ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ | ਮੁਫਤ MW ਟੂਲ

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ

ਜਾਣ-ਪਛਾਣ

ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਨਾਲ ਕੰਮ ਕਰਨ ਦਾ ਮਤਲਬ ਹੈ ਕਿ ਤੁਹਾਨੂੰ ਲਗਾਤਾਰ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦਾ ਹਿਸਾਬ ਲਗਾਉਣਾ ਪਵੇਗਾ। ਭਾਵੇਂ ਤੁਸੀਂ SDS-PAGE ਲਈ ਤਿਆਰ ਹੋ, ਜੈਲ ਫਿਲਟ੍ਰੇਸ਼ਨ ਸੈੱਟ ਅਪ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਜਾਂ ਮਾਸ ਸਪੈਕ ਦੇ ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਆਪਣੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਦੇ ਸੈਧਾਂਤਿਕ ਭਾਰ ਨੂੰ ਜਾਣਨਾ ਮੌਲਿਕ ਹੈ।

ਇਹ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਤੁਹਾਨੂੰ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਅਨੁਕ੍ਰਮਾਂ ਤੋਂ ਤੁਰੰਤ, ਸਟੀਕ ਨਤੀਜੇ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਮਿਆਰੀ ਇੱਕ-ਅੱਖਰ ਕੋਡਾਂ (ਜਿਵੇਂ MVKMDVYKGSSIGDSMSRSM) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਆਪਣਾ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਦਾਖਲ ਕਰੋ, ਅਤੇ ਤੁਹਾਨੂੰ ਡਾਲਟਨ ਵਿੱਚ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਅਤੇ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਸੰਰਚਨਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਮਿਲੇਗਾ। ਇਸਨੂੰ ਵਿਵਹਾਰ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉਪਯੋਗੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ ਆਟੋਮੈਟਿਕ ਵੈਲੀਡੇਸ਼ਨ—ਇਹ ਅਵੈਧ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਕੋਡਾਂ ਨੂੰ ਫੜ ਲੈਂਦਾ ਹੈ ਇਸ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ ਕਿ ਤੁਸੀਂ ਡਾਊਨਸਟ੍ਰੀਮ ਸਮੱਸਿਆ ਨਿਵਾਰਣ ਵਿੱਚ ਸਮਾਂ ਬਰਬਾਦ ਕਰੋ।

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਭਾਰਾਂ ਦਾ ਯੋਗ ਹੈ, ਪੈਪਟਾਈਡ ਬੰਧ ਬਣਨ ਦੌਰਾਨ ਖਤਮ ਹੋਏ ਪਾਣੀ ਦੇ ਮੋਲੇਕਿਊਲਾਂ ਨੂੰ ਘਟਾ ਕੇ। ਤੁਸੀਂ ਇਸ ਮੁੱਲ ਨੂੰ ਡਾਲਟਨ (Da) ਜਾਂ ਕਿਲੋਡਾਲਟਨ (kDa) ਵਿੱਚ ਵਿਅਕਤ ਹੁੰਦੇ ਹੋਏ ਵੇਖੋਗੇ, ਜਿੱਥੇ 1 kDa 1,000 Da ਦੇ ਬਰਾਬਰ ਹੈ। ਇੱਥੇ ਕੁਝ ਯਾਦ ਰੱਖਣ ਲਈ ਹੈ: ਇਹ ਗਣਨਾ ਤੁਹਾਨੂੰ ਸਿਰਫ਼ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਸੈਧਾਂਤਿਕ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਅਸਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਕਸਰ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਪੋਸਟ-ਟ੍ਰਾਂਸਲੇਸ਼ਨਲ ਸੋਧਾਂ ਦੇ ਕਾਰਨ, ਜੋ ਕਿ ਕੁਝ ਡਾਲਟਨ (ਫਾਸਫੋਰਾਈਲੇਸ਼ਨ) ਤੋਂ ਲੈ ਕੇ ਕਈ ਕਿਲੋਡਾਲਟਨ (ਗਲਾਈਕੋਸਾਈਲੇਸ਼ਨ) ਤੱਕ ਜੋੜ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ।

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਿਵੇਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ

ਮੂਲ ਫਾਰਮੂਲਾ

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਹੇਠ ਦਿੱਤੇ ਫਾਰਮੂਲੇ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਗਣਨਾ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ:

$MW_{protein} = \sum_{i=1}^{n} MW_{amino acid_i} - (n-1) \times MW_{water} + MW_{water}$

ਜਿੱਥੇ:

• $MW_{protein}$ ਡਾਲਟਨ (Da) ਵਿੱਚ ਪੂਰੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਹੈ
• $\sum_{i=1}^{n} MW_{amino acid_i}$ ਸਾਰੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੇ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦਾ ਯੋਗ ਹੈ
• $n$ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਵਿੱਚ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਹੈ
• $MW_{water}$ ਪਾਣੀ ਦਾ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ (18.01528 Da) ਹੈ
• $(n-1)$ ਬਣੇ ਪੈਪਟਾਈਡ ਬੰਧਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ
• ਅੰਤਮ $+ MW_{water}$ ਪੜਾਅ ਟਰਮੀਨਲ ਸਮੂਹਾਂ (H ਅਤੇ OH) ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਰੱਖਦਾ ਹੈ

[ਬਾਕੀ ਅਨੁਵਾਦ ਜਾਰੀ ਰਹੇਗਾ...]

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲੈਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਿਵੇਂ ਕਰੀਏ

ਇਸ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਸਕਿੰਟਾਂ ਵਿੱਚ ਹੋ ਜਾਂਦੀ ਹੈ:

1. ਆਪਣਾ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਟੈਕਸਟ ਬਾਕਸ ਵਿੱਚ ਪੇਸਟ ਕਰੋ। ਮਾਨਕ ਇੱਕ-ਅੱਖਰ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਕੋਡ (A, R, N, D, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V) ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰੋ। ਵੱਡੇ ਅਤੇ ਛੋਟੇ ਅੱਖਰ ਦੋਵੇਂ ਠੀਕ ਹਨ।

2. ਵੈਲੀਡੇਸ਼ਨ ਆਪਣੇ ਆਪ ਹੁੰਦਾ ਹੈ—ਤੁਸੀਂ ਤੁਰੰਤ ਵੇਖ ਸਕੋਗੇ ਕਿ ਤੁਹਾਡੇ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਵਿੱਚ ਅਵੈਧ ਅੱਖਰ ਹਨ ਜਾਂ ਨਹੀਂ। ਇਹ ਆਮ ਗਲਤੀਆਂ ਨੂੰ ਫੜਦਾ ਹੈ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਅਨਜਾਣੇ ਵਿੱਚ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਨੰਬਰ ਜਾਂ FASTA ਹੈਡਰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨਾ।

3. ਨਤੀਜੇ ਤੁਰੰਤ ਦਿਖਾਈ ਦਿੰਦੇ ਹਨ ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ:

   • ਡਾਲਟਨਸ (Da) ਵਿੱਚ ਮੋਲੈਕਿਊਲਰ ਭਾਰ
   • ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਲੰਬਾਈ (ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਗਿਣਤੀ)
   • ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਸੰਰਚਨਾ ਵੇਰਵਾ
   • ਵਰਤੀ ਗਈ ਗਣਨਾ ਵਿਧੀ

4. ਨਤੀਜਿਆਂ ਨੂੰ ਕਲਿੱਪਬੋਰਡ 'ਤੇ ਕਾਪੀ ਕਰੋ ਇੱਕ ਕਲਿੱਕ ਨਾਲ ਲੈਬ ਨੋਟਬੁੱਕਾਂ, ਰਿਪੋਰਟਾਂ ਜਾਂ ਹੋਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ।

ਇੱਕ ਆਮ ਕਾਰਜ ਪ੍ਰਵਾਹ: ਯੂਨੀਪ੍ਰੋਟ ਜਾਂ ਤੁਹਾਡੇ ਪਲਾਸਮਿਡ ਡੇਟਾਬੇਸ ਤੋਂ ਇੱਕ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਕਾਪੀ ਕਰੋ, ਇਸਨੂੰ ਇੱਥੇ ਪੇਸਟ ਕਰੋ, ਮੋਲੈਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰੋ, ਫਿਰ ਉਸ ਮੁੱਲ ਨੂੰ ਆਪਣੇ ਜੈਲ ਫਿਲਟ੍ਰੇਸ਼ਨ ਕਾਲਮ ਨੂੰ ਸੈੱਟ ਕਰਨ ਜਾਂ ਵੈਸਟਰਨ ਬਲਾਟ 'ਤੇ ਅਪੇਖਿਤ ਬੈਂਡ ਸਥਿਤੀ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤੋ।

ਸਟੀਕ ਨਤੀਜਿਆਂ ਲਈ ਇਨਪੁਟ ਮਾਰਗਦਰਸ਼ਨ

ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਦਾਖਲ ਕਰਦੇ ਸਮੇਂ ਇਨ੍ਹਾਂ ਸੁਝਾਵਾਂ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਰੱਖੋ:

• ਕੇਵਲ ਮਾਨਕ ਇੱਕ-ਅੱਖਰ ਕੋਡ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰੋ (ਵੱਡੇ ਜਾਂ ਛੋਟੇ ਅੱਖਰ ਦੋਵੇਂ ਠੀਕ ਹਨ)
• FASTA ਹੈਡਰ ਨੂੰ ਹਟਾਓ — ਇੱਕ ਆਮ ਗਲਤੀ ਹੈ > ਹੈਡਰ ਲਾਈਨ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਨਾ
• ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਨੰਬਰਿੰਗ ਨੂੰ ਹਟਾਓ — ਜੇਕਰ ਤੁਸੀਂ ਅਲਾਈਨਮੈਂਟ ਸਾਫਟਵੇਅਰ ਤੋਂ ਕਾਪੀ ਕਰਦੇ ਹੋ, ਤਾਂ ਪਹਿਲਾਂ ਸਥਿਤੀ ਨੰਬਰਾਂ ਨੂੰ ਹਟਾ ਦਿਓ
• ਅਸਪਸ਼ਟ ਕੋਡਾਂ 'ਤੇ ਨਜ਼ਰ ਰੱਖੋ — X, B, Z, ਅਤੇ J ਸਮਰਥਿਤ ਨਹੀਂ ਹਨ; ਤੁਹਾਨੂੰ ਇਨ੍ਹਾਂ ਨੂੰ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡਾਂ ਨਾਲ ਬਦਲਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੋਵੇਗੀ
• ਗੈਰ-ਮਾਨਕ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡਾਂ ਲਈ (ਸੈਲੀਨੋਸਿਸਟੀਨ, ਪਾਇਰੋਲਿਸਾਈਨ, ਸੋਧੇ ਗਏ ਅਵਸ਼ੇਸ਼) — ਇਹ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਸਟੀਕ ਨਤੀਜੇ ਨਹੀਂ ਦੇਵੇਗਾ। ਤੁਹਾਨੂੰ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਔਜਾਰਾਂ ਜਾਂ ਮੈਨੁਅਲ ਗਣਨਾਵਾਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੋਵੇਗੀ ਜੋ ਸਹੀ ਸੋਧਾਂ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਰੱਖਦੀਆਂ ਹਨ।

ਨਤੀਜਿਆਂ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ

ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਕਈ ਜਾਣਕਾਰੀਆਂ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ:

1. ਮੋਲੈਕਿਊਲਰ ਭਾਰ: ਡਾਲਟਨਸ (Da) ਵਿੱਚ ਤੁਹਾਡੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨਿਤ ਮੋਲੈਕਿਊਲਰ ਭਾਰ। ਵੱਡੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਲਈ, ਇਹ ਕਿਲੋਡਾਲਟਨਸ (kDa) ਵਿੱਚ ਦਰਸਾਇਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।

2. ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਲੰਬਾਈ: ਤੁਹਾਡੇ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਵਿੱਚ ਕੁੱਲ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ।

3. ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਸੰਰਚਨਾ: ਤੁਹਾਡੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਸਮੱਗਰੀ ਦਾ ਇੱਕ ਦ੍ਰਿਸ਼ ਵੇਰਵਾ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਹਰੇਕ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਅਤੇ ਪ੍ਰਤੀਸ਼ਤਤਾ ਦਿਖਾਈ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।

4. ਗਣਨਾ ਵਿਧੀ: ਮੋਲੈਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਿਵੇਂ ਕੀ

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਗਣਨਾ ਦੇ ਆਮ ਉਪਯੋਗ ਕੇਸ

ਇੱਥੇ ਉਹ ਸਥਾਨ ਹਨ ਜਿੱਥੇ ਆਪਣੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਨੂੰ ਜਾਣਨਾ ਰੋਜ਼ਾਨਾ ਲੈਬ ਦੇ ਕੰਮ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੁੰਦਾ ਹੈ:

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸ਼ੁੱਧੀਕਰਣ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸ਼ੁੱਧ ਕਰਦੇ ਸਮੇਂ, ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਫੈਸਲੇ ਲੈਣ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰਦਾ ਹੈ:

• ਜੈਲ ਫਿਲਟ੍ਰੇਸ਼ਨ ਸੈਟਅੱਪ — ਤੁਸੀਂ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਰੇਂਜ ਦੇ ਅਧਾਰ 'ਤੇ ਕਾਲਮ ਰੇਸਿਨ ਚੁਣੋਗੇ। 50 kDa ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲਈ, ਸੁਪਰਡੈਕਸ 75 ਚੰਗਾ ਕੰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ; 100 kDa ਤੋਂ ਉੱਪਰ, ਸੁਪਰਡੈਕਸ 200 ਵਿੱਚ ਬਦਲੋ।
• SDS-PAGE ਜੈਲ ਸਾੰਦ੍ਰਤਾ — ਛੋਟੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (< 20 kDa) ਨੂੰ ਚੰਗੀ ਰੇਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਲਈ 15% ਜੈਲ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਜਦੋਂ ਕਿ ਵੱਡੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ (> 100 kDa) 8% ਜੈਲ 'ਤੇ ਬਿਹਤਰ ਚੱਲਦੇ ਹਨ। ਸਹੀ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਜਾਣਨਾ ਤੁਹਾਨੂੰ ਸਹੀ ਪ੍ਰਤੀਸ਼ਤ ਚੁਣਨ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰਦਾ ਹੈ।
• ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰੀ ਵੈਲੀਡੇਸ਼ਨ — ਤੁਹਾਡਾ ਗਣਨਾ ਕੀਤਾ ਸੈਧਾਂਤਿਕ ਭਾਰ ਤੁਹਾਡੇ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਮਾਸ ਸਪੈਕ ਨਤੀਜਿਆਂ ਨਾਲ ਕੁਝ ਡਾਲਟਨ ਦੇ ਅੰਦਰ ਮੇਲ ਖਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ। ਵੱਡੇ ਅੰਤਰ ਅਣਅਪੇਖਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਓਲਿਸਿਸ ਜਾਂ ਸੋਧਾਂ ਦੇ ਸੰਕੇਤ ਹਨ।
• ਅਭਿਵਿਅਕਤੀ ਤਸਦੀਕ — ਜਦੋਂ ਤੁਸੀਂ ਆਪਣੀ ਜੈਲ 'ਤੇ ਇੱਕ ਪੱਟੀ ਵੇਖਦੇ ਹੋ, ਗਣਨਾ ਕੀਤੇ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਕੇ ਤੁਸੀਂ ਸਹੀ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਅਭਿਵਿਅਕਤੀ ਦੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹੋ।

(ਅਨੁਵਾਦ ਜਾਰੀ ਹੈ...)

ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਨਿਰਧਾਰਣ ਦੇ ਵੈਕਲਪਿਕ ਤਰੀਕੇ

ਜਦੋਂਕਿ ਇਹ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਤੁਹਾਨੂੰ ਤੁਰੰਤ ਸੈਧਾਂਤਿਕ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦਿੰਦਾ ਹੈ, ਹੋਰ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਵੀ ਆਪਣਾ ਸਥਾਨ ਹੈ:

ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਤਕਨੀਕਾਂ

ਮਾਸ ਸਪੈਕਟਰੋਮੈਟਰੀ (MS) — ਵਾਸਤਵਿਕ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਲਈ ਸੋਨੇ ਦਾ ਮਾਨਕ। ESI-MS ਅਤੇ MALDI-TOF ±1 Da ਦੀ ਸਟੀਕਤਾ ਨਾਲ ~100 kDa ਤੱਕ ਦੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਨੂੰ ਮਾਪ ਸਕਦੇ ਹਨ। ਅਨੁਕ੍ਰਮ-ਅਧਾਰਿਤ ਗਣਨਾਵਾਂ ਦੇ ਉਲਟ, MS ਪੋਸਟ-ਟਰਾਂਸਲੇਸ਼ਨਲ ਸੋਧਾਂ, ਪ੍ਰੋਟੀਓਲਾਈਟਿਕ ਕਟਾਈ ਅਤੇ ਹੋਰ ਸੋਧਾਂ ਦਾ ਪਤਾ ਲਗਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਵਿਪਰੀਤ ਪੱਖ: ਸ਼ੁੱਧ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਉਪਕਰਣਾਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।

ਸਾਇਜ਼ ਅਪਵਰਜਨ ਕ੍ਰੋਮੈਟੋਗ੍ਰਾਫੀ (SEC) — ਹਾਈਡਰੋਡਾਇਨਾਮਿਕ ਰੇਡੀਅਸ ਤੋਂ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ ਲਗਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਤੇਜ਼ ਅਤੇ ਕੱਚੇ ਨਮੂਨਿਆਂ 'ਤੇ ਕੰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਪਰ ਸਟੀਕਤਾ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਹੁੰਦੀ ਹੈ (±10-20%)। SEC ਦਿਖਾਈ ਦੇਣ ਵਾਲਾ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦਿੰਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਗੈਰ-ਗਲੋਬੁਲਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਜਾਂ ਬਹੁਤ ਚਾਰਜਡ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਲਈ ਅਸਲੀ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਤੋਂ ਵੱਖਰਾ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।

SDS-PAGE — ਤੇਜ਼ ਅਤੇ ਸਸਤਾ, ਪਰ ਸਭ ਤੋਂ ਘੱਟ ਸਟੀਕ (±15-30%)। ਬਹੁਤ ਤਿੱਖੇ/ਮੂਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ, ਗਲਾਈਕੋਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ, ਜਾਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਲਈ ਅਸਧਾਰਣ ਗਤੀ ਹੁੰਦੀ ਹੈ ਜੋ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਨਹੀਂ ਵਿਘਟਿਤ ਹੁੰਦੀਆਂ। ਇਸ ਨੂੰ ਮੋਟੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਨੁਮਾਨ ਲਗਾਉਣ ਲਈ ਵਰਤੋ, ਸਟੀਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਨਹੀਂ।

ਕੰਪਿਊਟੇਸ਼ਨਲ ਵਿਕਲਪ

ExPASy ProtParam — ਸਵਿਸ ਇੰਸਟੀਟਿਊਟ ਆਫ਼ ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ ਟੂਲ ਜੋ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਆਇਸੋਇਲੈਕਟਰਿਕ ਪੁਆਇੰਟ, ਅਪਵਰਜਨ ਗੁਣਾਂਕ, ਅਸਥਿਰਤਾ ਸੂਚਕਾਂਕ ਅਤੇ ਹੋਰ ਕਈ ਚੀਜ਼ਾਂ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਜਦੋਂ ਤੁਹਾਨੂੰ ਸਿਰਫ਼ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਬਜਾਏ ਵਿਆਪਕ ਭੌਤਿਕ-ਰਸਾਇਣਿਕ ਗੁਣਾਂ ਦੀ ਲੋੜ ਹੋਵੇ ਤਾਂ ਇੱਥੇ ਜਾਓ।

EMBOSS Pepstats — EMBL-EBI ਤੋਂ EMBOSS ਸੂਟ ਦਾ ਹਿੱਸਾ। ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਸੰਰਚਨਾ ਦੇ ਅੰਕੜੇ ਅਤੇ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਬੈਚ ਮੋਡ ਵਿੱਚ ਬਹੁ ਅਨੁਕ੍ਰਮਾਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਦੇ ਸਮੇਂ ਉਪਯੋਗੀ।

ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਸਥਿਤੀਆਂ

ਗੈਰ-ਮਾਨਕ ਸੋਧਾਂ (ਫਾਸਫੋਰਾਈਲੇਸ਼ਨ, ਗਲਾਈਕੋਸਾਈਲੇਸ਼ਨ, ਲਿਪਿਡੇਸ਼ਨ) ਵਾਲੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਲਈ, ਤੁਹਾਨੂੰ ਗਣਨਾ ਕੀਤੇ ਗਏ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਵਿੱਚ ਸੋਧ ਦੇ ਭਾਰ ਨੂੰ ਮੈਨੁਅਲੀ ਜੋੜਨਾ ਪਵੇਗਾ। NMR ਵਿੱਚ ਵਰਤੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਆਇਸੋਟੋਪਿਕ ਲੇਬਲ ਕੀਤੇ ਗਏ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ (¹⁵N, ¹³C, ²H) ਲਈ, ਲੇਬਲਿੰਗ ਪ੍ਰਤੀਸ਼ਤਤਾ ਦੇ ਅਧਾਰ 'ਤੇ ਮਾਸ ਸਿਫਟ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ ਅਤੇ ਇਸ ਨੂੰ ਮਾਨਕ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਵਿੱਚ ਜੋੜ ਦਿਓ।

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਣੂ ਭਾਰ ਨਿਰਧਾਰਣ ਦਾ ਇਤਿਹਾਸ

ਅਣੂ ਭਾਰ ਦੀ ਧਾਰਣਾ ਜੌਨ ਡਾਲਟਨ ਦੁਆਰਾ ਉਨਵੇਂ 19ਵੀਂ ਸਦੀ ਦੇ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਦੌਰ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਸਤਾਵਿਤ ਉਨਦੇ ਅਣੂ ਸਿਧਾਂਤ ਤੋਂ ਰਸਾਇਣ ਵਿਗਿਆਨ ਲਈ ਮੌਲਿਕ ਰਹੀ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਲਾਗੂ ਕਰਨ ਦਾ ਇਤਿਹਾਸ ਹੁਣ ੇਹੀ ਹੈ:

ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿਗਿਆਨ (1800-1920)

• 1838 ਵਿੱਚ, ਜੌਨਸ ਜੇਕਬ ਬੇਰਜ਼ੇਲੀਅਸ ਨੇ ਯੂਨਾਨੀ ਸ਼ਬਦ "ਪ੍ਰੋਟੇਇਓਸ" ਤੋਂ "ਪ੍ਰੋਟੀਨ" ਸ਼ਬਦ ਦੀ ਉਤਪਤੀ ਕੀਤੀ, ਜਿਸਦਾ ਅਰਥ ਹੈ "ਮੁੱਖ" ਜਾਂ "ਪਹਿਲੀ ਮਹੱਤਤਾ ਦਾ"।
• ਫ੍ਰੈਡਰਿਕ ਸੈਂਗਰ ਵਰਗੇ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿਗਿਆਨੀਆਂ ਨੇ ਸਮਝਿਆ ਕਿ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਤੋਂ ਬਣੇ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।
• ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਨੂੰ ਮੈਕਰੋਮੋਲੇਕਿਊਲ ਵਜੋਂ ਨਿਰਧਾਰਤ ਅਣੂ ਭਾਰ ਦੇ ਨਾਲ ਧੀਰੇ-ਧੀਰੇ ਸਮਝਿਆ ਗਿਆ।

ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦਾ ਵਿਕਾਸ (1930-1960)

• ਥਿਓਡੋਰ ਸਵੇਡਬਰਗ ਦੁਆਰਾ 1920 ਦੇ ਦਸਕ ਵਿੱਚ ਅਲਟਰਾਸੈਂਟ੍ਰੀਫਿਊਜ਼ੇਸ਼ਨ ਦੀ ਖੋਜ ਨੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਣੂ ਭਾਰ ਦੇ ਪਹਿਲੇ ਸਟੀਕ ਮਾਪ ਕਰਨ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੱਤੀ।
• 1930 ਦੇ ਦਸਕ ਵਿੱਚ ਅਰਨੇ ਟਿਸੇਲੀਅਸ ਦੁਆਰਾ ਇਲੈਕਟ੍ਰੋਫੋਰੇਸਿਸ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਨੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਆਕਾਰ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ ਲਗਾਉਣ ਦਾ ਇੱਕ ਹੋਰ ਤਰੀਕਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕੀਤਾ।
• 1958 ਵਿੱਚ, ਸਟੈਨਫੋਰਡ ਮੂਰ ਅਤੇ ਵਿਲੀਅਮ ਐਚ. ਸਟੀਨ ਨੇ ਰਾਈਬੋਨਿਊਕਲੇਜ਼ ਦੀ ਪਹਿਲੀ ਪੂਰੀ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਸਮਾਂ ਰੇਖਾ ਪੂਰੀ ਕੀਤੀ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਸਟੀਕ ਅਣੂ ਭਾਰ ਦਾ ਹਿਸਾਬ ਲਗਾਇਆ ਜਾ ਸਕਿਆ।

ਆਧੁਨਿਕ ਯੁੱਗ (1970-ਵਰਤਮਾਨ)

• ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰੀ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਨੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਣੂ ਭਾਰ ਨਿਰਧਾਰਣ ਨੂੰ ਕ੍ਰਾਂਤੀਕਾਰੀ ਢੰਗ ਨਾਲ ਬਦਲ ਦਿੱਤਾ।
• ਜੌਨ ਫੈਨ ਅਤੇ ਕੋਈਚੀ ਤਨਾਕਾ ਨੂੰ 2002 ਵਿੱਚ ਰਸਾਇਣ ਵਿਗਿਆਨ ਵਿੱਚ ਨੋਬਲ ਪੁਰਸਕਾਰ ਮਿਲਿਆ ਜੈਵਿਕ ਮੈਕਰੋਮੋਲੇਕਿਊਲ ਦੇ ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਨਰਮ ਡੀਸੋਰਪਸ਼ਨ ਆਇਨਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਵਿਧੀਆਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਲਈ।
• ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੇ ਗੁਣਾਂ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਅਣੂ ਭਾਰ, ਦੀ ਭਵਿੱਖਵਾਣੀ ਕਰਨ ਲਈ ਕੰਪਿਊਟੇਸ਼ਨਲ ਵਿਧੀਆਂ ਵਧੇਰੇ ਸਫਿਸਟੀਕੇਟਡ ਅਤੇ ਸੁਲਭ ਹੋ ਗਈਆਂ।
• 1990 ਅਤੇ 2000 ਦੇ ਦਸਕ ਵਿੱਚ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਦੇ ਆਗਮਨ ਨੇ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁਟ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟੂਲਸ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਸਵੈਚਾਲਿਤ ਅਣੂ ਭਾਰ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਦੀ ਲੋੜ ਪੈਦਾ ਕੀਤੀ।

ਅੱਜ, ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਣੂ ਭਾਰ ਦਾ ਹਿਸਾਬ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿਗਿਆਨ ਦਾ ਇੱਕ ਨਿਯਮਿਤ ਪਰ ਮੌਲਿਕ ਹਿੱਸਾ ਹੈ, ਜੋ ਸਾਡੇ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਵਰਗੇ ਟੂਲਸ ਦੁਆਰਾ ਸੁਗਮ ਬਣਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ ਜੋ ਦੁਨੀਆ ਭਰ ਦੇ ਖੋਜਕਰਤਾਵਾਂ ਲਈ ਇਹਨਾਂ ਗਣਨਾਵਾਂ ਨੂੰ ਸੁਲਭ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ।

ਸੀਮਾਵਾਂ ਅਤੇ ਆਮ ਸਮੱਸਿਆਵਾਂ

ਇਹ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਕੀ ਨਹੀਂ ਕਰ ਸਕਦਾ

ਇਹ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਤੋਂ ਸੈਧਾਂਤਿਕ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਇਨ੍ਹਾਂ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਨਹੀਂ ਰੱਖਦਾ:

ਪੋਸਟ-ਅਨੁਵਾਦ ਸੋਧਾਂ — ਗਲਾਈਕੋਸਾਈਲੇਸ਼ਨ, ਫਾਸਫੋਰਾਈਲੇਸ਼ਨ, ਯੂਬਿਕੁਟਿਨੇਸ਼ਨ, ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ, ਐਸੀਟਾਈਲੇਸ਼ਨ, ਅਤੇ ਦਰਜਨਾਂ ਹੋਰ ਸੋਧਾਂ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਨੂੰ ਬਦਲ ਦਿੰਦੀਆਂ ਹਨ। ਸੋਧਿਆ ਹੋਇਆ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲਈ, ਤੁਹਾਨੂੰ ਸੋਧ ਦਾ ਭਾਰ ਮੈਨੁਅਲੀ ਜੋੜਨਾ ਹੋਵੇਗਾ ਜਾਂ ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਨੀ ਹੋਵੇਗੀ।

ਡਾਈਸਲਫਾਈਡ ਬੰਧ — ਆਕਸੀਕ੍ਰਿਤ ਸਾਈਸਟੀਨ ਜੋ ਡਾਈਸਲਫਾਈਡ ਬੰਧ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ, ਪ੍ਰਤੀ ਬੰਧ 2 ਡਾ ਗੁਆ ਦਿੰਦੇ ਹਨ। ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਮੰਨਦਾ ਹੈ ਕਿ ਸਾਰੇ ਸਾਈਸਟੀਨ ਘਟਾਏ ਹੋਏ (ਮੁਕਤ -SH) ਹਨ। ਜੇ ਤੁਹਾਨੂੰ ਬੰਧ ਦਾ ਢਾਂਚਾ ਪਤਾ ਹੈ ਤਾਂ ਪ੍ਰਤੀ ਡਾਈਸਲਫਾਈਡ ਬੰਧ 2.016 ਡਾ ਘਟਾਓ।

ਗੈਰ-ਮਾਨਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ — ਸੈਲੀਨੋਸਾਈਸਟੀਨ (U), ਪਾਈਰੋਲਾਈਸਿਨ (O), ਹਾਈਡ੍ਰੋਕਸੀਪ੍ਰੋਲਾਈਨ, ਜਾਂ ਹੋਰ ਅਸਾਧਾਰਣ ਅਵਸ਼ੇਸ਼ ਸਮਰਥਿਤ ਨਹੀਂ ਹਨ। ਉਨ੍ਹਾਂ ਨੂੰ ਸਭ ਤੋਂ ਨੇੜਲੇ ਮਾਨਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਨਾਲ ਬਦਲੋ ਜਾਂ ਮੈਨੁਅਲੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ।

ਸਹਾਇਕ ਕਾਰਕ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਸਥੈਟਿਕ ਸਮੂਹ — ਹੀਮ ਸਮੂਹ, ਧਾਤੂ ਆਇਨ, FAD, NAD+, ਅਤੇ ਹੋਰ ਸਹਾਇਕ ਕਾਰਕ ਸ਼ਾਮਲ ਨਹੀਂ ਹਨ। ਜੇ ਉਹ ਮਜਬੂਤੀ ਨਾਲ ਬੱਝੇ ਹੋਏ ਹਨ ਤਾਂ ਉਨ੍ਹਾਂ ਦਾ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਜੋੜੋ।

ਆਮ ਸਮੱਸਿਆ ਨਿਵਾਰਣ

"ਅਵੈਧ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਕੋਡ" ਗਲਤੀ — ਤੁਸੀਂ ਅਜਿਹੇ ਅੱਖਰ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤੇ ਹਨ ਜੋ ਮਾਨਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਨਹੀਂ ਹਨ। ਆਮ ਕਾਰਨ: FASTA ਹੈਡਰ (ਜੋ > ਨਾਲ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦੇ ਹਨ), ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਨੰਬਰਿੰਗ, ਸਪੇਸ, ਜਾਂ ਅਸਪੱਸ਼ਟ ਕੋਡ ਜਿਵੇਂ X, B, Z। ਆਪਣੇ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਸਿਰਫ A-Z ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਅੱਖਰਾਂ ਤੱਕ ਸਾਫ਼ ਕਰੋ।

ਨਤੀਜਾ ਸਾਹਿਤ ਨਾਲ ਮੇਲ ਨਹੀਂ ਖਾਂਦਾ — ਜਾਂਚ ਕਰੋ ਕਿ ਸਾਹਿਤ ਦਾ ਮੁੱਲ ਟੈਗਾਂ (His-tag, GST, MBP), ਸਿਗਨਲ ਪੈਪਟਾਈਡ, ਜਾਂ ਸੋਧਾਂ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਵੀ ਜਾਂਚ ਕਰੋ ਕਿ ਉਹ ਪੂਰੇ ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਪ੍ਰੀਕਰਸਰ ਜਾਂ ਪ੍ਰੋਸੈਸਡ ਪਰਿਪੱਕ ਰੂਪ ਦੀ ਰਿਪੋਰਟ ਕਰ ਰਹੇ ਹਨ।

ਜੈਲ ਬੈਂਡ ਗਲਤ ਆਕਾਰ 'ਤੇ ਦਿਖਾਈ ਦਿੰਦਾ ਹੈ — SDS-PAGE ਮਾਈਗ੍ਰੇਸ਼ਨ ਅਨੋਮਾਲੀਆਂ ਆਮ ਹਨ। ਬਹੁਤ ਤਿੱਖੇ ਐਸਿਡ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਮਾਨਿਤ ਤੋਂ ਹੌਲੀ ਚੱਲਦੇ ਹਨ। ਬਹੁਤ ਬੇਸਿਕ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਜਾਂ ਪ੍ਰੋਲਾਈਨ-ਸਮੱਸ਼ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਤੇਜ਼ ਚੱਲਦੇ ਹਨ। ਗਲਾਈਕੋਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿੱਚ ਵੱਡੇ ਅੰਤਰ ਦਿਖਾਈ ਦਿੰਦੇ ਹਨ। ਸਟੀਕ ਮੋਲਿਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਲਈ ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਸਕੋਪੀ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰੋ, ਜੈਲ-ਅਧਾਰਿਤ ਅਨੁਮਾਨਾਂ ਦੀ ਨਹੀਂ।

ਕੋਡ ਉਦਾਹਰਣਾਂ

ਇੱਥੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰੋਗਰਾਮਿੰਗ ਭਾਸ਼ਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਨ ਦੀਆਂ ਉਦਾਹਰਣਾਂ ਹਨ:

1' ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਲਈ Excel VBA ਫੰਕਸ਼ਨ
2Function ProteinMolecularWeight(sequence As String) As Double
3    ' ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ
4    Dim aaWeights As Object
5    Set aaWeights = CreateObject("Scripting.Dictionary")
6    
7    ' ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਭਾਰ ਨੂੰ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰੋ
8    aaWeights("A") = 71.03711
9    aaWeights("R") = 156.10111
10    aaWeights("N") = 114.04293
11    aaWeights("D") = 115.02694
12    aaWeights("C") = 103.00919
13    aaWeights("E") = 129.04259
14    aaWeights("Q") = 128.05858
15    aaWeights("G") = 57.02146
16    aaWeights("H") = 137.05891
17    aaWeights("I") = 113.08406
18    aaWeights("L") = 113.08406
19    aaWeights("K") = 128.09496
20    aaWeights("M") = 131.04049
21    aaWeights("F") = 147.06841
22    aaWeights("P") = 97.05276
23    aaWeights("S") = 87.03203
24    aaWeights("T") = 101.04768
25    aaWeights("W") = 186.07931
26    aaWeights("Y") = 163.06333
27    aaWeights("V") = 99.06841
28    
29    ' ਪਾਣੀ ਦਾ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ
30    Const WATER_WEIGHT As Double = 18.01528
31    
32    ' ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਨੂੰ ਵੱਡੇ ਅੱਖਰਾਂ ਵਿੱਚ ਬਦਲੋ
33    sequence = UCase(sequence)
34    
35    ' ਕੁੱਲ ਭਾਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ
36    Dim totalWeight As Double
37    totalWeight = 0
38    
39    ' ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਭਾਰ ਦਾ ਯੋਗ
40    Dim i As Integer
41    For i = 1 To Len(sequence)
42        Dim aa As String
43        aa = Mid(sequence, i, 1)
44        
45        If aaWeights.Exists(aa) Then
46            totalWeight = totalWeight + aaWeights(aa)
47        Else
48            ' ਅਵੈਧ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਕੋਡ
49            ProteinMolecularWeight = -1
50            Exit Function
51        End If
52    Next i
53    
54    ' ਪੈਪਟਾਈਡ ਬੰਧਾਂ ਤੋਂ ਪਾਣੀ ਦੇ ਨੁਕਸਾਨ ਨੂੰ ਘਟਾਓ ਅਤੇ ਟਰਮੀਨਲ ਪਾਣੀ ਜੋੜੋ
55    Dim numAminoAcids As Integer
56    numAminoAcids = Len(sequence)
57    
58    ProteinMolecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
59End Function
60
61' Excel ਵਿੱਚ ਵਰਤੋਂ:
62' =ProteinMolecularWeight("ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY")
63

[ਬਾਕੀ ਦਾ ਅਨੁਵਾਦ ਇਸੇ ਤਰ੍ਹਾਂ ਜਾਰੀ ਰਹੇਗਾ...]

ਅਕਸਰ ਪੁੱਛੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਸਵਾਲ

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਕੀ ਹੈ ਅਤੇ ਇਹ ਕਿਉਂ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ?

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਇੱਕ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦਾ ਕੁੱਲ ਭਾਰ ਹੈ ਜੋ ਡਾਲਟਨ (Da) ਜਾਂ ਕਿਲੋਡਾਲਟਨ (kDa) ਵਿੱਚ ਦਰਸਾਇਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਜਿੱਥੇ 1 kDa = 1,000 Da ਹੈ। ਇਹ ਸਾਰੇ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਦੇ ਭਾਰ ਦਾ ਯੋਗ ਹੈ ਘਟਾ ਪੈਪਟਾਈਡ ਬੰਧ ਬਣਨ ਦੌਰਾਨ ਨਿਕਲੇ ਪਾਣੀ ਦੇ ਅਣੂਆਂ ਨੂੰ।

ਇਹ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ: ਤੁਸੀਂ ਲੈਬ ਵਿੱਚ ਇਸ ਮੁੱਲ ਦੀ ਲਗਾਤਾਰ ਵਰਤੋਂ ਕਰੋਗੇ। SDS-PAGE ਸੈਟ ਅੱਪ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ? ਤੁਹਾਨੂੰ ਜੈਲ ਦਾ ਪ੍ਰਤੀਸ਼ਤ ਚੁਣਨ ਅਤੇ ਬੈਂਡ ਦੀ ਸਥਿਤੀ ਦਾ ਅਨੁਮਾਨ ਲਗਾਉਣ ਲਈ ਮੋਲਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਲੋੜ ਹੈ। ਜੈਲ ਫਿਲਟ੍ਰੇਸ਼ਨ ਚਲਾ ਰਹੇ ਹੋ? ਮੋਲਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਇਹ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਦਾ ਹੈ ਕਿ ਕਿਹੜਾ ਕਲਮ ਰੇਸਿਨ ਵਰਤਣਾ ਹੈ। ਮਾਸ ਸਪੈਕ ਡੇਟਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ? ਅਣਜਾਣ ਸੋਧਾਂ ਜਾਂ ਖਰਾਬੀ ਨੂੰ ਫੜਨ ਲਈ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਭਾਰ ਦੀ ਤਕਨੀਕੀ ਮੋਲਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਨਾਲ ਤੁਲਨਾ ਕਰੋ।

[ਬਾਕੀ ਅਨੁਵਾਦ ਜਾਰੀ ਰਹੇਗਾ...]

ਸੰਦਰਭ ਅਤੇ ਹੋਰ ਪੜ੍ਹਾਈ

1. ਅੰਤਰਰਾਸ਼ਟਰੀ ਸ਼ੁੱਧ ਅਤੇ ਅਨੁਪਯੋਗੀ ਰਸਾਇਣ ਸੰਘ (IUPAC) - ਪਰਮਾਣੂ ਭਾਰ ਅਤੇ ਆਇਸੋਟੋਪਿਕ ਸੰਯੋਜਨ - NIST ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਗਣਨਾ ਵਿੱਚ ਵਰਤੇ ਜਾਣ ਵਾਲੇ ਅਧਿਕਾਰਿਕ ਪਰਮਾਣੂ ਭਾਰ ਮੁੱਲ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।

2. ਗਾਸਟੇਗਰ ਈ., ਹੂਗਲੈਂਡ ਸੀ., ਗਟਿਕਰ ਏ., ਆਦਿ (2005) - ExPASy ਸਰਵਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਪਛਾਣ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟੂਲ। ਵਾਕਰ ਜੇ.ਐਮ. (ਸੰਪਾਦਕ) ਪ੍ਰੋਟੀਓਮਿਕਸ ਪ੍ਰੋਟੋਕੋਲ ਹੈਂਡਬੁੱਕ। ਹਿਊਮਨਾ ਪ੍ਰੈਸ। ਇਹ ਵਿਆਪਕ ਸੰਦਰਭ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਕੰਪਿਊਟੇਸ਼ਨਲ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਵਰਣਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।

3. ਯੂਨੀਪ੍ਰੋਟ ਕੌਂਸੋਰਟੀਅਮ - ਯੂਨੀਵਰਸਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸਰੋਤ ਲੱਖਾਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨਾਂ ਲਈ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ, ਪੋਸਟ-ਟ੍ਰਾਂਸਲੇਸ਼ਨਲ ਸੋਧਾਂ ਅਤੇ ਸੰਰਚਨਾਤਮਕ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਸਮੇਤ ਸੰਪਾਦਿਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਡਾਟਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।

4. ਨੈਲਸਨ, ਡੀ. ਐਲ., & ਕੌਕਸ, ਐਮ. ਐਮ. (2017) - ਲੇਹਨਿੰਗਰ ਬਾਇਓਕੈਮਿਸਟਰੀ ਦੇ ਮੂਲ ਸਿਧਾਂਤ (7ਵਾਂ ਸੰਸਕਰਣ)। ਡਬਲਯੂ.ਐਚ. ਫ੍ਰੀਮੈਨ। ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਸੰਰਚਨਾ, ਕਾਰਜ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿਧੀਆਂ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਨ ਵਾਲੀ ਮਾਨਕ ਬਾਇਓਕੈਮਿਸਟਰੀ ਦੀ ਪਾਠ ਪੁਸਤਕ।

5. ExPASy ਪ੍ਰੋਟਪੈਰਾਮ ਟੂਲ - ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਕ੍ਰਮਾਂ ਤੋਂ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਅਤੇ ਹੋਰ ਭੌਤਿਕ-ਰਸਾਇਣਿਕ ਗੁਣਾਂ ਦੀ ਗਣਨਾ ਲਈ ਸਵਿਸ ਬਾਇੋਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਕੰਪਿਊਟੇਸ਼ਨਲ ਟੂਲ।

6. ਸਟੀਨ, ਐਚ., & ਮੈਨ, ਐਮ. (2004) - ਪੈਪਟਾਈਡ ਅਨੁਕ੍ਰਮਣ ਦੇ ABC (ਅਤੇ XYZ)। ਨੇਚਰ ਰਿਵਿਊ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਸੈੱਲ ਬਾਇਓਲੋਜੀ, 5(9), 699-711। ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਨਿਰਧਾਰਣ ਲਈ ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰੀ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਅਧਿਕਾਰਪੂਰਵਕ ਸਮੀਖਿਆ।

7. EMBL-EBI ਬਾਇੋਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਸਰੋਤ - ਯੂਰੋਪੀ ਬਾਇੋਇਨਫਾਰਮੈਟਿਕਸ ਇੰਸਟੀਟਿਊਟ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਲਈ ਮੁਫਤ ਪਹੁੰਚ ਟੂਲ ਅਤੇ ਡਾਟਾਬੇਸ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।

8. ਕਿੰਟਰ, ਐਮ., & ਸ਼ਰਮਨ, ਐਨ. ਈ. (2005) - ਟੈਂਡਮ ਮਾਸ ਸਪੈਕਟ੍ਰੋਮੈਟਰੀ ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਕ੍ਰਮਣ ਅਤੇ ਪਛਾਣ। ਵਾਈਲੀ-ਇੰਟਰਸਾਇੰਸ। ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਨਿਰਧਾਰਣ ਲਈ ਵਿਸਤ੍ਰਿਤ ਤਕਨੀਕੀ ਸੰਦਰਭ।

---

ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਲਈ ਤਿਆਰ? ਤੁਰੰਤ ਸਟੀਕ ਨਤੀਜੇ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਲਈ ਉੱਪਰ ਆਪਣਾ ਅਮਿਨੋ ਐਸਿਡ ਅਨੁਕ੍ਰਮ ਦਾਖਲ ਕਰੋ। ਭਾਵੇਂ ਤੁਸੀਂ SDS-PAGE ਜੈਲ ਸੈੱਟ ਅਪ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਮਾਸ ਸਪੈਕ ਡਾਟਾ ਦੀ ਵਿਆਖਿਆ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਜਾਂ ਸ਼ੋਧਨ ਪ੍ਰੋਟੋਕੋਲ ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਇਹ ਕੈਲਕੁਲੇਟਰ ਤੁਹਾਨੂੰ ਵਿਸ਼ਵਾਸ ਨਾਲ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਯੋਜਨਾ ਲਈ ਲੋੜੀਂਦਾ ਸੈਧਾਂਤਿਕ ਮੋਲੇਕਿਊਲਰ ਭਾਰ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।