ਅਨੁਕੂਲ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ ਜਦੋਂ ਤੁਸੀਂ ਲੜੀ ਡੇਟਾ, ਲਕਸ਼ ਯੂਨੀਕ ਲੜੀ, ਕੇਂਦਰੀਤਾ ਅਤੇ ਆਯਤਨ ਦਰਜ ਕਰਦੇ ਹੋ। ਸਧਾਰਣ, ਸਹੀ ਜੀਨੋਮਿਕ ਨਕਲ ਅਨੁਮਾਨ ਬਿਨਾਂ ਕਿਸੇ ਜਟਿਲ ਸੰਰਚਨਾਵਾਂ ਜਾਂ ਏਪੀਐਈ ਇੰਟਿਗਰੇਸ਼ਨਾਂ ਦੇ।
ਜਿਸ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦਾ ਤੁਸੀਂ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨਾ ਚਾਹੁੰਦੇ ਹੋ, ਉਹ ਦਰਜ ਕਰੋ
ਉਸ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਨੂੰ ਦਰਜ ਕਰੋ ਜਿਸ ਦੀਆਂ ਵਾਰਤਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰਨੀ ਹੈ
ਅੰਦਾਜ਼ਿਤ ਨਕਲ ਸੰਖਿਆ
0
ਨਕਲ ਸੰਖਿਆ ਲਕਸ਼ ਲੜੀ ਦੀਆਂ ਵਾਰਤਾਂ, ਡੀਐਨਏ ਸੰਕੇਂਦ੍ਰਣ, ਨਮੂਨਾ ਮਾਤਰਾ ਅਤੇ ਡੀਐਨਏ ਦੇ ਮੌਲਿਕ ਗੁਣਾਂ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਗਣਨਾ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।
ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਦੇਖਣ ਲਈ ਵੈਧ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਅਤੇ ਪੈਰਾਮੀਟਰ ਦਰਜ ਕਰੋ
ਜੈਨੋਮਿਕ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਟੂਲ ਹੈ ਜੋ ਕਿਸੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦੇ ਨਕਸ਼ੇ ਵਿੱਚ ਮੌਜੂਦ ਕਾਪੀਆਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਦਾ ਅੰਦਾਜ਼ਾ ਲਗਾਉਣ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਮੌਲਿਕ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ, ਜੈਨੇਟਿਕਸ ਅਤੇ ਕਲੀਨਿਕਲ ਡਾਇਗਨੋਸਟਿਕਸ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਮੁੱਢਲਾ ਤਕਨੀਕ ਹੈ ਜੋ ਖੋਜਕਰਤਾ ਅਤੇ ਡਾਕਟਰਾਂ ਨੂੰ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਦੀ ਬਹੁਤਾਤਾ ਦੀ ਮਾਪ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਇਹ ਗਣਨਾ ਕਈ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਅਹਿਮ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਜੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਧਿਐਨ, ਪੈਥੋਜਨ ਪਛਾਣ, ਟ੍ਰਾਂਸਜੀਨ ਮਾਪ, ਅਤੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ (CNVs) ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਜੈਨੇਟਿਕ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਦੀ ਨਿਦਾਨ।
ਸਾਡਾ ਜੈਨੋਮਿਕ ਰਿਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਐਸਟਿਮੇਟਰ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸਿੱਧਾ ਤਰੀਕਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਬਿਨਾਂ ਕਿਸੇ ਜਟਿਲ ਸੰਰਚਨਾਵਾਂ ਜਾਂ ਏਪੀਐਈ ਇੰਟਿਗ੍ਰੇਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਲੋੜ। ਤੁਹਾਡੇ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦੇ ਡੇਟਾ ਅਤੇ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੇ ਨਾਲ, ਸੰਕੇਤਾਂ ਦੇ ਪੈਰਾਮੀਟਰਾਂ ਨੂੰ ਦਰਜ ਕਰਕੇ, ਤੁਸੀਂ ਆਪਣੇ ਨਮੂਨੇ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਦੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਨੂੰ ਤੇਜ਼ੀ ਨਾਲ ਨਿਰਧਾਰਿਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹੋ। ਇਹ ਜਾਣਕਾਰੀ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨਾਂ, ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਮਕੈਨਿਜਮਾਂ ਨੂੰ ਸਮਝਣ ਅਤੇ ਮੌਲਿਕ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਪ੍ਰੋਟੋਕੋਲਾਂ ਨੂੰ ਢੰਗ ਨਾਲ ਢਾਲਣ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ।
ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਇਸ ਗੱਲ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਕਿਸੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦਾ ਨਕਸ਼ੇ ਜਾਂ ਨਮੂਨੇ ਵਿੱਚ ਕਿੰਨੀ ਵਾਰ ਉਲਲੇਖ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। ਇੱਕ ਸਧਾਰਨ ਮਨੁੱਖੀ ਨਕਸ਼ੇ ਵਿੱਚ, ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਜੀਨ ਦੋ ਕਾਪੀਆਂ ਵਿੱਚ ਮੌਜੂਦ ਹੁੰਦੇ ਹਨ (ਹਰ ਮਾਪੇ ਤੋਂ ਇੱਕ)। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਵੱਖ-ਵੱਖ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਹਾਲਤਾਂ ਇਸ ਮਿਆਰੀ ਤੋਂ ਦੂਰ ਹੋ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ:
ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਸਹੀ ਗਣਨਾ ਵਿਗਿਆਨੀਆਂ ਨੂੰ ਇਹ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਅਤੇ ਇਹਨਾਂ ਦੇ ਸਿਹਤ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਲਈ ਅਰਥਾਂ ਨੂੰ ਸਮਝਣ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰਦੀ ਹੈ।
ਕਿਸੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦਾ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਹੇਠਾਂ ਦਿੱਤੇ ਫਾਰਮੂਲੇ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਗਣਨਾ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ:
ਜਿੱਥੇ:
ਇਹ ਫਾਰਮੂਲਾ ਡੀਐਨਏ ਦੇ ਮੌਲਿਕ ਗੁਣਾਂ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਰੱਖਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਤੁਹਾਡੇ ਨਮੂਨੇ ਵਿੱਚ ਅਬਸੋਲਿਊਟ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦਾ ਅੰਦਾਜ਼ਾ ਲਗਾਉਂਦਾ ਹੈ।
ਉਲਲੇਖ: ਇਹ ਨਿਰਧਾਰਿਤ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਨਮੂਨੇ ਦੇ ਪੂਰੇ ਡੀਐਨਏ ਵਿੱਚ ਕਿੰਨੀ ਵਾਰ ਉਲਲੇਖਿਤ ਹੈ। ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ, ਜੇ ਤੁਹਾਡੀ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ "ATCG" ਹੈ ਅਤੇ ਇਹ ਤੁਹਾਡੇ ਡੀਐਨਏ ਨਮੂਨੇ ਵਿੱਚ 5 ਵਾਰੀ ਉਲਲੇਖਿਤ ਹੈ, ਤਾਂ ਉਲਲੇਖ ਦੀ ਕੀਮਤ 5 ਹੋਵੇਗੀ।
ਡੀਐਨਏ ਸੰਕੇਤ: ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ng/μL (ਨੈਨੋਗ੍ਰਾਮ ਪ੍ਰਤੀ ਮਾਈਕ੍ਰੋਲੀਟਰ) ਵਿੱਚ ਮਾਪਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਹ ਤੁਹਾਡੇ ਹੱਲ ਵਿੱਚ ਮੌਜੂਦ ਡੀਐਨਏ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ। ਇਹ ਮੁੱਲ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਾਨੋਡ੍ਰੌਪ ਜਾਂ ਕਲੋਰੀਮੀਟਰਿਕ ਅਸੈਸਮੈਂਟਾਂ ਵਰਗੀਆਂ ਵਿਧੀਆਂ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਕੇ ਨਿਰਧਾਰਿਤ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਨਮੂਨਾ ਵਾਲੀਅਮ: ਤੁਹਾਡੇ ਡੀਐਨਏ ਨਮੂਨੇ ਦਾ ਕੁੱਲ ਵਾਲੀਅਮ μL (ਮਾਈਕ੍ਰੋਲੀਟਰ) ਵਿੱਚ।
ਐਵੋਗੈਡਰੋ ਦਾ ਨੰਬਰ: ਇਹ ਮੂਲ ਸੰਖਿਆ (6.022 × 10²³) ਇੱਕ ਪਦਾਰਥ ਦੇ ਇੱਕ ਮੋਲ ਵਿੱਚ ਮੌਜੂਦ ਮੌਲਿਕਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ।
ਡੀਐਨਏ ਲੰਬਾਈ: ਤੁਹਾਡੇ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦੀ ਕੁੱਲ ਲੰਬਾਈ ਬੇਸ ਪੇਅਰ ਵਿੱਚ।
ਔਸਤ ਬੇਸ ਪੇਅਰ ਭਾਰ: ਡੀਐਨਏ ਬੇਸ ਪੇਅਰ ਦਾ ਔਸਤ ਮੌਲਿਕ ਭਾਰ ਲਗਭਗ 660 g/mol ਹੈ। ਇਹ ਮੁੱਲ ਨੂਕਲੀਓਟਾਈਡਾਂ ਅਤੇ ਡੀਐਨਏ ਵਿੱਚ ਫਾਸਫੋਡੀਐਸਟਰ ਬਾਂਧਾਂ ਦੇ ਔਸਤ ਭਾਰ ਨੂੰ ਧਿਆਨ ਵਿੱਚ ਰੱਖਦਾ ਹੈ।
ਸਾਡਾ ਜੈਨੋਮਿਕ ਰਿਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਐਸਟਿਮੇਟਰ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਵਰਤੋਂਕਾਰ-ਮਿੱਤਰ ਇੰਟਰਫੇਸ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਸਹੀ ਨਤੀਜੇ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਲਈ ਹੇਠਾਂ ਦਿੱਤੇ ਕਦਮਾਂ ਦੀ ਪਾਲਣਾ ਕਰੋ:
ਪਹਿਲੇ ਇਨਪੁਟ ਖੇਤਰ ਵਿੱਚ, ਉਹ ਪੂਰੀ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦਰਜ ਕਰੋ ਜਿਸਨੂੰ ਤੁਸੀਂ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨਾ ਚਾਹੁੰਦੇ ਹੋ। ਇਹ ਉਹ ਪੂਰੀ ਲੜੀ ਹੋਣੀ ਚਾਹੀਦੀ ਹੈ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਤੁਸੀਂ ਆਪਣੇ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੇ ਉਲਲੇਖ ਗਿਣਨਾ ਚਾਹੁੰਦੇ ਹੋ।
ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਨੋਟਸ:
ਵੈਧ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦਾ ਉਦਾਹਰਨ:
1ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAG
2
ਦੂਜੇ ਇਨਪੁਟ ਖੇਤਰ ਵਿੱਚ, ਉਹ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦਰਜ ਕਰੋ ਜਿਸਦਾ ਤੁਸੀਂ ਉਲਲੇਖ ਗਿਣਨਾ ਚਾਹੁੰਦੇ ਹੋ। ਇਹ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਹੈ ਜਿਸਦਾ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਤੁਸੀਂ ਨਿਰਧਾਰਿਤ ਕਰਨਾ ਚਾਹੁੰਦੇ ਹੋ।
ਆਵਸ਼ਕਤਾਵਾਂ:
ਵੈਧ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦਾ ਉਦਾਹਰਨ:
1ATCG
2
ਆਪਣੇ ਡੀਐਨਏ ਨਮੂਨੇ ਦੀ ਸੰਕੇਤ ng/μL (ਨੈਨੋਗ੍ਰਾਮ ਪ੍ਰਤੀ ਮਾਈਕ੍ਰੋਲੀਟਰ) ਅਤੇ ਵਾਲੀਅਮ μL (ਮਾਈਕ੍ਰੋਲੀਟਰ) ਵਿੱਚ ਦਰਜ ਕਰੋ।
ਆਮ ਮੁੱਲ:
ਸਾਰੇ ਲੋੜੀਂਦੇ ਜਾਣਕਾਰੀ ਦਰਜ ਕਰਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਆਪਣੇ ਆਪ ਤੁਹਾਡੇ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦਾ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਗਣਨਾ ਕਰੇਗਾ। ਨਤੀਜਾ ਤੁਹਾਡੇ ਨਮੂਨੇ ਵਿੱਚ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੇ ਕਾਪੀਆਂ ਦੀ ਅੰਦਾਜ਼ਿਤ ਗਿਣਤੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ।
ਨਤੀਜੇ ਦੇ ਖੇਤਰ ਵਿੱਚ ਵੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ:
ਜੈਨੋਮਿਕ ਰਿਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਐਸਟਿਮੇਟਰ ਕਈ ਪ੍ਰਮਾਣੀਕਰਨ ਜਾਂਚਾਂ ਨੂੰ ਸ਼ਾਮਲ ਕਰਦਾ ਹੈ ਤਾਂ ਕਿ ਸਹੀ ਨਤੀਜੇ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਏ ਜਾ ਸਕਣ:
ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਪ੍ਰਮਾਣੀਕਰਨ: ਇਹ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਇਨਪੁਟ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ ਵਿਧਾਨ ਡੀਐਨਏ ਬੇਸ (A, T, C, G) ਹਨ।
ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਪ੍ਰਮਾਣੀਕਰਨ: ਇਹ ਜਾਂਚਦਾ ਹੈ ਕਿ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ ਵਿਧਾਨ ਡੀਐਨਏ ਬੇਸ ਹਨ ਅਤੇ ਇਹ ਮੁੱਖ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਤੋਂ ਲੰਬੀ ਨਹੀਂ ਹੈ।
ਸੰਕੇਤ ਅਤੇ ਵਾਲੀਅਮ ਪ੍ਰਮਾਣੀਕਰਨ: ਇਹ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਇਹ ਮੁੱਲ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਸੰਖਿਆਵਾਂ ਹਨ।
ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ ਅਤੇ ਦਵਾਈ ਦੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਕਈ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਹਨ:
ਜੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਧਿਐਨ: ਕਿਸੇ ਜੀਨ ਦੀ ਕਾਪੀ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਨੂੰ ਮਾਪਣਾ ਇਸਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪੱਧਰ ਅਤੇ ਕਾਰਜ ਨੂੰ ਸਮਝਣ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ।
ਟ੍ਰਾਂਸਜੈਨਿਕ ਜੀਵ ਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ: ਜੈਵਿਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਸੰਯੋਜਿਤ ਜੀਨਾਂ ਦੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦਾ ਨਿਰਧਾਰਨ ਕਰਨਾ ਜੋ ਇੰਟੇਗ੍ਰੇਸ਼ਨ ਦੀ ਕੁਸ਼ਲਤਾ ਨੂੰ ਮਾਪਦਾ ਹੈ।
ਮਾਈਕ੍ਰੋਬੀਅਲ ਮਾਪ: ਵਾਤਾਵਰਣ ਜਾਂ ਕਲੀਨਿਕਲ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬੀਅਲ ਲੜੀਆਂ ਦੀ ਬਹੁਤਾਤਾ ਨੂੰ ਮਾਪਣਾ।
ਵਾਇਰਲ ਲੋਡ ਟੈਸਟਿੰਗ: ਮਰੀਜ਼ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਵਾਇਰਲ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰਨਾ ਤਾਂ ਕਿ ਸੰਕਰਮਣ ਦੀ ਪ੍ਰਗਤੀ ਅਤੇ ਉਪਚਾਰ ਦੀ ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ੀਲਤਾ ਦੀ ਨਿਗਰਾਨੀ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕੇ।
ਕੈਂਸਰ ਡਾਇਗਨੋਸਟਿਕਸ: ਓਨਕੋਜੀਨਜ਼ ਅਤੇ ਟਿਊਮਰ ਦਬਾਉਣ ਵਾਲੇ ਜੀਨਾਂ ਦੇ ਉਲਲੇਖਾਂ ਜਾਂ ਹਟਾਉਣਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨਾ।
ਜੈਨੇਟਿਕ ਬਿਮਾਰੀ ਦਾ ਨਿਦਾਨ: ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨਾ ਜੋ ਜੈਨੇਟਿਕ ਰੋਗਾਂ ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਹੈ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਡਿਊਸ਼ੇਨ ਮਾਸਕੁਲਰ ਡਿਸਟ੍ਰੋਫੀ ਜਾਂ ਚਾਰਕੋਟ-ਮੈਰੀ-ਟੂਥ ਬਿਮਾਰੀ।
ਫਾਰਮਾਕੋਜੀਨੋਮਿਕਸ: ਸਮਝਣਾ ਕਿ ਕਿਵੇਂ ਜੀਨ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦਵਾਈ ਦੇ ਮੈਟਾਬੋਲਿਜ਼ਮ ਅਤੇ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆ ਨੂੰ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਪ੍ਰੀਨਾਟਲ ਟੈਸਟਿੰਗ: ਟ੍ਰਾਈਸੋਮੀਜ਼ ਜਾਂ ਮਾਈਕ੍ਰੋਡਿਲੀਸ਼ਨਜ਼ ਵਰਗੀਆਂ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮਲ ਅਸਮਾਨਤਾਵਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨਾ।
ਇੱਕ ਖੋਜ ਟੀਮ ਜੋ ਛਾਤੀ ਦੇ ਕੈਂਸਰ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰ ਰਹੀ ਹੈ, ਉਹ HER2 ਜੀਨ ਦੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਨੂੰ ਨਿਰਧਾਰਿਤ ਕਰਨ ਲਈ ਜੈਨੋਮਿਕ ਰਿਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਐਸਟਿਮੇਟਰ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰ ਸਕਦੀ ਹੈ। HER2 ਦੀ ਵਧਾਈ (ਵਧੇਰੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ) ਆਗਰਾਈ ਛਾਤੀ ਦੇ ਕੈਂਸਰ ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਹੈ ਅਤੇ ਇਲਾਜ ਦੇ ਫੈਸਲਿਆਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕਰਦੀ ਹੈ। ਸਹੀ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਕੇ, ਖੋਜਕਰਤਾ:
ਜਦੋਂ ਕਿ ਸਾਡਾ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸਿੱਧਾ ਤਰੀਕਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਹੋਰ ਤਕਨੀਕਾਂ ਵੀ ਖੋਜ ਅਤੇ ਕਲੀਨਿਕਲ ਸੈਟਿੰਗਜ਼ ਵਿੱਚ ਵਰਤੀ ਜਾਂਦੀਆਂ ਹਨ:
ਕਵਾਂਟਿਟੇਟਿਵ ਪੀਸੀਆਰ (qPCR): ਡੀਐਨਏ ਵਧਾਅ ਨੂੰ ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ ਵਿੱਚ ਮਾਪਣਾ ਤਾਂ ਕਿ ਸ਼ੁਰੂਆਤੀ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦਾ ਨਿਰਧਾਰਨ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕੇ।
ਡਿਜੀਟਲ ਪੀਸੀਆਰ (dPCR): ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ ਹਜ਼ਾਰਾਂ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਪ੍ਰਤੀਕਿਰਿਆਵਾਂ ਵਿੱਚ ਵੰਡਣਾ ਤਾਂ ਕਿ ਬਿਨਾਂ ਮਿਆਰੀ ਵਕਰਾਂ ਦੇ ਅਬਸੋਲਿਊਟ ਮਾਪ ਦਿੱਤਾ ਜਾ ਸਕੇ।
ਫਲੋਰੇਸੈਂਸ ਇਨ ਸਿਟੂ ਹਾਈਬ੍ਰਿਡਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ (FISH): ਸਿੱਧੇ ਹੀ ਕੋਸ਼ਿਕਾਵਾਂ ਜਾਂ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਨੂੰ ਵਿਜ਼ੂਅਲਾਈਜ਼ ਅਤੇ ਗਿਣਤੀ ਕਰਨਾ।
ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੈਨੋਮਿਕ ਹਾਈਬ੍ਰਿਡਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ (CGH): ਇੱਕ ਟੈਸਟ ਅਤੇ ਰਿਫਰੈਂਸ ਨਮੂਨੇ ਦੇ ਵਿਚਕਾਰ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਦੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਨਾ।
ਅਗਲੇ ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ (NGS): ਪੂਰੇ ਜੈਨੋਮ ਦੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਉੱਚ ਰੇਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਨਾਲ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਨਾ।
ਹਰ ਵਿਧੀ ਦੀ ਆਪਣੀ ਫਾਇਦੇ ਅਤੇ ਸੀਮਾਵਾਂ ਹਨ ਜਿਹੜੀਆਂ ਸਹੀਤਾ, ਲਾਗਤ, ਥਰੋਪੁੱਟ ਅਤੇ ਰੇਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਹਨ। ਸਾਡਾ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਪਹਿਲਿਕ ਅੰਦਾਜ਼ੇ ਜਾਂ ਜਦੋਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਉਪਕਰਨ ਉਪਲਬਧ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦੇ, ਲਈ ਇੱਕ ਤੇਜ਼ ਅਤੇ ਪਹੁੰਚਯੋਗ ਤਰੀਕਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੇ ਧਾਰਨਾ ਅਤੇ ਇਸਦੀ ਮਹੱਤਤਾ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ ਵਿੱਚ ਕਈ ਦਹਾਕਿਆਂ ਵਿੱਚ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤਬਦੀਲੀਆਂ ਦੇਖ ਚੁੱਕੀ ਹੈ:
ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦਾ ਆਧਾਰ ਵਾਟਸਨ ਅਤੇ ਕ੍ਰਿਕ ਦੁਆਰਾ 1953 ਵਿੱਚ ਡੀਐਨਏ ਦੀ ਬਣਤਰ ਦੀ ਖੋਜ ਨਾਲ ਰੱਖਿਆ ਗਿਆ ਸੀ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵਿੱਚ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੀ ਸਮਰੱਥਾ 1970 ਦੇ ਦਹਾਕੇ ਵਿੱਚ ਮੌਲਿਕ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨਕ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਵਿਕਾਸ ਤੱਕ ਸੀਮਿਤ ਰਹੀ।
1980 ਦੇ ਦਹਾਕੇ ਵਿੱਚ ਸਾਊਦਰਨ ਬਲੌਟਿੰਗ ਅਤੇ ਇਨ ਸਿਟੂ ਹਾਈਬ੍ਰਿਡਾਈਜ਼ੇਸ਼ਨ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦਾ ਵਿਕਾਸ ਹੋਇਆ ਜਿਸਨੇ ਵਿਗਿਆਨੀਆਂ ਨੂੰ ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ ਦੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਬਦਲਾਅ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੱਤੀ। ਇਹ ਤਕਨੀਕਾਂ ਨੇ ਪਹਿਲੀ ਵਾਰੀ ਇਹ ਦਰਸਾਇਆ ਕਿ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਕਿਸ ਤਰ੍ਹਾਂ ਜੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਫੀਨੋਟਾਈਪ ਨੂੰ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।
ਕੈਰੀ ਮੁੱਲਿਸ ਦੁਆਰਾ ਪੋਲੀਮਰੇਜ਼ ਚੇਨ ਰਿਐਕਸ਼ਨ (ਪੀਸੀਆਰ) ਦਾ ਆਵਿਸ਼ਕਾਰ ਅਤੇ ਸੁਧਾਰ ਡੀਐਨਏ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਕ੍ਰਾਂਤੀਕਾਰੀ ਬਦਲਾਅ ਲਿਆ। 1990 ਦੇ ਦਹਾਕੇ ਵਿੱਚ ਕਵਾਂਟਿਟੇਟਿਵ ਪੀਸੀਆਰ (qPCR) ਦਾ ਵਿਕਾਸ ਹੋਇਆ ਜਿਸਨੇ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਮਾਪਣ ਲਈ ਹੋਰ ਸਹੀ ਮਾਪਣ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੱਤੀ ਅਤੇ ਬਹੁਤ ਸਾਰੀਆਂ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਸੋਨੇ ਦੇ ਮਿਆਰ ਬਣ ਗਿਆ।
2003 ਵਿੱਚ ਮਨੁੱਖੀ ਜੈਨੋਮ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਦੇ ਪੂਰੇ ਹੋਣ ਅਤੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਐਰੇ ਅਤੇ ਅਗਲੇ ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਤਕਨੀਕਾਂ ਦੇ ਆਵਿਸ਼ਕਾਰ ਨੇ ਸਾਡੇ ਲਈ ਪੂਰੇ ਜੈਨੋਮ ਵਿੱਚ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੇ ਬਦਲਾਅ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੀ ਸਮਰੱਥਾ ਨੂੰ ਬਹੁਤ ਵਧਾਇਆ। ਇਹ ਤਕਨੀਕਾਂ ਨੇ ਦਰਸਾਇਆ ਕਿ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਪਹਿਲਾਂ ਦੇ ਸੋਚਿਆ ਗਿਆ ਨਾਲੋਂ ਬਹੁਤ ਆਮ ਅਤੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹਨ, ਜੋ ਕਿ ਸਧਾਰਨ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਆਪਕਤਾ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਂਦੇ ਹਨ।
ਅੱਜ, ਗਣਨਾਤਮਕ ਤਰੀਕੇ ਅਤੇ ਬਾਇਓਇੰਫੋਰਮੈਟਿਕਸ ਟੂਲਾਂ ਨੇ ਸਾਡੇ ਲਈ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਸਹੀ ਗਣਨਾ ਅਤੇ ਵਿਵੇਚਨਾ ਕਰਨ ਦੀ ਸਮਰੱਥਾ ਨੂੰ ਹੋਰ ਵਧਾਇਆ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਇਹ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੁਨੀਆ ਭਰ ਦੇ ਖੋਜਕਰਤਾ ਅਤੇ ਡਾਕਟਰਾਂ ਲਈ ਪਹੁੰਚਯੋਗ ਬਣ ਗਿਆ ਹੈ।
ਇੱਥੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਪ੍ਰੋਗਰਾਮਿੰਗ ਭਾਸ਼ਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਗਣਨਾ ਦੇ ਕਾਰਜਾਂ ਦੀਆਂ ਕਾਰਵਾਈਆਂ ਹਨ:
1def calculate_dna_copy_number(dna_sequence, target_sequence, concentration, volume):
2 """
3 ਟਾਰਗਟ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦਾ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਗਣਨਾ ਕਰੋ।
4
5 ਪੈਰਾਮੀਟਰ:
6 dna_sequence (str): ਪੂਰੀ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ
7 target_sequence (str): ਗਿਣਤੀ ਕਰਨ ਲਈ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ
8 concentration (float): ng/μL ਵਿੱਚ ਡੀਐਨਏ ਸੰਕੇਤ
9 volume (float): μL ਵਿੱਚ ਨਮੂਨਾ ਵਾਲੀਅਮ
10
11 ਵਾਪਸ ਕਰੋ:
12 int: ਅੰਦਾਜ਼ਿਤ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ
13 """
14 # ਲੜੀਆਂ ਨੂੰ ਸਾਫ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕਰੋ
15 dna_sequence = dna_sequence.upper().replace(" ", "")
16 target_sequence = target_sequence.upper().replace(" ", "")
17
18 if not all(base in "ATCG" for base in dna_sequence):
19 raise ValueError("ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ A, T, C, G ਅੱਖਰ ਹੋਣੇ ਚਾਹੀਦੇ ਹਨ")
20
21 if not all(base in "ATCG" for base in target_sequence):
22 raise ValueError("ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ A, T, C, G ਅੱਖਰ ਹੋਣੇ ਚਾਹੀਦੇ ਹਨ")
23
24 if len(target_sequence) > len(dna_sequence):
25 raise ValueError("ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਤੋਂ ਲੰਬੀ ਨਹੀਂ ਹੋ ਸਕਦੀ")
26
27 if concentration <= 0 or volume <= 0:
28 raise ValueError("ਸੰਕੇਤ ਅਤੇ ਵਾਲੀਅਮ 0 ਤੋਂ ਵੱਧ ਹੋਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ")
29
30 # ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੇ ਉਲਲੇਖਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰੋ
31 count = 0
32 pos = 0
33 while True:
34 pos = dna_sequence.find(target_sequence, pos)
35 if pos == -1:
36 break
37 count += 1
38 pos += 1
39
40 # ਸਥਿਰਾਂ
41 avogadro = 6.022e23 # ਮੋਲ/ਮੋਲ
42 avg_base_pair_weight = 660 # g/mol
43
44 # ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ
45 total_dna_ng = concentration * volume
46 total_dna_g = total_dna_ng / 1e9
47 moles_dna = total_dna_g / (len(dna_sequence) * avg_base_pair_weight)
48 total_copies = moles_dna * avogadro
49 copy_number = count * total_copies
50
51 return round(copy_number)
52
53# ਉਦਾਹਰਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ
54dna_seq = "ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAG"
55target_seq = "ATCG"
56conc = 10 # ng/μL
57vol = 20 # μL
58
59try:
60 result = calculate_dna_copy_number(dna_seq, target_seq, conc, vol)
61 print(f"ਅੰਦਾਜ਼ਿਤ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ: {result:,}")
62except ValueError as e:
63 print(f"ਗਲਤੀ: {e}")
64
1function calculateDnaCopyNumber(dnaSequence, targetSequence, concentration, volume) {
2 // ਲੜੀਆਂ ਨੂੰ ਸਾਫ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕਰੋ
3 dnaSequence = dnaSequence.toUpperCase().replace(/\s+/g, '');
4 targetSequence = targetSequence.toUpperCase().replace(/\s+/g, '');
5
6 // ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦੀ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ
7 if (!/^[ATCG]+$/.test(dnaSequence)) {
8 throw new Error("ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ A, T, C, G ਅੱਖਰ ਹੋਣੇ ਚਾਹੀਦੇ ਹਨ");
9 }
10
11 // ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੀ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ
12 if (!/^[ATCG]+$/.test(targetSequence)) {
13 throw new Error("ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ A, T, C, G ਅੱਖਰ ਹੋਣੇ ਚਾਹੀਦੇ ਹਨ");
14 }
15
16 if (targetSequence.length > dnaSequence.length) {
17 throw new Error("ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਤੋਂ ਲੰਬੀ ਨਹੀਂ ਹੋ ਸਕਦੀ");
18 }
19
20 if (concentration <= 0 || volume <= 0) {
21 throw new Error("ਸੰਕੇਤ ਅਤੇ ਵਾਲੀਅਮ 0 ਤੋਂ ਵੱਧ ਹੋਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ");
22 }
23
24 // ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੇ ਉਲਲੇਖਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰੋ
25 let count = 0;
26 let pos = 0;
27
28 while (true) {
29 pos = dnaSequence.indexOf(targetSequence, pos);
30 if (pos === -1) break;
31 count++;
32 pos++;
33 }
34
35 // ਸਥਿਰਾਂ
36 const avogadro = 6.022e23; // ਮੋਲ/ਮੋਲ
37 const avgBasePairWeight = 660; // g/mol
38
39 // ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ
40 const totalDnaNg = concentration * volume;
41 const totalDnaG = totalDnaNg / 1e9;
42 const molesDna = totalDnaG / (dnaSequence.length * avgBasePairWeight);
43 const totalCopies = molesDna * avogadro;
44 const copyNumber = count * totalCopies;
45
46 return Math.round(copyNumber);
47}
48
49// ਉਦਾਹਰਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ
50try {
51 const dnaSeq = "ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAG";
52 const targetSeq = "ATCG";
53 const conc = 10; // ng/μL
54 const vol = 20; // μL
55
56 const result = calculateDnaCopyNumber(dnaSeq, targetSeq, conc, vol);
57 console.log(`ਅੰਦਾਜ਼ਿਤ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ: ${result.toLocaleString()}`);
58} catch (error) {
59 console.error(`ਗਲਤੀ: ${error.message}`);
60}
61
1calculate_dna_copy_number <- function(dna_sequence, target_sequence, concentration, volume) {
2 # ਲੜੀਆਂ ਨੂੰ ਸਾਫ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਤ ਕਰੋ
3 dna_sequence <- gsub("\\s+", "", toupper(dna_sequence))
4 target_sequence <- gsub("\\s+", "", toupper(target_sequence))
5
6 # ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਦੀ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ
7 if (!grepl("^[ATCG]+$", dna_sequence)) {
8 stop("ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ A, T, C, G ਅੱਖਰ ਹੋਣੇ ਚਾਹੀਦੇ ਹਨ")
9 }
10
11 # ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੀ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ
12 if (!grepl("^[ATCG]+$", target_sequence)) {
13 stop("ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਵਿੱਚ ਸਿਰਫ A, T, C, G ਅੱਖਰ ਹੋਣੇ ਚਾਹੀਦੇ ਹਨ")
14 }
15
16 if (nchar(target_sequence) > nchar(dna_sequence)) {
17 stop("ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਤੋਂ ਲੰਬੀ ਨਹੀਂ ਹੋ ਸਕਦੀ")
18 }
19
20 if (concentration <= 0 || volume <= 0) {
21 stop("ਸੰਕੇਤ ਅਤੇ ਵਾਲੀਅਮ 0 ਤੋਂ ਵੱਧ ਹੋਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ")
22 }
23
24 # ਟਾਰਗਟ ਲੜੀ ਦੇ ਉਲਲੇਖਾਂ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰੋ
25 count <- 0
26 pos <- 1
27
28 while (TRUE) {
29 pos <- regexpr(target_sequence, substr(dna_sequence, pos, nchar(dna_sequence)))
30 if (pos == -1) break
31 count <- count + 1
32 pos <- pos + 1
33 }
34
35 # ਸਥਿਰਾਂ
36 avogadro <- 6.022e23 # ਮੋਲ/ਮੋਲ
37 avg_base_pair_weight <- 660 # g/mol
38
39 # ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰੋ
40 total_dna_ng <- concentration * volume
41 total_dna_g <- total_dna_ng / 1e9
42 moles_dna <- total_dna_g / (nchar(dna_sequence) * avg_base_pair_weight)
43 total_copies <- moles_dna * avogadro
44 copy_number <- count * total_copies
45
46 return(round(copy_number))
47}
48
49# ਉਦਾਹਰਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ
50tryCatch({
51 dna_seq <- "ATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAG"
52 target_seq <- "ATCG"
53 conc <- 10 # ng/μL
54 vol <- 20 # μL
55
56 result <- calculate_dna_copy_number(dna_seq, target_seq, conc, vol)
57 cat(sprintf("ਅੰਦਾਜ਼ਿਤ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ: %s\n", format(result, big.mark=",")))
58}, error = function(e) {
59 cat(sprintf("ਗਲਤੀ: %s\n", e$message))
60})
61
ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਇਸ ਗੱਲ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਕਿਸੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀ ਨਕਸ਼ੇ ਜਾਂ ਨਮੂਨੇ ਵਿੱਚ ਕਿੰਨੀ ਵਾਰ ਉਲਲੇਖਿਤ ਹੈ। ਮਨੁੱਖਾਂ ਵਿੱਚ, ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਜੀਨ ਦੋ ਕਾਪੀਆਂ ਵਿੱਚ ਮੌਜੂਦ ਹੁੰਦੇ ਹਨ (ਹਰ ਮਾਪੇ ਤੋਂ ਇੱਕ), ਪਰ ਇਹ ਗਿਣਤੀ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨਾਂ, ਮਿਟੇਸ਼ਨਾਂ ਜਾਂ ਬਿਮਾਰੀ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਦੇ ਕਾਰਨ ਬਦਲ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਗਣਨਾ ਸਿਹਤ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀ ਲਈ ਇਹਨਾਂ ਦੇ ਅਰਥਾਂ ਨੂੰ ਸਮਝਣ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ।
ਜੈਨੋਮਿਕ ਰਿਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਐਸਟਿਮੇਟਰ ਮੌਲਿਕ ਸਿਧਾਂਤਾਂ ਅਤੇ ਤੁਹਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਦਿੱਤੇ ਗਏ ਇਨਪੁਟ ਪੈਰਾਮੀਟਰਾਂ ਦੇ ਆਧਾਰ 'ਤੇ ਇੱਕ ਸਿਧਾਂਤਕ ਗਣਨਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸਦੀ ਸਹੀਤਾ ਕਈ ਕਾਰਕਾਂ 'ਤੇ ਨਿਰਭਰ ਕਰਦੀ ਹੈ:
ਜੋ ਖੋਜਾਂ ਬਹੁਤ ਸਹੀ ਮਾਪਣ ਦੀ ਲੋੜ ਕਰਦੀਆਂ ਹਨ, ਉਹ ਡਿਜੀਟਲ ਪੀਸੀਆਰ ਵਰਗੀਆਂ ਤਕਨੀਕਾਂ ਹੋਰ ਸਹੀਤਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰ ਸਕਦੀਆਂ ਹਨ, ਪਰ ਸਾਡਾ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਬਹੁਤ ਸਾਰੀਆਂ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਇੱਕ ਚੰਗਾ ਅੰਦਾਜ਼ਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਨਹੀਂ, ਇਹ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ ਅਤੇ ਇਸਦੀ ਗਣਨਾ ਵਿੱਚ ਡੀਐਨਏ-ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਮੌਲਿਕ ਭਾਰ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ। ਆਰਐਨਏ ਦੇ ਵੱਖਰੇ ਮੌਲਿਕ ਗੁਣ ਹਨ (ਯੂਰਾਸਿਲ ਦੇ ਬਦਲੇ ਵਿੱਚ ਥਾਇਮਾਈਨ ਅਤੇ ਵੱਖਰੇ ਮੌਲਿਕ ਭਾਰ ਦੇ ਨਾਲ)। ਆਰਐਨਏ ਦੀ ਮਾਪਣ ਲਈ, ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਆਰਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਜਾਣੀ ਚਾਹੀਦੀ ਹੈ।
ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਕਿਸੇ ਵੀ ਸਕਾਰਾਤਮਕ ਡੀਐਨਏ ਸੰਕੇਤ ਮੁੱਲ ਨਾਲ ਕੰਮ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨਕ ਨਮੂਨਿਆਂ ਲਈ, ਡੀਐਨਏ ਸੰਕੇਤ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ 1 ਤੋਂ 100 ng/μL ਦੇ ਦਰਮਿਆਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ। ਬਹੁਤ ਘੱਟ ਸੰਕੇਤ (1 ng/μL ਤੋਂ ਘੱਟ) ਮਾਪਣ ਦੀ ਸੀਮਾਵਾਂ ਦੇ ਕਾਰਨ ਗਣਨਾ ਵਿੱਚ ਹੋਰ ਅਸਮਾਨਤਾ ਪੈਦਾ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਨ।
ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਬਹੁਤ ਵੱਡੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਨੂੰ ਸੰਭਾਲ ਸਕਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਇਹਨਾਂ ਨੂੰ ਪੜ੍ਹਨਯੋਗ ਫਾਰਮੈਟ ਵਿੱਚ ਦਰਸਾਏਗਾ। ਬਹੁਤ ਵੱਡੇ ਮੁੱਲਾਂ ਲਈ ਵਿਗਿਆਨਕ ਨੋਟੇਸ਼ਨ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਅਧਾਰਤ ਗਣਨਾ ਪੂਰੀ ਸਹੀਤਾ ਨੂੰ ਬਣਾਈ ਰੱਖਦੀ ਹੈ ਚਾਹੇ ਨਤੀਜੇ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਕਿਸੇ ਵੀ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਹੋਵੇ।
ਜਦੋਂ ਕਿ ਇਹ ਟੂਲ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਜੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਆਰਐਨਏ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਮਾਪਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ। ਜੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਅਧਿਐਨ ਲਈ, RT-qPCR, RNA-seq, ਜਾਂ ਮਾਈਕ੍ਰੋਐਰੇਜ਼ ਵਰਗੀਆਂ ਤਕਨੀਕਾਂ ਹੋਰ ਮੌਜੂਦ ਹਨ। ਹਾਲਾਂਕਿ, ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਜੀਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕਰ ਸਕਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਲਈ ਇਹ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਆਮ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪੂਰਨ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।
ਡੀਐਨਏ ਸੰਕੇਤ ਦੀ ਸਿੱਧੀ ਰੀਤੀ ਨਾਲ ਗਣਨਾ ਕੀਤੀ ਗਈ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਨਾਲ ਸੰਬੰਧਿਤ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। ਸੰਕੇਤ ਨੂੰ ਦੋਗੁਣਾ ਕਰਨ ਨਾਲ ਅੰਦਾਜ਼ਿਤ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੋਗੁਣਾ ਹੋ ਜਾਵੇਗਾ, ਜੇਕਰ ਸਾਰੇ ਹੋਰ ਪੈਰਾਮੀਟਰ ਇੱਕੋ ਹੀ ਰਹਿੰਦੇ ਹਨ। ਇਸਦਾ ਇਹ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ ਕਿ ਸਹੀਤਾ ਮਾਪਣ ਲਈ ਸਹੀਤਾ ਦੀ ਮਹੱਤਤਾ ਹੈ।
ਬਸਟਿਨ, ਐਸ. ਏ., ਬੇਨੇਸ, ਵੀ., ਗਾਰਸਨ, ਜੇ. ਏ., ਹੇਲਮੈਨਸ, ਜੇ., ਹੱਗੇਟ, ਜੇ., ਕੁਬਿਸਟਾ, ਐਮ., ... & ਵਿਟਵਰ, ਸੀ. ਟੀ. (2009). MIQE ਦਿਸ਼ਾ-ਨਿਰਦੇਸ਼: ਕੁਵਾਂਟਿਟੇਟਿਵ ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ ਪੀਸੀਆਰ ਪ੍ਰਯੋਗਾਂ ਦੀ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਨ ਲਈ ਘੱਟੋ-ਘੱਟ ਜਾਣਕਾਰੀ। ਕਲੀਨੀਕਲ ਰਸਾਇਣ, 55(4), 611-622।
ਡੀਹੇਨ, ਬੀ., ਵੈਂਡੇਸੋਮਪੇਲੇ, ਜੇ., & ਹੇਲਮੈਨਸ, ਜੇ. (2010). ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ ਕੁਵਾਂਟਿਟੇਟਿਵ ਪੀਸੀਆਰ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਨਾਲ ਸਹੀ ਅਤੇ ਵਸਤਵਿਕ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ। ਵਿਧੀਆਂ, 50(4), 262-270।
ਹਿੰਡਸਨ, ਬੀ. ਜੇ., ਨੇਸ, ਕੇ. ਡੀ., ਮਾਸਕੁਏਲਿਅਰ, ਡੀ. ਏ., ਬੇਲਗ੍ਰੇਡਰ, ਪੀ., ਹੇਰੇਡੀਆ, ਐਨ. ਜੇ., ਮਾਕਰੇਵਿਚ, ਏ. ਜੇ., ... & ਕੋਲਸਟਨ, ਬੀ. ਡਬਲਯੂ. (2011). ਡਿਜੀਟਲ ਡ੍ਰੋਪਲੈਟ ਪੀਸੀਆਰ ਪ੍ਰਣਾਲੀ ਲਈ ਅਬਸੋਲਿਊਟ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਦੀ ਮਾਪਣ। ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣੀ ਰਸਾਇਣ, 83(22), 8604-8610।
ਝਾਓ, ਐਮ., ਵਾਂਗ, ਕਿਊ., ਵਾਂਗ, ਕਿਊ., ਜੀਆ, ਪੀ., & ਝਾਓ, ਜੇ. (2013). ਅਗਲੇ ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਨਾਲ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ (CNV) ਪਛਾਣ ਲਈ ਗਣਨਾਤਮਕ ਟੂਲ: ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਅਤੇ ਨਜ਼ਰਾਂ। BMC ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ, 14(11), 1-16।
ਰੇਡਨ, ਆਰ., ਇਸ਼ਿਕਾਵਾ, ਐਸ., ਫਿਚ, ਕੇ. ਆਰ., ਫੀਕ, ਐਲ., ਪੈਰੀ, ਜੀ. ਐਚ., ਐਂਡਰੂਜ਼, ਟੀ. ਡੀ., ... & ਹੁਰਲੇਸ, ਐਮ. ਈ. (2006). ਮਨੁੱਖੀ ਜੈਨੋਮ ਵਿੱਚ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ਵ ਵਿਆਪਕਤਾ। ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ, 444(7118), 444-454।
ਜ਼ਰਰੇਈ, ਐਮ., ਮੈਕਡੋਨਲਡ, ਜੇ. ਆਰ., ਮੇਰੀਕੋ, ਡੀ., & ਸ਼ੇਰੇਰ, ਐਸ. ਡਬਲਯੂ. (2015). ਮਨੁੱਖੀ ਜੈਨੋਮ ਦਾ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਨਕਸ਼ਾ। ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਸਮੀਖਿਆ, 16(3), 172-183।
ਸਟ੍ਰੇਂਜਰ, ਬੀ. ਈ., ਫੋਰਸਟ, ਐਮ. ਐਸ., ਡੁਨਿੰਗ, ਐਮ., ਇੰਗਲ, ਸੀ. ਈ., ਬੀਜ਼ਲੇ, ਸੀ., ਥੋਰਨ, ਐਨ., ... & ਡਰਮਿਟਜ਼ਾਕਿਸ, ਈ. ਟੀ. (2007). ਜ਼ਮੀਨੀ ਨੰਬਰ ਅਤੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਦੇ ਪ੍ਰਭਾਵਾਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ। ਵਿਗਿਆਨ, 315(5813), 848-622।
ਅਲਕਾਨ, ਸੀ., ਕੋਏ, ਬੀ. ਪੀ., & ਈਚਲਰ, ਈ. ਈ. (2011). ਜੈਨੋਮਿਕ ਸਟਰਕਚਰਲ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨ ਦੀ ਖੋਜ ਅਤੇ ਜੈਨੋਟਾਈਪਿੰਗ। ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਸਮੀਖਿਆ, 12(5), 363-376।
ਜੈਨੋਮਿਕ ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਤੁਹਾਡੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਵਿੱਚ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਦੇ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਦੀ ਗਣਨਾ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਪਰੰਤੂ ਪਹੁੰਚਯੋਗ ਤਰੀਕਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਮੌਲਿਕ ਸਿਧਾਂਤਾਂ ਨੂੰ ਵਰਤੋਂਕਾਰ-ਮਿੱਤਰ ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਦੇ ਨਾਲ ਮਿਲਾਕੇ, ਇਹ ਟੂਲ ਖੋਜਕਰਤਾ, ਵਿਦਿਆਰਥੀਆਂ ਅਤੇ ਪੇਸ਼ੇਵਰਾਂ ਨੂੰ ਕੀਮਤੀ ਮਾਤਰਾਤਮਕ ਡੇਟਾ ਤੇਜ਼ੀ ਨਾਲ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰਦਾ ਹੈ ਬਿਨਾਂ ਕਿਸੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਉਪਕਰਨ ਜਾਂ ਜਟਿਲ ਪ੍ਰੋਟੋਕੋਲਾਂ ਦੀ ਲੋੜ।
ਡੀਐਨਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਨੂੰ ਸਮਝਣਾ ਜੈਨੇਟਿਕਸ, ਮੌਲਿਕ ਜੀਵ ਵਿਗਿਆਨ, ਅਤੇ ਦਵਾਈ ਵਿੱਚ ਕਈ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ। ਚਾਹੇ ਤੁਸੀਂ ਕੈਂਸਰ ਵਿੱਚ ਜੀਨ ਵਧਾਈ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਟ੍ਰਾਂਸਜੀਨ ਇੰਟੇਗ੍ਰੇਸ਼ਨ ਦੀ ਗਿਣਤੀ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਜਾਂ ਜੈਨੇਟਿਕ ਬਿਮਾਰੀਆਂ ਵਿੱਚ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰ ਵੈਰੀਏਸ਼ਨਾਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰ ਰਹੇ ਹੋ, ਸਾਡਾ ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਤੁਹਾਨੂੰ ਜਾਣਕਾਰੀ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਸਿੱਧਾ ਤਰੀਕਾ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਅਸੀਂ ਤੁਹਾਨੂੰ ਆਪਣੇ ਡੀਐਨਏ ਲੜੀਆਂ ਨਾਲ ਜੈਨੋਮਿਕ ਰਿਪਲੀਕੇਸ਼ਨ ਐਸਟਿਮੇਟਰ ਦੀ ਕੋਸ਼ਿਸ਼ ਕਰਨ ਅਤੇ ਦੇਖਣ ਲਈ ਪ੍ਰੇਰਿਤ ਕਰਦੇ ਹਾਂ ਕਿ ਕਿਵੇਂ ਸੰਕੇਤ, ਵਾਲੀਅਮ, ਅਤੇ ਟਾਰਗਟ ਲੜੀਆਂ ਵਿੱਚ ਬਦਲਾਅ ਗਣਨਾ ਕੀਤੇ ਗਏ ਕਾਪੀ ਨੰਬਰਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕਰਦੇ ਹਨ। ਇਹ ਹੱਥਾਂ ਵਿੱਚ ਅਨੁਭਵ ਤੁਹਾਨੂੰ ਮੌਲਿਕ ਗਣਨਾ ਸਿਧਾਂਤਾਂ ਨੂੰ ਸਮਝਣ ਵਿੱਚ ਗਹਿਰਾਈ ਦੇਵੇਗਾ ਅਤੇ ਤੁਹਾਨੂੰ ਆਪਣੇ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ ਖੋਜ ਪ੍ਰਸ਼ਨਾਂ ਲਈ ਇਹ ਸਿਧਾਂਤ ਲਾਗੂ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਮਦਦ ਕਰੇਗਾ।
ਕੈਲਕੂਲੇਟਰ ਬਾਰੇ ਕਿਸੇ ਵੀ ਸਵਾਲ ਜਾਂ ਫੀਡਬੈਕ ਲਈ, ਕਿਰਪਾ ਕਰਕੇ FAQ ਹਿੱਸੇ ਵਿੱਚ ਜਾਣਕਾਰੀ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰੋ ਜਾਂ ਸਾਡੇ ਸਹਾਇਤਾ ਟੀਮ ਨਾਲ ਸੰਪਰਕ ਕਰੋ।
ਆਪਣੇ ਕਾਰਜ ਦੇ ਲਈ ਵਰਤਣ ਯੋਗ ਹੋਣ ਵਾਲੇ ਹੋਰ ਸੰਦੇਸ਼ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰੋ