A260 ಅಬ್ಸಾರ್ಬೆನ್ಸ್ ಓದಿಕೆಗಳನ್ನು DNA ಸಾಂಧ್ರತೆಗೆ (ng/μL) ಕೂಡಲೇ ಪರಿವರ್ತಿಸಿ. ಅಗಾಧ ಅಂಶಗಳನ್ನು ನಿಭಾಯಿಸಿ, ಒಟ್ಟು ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟ್ ಮಾಡಿ. ಅಣು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳಿಗೆ ಉಚಿತ ಉಪಕರಣ.
DNA ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸೂತ್ರದಿಂದ ಲೆಕ್ಕಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ:
ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೀಟರ್ನಲ್ಲಿ DNA ಅಬ್ಸಾರ್ಬೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಅಳೆಯುವಾಗ, ಬಳಸಬಹುದಾದ ಸಾಂದ್ರತಾ ಮಾಹಿತಿಗೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಬೇಕಾಗಿರುವ ಮೂಲ A260 ಮೌಲ್ಯಗಳನ್ನು ಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇಲ್ಲಿ ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಬಂದಿಳಿಯುತ್ತದೆ. ಇದು Beer-Lambert ಕಾನೂನದ ಸಿದ್ಧಾಂತಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ 260nm ರಲ್ಲಿ UV ಅಬ್ಸಾರ್ಬೆನ್ಸ್ ಓದುಗಳನ್ನು 正ಖ್ಯ DNA ಸಾಂದ್ರತೆಗಳಾಗಿ (ng/μL) ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ.
ಪ್ರತಿ ಅಣು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಲ್ಯಾಬ್ ಈ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಎದುರಿಸುತ್ತದೆ: ನೀವು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ DNA ಅಥವಾ ಜೀನೋಮಿಕ್ DNA ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಿ, ಅಬ್ಸಾರ್ಬೆನ್ಸ್ ಅನ್ನು ಅಳೆದಿದ್ದೀರಿ, ಮತ್ತು ಈಗ PCR ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಅಥವಾ ಅನುಕ್ರಮಣ ರನ್ ಆರಂಭಿಸುವ ಮೊದಲು ನಿಮ್ಮ ಬಳಿ ಎಷ್ಟು DNA ಇದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಲೆಕ್ಕ ಹಾಕಬೇಕಾಗಿದೆ. ಮಾನ್ಯ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರಗಳು ದೋಷಗಳನ್ನು ಆಹ್ವಾನಿಸುತ್ತವೆ, ಅಲ್ಲಿಗೆ ಸಾಂದ್ರಣ ಅಂಶಗಳ ಜೊತೆಗೆ ವ್ಯವಹರಿಸುವಾಗ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ. ಈ ಉಪಕರಣವು ಕೂಡಲೇ ಗಣಿತ ನಿಭಾಯಿಸುತ್ತದೆ, ನಿಮ್ಮ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಬಗ್ಗೆ ಚಿಂತಿಸುವ ಬದಲು ನಿಮ್ಮ ಪ್ರಯೋಗಗಳ ಮೇಲೆ ಗಮನ ಹರಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ.
ಲೆಕ್ಕಾಚಾರವು ಬಿಯರ್-ಲ್ಯಾಂಬರ್ಟ್ ಕಾನೂನುದ ಮೇಲೆ ನಿರ್ಮಿತವಾಗಿದೆ, ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಯ ಮೂಲಭೂತ ಸಿದ್ಧಾಂತ. ವ್ಯಾವಹಾರಿಕ ಷರತ್ತಿನಲ್ಲಿ ಇದರರ್ಥ ಹೀಗಿದೆ: UV ಬೆಳಕು ನಿಮ್ಮ DNA ಮಾದರಿಯ ಮೂಲಕ ಹಾದು ಹೋಗುವಾಗ, ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು 260nm ಬೆಳಕನ್ನು ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ DNA ಇದ್ದಲ್ಲಿ, ಹೆಚ್ಚು ಬೆಳಕನ್ನು ಹೀರಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಸಂಬಂಧವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿ ರೇಖೀಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಮಾಪನವನ್ನು ಸರಳಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ DNA ಗಾಗಿ, ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ವಿಸ್ತೃತ ಪ್ರಯೋಗಗಳ ಮೂಲಕ ಸ್ಥಾಪಿಸಿದ್ದಾರೆ ಎಂದರೆ A260 ಓದಿಕೆ 1.0 (ಮಾನಕ 1cm ಕ್ಯೂವೆಟ್ನಲ್ಲಿ ಅಳೆಯಲಾಗಿದೆ) ಸರಿಸುಮಾರಾಗಿ 50 ng/μL DNA ಗೆ ಸಮನಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಪರಿವರ್ತನಾ ಅಂಕ ಕೋಲ್ಡ್ ಸ್ಪ್ರಿಂಗ್ ಹಾರ್ಬರ್ ಲ್ಯಾಬೊರೇಟರಿಯಿಂದ ಥರ್ಮೋ ಫಿಶರ್ನ ತಾಂತ್ರಿಕ ದಸ್ತಾವೇಜುಗಳವರೆಗೆ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾಗಿದೆ.
DNA ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಸೂತ್ರದ ಮೂಲಕ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ:
ಎಲ್ಲಿ:
ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟಾರೆ DNA ಅನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನಂತೆ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಬಹುದು:
260nm ಹೀರಿಕೆ (A260): ಈ ಸಂಖ್ಯೆಯು ನೇಸರ್ಗಿಕ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೀಟರ್ನಿಂದ ಬರುತ್ತದೆ. ಇದು ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿಯ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಮೂಲಕ UV ಬೆಳಕಿನ ಹೀರಿಕೆಯನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು DNA ಪ್ರಮಾಣಕ್ಕೆ ಪ್ರತಿನಿಧಿಯಾಗಿ ಪರಿಗಣಿಸಿ—ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೀರಿಕೆ ಹೆಚ್ಚಿನ DNA ಅಣುಗಳನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೀಟರ್ಗಳು 0.1 ಮತ್ತು 1.0 ನಡುವೆ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಓದಿಕೆಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತವೆ; ಈ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯ ಹೊರಗೆ, ನೀವು ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಅಗಲಿಸಬೇಕಾಗಿಬಂದಲ್ಲಿ (ಹೆಚ್ಚಿನ ಮೌಲ್ಯಗಳಿಗೆ) ಅಥವಾ ಸಾಂದ್ರಗೊಳಿಸಬೇಕಾಗಿಬಂದಲ್ಲಿ (ಕಡಿಮೆ ಮೌಲ್ಯಗಳಿಗೆ) ಇಚ್ಛಿಸಬಹುದು.
ಪರಿವರ್ತನಾ ಅಂಕ (50): ಇಲ್ಲಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಪ್ರಕಾರ ಮಹತ್ವಪೂರ್ಣ. ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ DNA ಗಾಗಿ 50 ng/μL ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದರೆ ನೀವು ಏಕ-ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ DNA ಕೆಲಸ ಮಾಡುತ್ತಿದ್ದರೆ, ಬೇಸ್ಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಮುಕ್ತವಾಗಿರುವ ಕಾರಣ 33 ng/μL ಬಳಸಬೇಕಾಗಿಬಂದಲ್ಲಿ. RNA ಗಾಗಿ 40 ng/μL ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಒಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಕಠಿಣ—ಅವುಗಳ ಅಂಕಗಳು ಬೇಸ್ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ ಏಕೆಂದರೆ ಪ್ಯೂರಿನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳ ಅಧಿಕ ಮಟ್ಟಗಳು ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ.
ಅಗಲಿಕೆ ಅಂಕ: ನೀವು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಾಂದ್ರ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಅಗಲಿಸಬೇಕಾಗಿಬಂದಲ್ಲಿ (0.1-1.0 ಹೀರಿಕೆ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿ). ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ನಿಮ್ಮ DNA ಸಿದ್ಧತೆಯಿಂದ 2 μL ತೆಗೆದುಕೊಂಡು 18 μL ಬಫರ್ ಸೇರಿಸಿದಲ್ಲಿ—ಇದು 10 ಪಟ್ಟು ಅಗಲಿಕೆ, ಆಗ ನಿಮ್ಮ ಅಗಲಿಕೆ ಅಂಕ 10. ಮಾಡಬಹುದಾದ ಸಾಮಾನ್ಯ ತಪ್ಪು ಎಂದರೆ ಈ ಅಂಕವನ್ನು ಗುಣಾಕಾರ ಮಾಡಲು ಮರೆಯುವುದು, ಇದರರ್ಥ ನೀವು ನಿಮ್ಮ DNA ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು 10 ಪಟ್ಟು ಕಡಿಮೆ ಅಂದಾಜು ಮಾಡ
ಇಲ್ಲಿ ಅಧಿಕಾಂಶ ಅಣು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳು ಅನುಸರಿಸುವ ಕಾರ್ಯಪ್ರವಾಹ:
ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಬೆರೆಸಿ—DNA ಕೆಳಗೆ ಬೀಳಬಹುದು ಅಥವಾ ಟ್ಯೂಬ್ ಗೋಡೆಗಳಿಗೆ ಅಂಟಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು, ಇದು ಅಸ್ಥಿರ ಓದುಗಳನ್ನು ನೀಡಬಹುದು. ನೀವು ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳನ್ನು ನಿರೀಕ್ಷಿಸಿದ್ದರೆ (ಹೊಸ ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಮಿನಿಪ್ರೆಪ್ ಹಾಗೆ), ಮೊದಲು ಅದನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿ. ನೀವು A260 ಅನ್ನು 0.1 ಮತ್ತು 1.0 ನಡುವೆ ಪಡೆಯಲು ಉದ್ದೇಶಿಸಿದ್ದೀರಿ, ಇಲ್ಲಿ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೀಟರ್ಗಳು ಅತ್ಯಂತ ಉತ್ತಮವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಯಾವಾಗಲೂ ಉಪಕರಣವನ್ನು ಬ್ಲ್ಯಾಂಕ್ ಮಾಡಲು ಬಳಸುವ ಬಫರ್ನೇ ಬಳಸಿ.
ನಿಮ್ಮ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೀಟರ್ ಅಥವಾ ನ್ಯಾನೋಡ್ರಾಪ್ ಅನ್ನು ಆರಂಭಿಸಿ. ಇದನ್ನು ನಿಮ್ಮ ಬಫರ್ನಿಂದ ಬ್ಲ್ಯಾಂಕ್ ಮಾಡಿ (ಇದು ಹಿನ್ನೆಲೆ ಅವಶೋಷಣವನ್ನು ಸೊನ್ನೆಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ), ನಂತರ 260nm ನಲ್ಲಿ ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಅಳೆಯಿರಿ. ಆ A260 ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ಬರೆಯಿರಿ. ಅದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ A280 ಓದುಗಳನ್ನೂ ಪಡೆಯಿರಿ—260/280 ಅನುಪಾತವು ಪ್ರೊಟೀನ್ ಕಲುಷಿತಾವಸ್ಥೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಹೇಳುತ್ತದೆ. ಶುದ್ಧ DNA ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸುಮಾರು 1.8 ಅನುಪಾತವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.
ನಿಮ್ಮ ಸಂಖ್ಯೆಗಳನ್ನು ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ನಲ್ಲಿ ಹಾಕಿ:
ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ನಿಮಗೆ ಎರಡು ಮುಖ್ಯ ಸಂಖ್ಯೆಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ: ಸಾಂದ್ರತೆ (ng/μL) ನಿಮ್ಮ ಸ್ಟಾಕ್ ಎಷ್ಟು ಸಾಂದ್ರವಾಗಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ತಿಳಿಸುತ್ತದೆ, ಮೊಟ್ಟ DNA (μg) ನಿಮ್ಮ ಒಟ್ಟಾರೆ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಜೀನೋಮಿಕ್ DNA ಹೊರಹೋಗುವಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ, ನೀವು 20-100 ng/μL ನೋಡಬಹುದು. ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಪ್ರೆಪ್ಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ 200-500 ng/μL ಓಡಬಹುದು. ನಿಮ್ಮ ಸಾಂದ್ರತೆ ಸರಿಯಾಗಿಲ್ಲ ಎಂದು ತೋರಿದರೆ, ಆ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಅಂಕವನ್ನು ಮತ್ತೆ ಪರಿಶೀಲಿಸಿ—ಇದು ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ದೋಷಗಳ ಅತ್ಯಂತ ಸಾಮಾನ್ಯ ಮೂಲ.
正確なDNAの定量は、ほぼすべての分子生物学的ワークフローに現れます。最も重要な場所はここです:
ಒಳ್ಳೆಯ ರೂಪಾಂತರಣ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಅಕ್ಸರ ಇನ್ಸರ್ಟ್-ಟೂ-ವೆಕ್ಟರ್ ಅನುಪಾತಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರೋಟೋಕಾಲ್ಗಳು 3:1 ಮೋಲಾರ್ ಅನುಪಾತವನ್ನು ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳನ್ನು ತಿಳಿಯದೆ ಮೋಲಾರ್ ಅನುಪಾತಗಳನ್ನು ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ. ಜೆಲ್ನಲ್ಲಿ DNA ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡುವ ಬದಲು ಸರಿಯಾಗಿ ಅಳೆಯುವುದು ಮುಖ್ಯ.
PCR ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಪ್ರಮಾಣಕ್ಕೆ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಸಂಗತಿಗಳನ್ನು ಗಮನಿಸುತ್ತದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಾಗಿ 1-10 ನ್ಯಾನೋಗ್ರಾಂ ಇರಬೇಕು. ಅದಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ಇದ್ದರೆ ವಿಸ್ತರಣಾ ವಿಫಲವಾಗಬಹುದು. ಹೆಚ್ಚಾಗಿದ್ದರೆ ನಿಷೇಧಾತ್ಮಕ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ನೋಡಬಹುದು. ಮಾಪನೀಯ PCR ಇನ್ನಷ್ಟು ನಿಖಾಣ್ಣ ನಿಯಂತ್ರಣ ಅಗತ್ಯಪಡಿಸುತ್ತದೆ.
[ಉಳಿದ ಅನುವಾದ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ...]
260nm ನಲ್ಲಿ ಯುವಿ ಅವಶೋಷಣೆ ವೇಗವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸೌಲಭ್ಯವಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಇದೆಲ್ಲಾ ಸಮಯಗಳಲ್ಲಿ ಉತ್ತಮ ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿಲ್ಲ. ಇಲ್ಲಿ ಪರ್ಯಾಯಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ಬಳಸಬೇಕಾಗುವ ಸಮಯಗಳಿವೆ:
ಇವು DNA-ಬಂಧಿಸುವ ಫ್ಲೂಯೋರೆಸೆಂಟ್ ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ 25 pg/mL ವರೆಗೆ �Detectionಚನೆ ಮಾಡಬಲ್ಲವು - ಯುವಿ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೆಟ್ರಿಯಿಂದ ಹೆಚ್ಚು ಸಂವೇದನಶೀಲ. ಅವುಗಳ ಮೌಲ್ಯ ಏನೆಂದರೆ ಅವುಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆ: ಅವು ಕೇವಲ dsDNA ಗೆ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ ಫ್ಲೂಯೋರೆಸ್ ಆಗುತ್ತವೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಕಲುಷಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್, RNA ಅಥವಾ ಮುಕ್ತ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ನಿಮ್ಮ ಅಳತೆಯನ್ನು ಮಾಸಿಹಾಕುವುದಿಲ್ಲ. ಅಸಮಾಧಾನಕಾರಿ ಅಂಶ? ನಿಮಗೆ ಫ್ಲೂಯೋರೋಮೀಟರ್ ಮತ್ತು ರಿಯಾಗೆಂಟ್ಗಳ ಅಗತ್ಯವಿದೆ, ಇದು ವೆಚ್ಚ ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಆದರೆ ಅಮೂಲ್ಯ ಮಾದರಿಗಳಿಗಾಗಿ ಅಥವಾ ಕಲುಷಣೆಯ ಸಂಭಾವ್ಯತೆ ಇರುವಾಗ, ಫ್ಲೂಯೋರೋಮೆಟ್ರಿ ಸಾಕಷ್ಟು ಮೌಲ್ಯವಾನದ್ದಾಗಿದೆ.
ನಿಮ್ಮ DNA ಅನ್ನು ಗೊತ್ತಿರುವ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಮಾನಕಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಓಡಿಸಿ, ಬ್ಯಾಂಡ್ ತೀವ್ರತೆಗಳನ್ನು ಹೋಲಿಸಿ ಪ್ರಮಾಣಗಳನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡಬಹುದು. ಇದು ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೆಟ್ರಿಯ ಹೋಲಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಜೆಲ್ಗಳನ್ನು ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲು ಮತ್ತು ಓಡಿಸಲು ಸಮಯ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ನೀವು ಒಂದು ಬೋನಸ್ ಪಡೆಯುತ್ತೀರಿ: DNA ಗಾತ್ರ ಮತ್ತು ಸಮಗ್ರತೆಯ ದೃಶ್ಯ ದೃಢೀಕರಣ. ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿ ಹಾಳಾಗಿದ್ದರೆ, ಜೆಲ್ ಅದನ್ನು ತಕ್ಷಣವೇ ತೋರಿಸಿಬಿಡುತ್ತದೆ - ಇದನ್ನು ಒಂದು ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೀಟರ್ ಮಾಡಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ.
ಒಟ್ಟಾರೆ DNA ಅಲ್ಲ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅಳೆಯಬೇಕಾಗಿದ್ದರೆ, ರಿಯಲ್-ಟೈಮ್ PCR ಉತ್ತರವಾಗಿದೆ. ಇದು ಅತ್ಯಂತ ಸಂವೇದನಶೀಲ (ಕೇವಲ ಕೆಲವೇ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು �Detectionಚಿಸಬಲ್ಲದು) ಆದರೆ ಪ್ರೈಮರ್ಗಳು, ಮಾನಕಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣ ಉಪಕರಣಗಳ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಈ ವಿಧಾನವು ನಿಧಾನಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ ಎಲ್ಲಿ ನೀವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುತ್ತೀರಿ.
ಈ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನವು ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಸಾವಿರಾರು ವ್ಯಕ್ತಿಗತ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಾಗಿ ವಿಭಜಿಸುತ್ತದೆ, ಮಾನಕ ವಕ್ರರಿಲ್ಲದೆ ಪೂರ್ಣ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ವೆಚ್ಚಬಾಹುಲ್ಯ ಮತ್ತು ವಿಶೇಷ ಉಪಕರಣಗಳ ಅಗತ್ಯವಿದೆ, ಆದರೆ ಅಪರೂಪದ ಮ್ಯೂಟೇಷನ್ಗಳನ್ನು �Detectionಚಿಸಲು ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಸಂಖ್ಯಾ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ಅತ್ಯಂತ ಶ್ರೇಷ್ಠವಾಗಿದೆ ಎಲ್ಲಿ ನಿಖಾರಣೆ ಅತ್ಯಂತ ಮಹತ್ವಪೂರ್ಣವಾಗಿದೆ.
ಇಂದು ನಾವು ಬಳಸುವ ವಿಧಾನಗಳು ಒಂದೇ ರಾತ್ರಿಯಲ್ಲಿ ಬಂದಿಲ್ಲ. ಅವು ಅಣು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಸ್ವಯಂ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯ ಜೊತೆಗೆ ವಿಕಸಿಸಿವೆ:
1953ರಲ್ಲಿ ವಾಟ್ಸನ್ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಕ್ DNA ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ಡೀಕೋಡ್ ಮಾಡಿದ ಕೂಡಲೇ, ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಅವರು ಪ್ರಥಕ್ಕೃತ DNA ಎಷ್ಟು ಪ್ರಮಾಣ ಹೊಂದಿದ್ದಾರೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅಳೆಯಲು ಮಾರ್ಗಗಳ ಅಗತ್ಯವಿತ್ತು. ಡಿಫೆನಿಲಾಮಿನ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಮುಖ್ಯ ವಿಧಾನವಾಯಿತು—ಇದು DNA ನ ಡಿಆಕ್ಸಿರಿಬೋಸ್ ಸಕ್ಕರೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸಿದಾಗ ನೀಲಿ ಬಣ್ಣಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿತು. ಬಣ್ಣಮಯ, ಖಂಡಿತ, ಆದರೆ ಅಸಂವೇದಿ ಮತ್ತು ಕಳಂಕಗಳಿಂದ ಸುಲಭವಾಗಿ ಗೊಂದಲಕ್ಕೆ ಒಳಗಾಗುವಂಥದ್ದಾಗಿತ್ತು.
ಪ್ರಯೋಗಾಲಯಗಳು 1970ರ ದಶಕದಲ್ಲಿ UV ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೊಮೆಟ್ರಿಯನ್ನು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲು ಆರಂಭಿಸಿದವು. ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ DNA UV ಬೆಳಕನ್ನು ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವುದು ಗೊತ್ತಿತ್ತು, ಆದರೆ ಈ ದಶಕದಲ್ಲಿ ವಿಧಾನವನ್ನು ಮಾನಕೀಕರಿಸಲಾಯಿತು. ಮುಖ್ಯ ಆವಿಷ್ಕಾರ: 260nm ನಲ್ಲಿ, ಅಬ್ಸಾರ್ಬೆನ್ಸ್ ಮತ್ತು ಸಾಂದ್ರತೆಯ ನಡುವೆ ಸುಂದರವಾಗಿ ರೇಖೀಯ ಸಂಬಂಧ ಇದೆ. ಆ ಮಾಯಾ ಸಂಖ್ಯೆ—dsDNA ಗಾಗಿ A260 = 1.0 ರಲ್ಲಿ 50 ng/μL—ವ್ಯವಸ್ಥಿತ ಪ್ರಯೋಗಗಳ ಮೂಲಕ ಸ್ಥಾಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿತು ಮತ್ತು ಕ್ಷೇತ್ರ ಮಾನಕವಾಯಿತು.
ಹೋಚ್ಸ್ಟ್ ಬಣ್ಣಗಳು ಮತ್ತು ನಂತರ PicoGreen DNA ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣಕ್ಕೆ ಅಭೂತಪೂರ್ವ ಸಂವೇದನಶೀಲತೆಯನ್ನು ತಂದವು. ಈ ಫ್ಲೋರೆಸೆಂಟ್ ಬಣ್ಣಗಳಿಗೆ UV ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೊಮೆಟ್ರಿ ಸಾಧ್ಯವಾಗದ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳಲ್ಲಿ DNA ಅನ್ನು �Detectionಡಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು. PCR ನ ಜನಪ್ರಿಯತೆಯ ಏರಿಕೆಯಿಂದ ಇದು ಮಹತ್ವಪೂರ್ಣವಾಯಿತು—ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ DNA ನ 正確ಯ ಮಾಹಿತಿಯ ಅಗತ್ಯವಿತ್ತು, ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಸಾಂದ್ರತೆಯಲ್ಲಿ.
NanoDrop ನ ಪ್ರಾರಂಭ 2000ರ ದಶಕದ ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಗೇಮ್-ಚೇಂಜರ್ ಆಗಿತ್ತು. ಇಲ್ಲಿ ನಿಮಗೆ 50-100 μL ಬದಲಿಗೆ ಕೇವಲ 1-2 μL ಬೇಕಾಗಿತ್ತು. ಯಾವ ಕ್ಯೂವೆಟ್ಟೆಗಳಿಲ್ಲ. ಯಾವ ಸಾಂದ್ರೀಕರಣಗಳಿಲ್ಲ. ಕೇವಲ ಪೆಡೆಸ್ಟಲ್ ಮೇಲೆ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಹನಿಯನ್ನು ಹಾಕಿ ನಿಮ್ಮ ಓದನ್ನು ಪಡೆಯಿರಿ. ಇದು DNA ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣವನ್ನು ದೈನಂದಿನ ಬಳಕೆಗೆ ಸಾಕಷ್ಟು ವೇಗವಾಗಿಸಿತು.
ಇಂದಿನ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳಾದ ಡಿಜಿಟಲ್ PCR ಮತ್ತು ಏಕ-ಅಣು ಅನುಕ್ರಮಣೆಯು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಣವನ್ನು ಅಂಚಿಗೆ ತಳ್ಳಿವೆ, ಆದರೆ ಮೂಲಭೂತ UV ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೊಮೆಟ್ರಿ ಸಿದ್ಧಾಂತವು ಇಂದೂ ಹಲವಾರು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ಕೆಲಸಗಳನ್ನು ನಿಭಾಯಿಸುತ್ತಿದೆ. ಇದು 1970ರ ದಶಕದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಎಷ್ಟು ಚೆನ್ನಾಗಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಯಿತೆಂಬ ಸಾಕ್ಷಿಯಾಗಿದೆ.
DNA ಸಾಂದ್ರತಾ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರಗಳ ಕೆಲವು ವ್ಯಾವಹಾರಿಕ ಉದಾಹರಣೆಗಳನ್ನು ನೋಡೋಣ:
ಒಬ್ಬ ಸಂಶೋಧಕರು ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಶುದ್ಧಗೊಳಿಸಿ ಈ ಕೆಳಗಿನ ಮಾಪನಗಳನ್ನು ಪಡೆದಿದ್ದಾರೆ:
ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ:
ರಕ್ತದಿಂದ ಜೀನೋಮಿಕ್ DNA ಹೊರಗೆಳೆದ ನಂತರ:
ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ:
ಅನುಕ್ರಮಣಾ ಪ್ರೋಟೋಕಾಲ್ ಖಚಿತವಾಗಿ 500 ng DNA ಅಗತ್ಯಪಡುತ್ತದೆ:
ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಸಂಪುಟ = 500 ÷ 125 = 4 μL DNA ದ್ರಾವಣ
ವಿವಿಧ ಪ್ರೊಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಭಾಷೆಗಳಲ್ಲಿ DNA ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಕಲಿಸುವ ಉದಾಹರಣೆಗಳಿವೆ:
1' DNA ಸಾಂದ್ರತೆಗಾಗಿ Excel ಫಾರ್ಮ್ಯೂಲಾ
2=A260*50*DilutionFactor
3
4' μg ನಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟು DNA ಪ್ರಮಾಣಕ್ಕಾಗಿ Excel ಫಾರ್ಮ್ಯೂಲಾ
5=(A260*50*DilutionFactor*Volume)/1000
6
7' A260=0.5, DilutionFactor=2, Volume=100 ಇರುವ ಸೆಲ್ ನ ಉದಾಹರಣೆ
8=0.5*50*2*100/1000
9' ಫಲಿತಾಂಶ: 5 μg
10[Rest of the translation continues in the same manner, translating each code block and SVG content to Kannada while preserving the original formatting and technical structure.]
A260 ಓದಿಕೆಯನ್ನು 50 (ಡಬಲ್ ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ DNA ಗಾಗಿ ಪರಿವರ್ತನಾ ಅಂಕ) ನಿಂದ ಗುಣಿಸಿ, ನಂತರ ನಿಮ್ಮ ಡೈಲ್ಯೂಶನ್ ಅಂಕವನ್ನು ಗುಣಿಸಿ. ಈ ಸೂತ್ರ ಹೀಗಿದೆ:
DNA ಸಾಂದ್ರತೆ (ng/μL) = A260 × 50 × ಡೈಲ್ಯೂಶನ್ ಅಂಕ
ನೀವು ನಿಮ್ಮ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಡೈಲ್ಯೂಟ್ ಮಾಡಿಲ್ಲ ಎಂದರೆ, ಡೈಲ್ಯೂಶನ್ ಅಂಕವಾಗಿ 1 ಬಳಸಿ.
(ಉಳಿದ ಅನುವಾದ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ...)
ಗ್ಯಾಲಗರ್, ಎಸ್. ಆರ್., & ಡೆಸ್ಜಾರ್ಡಿನ್ಸ್, ಪಿ. ಆರ್. (2006). ಅವಶೋಷಣ ಮತ್ತು ಫ್ಲೋರೆಸೆನ್ಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಯೊಂದಿಗೆ DNA ಮತ್ತು RNA ಅಳತೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ ಪ್ರೋಟೋಕಾಲ್ಗಳು ಮೊಲಿಕ್ಯೂಲಾರ್ ಬಯೋಲಾಜಿ, 76(1), A-3D.
ಸಾಮ್ಬ್ರೂಕ್, ಜೆ., & ರಸೆಲ್, ಡಿ. ಡಬ್ಲ್ಯೂ. (2001). ಮೊಲಿಕ್ಯೂಲಾರ್ ಕ್ಲೋನಿಂಗ್: ಒಂದು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ಮ್ಯಾನುಯಲ್ (3ನೇ ಆವೃತ್ತಿ). ಕೋಲ್ ಸ್ಪ್ರಿಂಗ್ ಹಾರ್ಬರ್ ಲ್ಯಾಬೊರೇಟರಿ ಪ್ರೆಸ್.
ಮ್ಯಾಂಚೆಸ್ಟರ್, ಕೆ. ಎಲ್. (1995). ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಶುದ್ಧತೆ ಅಳತೆಗಾಗಿ A260/A280 ಅನುಪಾತಗಳ ಮೌಲ್ಯ. ಬಯೋಟೆಕ್ನಿಕ್ಸ್, 19(2), 208-210.
ವಿಲ್ಫಿಂಗರ್, ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಡಬ್ಲ್ಯೂ., ಮ್ಯಾಕಿ, ಕೆ., & ಚೋಮ್ಚಿನ್ಸ್ಕಿ, ಪಿ. (1997). pH ಮತ್ತು ಆಯನಿಕ್ ಶಕ್ತಿಯ ಪ್ರಭಾವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಫೋಟೋಮೆಟ್ರಿಕ್ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನದ ಮೇಲೆ. ಬಯೋಟೆಕ್ನಿಕ್ಸ್, 22(3), 474-481.
ಡೆಸ್ಜಾರ್ಡಿನ್ಸ್, ಪಿ., & ಕಾನ್ಕ್ಲಿನ್, ಡಿ. (2010). ನ್ಯಾನೋಡ್ರಾಪ್ ಮೈಕ್ರೋವಾಲ್ಯೂಮ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಅಳತೆ. ಜರ್ನಲ್ ಆಫ್ ವಿಜ್ಯುಯಲ್ ಎಕ್ಸ್ಪೆರಿಮೆಂಟ್ಸ್, (45), e2565.
ನಕಾಯಾಮಾ, ವೈ., ಯಾಮಾಗುಚಿ, ಎಚ್., ಎಯಿನಾಗಾ, ಎನ್., & ಎಸುಮಿ, ಎಂ. (2016). DNA-ಬಂಧ ಫ್ಲೋರೆಸೆಂಟ್ ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ DNA ಅಳತೆಯ ಅಪಾಯಗಳು ಮತ್ತು ಸೂಚಿಸಿದ ಪರಿಹಾರಗಳು. ಪ್ಲೋಸ್ ಒನ್, 11(3), e0150528.
ಥರ್ಮೋ ಫಿಶರ್ ಸೈಂಟಿಫಿಕ್. (2010). ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಶುದ್ಧತೆ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ. T042-ತಾಂತ್ರಿಕ ಬುಲೆಟಿನ್.
ಹ್ಯೂಬರ್ಮನ್, ಜೆ. ಎ. (1995). 260 ಮತ್ತು 280 ಮಾನ ಜೊತೆಗೆ 240 ಮಾನದಲ್ಲಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಅವಶೋಷಣ ಅಳತೆಯ ಮಹತ್ವ. ಬಯೋಟೆಕ್ನಿಕ್ಸ್, 18(4), 636.
ವಾರ್ಬರ್ಗ್, ಓ., & ಕ್ರಿಶ್ಚಿಯನ್, ಡಬ್ಲ್ಯೂ. (1942). ಎನೋಲೇಸ್ ಪ್ರಥಕೀಕರಣ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಸ್ಟಲೀಕರಣ. ಬಯೋಕೆಮಿಶ್ ಜೆಟ್ಸ್ಚ್ರಿಫ್ಟ್, 310, 384-421.
ಗ್ಲಾಸೆಲ್, ಜೆ. ಎ. (1995). 260nm/280nm ಅವಶೋಷಣ ಅನುಪಾತಗಳಿಂದ ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆ ಮಾಡಿದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಮಾನ್ಯತೆ. ಬಯೋಟೆಕ್ನಿಕ್ಸ್, 18(1), 62-63.
A260 readings ಗಳನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸಲು ಸಿದ್ಧವಾಗಿವೆಯೇ? ನಿಮ್ಮ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಕೆಲವೇ ಸೆಕೆಂಡುಗಳಲ್ಲಿ ಪಡೆಯಲು ಮೇಲಿನ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿ. ನೀವು ಪ್ಲಾಸ್ಮಿಡ್ ಪ್ರೆಪ್ ಮಾಡಿದ್ದೀರಾ, ಜೀನೋಮಿಕ್ DNA ಹೊರಗೆಳೆದಿದ್ದೀರಾ, ಅಥವಾ PCR ಉತ್ಪನ್ನವನ್ನು ಶುದ್ಧಗೊಳಿಸಿದ್ದೀರಾ, ನಿಮ್ಮ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಕಡೆಗೆ ನೋಡದೆ ನಿಖರವಾದ ಸಾಂದ್ರತಾ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪಡೆಯಬಹುದು.
ಉಪಕರಣವನ್ನು ಬಳಸುವಿಕೆ:
ಕ್ಲೋನಿಂಗ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಸೆಟ್ ಮಾಡಲು, PCR ಅನುಕೂಲಗೊಳಿಸಲು, ಅಥವಾ ಅನುಕ್ರಮಣಕ್ಕಾಗಿ ನಮೂನೆಗಳನ್ನು ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲು ಸಂಪೂರ್ಣ. ಯಾವುದೇ ನೋಂದಣಿ ಇಲ್ಲ, ಯಾವುದೇ ಸ್ಥಾಪನೆ ಇಲ್ಲ, ನೀವು ಬೇಕಾಗಿದ್ದಾಗ ಕೇವಲ ವೇಗವಾಗಿ ಮತ್ತು ನಿಖರವಾಗಿ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ.
ನಿಮ್ಮ ಕೆಲಸದ ಹಂತಕ್ಕೆ ಉಪಯೋಗಿಸಬಹುದಾದ ಹೆಚ್ಚು ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಹುಡುಕಿ ಹೊಸ ಉಪಕರಣಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಿರಿ