Traductor de ADN a proteína - Conversor de codones y aminoácidos
Traduce una secuencia de ADN o ARN a una secuencia de aminoácidos con el código genético estándar. Elige un marco de lectura y consulta cada codón traducido.
Traductor de ADN a proteína
Introduce una secuencia de ADN o ARN. Usa las bases A, C, G y T. La U se lee como T. Los espacios, saltos de línea y números se ignoran. La traducción usa el Código Genético Estándar (tabla 1 de NCBI).
Comienza la traducción en el primer ATG de este marco de lectura, tal como un ribosoma empieza a leer un marco abierto de lectura, en lugar de empezar justo al inicio del marco.
Documentación
Un traductor de ADN a proteína convierte una secuencia de ADN o ARN en la cadena de aminoácidos que codifica, usando el código genético estándar. Lee la secuencia de tres en tres bases y busca cada triplete en una tabla fija de 64 codones.
Cómo funciona la traducción
Un gen está escrito con cuatro letras: A, C, G y T (o U en el ARN). Las células leen estas letras en grupos de tres sin solapamiento, llamados codones. Cada codón representa un aminoácido o una señal de parada que termina la cadena.
Esta herramienta primero limpia la entrada. Convierte las letras minúsculas en mayúsculas, elimina espacios, saltos de línea y dígitos, y cambia cada U por T, ya que el uracilo del ARN corresponde al mismo codón que la timina del ADN. Después rechaza cualquier carácter que no sea A, C, G o T, como los códigos de ambigüedad tipo N, de modo que una secuencia nunca se traduce mal sin avisar.
El código genético estándar
La herramienta usa la Tabla de traducción 1 del NCBI, «El código estándar», el código genético usado por la mayoría de los organismos, incluidos los humanos. Asigna cada uno de los 64 codones posibles a uno de los 20 aminoácidos o a una señal de parada.
Tres codones son codones de parada: TAA, TAG y TGA. Ninguno codifica un aminoácido. Cuando la herramienta llega a uno de ellos, termina la traducción ahí. El codón de parada en sí no se añade a la proteína, y las bases posteriores se ignoran.
El codón ATG codifica el aminoácido metionina (Met, M). En la mayoría de los organismos, ATG también actúa como codón de inicio, el codón donde un ribosoma empieza a leer un gen.
Marcos de lectura
Una secuencia de ADN se puede leer de tres formas distintas, llamadas marcos de lectura, según la base desde la que se empiece a contar:
- El marco 1 empieza en la primera base.
- El marco 2 empieza en la segunda base, saltando la primera.
- El marco 3 empieza en la tercera base, saltando las dos primeras.
Desplazar el marco aunque sea una sola base cambia todos los codones posteriores, por lo que la misma secuencia puede producir tres cadenas de aminoácidos completamente distintas. Por lo general, solo uno de los marcos es el marco de codificación real de un gen.
Búsqueda del primer codón de inicio
De forma predeterminada, la herramienta traduce empezando en la primera base del marco elegido, sea cual sea el codón que resulte. Así ha funcionado siempre la herramienta, y es útil para traducir una secuencia que ya se sabe que está en marco desde la posición uno.
La opción «Buscar el primer codón de inicio» cambia dónde empieza la traducción, no cómo se traduce. Cuando está activada, la herramienta busca a lo largo del marco elegido el primer codón ATG y empieza a traducir desde ahí, saltando las bases anteriores. Esto reproduce cómo un ribosoma encuentra el inicio de un marco abierto de lectura (ORF), en lugar de traducir desde un punto arbitrario de una secuencia más larga. Si no existe ningún ATG en ese marco, la herramienta informa de que no se encontró ningún codón de inicio en vez de suponer uno.
Al desactivar la opción se vuelve al comportamiento original: la traducción empieza justo al inicio del marco.
Cómo calcular una traducción de ADN a proteína
- Introduce una secuencia de ADN o ARN. Los espacios, saltos de línea, dígitos y caracteres de estilo FASTA se ignoran automáticamente.
- Elige un marco de lectura: 1, 2 o 3.
- Opcionalmente, activa «Buscar el primer codón de inicio» para empezar en el primer ATG dentro del marco en lugar de en el inicio del marco.
- La herramienta lee la secuencia de tres en tres bases, busca cada codón en el código genético estándar y se detiene en el primer codón de parada.
- El resultado es la secuencia de proteína, escrita como códigos de aminoácidos de una letra, junto con un desglose codón por codón.
Ejemplo resuelto
Secuencia: ATGGCCTAA, marco de lectura 1, búsqueda de codón de inicio desactivada.
| Posición | Codón | Aminoácido |
|---|---|---|
| 1 | ATG | Met (M) |
| 2 | GCC | Ala (A) |
| 3 | TAA | Stop |
La proteína es MA. La traducción se detiene en TAA, así que no se lee nada después.
Ahora toma una secuencia más larga, CCCATGGCCTAA, en el marco 1. Con la búsqueda desactivada, la herramienta lee desde la primera base: CCC (Pro), ATG (Met), GCC (Ala) y luego TAA (parada), lo que da la proteína PMA. Con la búsqueda activada, la herramienta salta CCC, empieza en el primer ATG y lee ATG (Met), GCC (Ala) y luego TAA (parada), lo que da la proteína MA. Ambos son resultados correctos de la misma secuencia; responden a preguntas distintas, una lee todo el marco y la otra lee solo el marco abierto de lectura que empieza en ATG.
Preguntas frecuentes
¿Qué es un codón?
Un codón es un grupo de tres bases de ADN o ARN. Cada uno de los 64 codones posibles representa un aminoácido o una señal de parada, según el código genético estándar.
¿Por qué la traducción se detiene en un codón de parada?
TAA, TAG y TGA no codifican ningún aminoácido. Son señales de parada. Un ribosoma que lee un gen real libera la cadena de proteína terminada en ese punto, así que la herramienta hace lo mismo e ignora las bases posteriores.
¿Qué es un marco de lectura y por qué es importante?
Es el punto de partida usado para dividir una secuencia en codones. Empezar una o dos bases más tarde cambia todos los codones siguientes, por lo que el mismo ADN se puede leer de tres formas distintas, y por lo general solo una de ellas es la secuencia codificante real.
¿Qué cambia la opción «Buscar el primer codón de inicio»?
Cambia dónde empieza la traducción, no el código genético usado. Con la opción activada, la herramienta avanza en el marco elegido hasta el primer ATG y traduce desde ahí, tal como un ribosoma empieza en un codón de inicio. Con la opción desactivada, la traducción empieza en la primera base del marco.
¿Puedo pegar una secuencia de ARN?
Sí. La herramienta trata la U igual que la T, ya que el uracilo del ARN y la timina del ADN corresponden al mismo significado de codón. Se aceptan tanto mayúsculas como minúsculas.
¿Qué ocurre si mi secuencia tiene letras distintas de A, C, G, T o U?
La herramienta marca los caracteres no válidos y no traduce la secuencia. Esto incluye códigos de ambigüedad como N, que son habituales en datos de secuenciación de baja calidad pero no son entradas válidas para la traducción.
¿Qué ocurre si la longitud de la secuencia no es múltiplo de tres?
La herramienta traduce todos los codones completos que puede y reporta aparte la una o dos bases sobrantes, sin suponer qué podrían codificar.