அமினோ அமில வரிசைகளுக்கான புரதத்தின் மூல எடை கணக்கீட்டாளர்

அமினோ அமில வரிசைகளை அடிப்படையாகக் கொண்டு புரதங்களின் மூல எடையை கணக்கிடுங்கள். உங்கள் புரத வரிசையை நிலையான ஒரே எழுத்து குறியீடுகளைப் பயன்படுத்தி உள்ளீடு செய்யவும், துல்லியமான மூல எடையை டால்டன்களில் பெறவும்.

புரதமூலக்கூறு எடை மதிப்பீட்டாளர்

அமினோ அமில வரிசையின் அடிப்படையில் புரதத்தின் மூலக்கூறு எடையை கணிக்கவும்.

சாதாரண ஒரு எழுத்து அமினோ அமில குறியீடுகளை (A, R, N, D, C, etc.) பயன்படுத்தவும்

இந்த கணக்கிடுபவர் பற்றி

இந்த கணக்கிடுபவர், அமினோ அமில வரிசையின் அடிப்படையில் புரதத்தின் மூலக்கூறு எடையை மதிப்பீடு செய்கிறது.

கணக்கீடு, அமினோ அமிலங்களின் சாதாரண மூலக்கூறு எடைகளை மற்றும் பெப்டைடு பிணைப்பு உருவாக்கும் போது நீர் இழப்பை கணக்கில் எடுத்துக் கொள்ளுகிறது.

சரியான முடிவுகளுக்கு, சாதாரண ஒரு எழுத்து குறியீடுகளை பயன்படுத்தி செல்லுபடியாகும் அமினோ அமில வரிசையை உள்ளிடவும்.

📚

ஆவணம்

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್

ಪರಿಚಯ

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಎಂಬುದು ಜೀವರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು, ಅಣು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳಿಗಾಗಿ ಅಗತ್ಯವಾದ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ, ಅವರು ತಮ್ಮ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಕ್ರಮವನ್ನು ಆಧರಿಸಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ತೂಕವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಸರಣಿಗಳಿಂದ ರೂಪಿತ ಸಂಕೀರ್ಣ ಮಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್‌ಗಳಾಗಿವೆ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ತಿಳಿಯುವುದು ವಿವಿಧ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ತಂತ್ರಗಳು, ಪ್ರಯೋಗಾತ್ಮಕ ವಿನ್ಯಾಸ ಮತ್ತು ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಅತ್ಯಂತ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ. ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಯಾವುದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಅದರ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಕ್ರಮವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಅಂದಾಜಿಸಲು ವೇಗವಾದ ಮತ್ತು ನಿಖರವಾದ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದ ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಅಮೂಲ್ಯವಾದ ಸಮಯವನ್ನು ಉಳಿಸುವುದರೊಂದಿಗೆ ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ದೋಷಗಳ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ.

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (Da) ಅಥವಾ ಕಿಲೋಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (kDa) ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಎಲ್ಲಾ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ವೈಯಕ್ತಿಕ ತೂಕಗಳ ಮೊತ್ತವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಕಳೆದುಕೊಂಡ ನೀರಿನ ಅಣುಗಳನ್ನು ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಮೂಲಭೂತ ಗುಣವು ದ್ರಾವಣದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ವರ್ತನೆ, ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್ ಚಲನೆ, ಕ್ರಿಸ್ಟಲೈಸೇಶನ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧನೆ ಮತ್ತು ಕೈಗಾರಿಕಾ ಅನ್ವಯಗಳಲ್ಲಿ ಮುಖ್ಯವಾದ ಇತರ ಶಾರೀರಿಕ ಮತ್ತು ರಾಸಾಯನಿಕ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ.

ನಮ್ಮ ಬಳಕೆದಾರ ಸ್ನೇಹಿ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ನಿಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಏಕಕಾಲದ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಕ್ರಮವನ್ನು ಮಾತ್ರ ಅಗತ್ಯವಿದೆ, ಇದು ನಿಖರವಾದ ಅಣು ತೂಕದ ಅಂದಾಜುಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದ ಅನುಭವ ಹೊಂದಿರುವ ಸಂಶೋಧಕರಿಗೂ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ಹೊಸ ವಿದ್ಯಾರ್ಥಿಗಳಿಗೆ ಸುಲಭವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ.

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಹೇಗೆ ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ

ಮೂಲ ಸೂತ್ರ

ಪ್ರೋಟೀನಿನ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಕೆಳಗಿನ ಸೂತ್ರವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ:

MWprotein=i=1nMWaminoacidi(n1)×MWwater+MWwaterMW_{protein} = \sum_{i=1}^{n} MW_{amino acid_i} - (n-1) \times MW_{water} + MW_{water}

ಅಲ್ಲಿ:

  • MWproteinMW_{protein} ಸಂಪೂರ್ಣ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಅಣು ತೂಕವು ಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (Da)
  • i=1nMWaminoacidi\sum_{i=1}^{n} MW_{amino acid_i} ಎಲ್ಲಾ ವೈಯಕ್ತಿಕ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಅಣು ತೂಕಗಳ ಮೊತ್ತ
  • nn ಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಇರುವ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯಾಗಿದೆ
  • MWwaterMW_{water} ನೀರಿನ ಅಣು ತೂಕ (18.01528 Da)
  • (n1)(n-1) ರೂಪಿತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ
  • ಕೊನೆಯ +MWwater+ MW_{water} ಪದವು ಟರ್ಮಿನಲ್ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು (N-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ H ಮತ್ತು C-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ OH) ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ

ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಅಣು ತೂಕಗಳು

ಈ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆ 20 ಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಮಾನಕ ಅಣು ತೂಕಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ:

ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಒಂದೇ-ಅಕ್ಷರ ಕೋಡ್ಅಣು ತೂಕ (Da)
ಆಲಾನೈನ್A71.03711
ಆರ್ಗಿನೈನ್R156.10111
ಅಸ್ಪಾರಾಜಿನ್N114.04293
ಅಸ್ಪಾರ್ಟಿಕ್ ಆಮ್ಲD115.02694
ಸಿಸ್ಟೈನ್C103.00919
ಗುಟಾಮಿಕ್ ಆಮ್ಲE129.04259
ಗುಟಾಮಿನ್Q128.05858
ಗ್ಲೈಸಿನ್G57.02146
ಹಿಸ್ಟಿಡೈನ್H137.05891
ಐಸೋಲ್ಯೂಸಿನ್I113.08406
ಲ್ಯೂಸಿನ್L113.08406
ಲೈಸಿನ್K128.09496
ಮೆಥಿಯೋನೈನ್M131.04049
ಫೆನಿಲಾಲನೈನ್F147.06841
ಪ್ರೋಲೈನ್P97.05276
ಸೆರಿನ್S87.03203
ಥ್ರಿಯೋನೈನ್T101.04768
ಟ್ರಿಪ್ಟೋಫಾನ್W186.07931
ಟೈರೋಸಿನ್Y163.06333
ವಾಲೈನ್V99.06841

ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ನೀರಿನ ಕಳೆವು

ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಸೇರಿದಾಗ, ಅವರು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ರಚಿಸುತ್ತಾರೆ. ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ, ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಬಂಧವನ್ನು ರೂಪಿಸುವಾಗ ನೀರಿನ ಅಣುವೊಂದು (H₂O) ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ನೀರಿನ ಕಳೆವು ಅಣು ತೂಕದ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳಬೇಕು.

n ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಾಗಿ, (n-1) ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳು ರೂಪಿಸಲಾಗುತ್ತವೆ, ಇದರಿಂದ (n-1) ನೀರಿನ ಅಣುಗಳನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಆದರೆ, ಟರ್ಮಿನಲ್ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು (N-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ H ಮತ್ತು C-ಟರ್ಮಿನಸ್‌ನಲ್ಲಿ OH) ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳಲು, ನಾವು ಒಬ್ಬ ನೀರಿನ ಅಣುವನ್ನು ಹಿಂತಿರುಗಿಸುತ್ತೇವೆ.

ಉದಾಹರಣೆ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆ

ನಾವು ಸರಳ ತ್ರಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕೋಣ: Ala-Gly-Ser (AGS)

  1. ವೈಯಕ್ತಿಕ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ತೂಕಗಳನ್ನು ಮೊತ್ತ ಹಾಕಿ:

    • ಆಲಾನೈನ್ (A): 71.03711 Da
    • ಗ್ಲೈಸಿನ್ (G): 57.02146 Da
    • ಸೆರಿನ್ (S): 87.03203 Da
    • ಒಟ್ಟು: 215.0906 Da
  2. ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳಿಂದ ನೀರಿನ ಕಳೆವು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿ:

    • ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು = 3-1 = 2
    • ನೀರಿನ ಅಣು ತೂಕ = 18.01528 Da
    • ಒಟ್ಟು ನೀರಿನ ಕಳೆವು = 2 × 18.01528 = 36.03056 Da
  3. ಟರ್ಮಿನಲ್ ಗುಂಪುಗಳಿಗೆ ಒಬ್ಬ ನೀರಿನ ಅಣುವನ್ನು ಹಿಂತಿರುಗಿಸಿ:

    • 18.01528 Da
  4. ಅಂತಿಮ ಅಣು ತೂಕ:

    • 215.0906 - 36.03056 + 18.01528 = 197.07532 Da

ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಬಳಸುವುದು

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುವುದು ಸುಲಭ:

  1. ನಿಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ರಮವನ್ನು ಪಠ್ಯ ಬಾಕ್ಸಿನಲ್ಲಿ ನಮೂದಿಸಿ, ಮಾನಕ ಒಂದೇ-ಅಕ್ಷರ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಕೋಡ್‌ಗಳನ್ನು (A, R, N, D, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V) ಬಳಸಿಕೊಂಡು.

  2. ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ನಿಮ್ಮ ಇನ್ಪುಟ್ ಅನ್ನು ಸ್ವಾಯತ್ತವಾಗಿ ಪರಿಶೀಲಿಸುತ್ತದೆ ಇದು ಮಾತ್ರ ಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಕೋಡ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸಲು.

  3. "ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಿ" ಬಟನ್ ಅನ್ನು ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡಿ ಅಥವಾ ಸ್ವಾಯತ್ತ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಯನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಲು ಕಾಯಿರಿ.

  4. ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಿ, ಇದರಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ:

    • ಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (Da) ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾದ ಅಣು ತೂಕ
    • ಕ್ರಮದ ಉದ್ದ (ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು)
    • ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಪುನರಾವೃತ್ತ
    • ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಗೆ ಬಳಸುವ ಸೂತ್ರ
  5. ನೀವು ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ನಿಮ್ಮ ಕ್ಲಿಪ್‌ಬೋರ್ಡ್‌ಗೆ "ಕಾಪಿ" ಬಟನ್ ಕ್ಲಿಕ್ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ವರದಿಗಳಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಮುಂದಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಬಳಸಬಹುದು.

ಇನ್ಪುಟ್ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳು

ನಿಖರವಾದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಗಾಗಿ, ನಿಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ರಮವನ್ನು ನಮೂದಿಸುವಾಗ ಈ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳನ್ನು ಅನುಸರಿಸಿ:

  • ಮಾನಕ ಒಂದೇ-ಅಕ್ಷರ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಕೋಡ್‌ಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಬಳಸಿರಿ (ಮೇಲಿನ ಅಥವಾ ಕೆಳಗಿನ)
  • ಖಾಲಿ ಸ್ಥಳಗಳು, ಸಂಖ್ಯೆಗಳು ಅಥವಾ ವಿಶೇಷ ಚಿಹ್ನೆಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಬೇಡಿ
  • ಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಅಣು-ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಚಿಹ್ನೆಗಳನ್ನು ತೆಗೆದು ಹಾಕಿ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಕ್ರಮ ಸಂಖ್ಯೆ)
  • ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳೊಂದಿಗೆ ಕ್ರಮಗಳಿಗೆ, ವಿಸ್ತಾರಿತ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಕೋಡ್‌ಗಳನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುವ ಪರ್ಯಾಯ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಬಳಸಲು ಪರಿಗಣಿಸಿ

ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುವುದು

ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಹಲವಾರು ಮಾಹಿತಿಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ:

  1. ಅಣು ತೂಕ: ನಿಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಅಂದಾಜಿತ ಅಣು ತೂಕವು ಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (Da). ದೊಡ್ಡ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗಾಗಿ, ಇದು ಕಿಲೋಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (kDa) ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಬಹುದು.

  2. ಕ್ರಮ ಉದ್ದ: ನಿಮ್ಮ ಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟು ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು.

  3. ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಸಂಯೋಜನೆ: ನಿಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ವಿಷಯದ ದೃಶ್ಯ ಪುನರಾವೃತ್ತ, ಪ್ರತಿ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಮತ್ತು ಶೇಕಡಾವಾರು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.

  4. ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆ ವಿಧಾನ: ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲು ಬಳಸುವ ಸೂತ್ರವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಯ ವಿವರವಾದ ವಿವರಣೆ.

ಬಳಕೆದಾರ ಪ್ರಕರಣಗಳು

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್‌ವು ಜೀವನ ವಿಜ್ಞಾನಗಳ ವಿವಿಧ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಅನ್ವಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ:

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಶುದ್ಧೀಕರಣ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ

ಶೋಧಕರು ಅಣು ತೂಕದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ:

  • ಸೂಕ್ತ ಜೇಲ್ ಫಿಲ್ಟ್ರೇಶನ್ ಕಾಲಮ್‌ಗಳನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲು
  • SDS-PAGE ಗೆ ಸೂಕ್ತ ಪೊಲಿಯಾಕ್ರಿಲಾಮೈಡ್ ಜೇಲ್ ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್‌ಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು
  • ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಡೇಟಾವನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲು
  • ಪ್ರೋಟೀನ್ ವ್ಯಕ್ತೀಕರಣ ಮತ್ತು ಶುದ್ಧೀಕರಣದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಮಾನ್ಯಗೊಳಿಸಲು

ಪುನಃಸಂಸ್ಕೃತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉತ್ಪಾದನೆ

ಜೀವಜ್ಞಾನ ಕಂಪನಿಗಳು ನಿಖರವಾದ ಅಣು ತೂಕದ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸುತ್ತವೆ:

  • ವ್ಯಕ್ತೀಕರಣ ನಿರ್ಮಾಣಗಳನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲು
  • ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉತ್ಪಾದನೆಗಳನ್ನು ಅಂದಾಜಿಸಲು
  • ಶುದ್ಧೀಕರಣ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು
  • ಅಂತಿಮ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧಗೊಳಿಸಲು

ಪೆಪ್ಟೈಡ್ 합성

ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ತೂಕದ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ:

  • ಆರಂಭಿಕ ಸಾಮಾನುಗಳ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು
  • ಸಿದ್ಧಾಂತದ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲು
  • ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಿದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಗುರುತನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲು
  • ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣಕ್ಕಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲು

ರಚನಾತ್ಮಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ

ರಚನಾತ್ಮಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ತೂಕದ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ:

  • ಕ್ರಿಸ್ಟಲೈಸೇಶನ್ ಪ್ರಯೋಗಗಳನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲು
  • ಎಕ್ಸ್-ರೇ ವಿಕಿರಣ ಡೇಟಾವನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲು
  • ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು
  • ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧಗಳ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲು

ಔಷಧೀಯ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ

ಔಷಧ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಕಾರರು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ:

  • ಔಷಧೀಯ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧಗೊಳಿಸಲು
  • ರೂಪರೇಖಾ ತಂತ್ರಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು
  • ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲು
  • ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣ ನಿರ್ದಿಷ್ಟೀಕರಣಗಳನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲು

ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧ ಶೋಧನೆ

ಶಿಕ್ಷಣಾರ್ಥಿಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಶೋಧಕರು ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ:

  • ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಪ್ರಯೋಗಗಳಿಗೆ
  • ಡೇಟಾ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ
  • ಪ್ರಯೋಗಾತ್ಮಕ ವಿನ್ಯಾಸಕ್ಕೆ
  • ಶೈಕ್ಷಣಿಕ ಉದ್ದೇಶಗಳಿಗೆ

ಪರ್ಯಾಯಗಳು

ನಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ವೇಗವಾದ ಮತ್ತು ನಿಖರವಾದ ಅಂದಾಜುಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತಿದ್ದರೂ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಪರ್ಯಾಯ ವಿಧಾನಗಳಿವೆ:

  1. ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ವಿಧಾನಗಳು:

    • ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ (MS): ಅತ್ಯಂತ ನಿಖರವಾದ ಅಣು ತೂಕದ ಅಳೆಯುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪೋಸ್ಟ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಲೇಶನಲ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ
    • ಗಾತ್ರ ಹೊರಹರಿವು ಕ್ರೋಮಟೋಗ್ರಫಿ (SEC): ಹೈಡ್ರೋಡೈನಾಮಿಕ್ ವ್ಯಾಸವನ್ನು ಆಧರಿಸಿ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಅಂದಾಜಿಸುತ್ತದೆ
    • SDS-PAGE: ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಟಿಕ್ ಚಲನೆ ಆಧರಿಸಿ ಅಂದಾಜಿತ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ
  2. ಇತರ ಗಣಕ ಸಾಧನಗಳು:

    • ExPASy ProtParam: ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಮೀರಿಸುವ ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪ್ಯಾರಾಮೀಟರ್‌ಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ
    • EMBOSS Pepstats: ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ರಮಗಳ ವಿವರವಾದ ಅಂಕಿಅಂಶಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ
    • Protein Calculator v3.4: ಐಸೋಇಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಪಾಯಿಂಟ್ ಮತ್ತು ವಿಸ್ತರಣಾ ಗುಣಾಂಕವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಇತರ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ
  3. ವಿಶೇಷ ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್:

    • ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಅಥವಾ ಪೋಸ್ಟ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಲೇಶನಲ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ
    • ಸಂಕೀರ್ಣ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಸಂಬ್ಲಿಗಳು ಅಥವಾ ಮಲ್ಟಿಮೆರಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ
    • NMR ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಸುವ ಐಸೋಟೋಪಿಕ್ ಲೇಬಲ್‌ ಮಾಡಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ನಿರ್ಧಾರದ ಇತಿಹಾಸ

ಅಣು ತೂಕದ ಪರಿಕಲ್ಪನೆ 19ನೇ ಶತಮಾನದಲ್ಲಿ ಜಾನ್ ಡಾಲ್ಟನ್ ತನ್ನ ಅಣು ಸಿದ್ಧಾಂತವನ್ನು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದಾಗಿನಿಂದ ರಾಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರಕ್ಕೆ ಮೂಲಭೂತವಾಗಿದೆ. ಆದರೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗೆ ಅನ್ವಯಿಸುವುದು ಹೆಚ್ಚು ಇತ್ತೀಚಿನ ಇತಿಹಾಸವಿದೆ:

ಪ್ರಾಚೀನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಜ್ಞಾನ (1800-1920)

  • 1838ರಲ್ಲಿ, ಜೆಾನ್ ಜಾಕಬ್ ಬೆರ್ಝೆಲಿಯಸ್ "ಪ್ರೋಟೀನ್" ಎಂಬ ಪದವನ್ನು "ಪ್ರಾಥಮಿಕ" ಅಥವಾ "ಮೊದಲ ಮಹತ್ವ" ಎಂಬ ಅರ್ಥವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಗ್ರೀಕ್ ಶಬ್ದದಿಂದ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಿದರು.
  • ಫ್ರೆಡರಿಕ್ ಸ್ಯಾಂಜರ್‌ನಂತಹ ಪ್ರಾಚೀನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಂದ ರೂಪಿತವಾಗಿವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿದರು.
  • ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳನ್ನು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಣು ತೂಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣ ಮಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್‌ಗಳಾಗಿ ಪರಿಗಣಿಸುವ ಪರಿಕಲ್ಪನೆ ಕ್ರಮೇಣ ಬೆಳೆಯಿತು.

ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ (1930-1960)

  • ಥಿಯೋಡೋರ್ ಸ್ವೆಡ್ಬರ್ಗ್ ಅವರಿಂದ 1920ರ ದಶಕದಲ್ಲಿ ಉಲ್ಟ್ರಾಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಗೇಶನ್ ಅನ್ನು ಆವಿಷ್ಕಾರ ಮಾಡಲಾಗಿದ್ದು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕದ ಮೊದಲ ನಿಖರವಾದ ಅಳೆಯುವಿಕೆಗಳನ್ನು ಅನುಮತಿಸಿತು.
  • 1930ರ ದಶಕದಲ್ಲಿ ಅರ್ಣೆ ಟಿಸಿಯಲಿಯಸ್ ಅವರಿಂದ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್ ತಂತ್ರಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಅಂದಾಜಿಸಲು ಇನ್ನೊಂದು ವಿಧಾನವನ್ನು ಒದಗಿಸಿತು.
  • 1958ರಲ್ಲಿ, ಸ್ಟಾನ್‌ಫೋರ್ಡ್ ಮೂರ್ ಮತ್ತು ವಿಲಿಯಮ್ ಎಚ್. ಸ್ಟೈನ್ ರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್‌ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಕ್ರಮವನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಿದರು, ಇದು ನಿಖರವಾದ ಅಣು ತೂಕದ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸಿತು.

ಆಧುನಿಕ ಯುಗ (1970-ಪ್ರಸ್ತುತ)

  • ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕದ ನಿರ್ಧಾರವನ್ನು ಕ್ರಾಂತಿಕಾರಿಯಾಗಿ ಬದಲಾಯಿಸಿತು.
  • ಜಾನ್ ಫೆನ್ ಮತ್ತು ಕೋಇಚಿ ಟಾನಕಾ 2002ರಲ್ಲಿ ಜೀವಿ ಮಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್‌ಗಳ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಸಾಫ್ಟ್ ಡಿಸಾರ್ಪ್ಷನ್ ಐಯೊನೈಸೇಶನ್ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದ್ದಕ್ಕಾಗಿ ರಾಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ನೊಬೆಲ್ ಪ್ರಶಸ್ತಿಯನ್ನು ಪಡೆದರು.
  • ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುವ ಗಣಕ ವಿಧಾನಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಸುಧಾರಿತ ಮತ್ತು ಲಭ್ಯವಾಗುವಂತಾಗಿವೆ.
  • 1990 ಮತ್ತು 2000ರ ದಶಕಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್‌ನ ಉದಯವು ಉನ್ನತ-ಪರಿಮಾಣದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಸಾಧನಗಳಿಗೆ ಅಗತ್ಯವಾಯಿತು, ಇದರಲ್ಲಿ ಸ್ವಾಯತ್ತ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್‌ಗಳು ಸೇರಿವೆ.

ಇಂದು, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕದ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವುದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ವಿಜ್ಞಾನದಲ್ಲಿ ನಿಯಮಿತ ಆದರೆ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಭಾಗವಾಗಿದೆ, ನಮ್ಮ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್‌ಂತಹ ಸಾಧನಗಳಿಂದ ಈ ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವಿಕೆಗಳನ್ನು ವಿಶ್ವಾದ್ಯಾಂತ ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಲಭ್ಯವಾಗಿಸುತ್ತದೆ.

ಕೋಡ್ ಉದಾಹರಣೆಗಳು

ಇಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಭಾಷೆಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕುವ ವಿಧಾನಗಳ ಉದಾಹರಣೆಗಳಿವೆ:

1' Excel VBA ಕಾರ್ಯವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕುತ್ತದೆ
2Function ProteinMolecularWeight(sequence As String) As Double
3    ' ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಅಣು ತೂಕಗಳು
4    Dim aaWeights As Object
5    Set aaWeights = CreateObject("Scripting.Dictionary")
6    
7    ' ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ತೂಕಗಳನ್ನು ಆರಂಭಿಸಿ
8    aaWeights("A") = 71.03711
9    aaWeights("R") = 156.10111
10    aaWeights("N") = 114.04293
11    aaWeights("D") = 115.02694
12    aaWeights("C") = 103.00919
13    aaWeights("E") = 129.04259
14    aaWeights("Q") = 128.05858
15    aaWeights("G") = 57.02146
16    aaWeights("H") = 137.05891
17    aaWeights("I") = 113.08406
18    aaWeights("L") = 113.08406
19    aaWeights("K") = 128.09496
20    aaWeights("M") = 131.04049
21    aaWeights("F") = 147.06841
22    aaWeights("P") = 97.05276
23    aaWeights("S") = 87.03203
24    aaWeights("T") = 101.04768
25    aaWeights("W") = 186.07931
26    aaWeights("Y") = 163.06333
27    aaWeights("V") = 99.06841
28    
29    ' ನೀರಿನ ಅಣು ತೂಕ
30    Const WATER_WEIGHT As Double = 18.01528
31    
32    ' ಕ್ರಮವನ್ನು ಮೇಲ್ಮಟ್ಟಕ್ಕೆ ಪರಿವರ್ತಿಸಿ
33    sequence = UCase(sequence)
34    
35    ' ಒಟ್ಟು ತೂಕವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಿ
36    Dim totalWeight As Double
37    totalWeight = 0
38    
39    ' ವೈಯಕ್ತಿಕ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ತೂಕವನ್ನು ಮೊತ್ತ ಹಾಕಿ
40    Dim i As Integer
41    For i = 1 To Len(sequence)
42        Dim aa As String
43        aa = Mid(sequence, i, 1)
44        
45        If aaWeights.Exists(aa) Then
46            totalWeight = totalWeight + aaWeights(aa)
47        Else
48            ' ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಕೋಡ್ ಅಮಾನ್ಯ
49            ProteinMolecularWeight = -1
50            Exit Function
51        End If
52    Next i
53    
54    ' ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳಿಂದ ನೀರಿನ ಕಳೆವು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ಟರ್ಮಿನಲ್ ನೀರನ್ನು ಸೇರಿಸಿ
55    Dim numAminoAcids As Integer
56    numAminoAcids = Len(sequence)
57    
58    ProteinMolecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
59End Function
60
61' Excel ನಲ್ಲಿ ಬಳಸುವುದು:
62' =ProteinMolecularWeight("ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY")
63

ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕೇಳುವ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳು

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವೇನು?

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ, ಅಣು ಮಾಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (Da) ಅಥವಾ ಕಿಲೋಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (kDa) ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾಕ್ರೋಮಾಲಿಕ್ಯೂಲ್‌ನ ಒಟ್ಟು ತೂಕವಾಗಿದೆ. ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಎಲ್ಲಾ ಅಣುಗಳ ಒಟ್ಟು ತೂಕವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ, ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಕಳೆದುಕೊಂಡ ನೀರಿನ ಅಣುಗಳನ್ನು ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಮೂಲಭೂತ ಗುಣವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಿಕರ, ಶುದ್ಧೀಕರಣ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅತ್ಯಂತ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ.

ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಎಷ್ಟು ನಿಖರವಾಗಿದೆ?

ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ಕ್ರಮವನ್ನು ಆಧರಿಸಿ ತಾತ್ತ್ವಿಕ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಅತ್ಯಂತ ನಿಖರವಾಗಿ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಮಾನಕ ಮೋನೋಐಸೊಟೋಪಿಕ್ ತೂಕಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ನೀರಿನ ಕಳೆವುಗಳನ್ನು ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಆದರೆ, ಇದು ಪೋಸ್ಟ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಲೇಶನಲ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು, ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಅಥವಾ ವಾಸ್ತವ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವ ಐಸೋಟೋಪಿಕ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳುವುದಿಲ್ಲ.

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕದ ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಯಾವ ಘಟಕಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ?

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (Da) ಅಥವಾ ಕಿಲೋಡಾಲ್ಟನ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (kDa) ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ 1 kDa 1,000 Da ಗೆ ಸಮಾನವಾಗಿದೆ. ಡಾಲ್ಟನ್ ಸುಮಾರು ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಅಣುವಿನ ತೂಕಕ್ಕೆ ಸಮಾನವಾಗಿದೆ (1.66 × 10^-24 ಗ್ರಾಂ). ಉಲ್ಲೇಖಕ್ಕಾಗಿ, ಸಣ್ಣ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳು ಕೆಲವು ಶತದಶಕಗಳ Da, ಆದರೆ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಶತಕೋಷ್ಟದ kDa ಇರಬಹುದು.

ನನ್ನ ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾದ ಅಣು ತೂಕವು ಪ್ರಯೋಗಾತ್ಮಕ ಮೌಲ್ಯಗಳಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುವುದೇಕೆ?

ಲೆಕ್ಕಹಾಕಿದ ಮತ್ತು ಪ್ರಯೋಗಾತ್ಮಕ ಅಣು ತೂಕಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುವ ಹಲವಾರು ಅಂಶಗಳಿವೆ:

  1. ಪೋಸ್ಟ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಲೇಶನಲ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು (ಫೋಸ್ಫೋರೀಲೇಶನ್, ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಶನ್ ಇತ್ಯಾದಿ)
  2. ಡಿಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ
  3. ಪ್ರೊಟಿಯೋಲಿಟಿಕ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆ
  4. ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳು
  5. ಪ್ರಯೋಗಾತ್ಮಕ ಅಳೆಯುವಿಕೆ ದೋಷಗಳು
  6. ಐಸೋಟೋಪಿಕ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳು

ಮಾರ್ಪಡಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ನಿಖರವಾದ ಅಣು ತೂಕದ ನಿರ್ಧಾರಕ್ಕಾಗಿ, ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.

ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಬಹುದೆ?

ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ 20 ಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಅವರ ಒಂದೇ-ಅಕ್ಷರ ಕೋಡ್‌ಗಳನ್ನು (A, R, N, D, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V) ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲಗಳು, ಸೆಲೆನೋಸಿಸ್ಟೈನ್, ಪೈರೋಲೈಸಿನ್ ಅಥವಾ ಇತರ ಮಾರ್ಪಟ್ಟ ಉಲ್ಲೇಖಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ, ವಿಸ್ತಾರಿತ ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲ ಕೋಡ್‌ಗಳನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುವ ವಿಶೇಷ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಬಳಸುವುದು ಅಗತ್ಯವಿದೆ.

ನಾನು ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಹೇಗೆ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು?

ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಅಣು ತೂಕವು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧಗೊಳಿಸುವಿಕೆ, ಶುದ್ಧೀಕರಣ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಪ್ರಮುಖ ಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧಗೊಳಿಸಲು, ಶುದ್ಧೀಕರಣ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಮತ್ತು ಪ್ರಯೋಗಾತ್ಮಕ ವಿನ್ಯಾಸದಲ್ಲಿ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.

ಅಣು ತೂಕದ ಸರಾಸರಿ ಮತ್ತು ಮೋನೋಐಸೊಟೋಪಿಕ್ ಅಣು ತೂಕದ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವೇನು?

  • ಮೋನೋಐಸೊಟೋಪಿಕ್ ಅಣು ತೂಕ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಅಂಶದ ಅತ್ಯಂತ ಸಮೃದ್ಧ ಐಸೊಟೋಪ್‌ನ ತೂಕವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ (ಇದು ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ)
  • ಸರಾಸರಿ ಅಣು ತೂಕ ಎಲ್ಲಾ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಐಸೊಟೋಪ್‌ಗಳ ತೂಕದ ತೂಕಿತ ಸರಾಸರಿಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ

ಸಣ್ಣ ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳಿಗೆ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ಕಡಿಮೆ, ಆದರೆ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳಿಗೆ ಇದು ಹೆಚ್ಚು ಮಹತ್ವಪೂರ್ಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳಿಗೆ ಮೋನೋಐಸೊಟೋಪಿಕ್ ತೂಕಗಳನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ದೊಡ್ಡದಾದವರಿಗೆ ಸರಾಸರಿ ತೂಕಗಳನ್ನು ಅಳೆಯುತ್ತದೆ.

ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ N-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಮತ್ತು C-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ?

ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ N-ಟರ್ಮಿನಲ್ (NH₂-) ಮತ್ತು C-ಟರ್ಮಿನಲ್ (-COOH) ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಪರಿಗಣಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಕಳೆದುಕೊಂಡ ನೀರಿನ ಅಣುವನ್ನು (18.01528 Da) ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ನಂತರ ಒಂದೇ ನೀರಿನ ಅಣುವನ್ನು ಸೇರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾದ ಅಣು ತೂಕವು ಸರಿಯಾದ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಂಪೂರ್ಣ ಪ್ರೋಟೀನನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸುತ್ತದೆ.

ನಾನು ಡಿಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ಲೆಕ್ಕಹಾಕಬಹುದೆ?

ಹೌದು, ಆದರೆ ಈ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಡಿಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ಸ್ವಾಯತ್ತವಾಗಿ ಸರಿಹೊಂದಿಸುತ್ತಿಲ್ಲ. ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಡಿಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧದ ರೂಪದಲ್ಲಿ ಎರಡು ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಅಣುಗಳನ್ನು (2.01588 Da) ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಡಿಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ಗಮನದಲ್ಲಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳಲು, ಲೆಕ್ಕಹಾಕಲಾದ ಅಣು ತೂಕದಿಂದ ಪ್ರತಿ ಡಿಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಕ್ಕಾಗಿ 2.01588 Da ಅನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿರಿ.

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗಾತ್ರಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಹೇಗೆ?

ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗಾತ್ರಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿದ್ದರೂ, ಸಂಬಂಧವು ಯಾವಾಗಲೂ ಸರಳವಾಗಿಲ್ಲ. ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಶಾರೀರಿಕ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಅಂಶಗಳು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ:

  • ಅಮೀನೋ ಆಮ್ಲದ ವಿಷಯ
  • ದ್ವಿತೀಯ ಮತ್ತು ತೃತೀಯ ರಚನೆ
  • ಹೈಡ್ರೇಶನ್ ಶೆಲ್
  • ಪೋಸ್ಟ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್‌ಲೇಶನಲ್ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು
  • ಪರಿಸರದ ಸ್ಥಿತಿಗಳು (pH, ಉಪ್ಪು ಕಾನ್ಸೆಂಟ್ರೇಶನ್)

ಒಂದು ಅಂದಾಜಿಗೆ, 10 kDa ಯ globular ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ವ್ಯಾಸವು ಸುಮಾರು 2-3 ನ್ಯಾನ್ ಮೀಟರ್.

ಉಲ್ಲೇಖಗಳು

  1. ಗಾಸ್ಟೈಗರ್ ಇ., ಹೂಗ್ಲಾಂಡ್ ಸಿ., ಗಟ್ಟಿಕರ್ ಎ., ದುವಾುದ್ದ್ ಎಸ್., ವಿಲ್ಕಿನ್ಸ್ ಎಮ್.ಆರ್., ಆಪೆಲ್ ಆರ್.ಡಿ., ಬೈರೋಚ್ ಎ. (2005) ExPASy ಸರ್ವರ್‌ನಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣಾ ಸಾಧನಗಳು. In: ವಾಕ್ ಜೆ.ಎಮ್. (eds) The Proteomics Protocols Handbook. ಹ್ಯೂಮನಾ ಪ್ರೆಸ್.

  2. ನೆಲ್ಸನ್, ಡಿ. ಎಲ್., & ಕಾಕ್, ಎಮ್. ಎಮ್. (2017). Lehninger Principles of Biochemistry (7ನೇ ಆವೃತ್ತಿ). W.H. ಫ್ರೀಮನ್ ಮತ್ತು ಕಂಪನಿಯು.

  3. ನಿಲ್ಲಿಸುವುದು, ಹೆಚ್., & ಮಾನ್, ಎಮ್. (2004). ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಕ್ರಮಾಂಕಣದ ABCಗಳು (ಮತ್ತು XYZಗಳು). ನೈಸರ್ಗಿಕ ವಿಮರ್ಶೆಗಳು ಅಣು ಶ್ರೇಣೀಬದ್ಧ ವಿಜ್ಞಾನ, 5(9), 699-711.

  4. ವೋಟ್, ಡಿ., ವೋಟ್, ಜೆ. ಜಿ., & ಪ್ರಾಟ್, ಸಿ. ಡಬ್ಲ್ಯೂ. (2016). ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಮೂಲಭೂತಗಳು: ಅಣು ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಜೀವನ (5ನೇ ಆವೃತ್ತಿ). ವೈಲಿ.

  5. ಕ್ರೈಟನ್, ಟಿ. ಇ. (2010). ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಭೌತಶಾಸ್ತ್ರ. ಹೆಲ್ವೆಟಿಯನ್ ಪ್ರೆಸ್.

  6. ಯುನಿಪ್ರಾಟ್ ಕಾನ್ಸಾರ್ಟಿಯಂ. (2021). 2021 ರಲ್ಲಿ ಯುನಿಪ್ರಾಟ್: ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜ್ಞಾನಕೋಶ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಶೋಧನೆ, 49(D1), D480-D489.

  7. ಆರ್ಟಿಮೋ, ಪಿ., ಜೋನ್ನಾಲೇಜಡ್ಡಾ, ಎಮ್., ಅರ್ಣೋಲ್ಡ್, ಕೆ., ಬಾರಟಿನ್, ಡಿ., ಸರ್ಡಿ, ಜಿ., ಡೆ ಕ್ಯಾಸ್ಟ್ರೋ, ಇ., ದುವಾುದ್ದ್, ಎಸ್., ಫ್ಲೆಗಲ್, ವಿ., ಫೋರ್ಟ್‌ಯರ್, ಎ., ಗಾಸ್ಟೈಗರ್, ಇ., ಗ್ರೋಸ್ಡಿಡಿಯರ್, ಎ., ಹೆರ್ನಾಂಡಜ್, ಸಿ., ಐಒಎನ್ನಿಡಿಸ್, ವಿ., ಕುಜ್ನೆಟ್ಸೋವ್, ಡಿ., ಲೀಚ್ಟಿ, ಆರ್., ಮೋಸ್ಟಾಗ್ವಿರ್, ಕೆ., ರೆಡಾಸ್ಚಿ, ಎನ್., ರೋಸಿಯರ್, ಜಿ., & ಸ್ಟಾಕ್‌ಇಂಗರ್, ಹೆಚ್. (2012). ExPASy: SIB ಜೀವವಿಜ್ಞಾನ ಸಂಪತ್ತು ಪೋರ್ಟಲ್. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳ ಸಂಶೋಧನೆ, 40(W1), W597-W603.

  8. ಕಿಂಟರ್, ಎಮ್., & ಶರ್ಮನ್, ಎನ್. ಇ. (2005). Tandem ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಬಳಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ರಮಾಂಕಣ ಮತ್ತು ಗುರುತಿಸುವಿಕೆ. ವೈಲಿ-ಇಂಟರ್‌ಸೈನ್ಸ್.

ನಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಣು ತೂಕ ಕ್ಯಾಲ್ಕುಲೇಟರ್ ಅನ್ನು ಇಂದು ಪ್ರಯತ್ನಿಸಿ, ನಿಮ್ಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ರಮಗಳ ಅಣು ತೂಕವನ್ನು ತಕ್ಷಣ ಮತ್ತು ನಿಖರವಾಗಿ ನಿರ್ಧರಿಸಲು. ನೀವು ಪ್ರಯೋಗಗಳನ್ನು ಯೋಜಿಸುತ್ತಿದ್ದರೂ, ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತಿದ್ದರೂ ಅಥವಾ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಬಗ್ಗೆ ಕಲಿಯುತ್ತಿದ್ದರೂ, ಈ ಸಾಧನವು ನಿಮಗೆ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಕ್ಷಣಗಳಲ್ಲಿ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ.

🔗

தொடர்புடைய கருவிகள்

உங்கள் பணிப்பாக்கிலுக்கு பயனுள்ள மேலும் பயனுள்ள கருவிகளைக் கண்டறியவும்

புரத மையம் கணக்கீட்டாளர்: உறிஞ்சல் மதிப்பீட்டை mg/mL ஆக மாற்றவும்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

DNA மையம் கணக்கீட்டாளர்: A260 ஐ ng/μL க்கு மாற்றவும்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

குதிரை எடை மதிப்பீட்டாளர்: உங்கள் குதிரையின் எடையை துல்லியமாக கணக்கிடவும்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

மூலக்கூறியல் சோதனைகளுக்கான DNA இணைப்பு கணக்கீட்டாளர்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

BMI கணக்கீட்டாளர்: உங்கள் உடல் பருமன் குறியீட்டை கணக்கிடுங்கள்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

எலெமென்டல் கணக்கீட்டாளர்: அணு எண்ணினால் அணுக்கருவிகளை கண்டறியவும்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

எலெமென்டல் மாஸ் கணக்கீட்டாளர்: உருப்படிகளின் அணு எடைகளை கண்டறியவும்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

அணுக்கூறு அமைப்புக்கான வேதியியல் பிணைப்பு ஒழுங்கு கணக்கீட்டாளர்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க

நாயின் ஆரோக்கியம் குறியீட்டு கணக்கீட்டாளர்: உங்கள் நாயின் BMI ஐ சரிபார்க்கவும்

இந்த கருவியை முயற்சி செய்க