತ್ಯವಿದೆ, ಇದು ಖಚಿತ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಲು ಖಚಿತ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ.
NGS ಗ್ರಂಥಾಲಯ ತಯಾರಿಕಾ ಪ್ರೋಟೋಕಾಲ್ಗಳು ಖಚಿತ ಡಿಎನ್ಎ ಇನ್ಪುಟ್ ಪ್ರಮಾಣಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 1-500 ng ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿ, ವೇದಿಕೆ ಮತ್ತು ಅನ್ವಯವನ್ನು ಆಧಾರಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಯಶಸ್ವಿ ಗ್ರಂಥಾಲಯ ತಯಾರಿಕೆಗೆ ಮತ್ತು ಬಹುಪರಿಮಾಣ ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧಗೊಳಿಸುವಿಕೆ ಓಟಗಳಲ್ಲಿ ಮಾದರಿಗಳ ಸಮಾನ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಲು ಖಚಿತ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅಳೆಯುವಿಕೆ ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಯೂಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಕೋಶಗಳಿಗೆ ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸುವಾಗ, ಉತ್ತಮ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣವು ಕೋಶದ ಪ್ರಕಾರ ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫೆಕ್ಷನ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಆಧಾರಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, 6-ವೆಲ್ ಪ್ಲೇಟ್ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ವೆಲ್ನಲ್ಲಿ 0.5-5 μg ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಡಿಎನ್ಎ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಪ್ರಯೋಗಗಳನ್ನು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ಖಚಿತ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅಳೆಯುವಿಕೆಯನ್ನು ಅಗತ್ಯವಿದೆ.
ಫಾರೆನ್ಸಿಕ್ ಅನ್ವಯಗಳಲ್ಲಿ, ಡಿಎನ್ಎ ಮಾದರಿಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸೀಮಿತ ಮತ್ತು ಅಮೂಲ್ಯವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಖಚಿತ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಅಳೆಯುವುದು ಫಾರೆನ್ಸಿಕ್ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳಿಗೆ ಪ್ರೊಫೈಲಿಂಗ್ಗಾಗಿ ಸಾಕಷ್ಟು ಡಿಎನ್ಎ ಇದೆ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಮತ್ತು ನಂತರದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸುವ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
ನಿರ್ಬಂಧಕ ಎಂಜೈಮ್ಗಳಿಗೆ μg ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಘಟಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಖಚಿತ ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ತಿಳಿಯುವುದು ಸಂಪೂರ್ಣ ಪಚನವನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಲು ಸರಿಯಾದ ಎಂಜೈಮ್-ಟು-ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಪಾತಗಳನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ, ಸ್ಟಾರ್ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕತೆಯನ್ನು (ಅನಿಯಮಿತ ಕತ್ತರಿಸುವಿಕೆ) ತಪ್ಪಿಸುತ್ತದೆ.
UV ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೆಟ್ರಿ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣದ ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಹಲವಾರು ಪರ್ಯಾಯಗಳು ಇವೆ:
ಫ್ಲುಯೋರೆಮೆಟ್ರಿಕ್ ವಿಧಾನಗಳು:
ಆಗರೋಸ್ ಜೇಲ್ ಇಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್:
ರಿಯಲ್-ಟೈಮ್ PCR:
ಡಿಜಿಟಲ್ PCR:
ಡಿಎನ್ಎ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ಅನ್ನು ಖಚಿತವಾಗಿ ಅಳೆಯುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಅಣುಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಪ್ರಗತಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಬಹಳಷ್ಟು ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಹೊಂದಿದೆ:
1953 ರಲ್ಲಿ ವಾಟ್ಸನ್ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಕ್ ಅವರಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ ರಚನೆಯ ಪತ್ತೆಯ ನಂತರ, ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿದರು. ಪ್ರಾರಂಭಿಕ ವಿಧಾನಗಳು ಡಿಪ್ಹೆನಿಲ್ಅಮೈನ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಂತಹ ಬಣ್ಣದ ಪರೀಕ್ಷೆಗಳನ್ನು ಆಧಾರಿತವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಡಿಎನ್ಎ ಯಲ್ಲಿ ಡಿಒಕ್ಸಿರಿಬೋಸ್ ಸಕ್ಕರೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಿದಾಗ ನೀಲಿ ಬಣ್ಣವನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ವಿಧಾನಗಳು ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿ ಅಸಂವೇದನಶೀಲವಾಗಿದ್ದು, ಹಸ್ತಕ್ಷೇಪಕ್ಕೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತವೆ.
ನೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣಕ್ಕೆ UV ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೆಟ್ರಿಯ ಬಳಕೆ 1970 ರಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ನಡೆಯಿತು. ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಡಿಎನ್ಎ 260nm ನಲ್ಲಿ UV ಬೆಳಕನ್ನು ಶೋಷಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಶೋಷಣೆ ಮತ್ತು ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಶ್ರೇಣಿಯಲ್ಲಿ ರೇಖೀಯವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿದರು. A260 = 1.0 ಗೆ ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಡಿಎನ್ಎಗಾಗಿ 50 ng/μL ಪರಿವರ್ತನಾ ಅಂಶವು ಈ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ ಸ್ಥಾಪಿತವಾಯಿತು.
1980 ಮತ್ತು 1990 ರಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಫ್ಲುೋರೆಸೆಂಟ್ ಬಣ್ಣಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣವನ್ನು ಕ್ರಾಂತಿಕಾರಿಯಾಗಿ ಬದಲಾಯಿಸಿತು, ವಿಶೇಷ
ನಿಮ್ಮ ಕೆಲಸದ ಹಂತಕ್ಕೆ ಉಪಯೋಗಿಸಬಹುದಾದ ಹೆಚ್ಚು ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಹುಡುಕಿ ಹೊಸ ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಿರಿ