Calcula el peso molecular de las proteínas basado en secuencias de aminoácidos. Ingresa tu secuencia de proteína utilizando los códigos estándar de una letra para obtener un peso molecular preciso en Daltons.
Calcula el peso molecular de una proteína basado en su secuencia de aminoácidos.
Usa códigos estándar de aminoácidos de una letra (A, R, N, D, C, etc.)
Este calculador estima el peso molecular de una proteína basado en su secuencia de aminoácidos.
El cálculo tiene en cuenta los pesos moleculares estándar de los aminoácidos y la pérdida de agua durante la formación de enlaces peptídicos.
Para obtener resultados precisos, asegúrate de ingresar una secuencia de aminoácidos válida utilizando códigos estándar de una letra.
La calculadora de peso molecular de proteínas es una herramienta esencial para bioquímicos, biólogos moleculares y científicos de proteínas que necesitan determinar la masa de las proteínas en función de sus secuencias de aminoácidos. Las proteínas son macromoléculas complejas compuestas por cadenas de aminoácidos, y conocer su peso molecular es crucial para diversas técnicas de laboratorio, diseño experimental y análisis de datos. Esta calculadora proporciona una forma rápida y precisa de estimar el peso molecular de cualquier proteína utilizando su secuencia de aminoácidos, ahorrando tiempo valioso a los investigadores y reduciendo el potencial de errores de cálculo.
El peso molecular de las proteínas, a menudo expresado en Daltons (Da) o kilodaltons (kDa), representa la suma de los pesos individuales de todos los aminoácidos en la proteína, teniendo en cuenta las moléculas de agua perdidas durante la formación de enlaces peptídicos. Esta propiedad fundamental influye en el comportamiento de la proteína en solución, la movilidad en electroforesis, las propiedades de cristalización y muchas otras características físicas y químicas que son importantes en aplicaciones de investigación e industriales.
Nuestra calculadora fácil de usar requiere solo la secuencia de aminoácidos en notación de una letra de su proteína para generar estimaciones precisas del peso molecular, lo que la hace accesible tanto para investigadores experimentados como para estudiantes nuevos en la ciencia de proteínas.
El peso molecular de una proteína se calcula utilizando la siguiente fórmula:
Donde:
El cálculo utiliza los pesos moleculares estándar de los 20 aminoácidos comunes:
Aminoácido | Código de una letra | Peso Molecular (Da) |
---|---|---|
Alanina | A | 71.03711 |
Arginina | R | 156.10111 |
Asparagina | N | 114.04293 |
Ácido aspártico | D | 115.02694 |
Cisteína | C | 103.00919 |
Ácido glutámico | E | 129.04259 |
Glutamina | Q | 128.05858 |
Glicina | G | 57.02146 |
Histidina | H | 137.05891 |
Isoleucina | I | 113.08406 |
Leucina | L | 113.08406 |
Lisina | K | 128.09496 |
Metionina | M | 131.04049 |
Fenilalanina | F | 147.06841 |
Prolina | P | 97.05276 |
Serina | S | 87.03203 |
Treonina | T | 101.04768 |
Triptófano | W | 186.07931 |
Tirosina | Y | 163.06333 |
Valina | V | 99.06841 |
Cuando los aminoácidos se unen para formar una proteína, crean enlaces peptídicos. Durante este proceso, se libera una molécula de agua (H₂O) por cada enlace formado. Esta pérdida de agua debe tenerse en cuenta en el cálculo del peso molecular.
Para una proteína con n aminoácidos, se forman (n-1) enlaces peptídicos, lo que resulta en la pérdida de (n-1) moléculas de agua. Sin embargo, se agrega de nuevo una molécula de agua para tener en cuenta los grupos terminales (H en el extremo N y OH en el extremo C).
Calculemos el peso molecular de un tripeptido simple: Ala-Gly-Ser (AGS)
Sumar los pesos de los aminoácidos individuales:
Restar la pérdida de agua por los enlaces peptídicos:
Agregar de nuevo una molécula de agua para los grupos terminales:
Peso molecular final:
Usar la Calculadora de Peso Molecular de Proteínas es sencillo:
Ingrese su secuencia de proteína en el cuadro de texto utilizando los códigos estándar de aminoácidos de una letra (A, R, N, D, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V).
La calculadora validará automáticamente su entrada para asegurarse de que contenga solo códigos de aminoácidos válidos.
Haga clic en el botón "Calcular Peso Molecular" o espere a que se complete el cálculo automático.
Vea los resultados, que incluyen:
Puede copiar los resultados al portapapeles haciendo clic en el botón "Copiar" para usarlos en informes o análisis posteriores.
Para obtener resultados precisos, siga estas directrices al ingresar su secuencia de proteína:
La calculadora proporciona varias piezas de información:
Peso Molecular: El peso molecular estimado de su proteína en Daltons (Da). Para proteínas más grandes, esto puede expresarse en kilodaltons (kDa).
Longitud de la Secuencia: El número total de aminoácidos en su secuencia.
Composición de Aminoácidos: Un desglose visual del contenido de aminoácidos de su proteína, mostrando tanto el conteo como el porcentaje de cada aminoácido.
Método de Cálculo: Una explicación clara de cómo se calculó el peso molecular, incluida la fórmula utilizada.
La Calculadora de Peso Molecular de Proteínas tiene numerosas aplicaciones en diversos campos de las ciencias de la vida:
Los investigadores utilizan la información sobre el peso molecular para:
Las empresas biotecnológicas confían en cálculos precisos del peso molecular para:
Los químicos de péptidos utilizan cálculos de peso molecular para:
Los biólogos estructurales necesitan información sobre el peso molecular para:
Los desarrolladores de fármacos utilizan el peso molecular de las proteínas para:
Los estudiantes e investigadores utilizan la calculadora para:
Si bien nuestra Calculadora de Peso Molecular de Proteínas proporciona estimaciones rápidas y precisas, hay enfoques alternativos para determinar el peso molecular de las proteínas:
Métodos Experimentales:
Otras Herramientas Computacionales:
Software Especializado:
El concepto de peso molecular ha sido fundamental para la química desde que John Dalton propuso su teoría atómica a principios del siglo XIX. Sin embargo, la aplicación a las proteínas tiene una historia más reciente:
Hoy en día, el cálculo del peso molecular de proteínas es una parte rutinaria pero esencial de la ciencia de proteínas, facilitado por herramientas como nuestra calculadora que hacen que estos cálculos sean accesibles para investigadores de todo el mundo.
Aquí hay ejemplos de cómo calcular el peso molecular de proteínas en varios lenguajes de programación:
1' Función VBA de Excel para el Cálculo del Peso Molecular de Proteínas
2Function ProteinMolecularWeight(sequence As String) As Double
3 ' Pesos moleculares de aminoácidos
4 Dim aaWeights As Object
5 Set aaWeights = CreateObject("Scripting.Dictionary")
6
7 ' Inicializar pesos de aminoácidos
8 aaWeights("A") = 71.03711
9 aaWeights("R") = 156.10111
10 aaWeights("N") = 114.04293
11 aaWeights("D") = 115.02694
12 aaWeights("C") = 103.00919
13 aaWeights("E") = 129.04259
14 aaWeights("Q") = 128.05858
15 aaWeights("G") = 57.02146
16 aaWeights("H") = 137.05891
17 aaWeights("I") = 113.08406
18 aaWeights("L") = 113.08406
19 aaWeights("K") = 128.09496
20 aaWeights("M") = 131.04049
21 aaWeights("F") = 147.06841
22 aaWeights("P") = 97.05276
23 aaWeights("S") = 87.03203
24 aaWeights("T") = 101.04768
25 aaWeights("W") = 186.07931
26 aaWeights("Y") = 163.06333
27 aaWeights("V") = 99.06841
28
29 ' Peso molecular del agua
30 Const WATER_WEIGHT As Double = 18.01528
31
32 ' Convertir secuencia a mayúsculas
33 sequence = UCase(sequence)
34
35 ' Calcular peso total
36 Dim totalWeight As Double
37 totalWeight = 0
38
39 ' Sumar pesos de aminoácidos individuales
40 Dim i As Integer
41 For i = 1 To Len(sequence)
42 Dim aa As String
43 aa = Mid(sequence, i, 1)
44
45 If aaWeights.Exists(aa) Then
46 totalWeight = totalWeight + aaWeights(aa)
47 Else
48 ' Código de aminoácido no válido
49 ProteinMolecularWeight = -1
50 Exit Function
51 End If
52 Next i
53
54 ' Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
55 Dim numAminoAcids As Integer
56 numAminoAcids = Len(sequence)
57
58 ProteinMolecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
59End Function
60
61' Uso en Excel:
62' =ProteinMolecularWeight("ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY")
63
1def calculate_protein_molecular_weight(sequence):
2 """
3 Calcular el peso molecular de una proteína a partir de su secuencia de aminoácidos.
4
5 Args:
6 sequence (str): Secuencia de proteína utilizando códigos de aminoácidos de una letra
7
8 Returns:
9 float: Peso molecular en Daltons (Da)
10 """
11 # Pesos moleculares de aminoácidos
12 aa_weights = {
13 'A': 71.03711,
14 'R': 156.10111,
15 'N': 114.04293,
16 'D': 115.02694,
17 'C': 103.00919,
18 'E': 129.04259,
19 'Q': 128.05858,
20 'G': 57.02146,
21 'H': 137.05891,
22 'I': 113.08406,
23 'L': 113.08406,
24 'K': 128.09496,
25 'M': 131.04049,
26 'F': 147.06841,
27 'P': 97.05276,
28 'S': 87.03203,
29 'T': 101.04768,
30 'W': 186.07931,
31 'Y': 163.06333,
32 'V': 99.06841
33 }
34
35 # Peso molecular del agua
36 WATER_WEIGHT = 18.01528
37
38 # Convertir secuencia a mayúsculas
39 sequence = sequence.upper()
40
41 # Validar secuencia
42 for aa in sequence:
43 if aa not in aa_weights:
44 raise ValueError(f"Código de aminoácido no válido: {aa}")
45
46 # Sumar pesos de aminoácidos individuales
47 total_weight = sum(aa_weights[aa] for aa in sequence)
48
49 # Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
50 num_amino_acids = len(sequence)
51 molecular_weight = total_weight - (num_amino_acids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT
52
53 return molecular_weight
54
55# Ejemplo de uso:
56sequence = "MVKMDVYKGSSIGDSMSRSM"
57mw = calculate_protein_molecular_weight(sequence)
58print(f"Peso molecular: {mw:.2f} Da")
59
1function calculateProteinMolecularWeight(sequence) {
2 // Pesos moleculares de aminoácidos
3 const aaWeights = {
4 'A': 71.03711,
5 'R': 156.10111,
6 'N': 114.04293,
7 'D': 115.02694,
8 'C': 103.00919,
9 'E': 129.04259,
10 'Q': 128.05858,
11 'G': 57.02146,
12 'H': 137.05891,
13 'I': 113.08406,
14 'L': 113.08406,
15 'K': 128.09496,
16 'M': 131.04049,
17 'F': 147.06841,
18 'P': 97.05276,
19 'S': 87.03203,
20 'T': 101.04768,
21 'W': 186.07931,
22 'Y': 163.06333,
23 'V': 99.06841
24 };
25
26 // Peso molecular del agua
27 const WATER_WEIGHT = 18.01528;
28
29 // Convertir secuencia a mayúsculas
30 sequence = sequence.toUpperCase();
31
32 // Validar secuencia
33 for (let i = 0; i < sequence.length; i++) {
34 const aa = sequence[i];
35 if (!aaWeights[aa]) {
36 throw new Error(`Código de aminoácido no válido: ${aa}`);
37 }
38 }
39
40 // Sumar pesos de aminoácidos individuales
41 let totalWeight = 0;
42 for (let i = 0; i < sequence.length; i++) {
43 totalWeight += aaWeights[sequence[i]];
44 }
45
46 // Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
47 const numAminoAcids = sequence.length;
48 const molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
49
50 return molecularWeight;
51}
52
53// Ejemplo de uso:
54const sequence = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY";
55try {
56 const mw = calculateProteinMolecularWeight(sequence);
57 console.log(`Peso molecular: ${mw.toFixed(2)} Da`);
58} catch (error) {
59 console.error(error.message);
60}
61
1import java.util.HashMap;
2import java.util.Map;
3
4public class ProteinMolecularWeightCalculator {
5 private static final Map<Character, Double> aminoAcidWeights = new HashMap<>();
6 private static final double WATER_WEIGHT = 18.01528;
7
8 static {
9 // Inicializar pesos de aminoácidos
10 aminoAcidWeights.put('A', 71.03711);
11 aminoAcidWeights.put('R', 156.10111);
12 aminoAcidWeights.put('N', 114.04293);
13 aminoAcidWeights.put('D', 115.02694);
14 aminoAcidWeights.put('C', 103.00919);
15 aminoAcidWeights.put('E', 129.04259);
16 aminoAcidWeights.put('Q', 128.05858);
17 aminoAcidWeights.put('G', 57.02146);
18 aminoAcidWeights.put('H', 137.05891);
19 aminoAcidWeights.put('I', 113.08406);
20 aminoAcidWeights.put('L', 113.08406);
21 aminoAcidWeights.put('K', 128.09496);
22 aminoAcidWeights.put('M', 131.04049);
23 aminoAcidWeights.put('F', 147.06841);
24 aminoAcidWeights.put('P', 97.05276);
25 aminoAcidWeights.put('S', 87.03203);
26 aminoAcidWeights.put('T', 101.04768);
27 aminoAcidWeights.put('W', 186.07931);
28 aminoAcidWeights.put('Y', 163.06333);
29 aminoAcidWeights.put('V', 99.06841);
30 }
31
32 public static double calculateMolecularWeight(String sequence) throws IllegalArgumentException {
33 // Convertir secuencia a mayúsculas
34 sequence = sequence.toUpperCase();
35
36 // Validar secuencia
37 for (int i = 0; i < sequence.length(); i++) {
38 char aa = sequence.charAt(i);
39 if (!aminoAcidWeights.containsKey(aa)) {
40 throw new IllegalArgumentException("Código de aminoácido no válido: " + aa);
41 }
42 }
43
44 // Sumar pesos de aminoácidos individuales
45 double totalWeight = 0;
46 for (int i = 0; i < sequence.length(); i++) {
47 totalWeight += aminoAcidWeights.get(sequence.charAt(i));
48 }
49
50 // Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
51 int numAminoAcids = sequence.length();
52 double molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
53
54 return molecularWeight;
55 }
56
57 public static void main(String[] args) {
58 try {
59 String sequence = "MVKMDVYKGSSIGDSMSRSM";
60 double mw = calculateMolecularWeight(sequence);
61 System.out.printf("Peso molecular: %.2f Da%n", mw);
62 } catch (IllegalArgumentException e) {
63 System.err.println(e.getMessage());
64 }
65 }
66}
67
1#include <iostream>
2#include <string>
3#include <map>
4#include <stdexcept>
5#include <algorithm>
6
7double calculateProteinMolecularWeight(const std::string& sequence) {
8 // Pesos moleculares de aminoácidos
9 std::map<char, double> aaWeights = {
10 {'A', 71.03711},
11 {'R', 156.10111},
12 {'N', 114.04293},
13 {'D', 115.02694},
14 {'C', 103.00919},
15 {'E', 129.04259},
16 {'Q', 128.05858},
17 {'G', 57.02146},
18 {'H', 137.05891},
19 {'I', 113.08406},
20 {'L', 113.08406},
21 {'K', 128.09496},
22 {'M', 131.04049},
23 {'F', 147.06841},
24 {'P', 97.05276},
25 {'S', 87.03203},
26 {'T', 101.04768},
27 {'W', 186.07931},
28 {'Y', 163.06333},
29 {'V', 99.06841}
30 };
31
32 // Peso molecular del agua
33 const double WATER_WEIGHT = 18.01528;
34
35 // Convertir secuencia a mayúsculas
36 std::string upperSequence = sequence;
37 std::transform(upperSequence.begin(), upperSequence.end(), upperSequence.begin(), ::toupper);
38
39 // Validar secuencia
40 for (char aa : upperSequence) {
41 if (aaWeights.find(aa) == aaWeights.end()) {
42 throw std::invalid_argument(std::string("Código de aminoácido no válido: ") + aa);
43 }
44 }
45
46 // Sumar pesos de aminoácidos individuales
47 double totalWeight = 0.0;
48 for (char aa : upperSequence) {
49 totalWeight += aaWeights[aa];
50 }
51
52 // Restar pérdida de agua por enlaces peptídicos y agregar agua terminal
53 int numAminoAcids = upperSequence.length();
54 double molecularWeight = totalWeight - (numAminoAcids - 1) * WATER_WEIGHT + WATER_WEIGHT;
55
56 return molecularWeight;
57}
58
59int main() {
60 try {
61 std::string sequence = "ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY";
62 double mw = calculateProteinMolecularWeight(sequence);
63 std::cout << "Peso molecular: " << std::fixed << std::setprecision(2) << mw << " Da" << std::endl;
64 } catch (const std::exception& e) {
65 std::cerr << "Error: " << e.what() << std::endl;
66 }
67
68 return 0;
69}
70
El peso molecular de una proteína, también llamado masa molecular, es la masa total de una molécula de proteína expresada en Daltons (Da) o kilodaltons (kDa). Representa la suma de las masas de todos los átomos en la proteína, teniendo en cuenta la pérdida de moléculas de agua durante la formación de enlaces peptídicos. Esta propiedad fundamental es crucial para la caracterización, purificación y análisis de proteínas.
Esta calculadora proporciona el peso molecular teórico basado en la secuencia de aminoácidos con alta precisión. Utiliza las masas monoisotópicas estándar de los aminoácidos y tiene en cuenta la pérdida de agua durante la formación de enlaces peptídicos. Sin embargo, no tiene en cuenta modificaciones post-traduccionales, aminoácidos no estándar o variaciones isotópicas que podrían estar presentes en proteínas reales.
Los pesos moleculares de proteínas se expresan típicamente en Daltons (Da) o kilodaltons (kDa), donde 1 kDa equivale a 1,000 Da. El Dalton es aproximadamente igual a la masa de un átomo de hidrógeno (1.66 × 10^-24 gramos). A modo de referencia, los péptidos pequeños pueden ser de unos pocos cientos de Da, mientras que las proteínas grandes pueden ser de cientos de kDa.
Varios factores pueden causar discrepancias entre los pesos moleculares calculados y experimentales:
Para la determinación precisa del peso molecular de proteínas modificadas, se recomienda la espectrometría de masas.
Sí, pero esta calculadora no ajusta automáticamente para enlaces disulfuro. Cada formación de enlace disulfuro resulta en la pérdida de dos átomos de hidrógeno (2.01588 Da). Para tener en cuenta los enlaces disulfuro, reste 2.01588 Da del peso molecular calculado por cada enlace disulfuro en su proteína.
Si bien el peso molecular se correlaciona con el tamaño de la proteína, la relación no siempre es directa. Los factores que afectan el tamaño físico de una proteína incluyen:
Para una estimación aproximada, una proteína globular de 10 kDa tiene un diámetro de aproximadamente 2-3 nm.
Gasteiger E., Hoogland C., Gattiker A., Duvaud S., Wilkins M.R., Appel R.D., Bairoch A. (2005) Herramientas de Identificación y Análisis de Proteínas en el Servidor ExPASy. En: Walker J.M. (eds) El Manual de Protocolos de Proteómica. Humana Press.
Nelson, D. L., & Cox, M. M. (2017). Principios de Bioquímica de Lehninger (7ª ed.). W.H. Freeman and Company.
Steen, H., & Mann, M. (2004). Las ABC's (y XYZ's) de la secuenciación de péptidos. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 5(9), 699-711.
Voet, D., Voet, J. G., & Pratt, C. W. (2016). Fundamentos de Bioquímica: La Vida a Nivel Molecular (5ª ed.). Wiley.
Creighton, T. E. (2010). La Química Biofísica de Ácidos Nucleicos y Proteínas. Helvetian Press.
UniProt Consortium. (2021). UniProt: la base de datos de conocimiento universal de proteínas en 2021. Nucleic Acids Research, 49(D1), D480-D489.
Artimo, P., Jonnalagedda, M., Arnold, K., Baratin, D., Csardi, G., de Castro, E., Duvaud, S., Flegel, V., Fortier, A., Gasteiger, E., Grosdidier, A., Hernandez, C., Ioannidis, V., Kuznetsov, D., Liechti, R., Moretti, S., Mostaguir, K., Redaschi, N., Rossier, G., Xenarios, I., & Stockinger, H. (2012). ExPASy: Portal de recursos bioinformáticos SIB. Nucleic Acids Research, 40(W1), W597-W603.
Kinter, M., & Sherman, N. E. (2005). Secuenciación e Identificación de Proteínas Usando Espectrometría de Masas. Wiley-Interscience.
Pruebe hoy nuestra Calculadora de Peso Molecular de Proteínas para determinar rápida y precisamente el peso molecular de sus secuencias de proteínas. Ya sea que esté planificando experimentos, analizando resultados o aprendiendo sobre bioquímica de proteínas, esta herramienta proporciona la información que necesita en segundos.
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