Calculadora de Peso Molecular de Proteínas

Introdução

A calculadora de peso molecular de proteínas é uma ferramenta essencial para bioquímicos, biólogos moleculares e cientistas de proteínas que precisam determinar a massa de proteínas com base em suas sequências de aminoácidos. As proteínas são macromoléculas complexas compostas por cadeias de aminoácidos, e conhecer seu peso molecular é crucial para várias técnicas de laboratório, design experimental e análise de dados. Esta calculadora fornece uma maneira rápida e precisa de estimar o peso molecular de qualquer proteína usando sua sequência de aminoácidos, economizando tempo valioso para os pesquisadores e reduzindo o potencial de erros de cálculo.

O peso molecular das proteínas, frequentemente expresso em Daltons (Da) ou quilodaltons (kDa), representa a soma dos pesos individuais de todos os aminoácidos na proteína, levando em consideração as moléculas de água perdidas durante a formação da ligação peptídica. Essa propriedade fundamental influencia o comportamento da proteína em solução, a mobilidade em eletroforese, as propriedades de cristalização e muitas outras características físicas e químicas que são importantes em aplicações de pesquisa e industriais.

Nossa calculadora amigável requer apenas a sequência de aminoácidos em uma letra da sua proteína para gerar estimativas precisas do peso molecular, tornando-a acessível tanto para pesquisadores experientes quanto para estudantes novos na ciência das proteínas.

Como o Peso Molecular da Proteína é Calculado

A Fórmula Básica

O peso molecular de uma proteína é calculado usando a seguinte fórmula:

$MW_{proteína} = \sum_{i=1}^{n} MW_{aminoácido_i} - (n-1) \times MW_{água} + MW_{água}$

Onde:

• $MW_{proteína}$ é o peso molecular da proteína inteira em Daltons (Da)
• $\sum_{i=1}^{n} MW_{aminoácido_i}$ é a soma dos pesos moleculares de todos os aminoácidos individuais
• $n$ é o número de aminoácidos na sequência
• $MW_{água}$ é o peso molecular da água (18.01528 Da)
• $(n-1)$ representa o número de ligações peptídicas formadas
• O termo final $+ MW_{água}$ leva em conta os grupos terminais (H e OH)

Pesos Moleculares de Aminoácidos

O cálculo utiliza os pesos moleculares padrão dos 20 aminoácidos comuns:

Perda de Água na Formação de Ligações Peptídicas

Quando os aminoácidos se unem para formar uma proteína, eles criam ligações peptídicas. Durante esse processo, uma molécula de água (H₂O) é liberada para cada ligação formada. Essa perda de água deve ser levada em conta no cálculo do peso molecular.

Para uma proteína com n aminoácidos, existem (n-1) ligações peptídicas formadas, resultando na perda de (n-1) moléculas de água. No entanto, adicionamos de volta uma molécula de água para contabilizar os grupos terminais (H no terminal N e OH no terminal C).

Exemplo de Cálculo

Vamos calcular o peso molecular de um tripeptídeo simples: Ala-Gly-Ser (AGS)

1. Some os pesos dos aminoácidos individuais:

   • Alanina (A): 71.03711 Da
   • Glicina (G): 57.02146 Da
   • Serina (S): 87.03203 Da
   • Total: 215.0906 Da

2. Subtraia a perda de água das ligações peptídicas:

   • Número de ligações peptídicas = 3-1 = 2
   • Peso molecular da água = 18.01528 Da
   • Perda total de água = 2 × 18.01528 = 36.03056 Da

3. Adicione de volta uma molécula de água para os grupos terminais:

   • 18.01528 Da

4. Peso molecular final:

   • 215.0906 - 36.03056 + 18.01528 = 197.07532 Da

Como Usar Esta Calculadora

Usar a Calculadora de Peso Molecular de Proteínas é simples:

1. Insira sua sequência de proteína na caixa de texto usando os códigos de aminoácidos padrão de uma letra (A, R, N, D, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V).

2. A calculadora irá validar automaticamente sua entrada para garantir que contenha apenas códigos de aminoácidos válidos.

3. Clique no botão "Calcular Peso Molecular" ou aguarde a conclusão do cálculo automático.

4. Veja os resultados, que incluem:

   • O peso molecular calculado em Daltons (Da)
   • O comprimento da sequência (número de aminoácidos)
   • Uma análise da composição dos aminoácidos
   • A fórmula usada para o cálculo

5. Você pode copiar os resultados para sua área de transferência clicando no botão "Copiar" para uso em relatórios ou análises adicionais.

Diretrizes de Entrada

Para resultados precisos, siga estas diretrizes ao inserir sua sequência de proteína:

• Use apenas os códigos de aminoácidos padrão de uma letra (maiúsculas ou minúsculas)
• Não inclua espaços, números ou caracteres especiais
• Remova quaisquer caracteres não-aminoácidos (como numeração de sequência)
• Para sequências com aminoácidos não padrão, considere usar ferramentas alternativas que suportem códigos de aminoácidos expandidos

Interpretando os Resultados

A calculadora fornece várias informações:

1. Peso Molecular: O peso molecular estimado da sua proteína em Daltons (Da). Para proteínas maiores, isso pode ser expresso em quilodaltons (kDa).

2. Comprimento da Sequência: O número total de aminoácidos na sua sequência.

3. Composição de Aminoácidos: Uma análise visual do conteúdo de aminoácidos da sua proteína, mostrando tanto a contagem quanto a porcentagem de cada aminoácido.

4. Método de Cálculo: Uma explicação clara de como o peso molecular foi calculado, incluindo a fórmula utilizada.

Casos de Uso

A Calculadora de Peso Molecular de Proteínas tem inúmeras aplicações em vários campos das ciências biológicas:

Purificação e Análise de Proteínas

Pesquisadores usam informações sobre peso molecular para:

• Configurar colunas de filtração em gel apropriadas
• Determinar concentrações apropriadas de poliacrilamida para SDS-PAGE
• Interpretar dados de espectrometria de massa
• Validar resultados de expressão e purificação de proteínas

Produção de Proteínas Recombinantes

Empresas de biotecnologia dependem de cálculos precisos de peso molecular para:

• Projetar construções de expressão
• Estimar rendimentos de proteínas
• Desenvolver estratégias de purificação
• Caracterizar produtos finais

Síntese de Peptídeos

Químicos de peptídeos usam cálculos de peso molecular para:

• Determinar a quantidade de materiais de partida necessária
• Calcular rendimentos teóricos
• Verificar a identidade de peptídeos sintetizados
• Projetar métodos analíticos para controle de qualidade

Biologia Estrutural

Biólogos estruturais precisam de informações sobre peso molecular para:

• Configurar testes de cristalização
• Interpretar dados de difração de raios X
• Analisar complexos de proteínas
• Calcular estequiometria de interações proteína-proteína

Desenvolvimento Farmacêutico

Desenvolvedores de medicamentos usam o peso molecular de proteínas para:

• Caracterizar proteínas terapêuticas
• Desenvolver estratégias de formulação
• Projetar métodos analíticos
• Estabelecer especificações de controle de qualidade

Pesquisa Acadêmica

Estudantes e pesquisadores usam a calculadora para:

• Experimentos de laboratório
• Análise de dados
• Design experimental
• Fins educacionais

Alternativas

Embora nossa Calculadora de Peso Molecular de Proteínas forneça estimativas rápidas e precisas, existem abordagens alternativas para determinar o peso molecular de proteínas:

1. Métodos Experimentais:

   • Espectrometria de Massa (MS): Fornece medições de peso molecular altamente precisas e pode detectar modificações pós-traducionais
   • Cromatografia de Exclusão por Tamanho (SEC): Estima o peso molecular com base no raio hidrodinâmico
   • SDS-PAGE: Fornece peso molecular aproximado com base na mobilidade eletroforética

2. Outras Ferramentas Computacionais:

   • ExPASy ProtParam: Oferece parâmetros adicionais de proteínas além do peso molecular
   • EMBOSS Pepstats: Fornece análise estatística detalhada de sequências de proteínas
   • Protein Calculator v3.4: Inclui cálculos adicionais como ponto isoelétrico e coeficiente de extinção

3. Software Especializado:

   • Para proteínas com aminoácidos não padrão ou modificações pós-traducionais
   • Para assembléias de proteínas complexas ou proteínas multiméricas
   • Para proteínas rotuladas isotopicamente usadas em estudos de RMN

História da Determinação do Peso Molecular de Proteínas

O conceito de peso molecular tem sido fundamental para a química desde que John Dalton propôs sua teoria atômica no início do século XIX. No entanto, a aplicação às proteínas tem uma história mais recente:

Ciência das Proteínas Antiga (1800-1920)

• Em 1838, Jöns Jacob Berzelius cunhou o termo "proteína" a partir da palavra grega "proteios", que significa "primário" ou "de primeira importância".
• Cientistas de proteínas antigos, como Frederick Sanger, começaram a entender que as proteínas eram compostas por aminoácidos.
• O conceito de proteínas como macromoléculas com pesos moleculares definidos surgiu gradualmente.

Desenvolvimento de Técnicas Analíticas (1930-1960)

• A invenção da ultracentrifugação por Theodor Svedberg na década de 1920 permitiu as primeiras medições precisas dos pesos moleculares de proteínas.
• O desenvolvimento de técnicas de eletroforese na década de 1930 por Arne Tiselius forneceu outro método para estimar o tamanho da proteína.
• Em 1958, Stanford Moore e William H. Stein completaram a primeira sequência completa de aminoácidos da ribonuclease, permitindo o cálculo preciso do peso molecular.

Era Moderna (1970-Presente)

• O desenvolvimento de técnicas de espectrometria de massa revolucionou a determinação do peso molecular de proteínas.
• John Fenn e Koichi Tanaka receberam o Prêmio Nobel de Química em 2002 por seu desenvolvimento de métodos de ionização de desorção suave para análises espectrométricas de macromoléculas biológicas.
• Métodos computacionais para prever propriedades de proteínas, incluindo peso molecular, tornaram-se cada vez mais sofisticados e acessíveis.
• O advento da genômica e proteômica nas décadas de 1990 e 2000 criou uma necessidade de ferramentas de análise de proteínas de alto rendimento, incluindo calculadoras automáticas de peso molecular.

Hoje, o cálculo do peso molecular de proteínas é uma parte rotineira, mas essencial da ciência das proteínas, facilitada por ferramentas como nossa calculadora que tornam esses cálculos acessíveis a pesquisadores em todo o mundo.

Exemplos de Código

Aqui estão exemplos de como calcular o peso molecular de proteínas em várias linguagens de programação:

1' Função VBA do Excel para Cálculo do Peso Molecular de Proteínas
2Function ProteinMolecularWeight(sequence As String) As Double
3    ' Pesos moleculares de aminoácidos
4    Dim aaWeights As Object
5    Set aaWeights = CreateObject("Scripting.Dictionary")
6    
7    ' Inicializa pesos de aminoácidos
8    aaWeights("A") = 71.03711
9    aaWeights("R") = 156.10111
10    aaWeights("N") = 114.04293
11    aaWeights("D") = 115.02694
12    aaWeights("C") = 103.00919
13    aaWeights("E") = 129.04259
14    aaWeights("Q") = 128.05858
15    aaWeights("G") = 57.02146
16    aaWeights("H") = 137.05891
17    aaWeights("I") = 113.08406
18    aaWeights("L") = 113.08406
19    aaWeights("K") = 128.09496
20    aaWeights("M") = 131.04049
21    aaWeights("F") = 147.06841
22    aaWeights("P") = 97.05276
23    aaWeights("S") = 87.03203
24    aaWeights("T") = 101.04768
25    aaWeights("W") = 186.07931
26    aaWeights("Y") = 163.06333
27    aaWeights("V") = 99.06841
28    
29    ' Peso molecular da água
30    Const WATER_WEIGHT As Double = 18.01528
31    
32    ' Converte sequência para maiúsculas
33    sequence = UCase(sequence)
34    
35    ' Calcula peso total
36    Dim totalWeight As Double
37    totalWeight = 0
38    
39    ' Soma pesos individuais de aminoácidos
40    Dim i As Integer
41    For i = 1 To Len(sequence)
42        Dim aa As String
43        aa = Mid(sequence, i, 1)
44        
45        If aaWeights.Exists(aa) Then
46            totalWeight = totalWeight + aaWeights(aa)
47        Else
48            ' Código de aminoácido inválido
49            ProteinMolecularWeight = -1
50            Exit Function
51        End If
52    Next i
53    
54    ' Subtrai perda de água das ligações peptídicas e adiciona água terminal
55    Dim numAminoAcids As Integer
56    numAminoAcids = Len(sequence)
57    
58    ProteinMolecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
59End Function
60
61' Uso no Excel:
62' =ProteinMolecularWeight("ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY")
63

1def calculate_protein_molecular_weight(sequence):
2    """
3    Calcular o peso molecular de uma proteína a partir de sua sequência de aminoácidos.
4    
5    Args:
6        sequence (str): Sequência de proteína usando códigos de aminoácidos de uma letra
7        
8    Returns:
9        float: Peso molecular em Daltons (Da)
10    """
11    # Pesos moleculares de aminoácidos
12    aa_weights = {
13        'A': 71.03711,
14        'R': 156.10111,
15        'N': 114.04293,
16        'D': 115.02694,
17        'C': 103.00919,
18        'E': 129.04259,
19        'Q': 128.05858,
20        'G': 57.02146,
21        'H': 137.05891,
22        'I': 113.08406,
23        'L': 113.08406,
24        'K': 128.09496,
25        'M': 131.04049,
26        'F': 147.06841,
27        'P': 97.05276,
28        'S': 87.03203,
29        'T': 101.04768,
30        'W': 186.07931,
31        'Y': 163.06333,
32        'V': 99.06841
33    }
34    
35    # Peso molecular da água
36    WATER_WEIGHT = 18.01528
37    
38    # Converte sequência para maiúsculas
39    sequence = sequence.upper()
40    
41    # Valida sequência
42    for aa in sequence:
43        if aa not in aa_weights:
44            raise ValueError(f"Código de aminoácido inválido: {aa}")
45    
46    # Soma pesos individuais de aminoácidos
47    total_weight = sum(aa_weights[aa] for aa in sequence)
48    
49    # Subtrai perda de água das ligações peptídicas e adiciona água terminal
50    num_amino_acids = len(sequence)
51    molecular_weight = total_weight - (num_amino_acids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
52    
53    return molecular_weight
54
55# Exemplo de uso:
56sequence = "MVKMDVYKGSSIGDSMSRSM"
57mw = calculate_protein_molecular_weight(sequence)
58print(f"Peso molecular: {mw:.2f} Da")
59

1function calculateProteinMolecularWeight(sequence) {
2  // Pesos moleculares de aminoácidos
3  const aaWeights = {
4    'A': 71.03711,
5    'R': 156.10111,
6    'N': 114.04293,
7    'D': 115.02694,
8    'C': 103.00919,
9    'E': 129.04259,
10    'Q': 128.05858,
11    'G': 57.02146,
12    'H': 137.05891,
13    'I': 113.08406,
14    'L': 113.08406,
15    'K': 128.09496,
16    'M': 131.04049,
17    'F': 147.06841,
18    'P': 97.05276,
19    'S': 87.03203,
20    'T': 101.04768,
21    'W': 186.07931,
22    'Y': 163.06333,
23    'V': 99.06841
24  };
25  
26  // Peso molecular da água
27  const WATER_WEIGHT = 18.01528;
28  
29  // Converte sequência para maiúsculas
30  sequence = sequence.toUpperCase();
31  
32  // Valida sequência
33  for (let i = 0; i < sequence.length; i++) {
34    const aa = sequence[i];
35    if (!aaWeights[aa]) {
36      throw new Error(`Código de aminoácido inválido: ${aa}`);
37    }
38  }
39  
40  // Soma pesos individuais de aminoácidos
41  let totalWeight = 0;
42  for (let i = 0; i < sequence.length; i++) {
43    totalWeight += aaWeights[sequence[i]];
44  }
45  
46  // Subtrai perda de água das ligações peptídicas e adiciona água terminal
47  const numAminoAcids = sequence.length;
48  const molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
49  
50  return molecularWeight;
51}
52
53// Exemplo de uso:
54const sequence = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY";
55try {
56  const mw = calculateProteinMolecularWeight(sequence);
57  console.log(`Peso molecular: ${mw.toFixed(2)} Da`);
58} catch (error) {
59  console.error(error.message);
60}
61

1import java.util.HashMap;
2import java.util.Map;
3
4public class ProteinMolecularWeightCalculator {
5    private static final Map<Character, Double> aminoAcidWeights = new HashMap<>();
6    private static final double WATER_WEIGHT = 18.01528;
7    
8    static {
9        // Inicializa pesos de aminoácidos
10        aminoAcidWeights.put('A', 71.03711);
11        aminoAcidWeights.put('R', 156.10111);
12        aminoAcidWeights.put('N', 114.04293);
13        aminoAcidWeights.put('D', 115.02694);
14        aminoAcidWeights.put('C', 103.00919);
15        aminoAcidWeights.put('E', 129.04259);
16        aminoAcidWeights.put('Q', 128.05858);
17        aminoAcidWeights.put('G', 57.02146);
18        aminoAcidWeights.put('H', 137.05891);
19        aminoAcidWeights.put('I', 113.08406);
20        aminoAcidWeights.put('L', 113.08406);
21        aminoAcidWeights.put('K', 128.09496);
22        aminoAcidWeights.put('M', 131.04049);
23        aminoAcidWeights.put('F', 147.06841);
24        aminoAcidWeights.put('P', 97.05276);
25        aminoAcidWeights.put('S', 87.03203);
26        aminoAcidWeights.put('T', 101.04768);
27        aminoAcidWeights.put('W', 186.07931);
28        aminoAcidWeights.put('Y', 163.06333);
29        aminoAcidWeights.put('V', 99.06841);
30    }
31    
32    public static double calculateMolecularWeight(String sequence) throws IllegalArgumentException {
33        // Converte sequência para maiúsculas
34        sequence = sequence.toUpperCase();
35        
36        // Valida sequência
37        for (int i = 0; i < sequence.length(); i++) {
38            char aa = sequence.charAt(i);
39            if (!aminoAcidWeights.containsKey(aa)) {
40                throw new IllegalArgumentException("Código de aminoácido inválido: " + aa);
41            }
42        }
43        
44        // Soma pesos individuais de aminoácidos
45        double totalWeight = 0;
46        for (int i = 0; i < sequence.length(); i++) {
47            totalWeight += aminoAcidWeights.get(sequence.charAt(i));
48        }
49        
50        // Subtrai perda de água das ligações peptídicas e adiciona água terminal
51        int numAminoAcids = sequence.length();
52        double molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
53        
54        return molecularWeight;
55    }
56    
57    public static void main(String[] args) {
58        try {
59            String sequence = "MVKMDVYKGSSIGDSMSRSM";
60            double mw = calculateMolecularWeight(sequence);
61            System.out.printf("Peso molecular: %.2f Da%n", mw);
62        } catch (IllegalArgumentException e) {
63            System.err.println(e.getMessage());
64        }
65    }
66}
67

1#include <iostream>
2#include <string>
3#include <map>
4#include <stdexcept>
5#include <algorithm>
6
7double calculateProteinMolecularWeight(const std::string& sequence) {
8    // Pesos moleculares de aminoácidos
9    std::map<char, double> aaWeights = {
10        {'A', 71.03711},
11        {'R', 156.10111},
12        {'N', 114.04293},
13        {'D', 115.02694},
14        {'C', 103.00919},
15        {'E', 129.04259},
16        {'Q', 128.05858},
17        {'G', 57.02146},
18        {'H', 137.05891},
19        {'I', 113.08406},
20        {'L', 113.08406},
21        {'K', 128.09496},
22        {'M', 131.04049},
23        {'F', 147.06841},
24        {'P', 97.05276},
25        {'S', 87.03203},
26        {'T', 101.04768},
27        {'W', 186.07931},
28        {'Y', 163.06333},
29        {'V', 99.06841}
30    };
31    
32    // Peso molecular da água
33    const double WATER_WEIGHT = 18.01528;
34    
35    // Converte sequência para maiúsculas
36    std::string upperSequence = sequence;
37    std::transform(upperSequence.begin(), upperSequence.end(), upperSequence.begin(), ::toupper);
38    
39    // Valida sequência
40    for (char aa : upperSequence) {
41        if (aaWeights.find(aa) == aaWeights.end()) {
42            throw std::invalid_argument(std::string("Código de aminoácido inválido: ") + aa);
43        }
44    }
45    
46    // Soma pesos individuais de aminoácidos
47    double totalWeight = 0.0;
48    for (char aa : upperSequence) {
49        totalWeight += aaWeights[aa];
50    }
51    
52    // Subtrai perda de água das ligações peptídicas e adiciona água terminal
53    int numAminoAcids = upperSequence.length();
54    double molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
55    
56    return molecularWeight;
57}
58
59int main() {
60    try {
61        std::string sequence = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY";
62        double mw = calculateProteinMolecularWeight(sequence);
63        std::cout << "Peso molecular: " << std::fixed << std::setprecision(2) << mw << " Da" << std::endl;
64    } catch (const std::exception& e) {
65        std::cerr << "Erro: " << e.what() << std::endl;
66    }
67    
68    return 0;
69}
70

Perguntas Frequentes

O que é peso molecular de proteínas?

O peso molecular de proteínas, também chamado de massa molecular, é a massa total de uma molécula de proteína expressa em Daltons (Da) ou quilodaltons (kDa). Representa a soma das massas de todos os átomos na proteína, levando em consideração a perda de moléculas de água durante a formação da ligação peptídica. Essa propriedade fundamental é crucial para a caracterização, purificação e análise de proteínas.

Quão precisa é esta calculadora de peso molecular de proteínas?

Esta calculadora fornece o peso molecular teórico com alta precisão com base na sequência de aminoácidos. Ela utiliza as massas monoisotópicas padrão dos aminoácidos e leva em consideração a perda de água durante a formação da ligação peptídica. No entanto, não leva em conta modificações pós-traducionais, aminoácidos não padrão ou variações isotópicas que possam estar presentes em proteínas reais.

Quais unidades são usadas para peso molecular de proteínas?

Os pesos moleculares de proteínas são tipicamente expressos em Daltons (Da) ou quilodaltons (kDa), onde 1 kDa é igual a 1.000 Da. O Dalton é aproximadamente igual à massa de um átomo de hidrogênio (1,66 × 10^-24 gramas). Para referência, pequenos peptídeos podem ter algumas centenas de Da, enquanto grandes proteínas podem ter centenas de kDa.

Por que meu peso molecular calculado difere dos valores experimentais?

Vários fatores podem causar discrepâncias entre os pesos moleculares calculados e experimentais:

1. Modificações pós-traducionais (fosforilação, glicosilação, etc.)
2. Formação de ligações de dissulfeto
3. Processamento proteolítico
4. Aminoácidos não padrão
5. Erros de medição experimental
6. Variações isotópicas

Para a determinação precisa do peso molecular de proteínas modificadas, a espectrometria de massa é recomendada.

Esta calculadora pode lidar com aminoácidos não padrão?

Esta calculadora suporta apenas os 20 aminoácidos padrão usando seus códigos de uma letra (A, R, N, D, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V). Para proteínas contendo aminoácidos não padrão, selenocisteína ou outros resíduos modificados, ferramentas especializadas ou cálculos manuais seriam necessários.

Como interpreto os resultados da composição de aminoácidos?

A composição de aminoácidos mostra a contagem e a porcentagem de cada aminoácido na sua sequência de proteína. Essas informações são úteis para:

• Compreender as propriedades físicas da sua proteína
• Identificar regiões de interesse (por exemplo, áreas hidrofóbicas)
• Planejar procedimentos experimentais (por exemplo, medições espectroscópicas)
• Comparar proteínas semelhantes entre espécies

Qual é a diferença entre peso molecular médio e monoisotópico?

• Peso molecular monoisotópico usa a massa do isotopo mais abundante de cada elemento (o que esta calculadora fornece)
• Peso molecular médio usa a média ponderada de todos os isotopos naturalmente ocorrentes

Para pequenos peptídeos, a diferença é mínima, mas torna-se mais significativa para proteínas maiores. A espectrometria de massa geralmente mede massas monoisotópicas para moléculas menores e massas médias para maiores.

Como a calculadora lida com grupos terminais N e C?

A calculadora leva em conta os grupos terminais padrão (NH₂- e -COOH) adicionando de volta uma molécula de água (18.01528 Da) após subtrair a água perdida na formação da ligação peptídica. Isso garante que o peso molecular calculado represente a proteína completa com os grupos terminais adequados.

Posso calcular o peso molecular de uma proteína com ligações de dissulfeto?

Sim, mas esta calculadora não ajusta automaticamente para ligações de dissulfeto. Cada formação de ligação de dissulfeto resulta na perda de dois átomos de hidrogênio (2.01588 Da). Para levar em conta ligações de dissulfeto, subtraia 2.01588 Da do peso molecular calculado para cada ligação de dissulfeto na sua proteína.

Como o peso molecular de proteínas se relaciona com o tamanho da proteína?

Embora o peso molecular correlacione-se com o tamanho da proteína, a relação nem sempre é direta. Fatores que afetam o tamanho físico de uma proteína incluem:

• Composição de aminoácidos
• Estrutura secundária e terciária
• Casca de hidratação
• Modificações pós-traducionais
• Condições ambientais (pH, concentração de sal)

Para uma estimativa aproximada, uma proteína globular de 10 kDa tem um diâmetro de aproximadamente 2-3 nm.

Referências

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8. Kinter, M., & Sherman, N. E. (2005). Sequenciamento e Identificação de Proteínas Usando Espectrometria de Massa. Wiley-Interscience.

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