DNA ਤੋਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਵਾਦਕ - ਕੋਡੋਨ ਅਤੇ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਕਨਵਰਟਰ
ਸਟੈਂਡਰਡ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ ਵਰਤ ਕੇ DNA ਜਾਂ RNA ਲੜੀ ਨੂੰ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਬਦਲੋ। ਇੱਕ ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਚੁਣੋ ਅਤੇ ਹਰ ਕੋਡੋਨ ਦਾ ਅਨੁਵਾਦ ਵੇਖੋ।
DNA ਤੋਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਵਾਦਕ
ਇੱਕ DNA ਜਾਂ RNA ਲੜੀ ਦਰਜ ਕਰੋ। A, C, G ਅਤੇ T ਬੇਸ ਵਰਤੋ। U ਨੂੰ T ਵਜੋਂ ਪੜ੍ਹਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਖਾਲੀ ਥਾਂਵਾਂ, ਲਾਈਨ ਬਰੇਕ ਅਤੇ ਅੰਕਾਂ ਨੂੰ ਨਜ਼ਰਅੰਦਾਜ਼ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਅਨੁਵਾਦ ਸਟੈਂਡਰਡ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ (NCBI ਟੇਬਲ 1) ਵਰਤਦਾ ਹੈ।
ਫਰੇਮ ਦੇ ਬਿਲਕੁਲ ਸ਼ੁਰੂ ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਨ ਦੀ ਥਾਂ, ਚੁਣੀ ਗਈ ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਵਿੱਚ ਪਹਿਲੇ ATG ਤੋਂ ਅਨੁਵਾਦ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰੋ, ਜਿਵੇਂ ਇੱਕ ਰਾਈਬੋਸੋਮ ਇੱਕ ਓਪਨ ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਪੜ੍ਹਨਾ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਦਸਤਾਵੇਜ਼ੀਕਰਣ
DNA ਤੋਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਵਾਦਕ ਇੱਕ DNA ਜਾਂ RNA ਲੜੀ ਨੂੰ ਉਸ ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਈਆਂ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡਾਂ ਦੀ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਬਦਲਦਾ ਹੈ, ਸਟੈਂਡਰਡ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ। ਇਹ ਲੜੀ ਨੂੰ ਇੱਕ ਵਾਰ ਵਿੱਚ ਤਿੰਨ ਬੇਸ ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਹਰ ਤਿੱਗਲੇ ਨੂੰ 64 ਕੋਡੋਨਾਂ ਦੀ ਇੱਕ ਸਥਿਰ ਸਾਰਣੀ ਵਿੱਚ ਲੱਭਦਾ ਹੈ।
ਅਨੁਵਾਦ ਕਿਵੇਂ ਕੰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ
ਇੱਕ ਜੀਨ ਚਾਰ ਅੱਖਰਾਂ ਵਿੱਚ ਲਿਖਿਆ ਹੁੰਦਾ ਹੈ: A, C, G ਅਤੇ T (ਜਾਂ RNA ਵਿੱਚ U)। ਸੈੱਲ ਇਹਨਾਂ ਅੱਖਰਾਂ ਨੂੰ ਤਿੰਨ-ਤਿੰਨ ਦੇ ਗੈਰ-ਓਵਰਲੈਪਿੰਗ ਸਮੂਹਾਂ ਵਿੱਚ ਪੜ੍ਹਦੇ ਹਨ ਜਿਹਨਾਂ ਨੂੰ ਕੋਡੋਨ ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਹਰ ਕੋਡੋਨ ਇੱਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜਾਂ ਇੱਕ ਸਟਾਪ ਸੰਕੇਤ ਨੂੰ ਜੋ ਲੜੀ ਨੂੰ ਖਤਮ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਇਹ ਟੂਲ ਪਹਿਲਾਂ ਇਨਪੁੱਟ ਨੂੰ ਸਾਫ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਛੋਟੇ ਅੱਖਰਾਂ ਨੂੰ ਵੱਡੇ ਅੱਖਰਾਂ ਵਿੱਚ ਬਦਲਦਾ ਹੈ, ਖਾਲੀ ਥਾਂਵਾਂ, ਲਾਈਨ ਬਰੇਕ ਅਤੇ ਅੰਕਾਂ ਨੂੰ ਹਟਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਹਰ U ਨੂੰ T ਵਿੱਚ ਬਦਲਦਾ ਹੈ, ਕਿਉਂਕਿ RNA ਦਾ ਯੂਰਾਸਿਲ ਉਸੇ ਕੋਡੋਨ ਵਿੱਚ ਜੋੜਾ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ ਜਿਵੇਂ DNA ਦਾ ਥਾਈਮਿਨ। ਫਿਰ ਇਹ ਹਰ ਉਸ ਅੱਖਰ ਨੂੰ ਰੱਦ ਕਰਦਾ ਹੈ ਜੋ A, C, G ਜਾਂ T ਨਹੀਂ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ N ਵਰਗੇ ਅਸਪਸ਼ਟਤਾ ਕੋਡ, ਤਾਂ ਜੋ ਕੋਈ ਲੜੀ ਚੁੱਪਚਾਪ ਗਲਤ ਅਨੁਵਾਦ ਨਾ ਹੋਵੇ।
ਸਟੈਂਡਰਡ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ
ਇਹ ਟੂਲ NCBI ਟ੍ਰਾਂਸਲੇਸ਼ਨ ਟੇਬਲ 1, "ਸਟੈਂਡਰਡ ਕੋਡ", ਵਰਤਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਮਨੁੱਖਾਂ ਸਮੇਤ ਬਹੁਤੇ ਜੀਵਾਂ ਦੁਆਰਾ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ ਹੈ। ਇਹ 64 ਸੰਭਵ ਕੋਡੋਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਹਰੇਕ ਨੂੰ 20 ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਜਾਂ ਇੱਕ ਸਟਾਪ ਸੰਕੇਤ ਨੂੰ ਸੌਂਪਦਾ ਹੈ।
ਤਿੰਨ ਕੋਡੋਨ ਸਟਾਪ ਕੋਡੋਨ ਹਨ: TAA, TAG ਅਤੇ TGA। ਇਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਕੋਈ ਵੀ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਲਈ ਕੋਡ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦਾ। ਜਦੋਂ ਟੂਲ ਇੱਕ ਤੱਕ ਪਹੁੰਚਦਾ ਹੈ, ਇਹ ਉੱਥੇ ਅਨੁਵਾਦ ਖਤਮ ਕਰ ਦਿੰਦਾ ਹੈ। ਸਟਾਪ ਕੋਡੋਨ ਖੁਦ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਵਿੱਚ ਸ਼ਾਮਲ ਨਹੀਂ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ, ਅਤੇ ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੇ ਕਿਸੇ ਵੀ ਬੇਸ ਨੂੰ ਨਜ਼ਰਅੰਦਾਜ਼ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਕੋਡੋਨ ATG ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਮੈਥਿਓਨਿਨ (Met, M) ਲਈ ਕੋਡ ਹੈ। ਬਹੁਤੇ ਜੀਵਾਂ ਵਿੱਚ ATG ਸਟਾਰਟ ਕੋਡੋਨ ਵਜੋਂ ਵੀ ਕੰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਉਹ ਕੋਡੋਨ ਜਿੱਥੋਂ ਇੱਕ ਰਾਈਬੋਸੋਮ ਜੀਨ ਪੜ੍ਹਨਾ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ
ਇੱਕ DNA ਲੜੀ ਨੂੰ ਤਿੰਨ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਤਰੀਕਿਆਂ ਨਾਲ ਪੜ੍ਹਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ, ਜਿਹਨਾਂ ਨੂੰ ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਕਿਹਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਗੱਲ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦਾ ਹੈ ਕਿ ਤੁਸੀਂ ਕਿਹੜੇ ਬੇਸ ਤੋਂ ਗਿਣਤੀ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਦੇ ਹੋ:
- ਫਰੇਮ 1 ਪਹਿਲੇ ਬੇਸ ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
- ਫਰੇਮ 2 ਦੂਜੇ ਬੇਸ ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਪਹਿਲੇ ਨੂੰ ਛੱਡ ਕੇ।
- ਫਰੇਮ 3 ਤੀਜੇ ਬੇਸ ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਪਹਿਲੇ ਦੋ ਨੂੰ ਛੱਡ ਕੇ।
ਫਰੇਮ ਨੂੰ ਇੱਕ ਬੇਸ ਵੀ ਖਿਸਕਾਉਣ ਨਾਲ ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦਾ ਹਰ ਕੋਡੋਨ ਬਦਲ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਲਈ ਇੱਕੋ ਲੜੀ ਤਿੰਨ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਵੱਖਰੀਆਂ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਲੜੀਆਂ ਪੈਦਾ ਕਰ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਿਰਫ਼ ਇੱਕ ਫਰੇਮ ਹੀ ਜੀਨ ਦਾ ਅਸਲੀ ਕੋਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
ਪਹਿਲੇ ਸਟਾਰਟ ਕੋਡੋਨ ਤੱਕ ਸਕੈਨਿੰਗ
ਮੂਲ ਰੂਪ ਵਿੱਚ, ਟੂਲ ਚੁਣੇ ਗਏ ਫਰੇਮ ਦੇ ਪਹਿਲੇ ਬੇਸ ਤੋਂ ਅਨੁਵਾਦ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਭਾਵੇਂ ਉਹ ਕੋਡੋਨ ਜੋ ਵੀ ਹੋਵੇ। ਇਹ ਉਸੇ ਤਰ੍ਹਾਂ ਹੈ ਜਿਵੇਂ ਟੂਲ ਹਮੇਸ਼ਾ ਕੰਮ ਕਰਦਾ ਆਇਆ ਹੈ ਅਤੇ ਉਸ ਲੜੀ ਦੇ ਅਨੁਵਾਦ ਲਈ ਲਾਭਦਾਇਕ ਹੈ ਜਿਸ ਬਾਰੇ ਤੁਸੀਂ ਪਹਿਲਾਂ ਹੀ ਜਾਣਦੇ ਹੋ ਕਿ ਉਹ ਪਹਿਲੀ ਸਥਿਤੀ ਤੋਂ ਹੀ ਫਰੇਮ ਵਿੱਚ ਹੈ।
ਵਿਕਲਪਿਕ "ਪਹਿਲੇ ਸਟਾਰਟ ਕੋਡੋਨ ਤੱਕ ਸਕੈਨ ਕਰੋ" ਸੈਟਿੰਗ ਇਹ ਬਦਲਦੀ ਹੈ ਕਿ ਅਨੁਵਾਦ ਕਿੱਥੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਨਾ ਕਿ ਇਹ ਕਿਵੇਂ ਅਨੁਵਾਦ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਜਦੋਂ ਚਾਲੂ ਹੋਵੇ, ਟੂਲ ਚੁਣੇ ਗਏ ਫਰੇਮ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਪਹਿਲਾ ATG ਕੋਡੋਨ ਲੱਭਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਉੱਥੋਂ ਅਨੁਵਾਦ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਤੋਂ ਪਹਿਲਾਂ ਦੇ ਕਿਸੇ ਵੀ ਬੇਸ ਨੂੰ ਛੱਡ ਕੇ। ਇਹ ਉਸ ਤਰੀਕੇ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਜਿਸ ਨਾਲ ਇੱਕ ਰਾਈਬੋਸੋਮ ਇੱਕ ਓਪਨ ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ (ORF) ਦੀ ਸ਼ੁਰੂਆਤ ਲੱਭਦਾ ਹੈ, ਨਾ ਕਿ ਲੰਮੀ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਕਿਸੇ ਮਨਮਾਨੇ ਬਿੰਦੂ ਤੋਂ ਅਨੁਵਾਦ ਕਰਨ ਦੀ ਥਾਂ। ਜੇ ਉਸ ਫਰੇਮ ਵਿੱਚ ਕੋਈ ATG ਮੌਜੂਦ ਨਹੀਂ ਹੈ, ਤਾਂ ਟੂਲ ਇਹ ਦੱਸਦਾ ਹੈ ਕਿ ਕੋਈ ਸਟਾਰਟ ਕੋਡੋਨ ਨਹੀਂ ਮਿਲਿਆ, ਅਨੁਮਾਨ ਲਗਾਉਣ ਦੀ ਥਾਂ।
ਸੈਟਿੰਗ ਬੰਦ ਕਰਨ ਨਾਲ ਮੂਲ ਵਿਵਹਾਰ 'ਤੇ ਵਾਪਸ ਜਾਂਦਾ ਹੈ: ਫਰੇਮ ਦੇ ਬਿਲਕੁਲ ਸ਼ੁਰੂ ਤੋਂ ਅਨੁਵਾਦ।
DNA ਤੋਂ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਨੁਵਾਦ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਿਵੇਂ ਕਰੀਏ
- ਇੱਕ DNA ਜਾਂ RNA ਲੜੀ ਦਰਜ ਕਰੋ। ਖਾਲੀ ਥਾਂਵਾਂ, ਲਾਈਨ ਬਰੇਕ, ਅੰਕ ਅਤੇ FASTA-ਸ਼ੈਲੀ ਦੇ ਅੱਖਰਾਂ ਨੂੰ ਆਪਣੇ-ਆਪ ਨਜ਼ਰਅੰਦਾਜ਼ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
- ਇੱਕ ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਚੁਣੋ: 1, 2 ਜਾਂ 3।
- ਵਿਕਲਪਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ, ਫਰੇਮ ਦੇ ਸ਼ੁਰੂ ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਨ ਦੀ ਬਜਾਏ ਪਹਿਲੇ ਇਨ-ਫਰੇਮ ATG ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਨ ਲਈ "ਪਹਿਲੇ ਸਟਾਰਟ ਕੋਡੋਨ ਤੱਕ ਸਕੈਨ ਕਰੋ" ਚਾਲੂ ਕਰੋ।
- ਟੂਲ ਲੜੀ ਨੂੰ ਇੱਕ ਵਾਰ ਵਿੱਚ ਤਿੰਨ ਬੇਸ ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ, ਹਰ ਕੋਡੋਨ ਨੂੰ ਸਟੈਂਡਰਡ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ ਵਿੱਚ ਲੱਭਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਪਹਿਲੇ ਸਟਾਪ ਕੋਡੋਨ 'ਤੇ ਰੁਕ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
- ਨਤੀਜਾ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲੜੀ ਹੈ, ਇੱਕ-ਅੱਖਰ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਕੋਡਾਂ ਵਜੋਂ ਲਿਖੀ ਗਈ, ਨਾਲ ਹੀ ਕੋਡੋਨ-ਦਰ-ਕੋਡੋਨ ਵੰਡ।
ਹੱਲ ਕੀਤੀ ਗਈ ਉਦਾਹਰਨ
ਲੜੀ: ATGGCCTAA, ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ 1, ਸਟਾਰਟ-ਕੋਡੋਨ ਸਕੈਨਿੰਗ ਬੰਦ।
| ਸਥਿਤੀ | ਕੋਡੋਨ | ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ |
|---|---|---|
| 1 | ATG | Met (M) |
| 2 | GCC | Ala (A) |
| 3 | TAA | ਸਟਾਪ |
ਪ੍ਰੋਟੀਨ MA ਹੈ। ਅਨੁਵਾਦ TAA 'ਤੇ ਰੁਕ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਲਈ ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਕੁਝ ਵੀ ਨਹੀਂ ਪੜ੍ਹਿਆ ਜਾਂਦਾ।
ਹੁਣ ਫਰੇਮ 1 ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਲੰਬੀ ਲੜੀ, CCCATGGCCTAA, ਲਓ। ਸਕੈਨਿੰਗ ਬੰਦ ਹੋਣ 'ਤੇ, ਟੂਲ ਬਿਲਕੁਲ ਪਹਿਲੇ ਬੇਸ ਤੋਂ ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ: ਪਹਿਲਾਂ CCC (Pro), ਫਿਰ ATG (Met), ਫਿਰ GCC (Ala), ਅਤੇ ਅੰਤ ਵਿੱਚ TAA (ਸਟਾਪ), ਜਿਸ ਨਾਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ PMA ਮਿਲਦਾ ਹੈ। ਸਕੈਨਿੰਗ ਚਾਲੂ ਹੋਣ 'ਤੇ, ਟੂਲ CCC ਨੂੰ ਛੱਡਦਾ ਹੈ, ਪਹਿਲੇ ATG ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਫਿਰ ATG (Met), ਫਿਰ GCC (Ala), ਅਤੇ ਅੰਤ ਵਿੱਚ TAA (ਸਟਾਪ) ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਪ੍ਰੋਟੀਨ MA ਮਿਲਦਾ ਹੈ। ਦੋਵੇਂ ਇੱਕੋ ਲੜੀ ਦੇ ਸਹੀ ਨਤੀਜੇ ਹਨ; ਇਹ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਵਾਲਾਂ ਦੇ ਜਵਾਬ ਦਿੰਦੇ ਹਨ, ਇੱਕ ਫਰੇਮ ਵਿੱਚ ਸਭ ਕੁਝ ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ, ਦੂਜਾ ਸਿਰਫ਼ ਉਸ ਓਪਨ ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਨੂੰ ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ ਜੋ ATG ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
ਅਕਸਰ ਪੁੱਛੇ ਜਾਂਦੇ ਸਵਾਲ
ਕੋਡੋਨ ਕੀ ਹੁੰਦਾ ਹੈ?
ਕੋਡੋਨ DNA ਜਾਂ RNA ਦੇ ਤਿੰਨ ਬੇਸਾਂ ਦਾ ਸਮੂਹ ਹੁੰਦਾ ਹੈ। 64 ਸੰਭਵ ਕੋਡੋਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਹਰੇਕ ਸਟੈਂਡਰਡ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਇੱਕ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਜਾਂ ਇੱਕ ਸਟਾਪ ਸੰਕੇਤ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ।
ਅਨੁਵਾਦ ਸਟਾਪ ਕੋਡੋਨ 'ਤੇ ਕਿਉਂ ਰੁਕਦਾ ਹੈ?
TAA, TAG ਅਤੇ TGA ਕਿਸੇ ਅਮੀਨੋ ਐਸਿਡ ਲਈ ਕੋਡ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦੇ। ਇਹ ਸਟਾਪ ਸੰਕੇਤ ਹਨ। ਇੱਕ ਅਸਲੀ ਜੀਨ ਪੜ੍ਹਦਾ ਰਾਈਬੋਸੋਮ ਉਸ ਬਿੰਦੂ 'ਤੇ ਬਣੀ ਹੋਈ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲੜੀ ਨੂੰ ਛੱਡ ਦਿੰਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਲਈ ਟੂਲ ਵੀ ਇਹੀ ਕਰਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੇ ਕਿਸੇ ਵੀ ਬੇਸ ਨੂੰ ਨਜ਼ਰਅੰਦਾਜ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਰੀਡਿੰਗ ਫਰੇਮ ਕੀ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਇਹ ਕਿਉਂ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ?
ਇਹ ਉਹ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਬਿੰਦੂ ਹੈ ਜੋ ਲੜੀ ਨੂੰ ਕੋਡੋਨਾਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਇੱਕ ਜਾਂ ਦੋ ਬੇਸ ਬਾਅਦ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਨ ਨਾਲ ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦਾ ਹਰ ਕੋਡੋਨ ਬਦਲ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਲਈ ਇੱਕੋ DNA ਨੂੰ ਤਿੰਨ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਤਰੀਕਿਆਂ ਨਾਲ ਪੜ੍ਹਿਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ, ਜਿਹਨਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸਿਰਫ਼ ਇੱਕ ਹੀ ਅਸਲੀ ਕੋਡਿੰਗ ਲੜੀ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
"ਪਹਿਲੇ ਸਟਾਰਟ ਕੋਡੋਨ ਤੱਕ ਸਕੈਨ ਕਰੋ" ਕੀ ਬਦਲਦਾ ਹੈ?
ਇਹ ਬਦਲਦਾ ਹੈ ਕਿ ਅਨੁਵਾਦ ਕਿੱਥੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ, ਵਰਤੇ ਗਏ ਜੈਨੇਟਿਕ ਕੋਡ ਨੂੰ ਨਹੀਂ। ਇਹ ਚਾਲੂ ਹੋਣ 'ਤੇ, ਟੂਲ ਚੁਣੇ ਗਏ ਫਰੇਮ ਵਿੱਚ ਪਹਿਲੇ ATG ਤੱਕ ਅੱਗੇ ਵਧਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਉੱਥੋਂ ਅਨੁਵਾਦ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਇੱਕ ਰਾਈਬੋਸੋਮ ਇੱਕ ਸਟਾਰਟ ਕੋਡੋਨ ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਬੰਦ ਹੋਣ 'ਤੇ, ਅਨੁਵਾਦ ਫਰੇਮ ਦੇ ਬਿਲਕੁਲ ਪਹਿਲੇ ਬੇਸ ਤੋਂ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦਾ ਹੈ।
ਕੀ ਮੈਂ ਇੱਕ RNA ਲੜੀ ਪੇਸਟ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹਾਂ?
ਹਾਂ। ਟੂਲ U ਨੂੰ T ਵਾਂਗ ਹੀ ਮੰਨਦਾ ਹੈ, ਕਿਉਂਕਿ RNA ਦਾ ਯੂਰਾਸਿਲ ਅਤੇ DNA ਦਾ ਥਾਈਮਿਨ ਇੱਕੋ ਕੋਡੋਨ ਅਰਥ ਨਾਲ ਜੋੜਾ ਬਣਾਉਂਦੇ ਹਨ। ਵੱਡੇ ਅਤੇ ਛੋਟੇ ਦੋਵੇਂ ਤਰ੍ਹਾਂ ਦੇ ਅੱਖਰ ਸਵੀਕਾਰ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ।
ਜੇ ਮੇਰੀ ਲੜੀ ਵਿੱਚ A, C, G, T ਜਾਂ U ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ ਹੋਰ ਅੱਖਰ ਹੋਣ ਤਾਂ ਕੀ ਹੁੰਦਾ ਹੈ?
ਟੂਲ ਗਲਤ ਅੱਖਰਾਂ ਦੀ ਨਿਸ਼ਾਨਦੇਹੀ ਕਰਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਲੜੀ ਦਾ ਅਨੁਵਾਦ ਨਹੀਂ ਕਰਦਾ। ਇਸ ਵਿੱਚ N ਵਰਗੇ ਅਸਪਸ਼ਟਤਾ ਕੋਡ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ, ਜੋ ਘੱਟ-ਗੁਣਵੱਤਾ ਵਾਲੀ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਡਾਟਾ ਵਿੱਚ ਆਮ ਹੁੰਦੇ ਹਨ ਪਰ ਅਨੁਵਾਦ ਲਈ ਸਹੀ ਇਨਪੁੱਟ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦੇ।
ਜੇ ਲੜੀ ਦੀ ਲੰਬਾਈ ਤਿੰਨ ਦਾ ਗੁਣਜ ਨਾ ਹੋਵੇ ਤਾਂ ਕੀ ਹੁੰਦਾ ਹੈ?
ਟੂਲ ਹਰ ਪੂਰੇ ਕੋਡੋਨ ਦਾ ਅਨੁਵਾਦ ਕਰਦਾ ਹੈ ਜੋ ਇਹ ਬਣਾ ਸਕਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਬਚੇ ਹੋਏ ਇੱਕ ਜਾਂ ਦੋ ਬੇਸਾਂ ਨੂੰ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਦੱਸਦਾ ਹੈ, ਇਹ ਅਨੁਮਾਨ ਲਗਾਏ ਬਿਨਾਂ ਕਿ ਉਹ ਕੀ ਦਰਸਾ ਸਕਦੇ ਹਨ।